MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 1114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	51038625
2	NC_006129	T	6	6	1033	1038	0 %	100 %	0 %	0 %	51038625
3	NC_006129	ATTAAT	2	12	1041	1052	50 %	50 %	0 %	0 %	51038625
4	NC_006129	ACAA	2	8	1088	1095	75 %	0 %	0 %	25 %	51038625
5	NC_006129	AATA	2	8	1126	1133	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
6	NC_006129	A	8	8	1144	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	51038625
7	NC_006129	CCTTT	2	10	1162	1171	0 %	60 %	0 %	40 %	51038625
8	NC_006129	ATTT	2	8	1175	1182	25 %	75 %	0 %	0 %	51038625
9	NC_006129	TGG	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038625
10	NC_006129	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038625
11	NC_006129	CTA	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038625
12	NC_006129	AGCA	2	8	1338	1345	50 %	0 %	25 %	25 %	51038625
13	NC_006129	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038625
14	NC_006129	A	7	7	1417	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	51038625
15	NC_006129	GAG	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038625
16	NC_006129	A	7	7	1495	1501	100 %	0 %	0 %	0 %	51038625
17	NC_006129	TTA	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038625
18	NC_006129	AATA	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
19	NC_006129	ATT	2	6	1837	1842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038626
20	NC_006129	ACAA	2	8	1876	1883	75 %	0 %	0 %	25 %	51038626
21	NC_006129	ATA	2	6	1886	1891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
22	NC_006129	TGC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51038626
23	NC_006129	GAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038626
24	NC_006129	ACA	2	6	1984	1989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038626
25	NC_006129	TAA	2	6	2003	2008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
26	NC_006129	TTAAAC	2	12	2014	2025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51038626
27	NC_006129	TAA	2	6	2054	2059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
28	NC_006129	AAAAG	2	10	2067	2076	80 %	0 %	20 %	0 %	51038626
29	NC_006129	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038626
30	NC_006129	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038626
31	NC_006129	AGA	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038626
32	NC_006129	A	8	8	2206	2213	100 %	0 %	0 %	0 %	51038626
33	NC_006129	A	6	6	2221	2226	100 %	0 %	0 %	0 %	51038626
34	NC_006129	A	7	7	2228	2234	100 %	0 %	0 %	0 %	51038626
35	NC_006129	AC	3	6	2261	2266	50 %	0 %	0 %	50 %	51038626
36	NC_006129	TGG	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038626
37	NC_006129	TAA	2	6	2292	2297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
38	NC_006129	TAA	2	6	2319	2324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
39	NC_006129	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038626
40	NC_006129	T	7	7	2496	2502	0 %	100 %	0 %	0 %	51038627
41	NC_006129	T	6	6	2566	2571	0 %	100 %	0 %	0 %	51038627
42	NC_006129	AG	3	6	2624	2629	50 %	0 %	50 %	0 %	51038627
43	NC_006129	ACT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038627
44	NC_006129	T	6	6	2647	2652	0 %	100 %	0 %	0 %	51038627
45	NC_006129	TCC	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038627
46	NC_006129	TTA	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038627
47	NC_006129	AGT	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038627
48	NC_006129	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038627
49	NC_006129	GGCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	40 %	20 %	51038627
50	NC_006129	GATT	2	8	2998	3005	25 %	50 %	25 %	0 %	51038627
51	NC_006129	AAT	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038627
52	NC_006129	TTTATT	2	12	3046	3057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51038627
53	NC_006129	T	9	9	3150	3158	0 %	100 %	0 %	0 %	51038627
54	NC_006129	TCC	2	6	3181	3186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038627
55	NC_006129	ATT	2	6	3220	3225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038627
56	NC_006129	AAC	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038627
57	NC_006129	CTA	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038628
58	NC_006129	TTA	2	6	3400	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038628
59	NC_006129	TA	3	6	3425	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	51038628
60	NC_006129	T	6	6	3440	3445	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
61	NC_006129	TAA	2	6	3465	3470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038628
62	NC_006129	A	6	6	3588	3593	100 %	0 %	0 %	0 %	51038628
63	NC_006129	CAT	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038628
64	NC_006129	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038628
65	NC_006129	TCT	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038628
66	NC_006129	GTA	2	6	3798	3803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038628
67	NC_006129	T	6	6	3813	3818	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
68	NC_006129	AAG	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038628
69	NC_006129	TTG	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038628
70	NC_006129	T	6	6	3865	3870	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
71	NC_006129	CAA	2	6	3877	3882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038628
72	NC_006129	TAAA	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	51038628
73	NC_006129	TTG	2	6	3929	3934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038628
74	NC_006129	TCT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038628
75	NC_006129	AAT	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038628
76	NC_006129	TCAA	2	8	3996	4003	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
77	NC_006129	ATCA	2	8	4058	4065	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
78	NC_006129	TCA	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038628
79	NC_006129	CCA	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51038628
80	NC_006129	TTA	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038628
81	NC_006129	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038628
82	NC_006129	T	6	6	4297	4302	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
83	NC_006129	T	6	6	4380	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
84	NC_006129	T	8	8	4442	4449	0 %	100 %	0 %	0 %	51038628
85	NC_006129	GTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038628
86	NC_006129	TCT	3	9	4497	4505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038628
87	NC_006129	A	6	6	4529	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	51038628
88	NC_006129	TAAAT	2	10	4573	4582	60 %	40 %	0 %	0 %	51038628
89	NC_006129	CAT	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038629
90	NC_006129	TAG	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038629
91	NC_006129	TAA	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038629
92	NC_006129	T	6	6	5080	5085	0 %	100 %	0 %	0 %	51038629
93	NC_006129	AAC	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038629
94	NC_006129	TGC	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51038629
95	NC_006129	CTTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	0 %	25 %	51038629
96	NC_006129	AAC	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038629
97	NC_006129	AGCA	2	8	5189	5196	50 %	0 %	25 %	25 %	51038629
98	NC_006129	TTAAA	2	10	5218	5227	60 %	40 %	0 %	0 %	51038629
99	NC_006129	ACC	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51038629
100	NC_006129	A	6	6	5276	5281	100 %	0 %	0 %	0 %	51038629
101	NC_006129	CTT	2	6	5287	5292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038629
102	NC_006129	TCA	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038629
103	NC_006129	TGC	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51038629
104	NC_006129	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038629
105	NC_006129	AAT	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038629
106	NC_006129	AAGAA	2	10	5413	5422	80 %	0 %	20 %	0 %	51038629
107	NC_006129	AAT	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038629
108	NC_006129	ATA	2	6	5437	5442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038629
109	NC_006129	T	6	6	5447	5452	0 %	100 %	0 %	0 %	51038629
110	NC_006129	AATAT	2	10	5591	5600	60 %	40 %	0 %	0 %	51038630
111	NC_006129	A	6	6	5644	5649	100 %	0 %	0 %	0 %	51038630
112	NC_006129	GAA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038630
113	NC_006129	AAC	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038630
114	NC_006129	AAG	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038630
115	NC_006129	CTTTA	2	10	5782	5791	20 %	60 %	0 %	20 %	51038630
116	NC_006129	T	6	6	5829	5834	0 %	100 %	0 %	0 %	51038630
117	NC_006129	TTA	2	6	5867	5872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038630
118	NC_006129	ACAATA	2	12	5899	5910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51038630
119	NC_006129	AGA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038631
120	NC_006129	AAAT	2	8	6263	6270	75 %	25 %	0 %	0 %	51038631
121	NC_006129	A	9	9	6334	6342	100 %	0 %	0 %	0 %	51038631
122	NC_006129	TTAAA	2	10	6343	6352	60 %	40 %	0 %	0 %	51038631
123	NC_006129	TGA	2	6	6698	6703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038632
124	NC_006129	A	7	7	6707	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	51038632
125	NC_006129	CAA	2	6	6745	6750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038632
126	NC_006129	ATT	3	9	6776	6784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038632
127	NC_006129	A	7	7	6793	6799	100 %	0 %	0 %	0 %	51038632
128	NC_006129	CTT	2	6	6802	6807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038632
129	NC_006129	A	6	6	6897	6902	100 %	0 %	0 %	0 %	51038633
130	NC_006129	CTT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038633
131	NC_006129	CAAT	2	8	6946	6953	50 %	25 %	0 %	25 %	51038633
132	NC_006129	AT	3	6	6977	6982	50 %	50 %	0 %	0 %	51038633
133	NC_006129	A	8	8	7023	7030	100 %	0 %	0 %	0 %	51038633
134	NC_006129	TAT	2	6	7064	7069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038633
135	NC_006129	AGA	2	6	7157	7162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038633
136	NC_006129	ATA	3	9	7176	7184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038633
137	NC_006129	GCA	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038633
138	NC_006129	A	6	6	7232	7237	100 %	0 %	0 %	0 %	51038633
139	NC_006129	A	8	8	7250	7257	100 %	0 %	0 %	0 %	51038633
140	NC_006129	AC	3	6	7268	7273	50 %	0 %	0 %	50 %	51038633
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