MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella henselae str. Houston-1 chromosome

Total Repeats: 31331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005956	AG	3	6	5	10	50 %	0 %	50 %	0 %	49474832
2	NC_005956	A	8	8	11	18	100 %	0 %	0 %	0 %	49474832
3	NC_005956	GAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474832
4	NC_005956	AG	3	6	155	160	50 %	0 %	50 %	0 %	49474832
5	NC_005956	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474832
6	NC_005956	ACA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474832
7	NC_005956	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	49474832
8	NC_005956	TTC	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474832
9	NC_005956	A	6	6	248	253	100 %	0 %	0 %	0 %	49474832
10	NC_005956	ATG	3	9	404	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474832
11	NC_005956	TTG	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474832
12	NC_005956	TATT	2	8	489	496	25 %	75 %	0 %	0 %	49474832
13	NC_005956	A	6	6	573	578	100 %	0 %	0 %	0 %	49474832
14	NC_005956	TGA	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474832
15	NC_005956	AT	3	6	686	691	50 %	50 %	0 %	0 %	49474832
16	NC_005956	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474832
17	NC_005956	CTG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474832
18	NC_005956	GAAA	2	8	824	831	75 %	0 %	25 %	0 %	49474832
19	NC_005956	A	7	7	893	899	100 %	0 %	0 %	0 %	49474833
20	NC_005956	TTC	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474833
21	NC_005956	CTT	2	6	928	933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474833
22	NC_005956	TGA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474833
23	NC_005956	A	6	6	952	957	100 %	0 %	0 %	0 %	49474833
24	NC_005956	A	6	6	968	973	100 %	0 %	0 %	0 %	49474833
25	NC_005956	GTT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474833
26	NC_005956	GCAAAA	2	12	1005	1016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	49474833
27	NC_005956	A	6	6	1013	1018	100 %	0 %	0 %	0 %	49474833
28	NC_005956	AGA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474833
29	NC_005956	ATTC	2	8	1149	1156	25 %	50 %	0 %	25 %	49474833
30	NC_005956	TCA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49474833
31	NC_005956	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	49474833
32	NC_005956	T	7	7	1358	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	49474833
33	NC_005956	TAT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474833
34	NC_005956	TTA	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474833
35	NC_005956	TAA	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474833
36	NC_005956	A	12	12	1451	1462	100 %	0 %	0 %	0 %	49474834
37	NC_005956	TGT	2	6	1476	1481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474834
38	NC_005956	TCA	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49474834
39	NC_005956	GAA	2	6	1582	1587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474834
40	NC_005956	T	6	6	1596	1601	0 %	100 %	0 %	0 %	49474834
41	NC_005956	GAT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474834
42	NC_005956	GAT	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474834
43	NC_005956	TGA	2	6	1788	1793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474834
44	NC_005956	GGT	2	6	1840	1845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474834
45	NC_005956	A	7	7	1872	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	49474834
46	NC_005956	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474834
47	NC_005956	AG	3	6	1926	1931	50 %	0 %	50 %	0 %	49474834
48	NC_005956	GAAA	2	8	2052	2059	75 %	0 %	25 %	0 %	49474834
49	NC_005956	CTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474834
50	NC_005956	T	8	8	2067	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	49474834
51	NC_005956	ACA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474834
52	NC_005956	AG	3	6	2297	2302	50 %	0 %	50 %	0 %	49474834
53	NC_005956	T	6	6	2360	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	49474835
54	NC_005956	TGA	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474835
55	NC_005956	TC	3	6	2439	2444	0 %	50 %	0 %	50 %	49474835
56	NC_005956	GTAAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	20 %	0 %	49474835
57	NC_005956	A	6	6	2545	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	49474835
58	NC_005956	AAGAAA	2	12	2569	2580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	49474835
59	NC_005956	A	8	8	2578	2585	100 %	0 %	0 %	0 %	49474835
60	NC_005956	GTT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474835
61	NC_005956	CTT	3	9	2640	2648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474835
62	NC_005956	GTT	3	9	2682	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474835
63	NC_005956	GAT	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474835
64	NC_005956	A	8	8	2746	2753	100 %	0 %	0 %	0 %	49474835
65	NC_005956	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474835
66	NC_005956	A	8	8	2788	2795	100 %	0 %	0 %	0 %	49474835
67	NC_005956	TAT	2	6	2813	2818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474835
68	NC_005956	AAT	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474836
69	NC_005956	ATT	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474836
70	NC_005956	ACA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474836
71	NC_005956	TTA	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474836
72	NC_005956	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474836
73	NC_005956	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	49474836
74	NC_005956	CAA	2	6	3146	3151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474836
75	NC_005956	ATA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474836
76	NC_005956	TGCTT	2	10	3348	3357	0 %	60 %	20 %	20 %	49474836
77	NC_005956	TGG	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474836
78	NC_005956	AG	3	6	3447	3452	50 %	0 %	50 %	0 %	49474836
79	NC_005956	CAG	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474836
80	NC_005956	A	6	6	3527	3532	100 %	0 %	0 %	0 %	49474836
81	NC_005956	ATGC	2	8	3535	3542	25 %	25 %	25 %	25 %	49474836
82	NC_005956	A	7	7	3553	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	49474836
83	NC_005956	AAT	2	6	3599	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474836
84	NC_005956	ATC	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49474837
85	NC_005956	T	7	7	3951	3957	0 %	100 %	0 %	0 %	49474837
86	NC_005956	TGT	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474837
87	NC_005956	GCAA	2	8	4158	4165	50 %	0 %	25 %	25 %	49474837
88	NC_005956	CCT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49474837
89	NC_005956	TC	3	6	4226	4231	0 %	50 %	0 %	50 %	49474837
90	NC_005956	CAA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474837
91	NC_005956	AGGA	2	8	4275	4282	50 %	0 %	50 %	0 %	49474837
92	NC_005956	GAT	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
93	NC_005956	CAA	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474837
94	NC_005956	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474837
95	NC_005956	TCT	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474837
96	NC_005956	ATG	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
97	NC_005956	AGAC	2	8	4417	4424	50 %	0 %	25 %	25 %	49474837
98	NC_005956	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	49474837
99	NC_005956	TCAA	2	8	4563	4570	50 %	25 %	0 %	25 %	49474837
100	NC_005956	CT	3	6	4576	4581	0 %	50 %	0 %	50 %	49474837
101	NC_005956	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474837
102	NC_005956	AAAC	2	8	4613	4620	75 %	0 %	0 %	25 %	49474837
103	NC_005956	ACG	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474837
104	NC_005956	GAT	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
105	NC_005956	CGT	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474837
106	NC_005956	GCA	2	6	4826	4831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474837
107	NC_005956	GA	4	8	4907	4914	50 %	0 %	50 %	0 %	49474837
108	NC_005956	TGA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
109	NC_005956	A	6	6	5025	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	49474837
110	NC_005956	CACAAG	2	12	5049	5060	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	49474837
111	NC_005956	CT	3	6	5095	5100	0 %	50 %	0 %	50 %	49474837
112	NC_005956	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474837
113	NC_005956	AGC	2	6	5155	5160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474837
114	NC_005956	GGGC	2	8	5206	5213	0 %	0 %	75 %	25 %	49474837
115	NC_005956	AGA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474837
116	NC_005956	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
117	NC_005956	TGA	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474837
118	NC_005956	ATA	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474837
119	NC_005956	A	6	6	5479	5484	100 %	0 %	0 %	0 %	49474837
120	NC_005956	TGC	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474837
121	NC_005956	GGA	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49474837
122	NC_005956	GAA	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474837
123	NC_005956	TTG	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474837
124	NC_005956	GCT	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474837
125	NC_005956	AGA	3	9	5734	5742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474837
126	NC_005956	GGA	2	6	5878	5883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49474837
127	NC_005956	GCT	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474837
128	NC_005956	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474837
129	NC_005956	ATT	2	6	6012	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474837
130	NC_005956	TCA	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49474837
131	NC_005956	TTG	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474837
132	NC_005956	AAG	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474837
133	NC_005956	GAC	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474837
134	NC_005956	ATT	2	6	6329	6334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474837
135	NC_005956	CAAT	2	8	6361	6368	50 %	25 %	0 %	25 %	49474837
136	NC_005956	AAG	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474837
137	NC_005956	GA	3	6	6416	6421	50 %	0 %	50 %	0 %	49474837
138	NC_005956	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	49474837
139	NC_005956	CGT	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474837
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271	NC_005956	A	6	6	12744	12749	100 %	0 %	0 %	0 %	49474842
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273	NC_005956	T	8	8	12836	12843	0 %	100 %	0 %	0 %	49474842
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