MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 484

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611501
2	NC_004703	TGT	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
3	NC_004703	CGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611501
4	NC_004703	TTTC	2	8	159	166	0 %	75 %	0 %	25 %	29611501
5	NC_004703	GACG	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	29611501
6	NC_004703	TTG	2	6	266	271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
7	NC_004703	GTC	2	6	277	282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611501
8	NC_004703	GAAA	2	8	287	294	75 %	0 %	25 %	0 %	29611501
9	NC_004703	AAT	3	9	352	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611501
10	NC_004703	GGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611501
11	NC_004703	GAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611501
12	NC_004703	A	6	6	633	638	100 %	0 %	0 %	0 %	29611502
13	NC_004703	CCA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611502
14	NC_004703	GGA	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611502
15	NC_004703	CAGCCG	2	12	873	884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29611502
16	NC_004703	GAT	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611502
17	NC_004703	ATC	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611502
18	NC_004703	CGTTT	2	10	993	1002	0 %	60 %	20 %	20 %	29611502
19	NC_004703	CTT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611503
20	NC_004703	ATG	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
21	NC_004703	TTCAT	2	10	1177	1186	20 %	60 %	0 %	20 %	29611503
22	NC_004703	GAC	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611503
23	NC_004703	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611503
24	NC_004703	GGA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611503
25	NC_004703	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
26	NC_004703	GTA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
27	NC_004703	ACG	2	6	1791	1796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
28	NC_004703	GAC	2	6	1815	1820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
29	NC_004703	ACG	2	6	1837	1842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
30	NC_004703	CGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611504
31	NC_004703	A	7	7	1945	1951	100 %	0 %	0 %	0 %	29611504
32	NC_004703	AGG	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
33	NC_004703	GAT	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611504
34	NC_004703	GGGA	2	8	2192	2199	25 %	0 %	75 %	0 %	29611504
35	NC_004703	GGA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
36	NC_004703	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611504
37	NC_004703	TACC	2	8	2281	2288	25 %	25 %	0 %	50 %	29611504
38	NC_004703	GAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
39	NC_004703	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
40	NC_004703	TCTT	2	8	2766	2773	0 %	75 %	0 %	25 %	29611505
41	NC_004703	GCA	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
42	NC_004703	TCG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
43	NC_004703	ACGA	2	8	2991	2998	50 %	0 %	25 %	25 %	29611505
44	NC_004703	TTG	3	9	3002	3010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
45	NC_004703	AGG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
46	NC_004703	TCGA	2	8	3234	3241	25 %	25 %	25 %	25 %	29611505
47	NC_004703	TAA	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611505
48	NC_004703	TTC	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
49	NC_004703	CCG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611505
50	NC_004703	GTA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611505
51	NC_004703	TGT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
52	NC_004703	CGT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
53	NC_004703	CAC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611505
54	NC_004703	TGG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611505
55	NC_004703	CAT	2	6	3515	3520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611505
56	NC_004703	TTG	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
57	NC_004703	TTC	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
58	NC_004703	C	6	6	3560	3565	0 %	0 %	0 %	100 %	29611505
59	NC_004703	TCG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
60	NC_004703	CGA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
61	NC_004703	GTT	2	6	3619	3624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
62	NC_004703	AGG	2	6	3669	3674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
63	NC_004703	CTT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
64	NC_004703	AGG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
65	NC_004703	TATG	2	8	4542	4549	25 %	50 %	25 %	0 %	29611506
66	NC_004703	CAA	3	9	4575	4583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
67	NC_004703	AAC	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
68	NC_004703	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611506
69	NC_004703	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
70	NC_004703	AT	3	6	4879	4884	50 %	50 %	0 %	0 %	29611506
71	NC_004703	CGA	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611506
72	NC_004703	GAA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611506
73	NC_004703	GGGA	2	8	5263	5270	25 %	0 %	75 %	0 %	29611507
74	NC_004703	T	6	6	5276	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	29611507
75	NC_004703	ACG	2	6	5359	5364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
76	NC_004703	TTC	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611507
77	NC_004703	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	29611507
78	NC_004703	ATC	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611507
79	NC_004703	CGG	2	6	5950	5955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611507
80	NC_004703	TCG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611507
81	NC_004703	AAGG	2	8	6005	6012	50 %	0 %	50 %	0 %	29611507
82	NC_004703	AAC	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611507
83	NC_004703	AGC	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
84	NC_004703	CCGG	2	8	6150	6157	0 %	0 %	50 %	50 %	29611507
85	NC_004703	ATG	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
86	NC_004703	ACG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
87	NC_004703	GAA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
88	NC_004703	A	6	6	6546	6551	100 %	0 %	0 %	0 %	29611507
89	NC_004703	GCC	2	6	6574	6579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611507
90	NC_004703	GTACAA	2	12	6611	6622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29611507
91	NC_004703	AGG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
92	NC_004703	TTTC	2	8	6670	6677	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
93	NC_004703	AGG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
94	NC_004703	GCA	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
95	NC_004703	CAG	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
96	NC_004703	GAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
97	NC_004703	ATG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
98	NC_004703	TTCT	2	8	7133	7140	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
99	NC_004703	TTGC	2	8	7158	7165	0 %	50 %	25 %	25 %	29611507
100	NC_004703	GGT	2	6	7245	7250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611507
101	NC_004703	CAAA	2	8	7256	7263	75 %	0 %	0 %	25 %	29611507
102	NC_004703	CGGA	2	8	7296	7303	25 %	0 %	50 %	25 %	29611507
103	NC_004703	ATG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
104	NC_004703	TATGA	2	10	7417	7426	40 %	40 %	20 %	0 %	29611507
105	NC_004703	TAT	3	9	7434	7442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611508
106	NC_004703	GCCT	2	8	7450	7457	0 %	25 %	25 %	50 %	29611508
107	NC_004703	ATC	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611508
108	NC_004703	GTT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611508
109	NC_004703	CAG	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
110	NC_004703	GAGG	2	8	7550	7557	25 %	0 %	75 %	0 %	29611508
111	NC_004703	TGG	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611508
112	NC_004703	TA	3	6	7654	7659	50 %	50 %	0 %	0 %	29611508
113	NC_004703	A	7	7	7731	7737	100 %	0 %	0 %	0 %	29611508
114	NC_004703	GTG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611508
115	NC_004703	GAT	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611508
116	NC_004703	CGT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611508
117	NC_004703	AGC	2	6	8107	8112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
118	NC_004703	AGC	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
119	NC_004703	A	7	7	8156	8162	100 %	0 %	0 %	0 %	29611508
120	NC_004703	GT	3	6	8164	8169	0 %	50 %	50 %	0 %	29611508
121	NC_004703	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611508
122	NC_004703	CCGT	2	8	8392	8399	0 %	25 %	25 %	50 %	29611508
123	NC_004703	CGG	2	6	8441	8446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611508
124	NC_004703	AGAGG	2	10	8571	8580	40 %	0 %	60 %	0 %	29611508
125	NC_004703	ACC	2	6	8596	8601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611508
126	NC_004703	AGC	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
127	NC_004703	GGGGA	2	10	8612	8621	20 %	0 %	80 %	0 %	29611508
128	NC_004703	CAG	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
129	NC_004703	GTG	2	6	9252	9257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611509
130	NC_004703	GGAC	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	29611509
131	NC_004703	CAT	3	9	9341	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611509
132	NC_004703	T	7	7	9476	9482	0 %	100 %	0 %	0 %	29611510
133	NC_004703	TAT	2	6	9493	9498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611510
134	NC_004703	T	6	6	9562	9567	0 %	100 %	0 %	0 %	29611510
135	NC_004703	TGG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611510
136	NC_004703	GGA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
137	NC_004703	TA	3	6	9982	9987	50 %	50 %	0 %	0 %	29611511
138	NC_004703	GACG	2	8	10012	10019	25 %	0 %	50 %	25 %	29611511
139	NC_004703	GAC	2	6	10273	10278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
140	NC_004703	AGA	2	6	10325	10330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611511
141	NC_004703	TGA	2	6	10353	10358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611511
142	NC_004703	AGG	2	6	10409	10414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
143	NC_004703	CAGC	2	8	10419	10426	25 %	0 %	25 %	50 %	29611511
144	NC_004703	GGA	2	6	10518	10523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
145	NC_004703	GGCCT	2	10	10594	10603	0 %	20 %	40 %	40 %	29611511
146	NC_004703	ATC	2	6	10618	10623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611511
147	NC_004703	GGA	2	6	10671	10676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
148	NC_004703	ATC	2	6	10792	10797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611511
149	NC_004703	AAC	2	6	10807	10812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611511
150	NC_004703	TTTC	2	8	10831	10838	0 %	75 %	0 %	25 %	29611511
151	NC_004703	TCG	2	6	10849	10854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
152	NC_004703	AGG	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
153	NC_004703	AACG	2	8	10912	10919	50 %	0 %	25 %	25 %	29611511
154	NC_004703	TCG	2	6	10994	10999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
155	NC_004703	CGT	2	6	11027	11032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
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158	NC_004703	TCG	3	9	11075	11083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
159	NC_004703	GCA	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
160	NC_004703	AGC	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
161	NC_004703	GGA	2	6	11268	11273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
162	NC_004703	GTT	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611511
163	NC_004703	TTA	2	6	11313	11318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611511
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167	NC_004703	G	6	6	11463	11468	0 %	0 %	100 %	0 %	29611511
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169	NC_004703	CGATA	2	10	11598	11607	40 %	20 %	20 %	20 %	29611511
170	NC_004703	ACAT	2	8	11705	11712	50 %	25 %	0 %	25 %	29611511
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173	NC_004703	TTGC	2	8	12034	12041	0 %	50 %	25 %	25 %	29611511
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175	NC_004703	TGA	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611512
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179	NC_004703	GGA	2	6	12508	12513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611512
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252	NC_004703	GGA	2	6	16129	16134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611516
253	NC_004703	GCC	2	6	16760	16765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611517
254	NC_004703	AGC	2	6	16766	16771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611517
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256	NC_004703	TAT	2	6	16869	16874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611517
257	NC_004703	AAATA	2	10	16882	16891	80 %	20 %	0 %	0 %	29611517
258	NC_004703	GTC	2	6	16939	16944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611518
259	NC_004703	CGA	3	9	16948	16956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611518
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262	NC_004703	AAC	2	6	17135	17140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611518
263	NC_004703	GGA	2	6	17350	17355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611518
264	NC_004703	ATG	2	6	17451	17456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611518
265	NC_004703	A	7	7	17484	17490	100 %	0 %	0 %	0 %	29611518
266	NC_004703	CCGG	2	8	17506	17513	0 %	0 %	50 %	50 %	29611518
267	NC_004703	TAT	2	6	17626	17631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611519
268	NC_004703	TGG	2	6	17647	17652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611519
269	NC_004703	AT	3	6	17669	17674	50 %	50 %	0 %	0 %	29611519
270	NC_004703	TGT	2	6	18052	18057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611519
271	NC_004703	AAC	2	6	18078	18083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611519
272	NC_004703	GTATTT	2	12	18143	18154	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29611520
273	NC_004703	TCG	2	6	18187	18192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611520
274	NC_004703	GCA	2	6	18196	18201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611520
275	NC_004703	GAC	3	9	18204	18212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611520
276	NC_004703	GGA	2	6	18219	18224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611520
277	NC_004703	GTCG	2	8	18284	18291	0 %	25 %	50 %	25 %	29611520
278	NC_004703	GAA	2	6	18369	18374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611520
279	NC_004703	ACG	2	6	18402	18407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611520
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282	NC_004703	GAT	2	6	18564	18569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611520
283	NC_004703	TAT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611520
284	NC_004703	TGACG	2	10	18588	18597	20 %	20 %	40 %	20 %	29611520
285	NC_004703	AAG	2	6	19273	19278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611521
286	NC_004703	TTC	2	6	19387	19392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611521
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288	NC_004703	TCCGGT	2	12	19512	19523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611522
289	NC_004703	CCT	2	6	19552	19557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29611522
290	NC_004703	AAT	2	6	19601	19606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611522
291	NC_004703	GA	3	6	19696	19701	50 %	0 %	50 %	0 %	29611522
292	NC_004703	ACT	2	6	19791	19796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611522
293	NC_004703	AGG	2	6	19817	19822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611522
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295	NC_004703	ACA	2	6	19867	19872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611522
296	NC_004703	AAC	2	6	19874	19879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611522
297	NC_004703	AG	3	6	19886	19891	50 %	0 %	50 %	0 %	29611522
298	NC_004703	T	8	8	19922	19929	0 %	100 %	0 %	0 %	29611522
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302	NC_004703	GAT	2	6	20504	20509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611523
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382	NC_004703	TTCT	2	8	26130	26137	0 %	75 %	0 %	25 %	29611531
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396	NC_004703	GAT	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611532
397	NC_004703	ATG	2	6	27247	27252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611532
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399	NC_004703	GTAA	2	8	27305	27312	50 %	25 %	25 %	0 %	29611532
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