MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 plasmid pBLO1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004943	CAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32456046
2	NC_004943	GAA	2	6	847	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32456046
3	NC_004943	GAG	2	6	938	943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32456046
4	NC_004943	CAA	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32456046
5	NC_004943	CGCC	2	8	1015	1022	0 %	0 %	25 %	75 %	32456046
6	NC_004943	ATC	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32456046
7	NC_004943	GACC	2	8	1093	1100	25 %	0 %	25 %	50 %	32456046
8	NC_004943	CCAG	2	8	1164	1171	25 %	0 %	25 %	50 %	32456046
9	NC_004943	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32456046
10	NC_004943	CGG	2	6	1578	1583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456046
11	NC_004943	GC	3	6	1778	1783	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
12	NC_004943	GC	3	6	1826	1831	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
13	NC_004943	C	6	6	1851	1856	0 %	0 %	0 %	100 %	32456047
14	NC_004943	TCG	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32456047
15	NC_004943	GTCGTG	2	12	2068	2079	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	32456047
16	NC_004943	TGG	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32456047
17	NC_004943	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456047
18	NC_004943	CG	3	6	2253	2258	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
19	NC_004943	GAT	2	6	2278	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32456047
20	NC_004943	CTC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32456047
21	NC_004943	CCA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32456047
22	NC_004943	GGC	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456047
23	NC_004943	GC	3	6	2419	2424	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
24	NC_004943	GGC	2	6	2503	2508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456047
25	NC_004943	CAG	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32456047
26	NC_004943	TGC	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32456047
27	NC_004943	CGCT	2	8	2606	2613	0 %	25 %	25 %	50 %	32456047
28	NC_004943	GGC	2	6	2641	2646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456047
29	NC_004943	TGG	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32456047
30	NC_004943	CG	3	6	2729	2734	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
31	NC_004943	CTGC	2	8	2821	2828	0 %	25 %	25 %	50 %	32456047
32	NC_004943	GCT	2	6	2916	2921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32456047
33	NC_004943	GCC	2	6	2935	2940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32456047
34	NC_004943	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32456047
35	NC_004943	TTG	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32456047
36	NC_004943	CGT	3	9	3003	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32456047
37	NC_004943	CG	3	6	3102	3107	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
38	NC_004943	CCA	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32456047
39	NC_004943	TCT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32456047
40	NC_004943	GGCC	2	8	3130	3137	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
41	NC_004943	CCGT	2	8	3141	3148	0 %	25 %	25 %	50 %	32456047
42	NC_004943	CGG	2	6	3183	3188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32456047
43	NC_004943	GCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32456047
44	NC_004943	GCA	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32456047
45	NC_004943	CGC	2	6	3273	3278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32456047
46	NC_004943	CGTGGC	2	12	3319	3330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	32456047
47	NC_004943	CG	3	6	3343	3348	0 %	0 %	50 %	50 %	32456047
48	NC_004943	TCGGCT	2	12	3384	3395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32456047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.