MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella henselae str. Houston-1 chromosome

Total Repeats: 31331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_005956	GAC	2	6	1227287	1227292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475845
21502	NC_005956	TTC	2	6	1227294	1227299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49475845
21503	NC_005956	ATA	2	6	1227309	1227314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475845
21504	NC_005956	T	7	7	1227341	1227347	0 %	100 %	0 %	0 %	49475845
21505	NC_005956	CAT	2	6	1227390	1227395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475845
21506	NC_005956	TCAC	2	8	1227421	1227428	25 %	25 %	0 %	50 %	49475845
21507	NC_005956	CAC	2	6	1227431	1227436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475845
21508	NC_005956	A	6	6	1227447	1227452	100 %	0 %	0 %	0 %	49475845
21509	NC_005956	TTG	2	6	1227549	1227554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49475845
21510	NC_005956	CCGC	2	8	1227578	1227585	0 %	0 %	25 %	75 %	49475845
21511	NC_005956	CAC	2	6	1227701	1227706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475845
21512	NC_005956	GCA	2	6	1227712	1227717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475845
21513	NC_005956	CCTT	2	8	1227726	1227733	0 %	50 %	0 %	50 %	49475845
21514	NC_005956	AAAGAT	2	12	1227745	1227756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49475845
21515	NC_005956	CTG	2	6	1227776	1227781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475845
21516	NC_005956	A	6	6	1227814	1227819	100 %	0 %	0 %	0 %	49475845
21517	NC_005956	AG	3	6	1227974	1227979	50 %	0 %	50 %	0 %	49475845
21518	NC_005956	CAT	2	6	1228010	1228015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475845
21519	NC_005956	CAT	2	6	1228061	1228066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475845
21520	NC_005956	TGC	2	6	1228104	1228109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475845
21521	NC_005956	AGC	2	6	1228298	1228303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475846
21522	NC_005956	TCT	2	6	1228353	1228358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49475846
21523	NC_005956	CACGCT	2	12	1228360	1228371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	49475846
21524	NC_005956	ATC	2	6	1228409	1228414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475846
21525	NC_005956	CTC	2	6	1228418	1228423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49475846
21526	NC_005956	TG	3	6	1228444	1228449	0 %	50 %	50 %	0 %	49475846
21527	NC_005956	CGC	2	6	1228509	1228514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49475846
21528	NC_005956	AGC	3	9	1228529	1228537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475846
21529	NC_005956	CCA	2	6	1228545	1228550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475846
21530	NC_005956	TCA	2	6	1228566	1228571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475846
21531	NC_005956	AAC	2	6	1228607	1228612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49475846
21532	NC_005956	A	6	6	1228626	1228631	100 %	0 %	0 %	0 %	49475846
21533	NC_005956	CAC	2	6	1228642	1228647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475846
21534	NC_005956	CAA	2	6	1228759	1228764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49475846
21535	NC_005956	CTC	2	6	1229036	1229041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49475846
21536	NC_005956	TGC	2	6	1229084	1229089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475846
21537	NC_005956	CTT	2	6	1229098	1229103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49475846
21538	NC_005956	TCA	2	6	1229130	1229135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475846
21539	NC_005956	AGAA	2	8	1229207	1229214	75 %	0 %	25 %	0 %	49475846
21540	NC_005956	ATC	2	6	1229246	1229251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475846
21541	NC_005956	T	6	6	1229275	1229280	0 %	100 %	0 %	0 %	49475846
21542	NC_005956	ACG	2	6	1229300	1229305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475846
21543	NC_005956	ACGC	2	8	1229361	1229368	25 %	0 %	25 %	50 %	49475846
21544	NC_005956	TGC	2	6	1229418	1229423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475846
21545	NC_005956	CCA	2	6	1229490	1229495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475846
21546	NC_005956	ATCAAC	2	12	1229522	1229533	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	49475846
21547	NC_005956	CAAC	2	8	1229566	1229573	50 %	0 %	0 %	50 %	49475846
21548	NC_005956	ATA	2	6	1229667	1229672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475846
21549	NC_005956	TCA	3	9	1229679	1229687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475846
21550	NC_005956	CAC	2	6	1229968	1229973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475847
21551	NC_005956	AAG	2	6	1229992	1229997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49475847
21552	NC_005956	GTG	2	6	1230010	1230015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49475847
21553	NC_005956	AGC	3	9	1230089	1230097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475847
21554	NC_005956	ATTTG	2	10	1230165	1230174	20 %	60 %	20 %	0 %	49475847
21555	NC_005956	CTC	2	6	1230185	1230190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49475847
21556	NC_005956	TCT	2	6	1230206	1230211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49475847
21557	NC_005956	GCA	2	6	1230216	1230221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475847
21558	NC_005956	CTT	2	6	1230235	1230240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49475847
21559	NC_005956	ATA	2	6	1230242	1230247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475847
21560	NC_005956	TC	3	6	1230282	1230287	0 %	50 %	0 %	50 %	49475847
21561	NC_005956	TTTAGC	2	12	1230299	1230310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49475847
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21563	NC_005956	CGA	2	6	1230411	1230416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475847
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21565	NC_005956	ATA	2	6	1230432	1230437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475847
21566	NC_005956	TAA	2	6	1230438	1230443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475847
21567	NC_005956	AGC	2	6	1230449	1230454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475847
21568	NC_005956	ATC	2	6	1230455	1230460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475847
21569	NC_005956	ATC	2	6	1230506	1230511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475847
21570	NC_005956	GCC	2	6	1230625	1230630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49475847
21571	NC_005956	T	7	7	1230714	1230720	0 %	100 %	0 %	0 %	49475847
21572	NC_005956	TAAA	2	8	1230724	1230731	75 %	25 %	0 %	0 %	49475847
21573	NC_005956	ATC	2	6	1230765	1230770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475847
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21575	NC_005956	ATTC	2	8	1231073	1231080	25 %	50 %	0 %	25 %	49475848
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21578	NC_005956	ATTC	2	8	1231174	1231181	25 %	50 %	0 %	25 %	49475848
21579	NC_005956	GA	3	6	1231232	1231237	50 %	0 %	50 %	0 %	49475848
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21583	NC_005956	AGA	2	6	1231382	1231387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49475848
21584	NC_005956	T	6	6	1231473	1231478	0 %	100 %	0 %	0 %	49475848
21585	NC_005956	TCA	2	6	1231524	1231529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475848
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21587	NC_005956	AAT	2	6	1231592	1231597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49475848
21588	NC_005956	AGC	2	6	1231616	1231621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475848
21589	NC_005956	CAC	2	6	1231796	1231801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475848
21590	NC_005956	ACT	2	6	1231842	1231847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475848
21591	NC_005956	T	6	6	1231847	1231852	0 %	100 %	0 %	0 %	49475848
21592	NC_005956	AATT	2	8	1232092	1232099	50 %	50 %	0 %	0 %	49475849
21593	NC_005956	GAC	2	6	1232105	1232110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475849
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21598	NC_005956	GCT	2	6	1232267	1232272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21599	NC_005956	TAGCT	2	10	1232295	1232304	20 %	40 %	20 %	20 %	49475849
21600	NC_005956	CAG	2	6	1232375	1232380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21601	NC_005956	AGG	2	6	1232409	1232414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49475849
21602	NC_005956	TGC	2	6	1232482	1232487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21603	NC_005956	TCATC	2	10	1232498	1232507	20 %	40 %	0 %	40 %	49475849
21604	NC_005956	AGC	2	6	1232622	1232627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21605	NC_005956	GCA	2	6	1232629	1232634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21606	NC_005956	GCA	2	6	1232641	1232646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49475849
21607	NC_005956	GTG	2	6	1232765	1232770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49475849
21608	NC_005956	CGAT	2	8	1232878	1232885	25 %	25 %	25 %	25 %	49475849
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21613	NC_005956	CAC	2	6	1233059	1233064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49475849
21614	NC_005956	ATC	2	6	1233075	1233080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49475849
21615	NC_005956	CAA	2	6	1233081	1233086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49475849
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