MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) plasmid pBBp1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004555	TA	3	6	56	61	50 %	50 %	0 %	0 %	28191367
2	NC_004555	CAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28191367
3	NC_004555	ATG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
4	NC_004555	TAG	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
5	NC_004555	TAT	2	6	170	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191367
6	NC_004555	TAG	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
7	NC_004555	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	28191367
8	NC_004555	GGAT	2	8	283	290	25 %	25 %	50 %	0 %	28191367
9	NC_004555	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	28191367
10	NC_004555	TCA	2	6	331	336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28191367
11	NC_004555	TCT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28191367
12	NC_004555	A	6	6	386	391	100 %	0 %	0 %	0 %	28191367
13	NC_004555	GT	3	6	414	419	0 %	50 %	50 %	0 %	28191367
14	NC_004555	TTA	3	9	556	564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191368
15	NC_004555	A	7	7	594	600	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
16	NC_004555	AT	3	6	603	608	50 %	50 %	0 %	0 %	28191368
17	NC_004555	TAA	2	6	614	619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
18	NC_004555	AATTTA	2	12	628	639	50 %	50 %	0 %	0 %	28191368
19	NC_004555	A	7	7	655	661	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
20	NC_004555	TAAT	2	8	679	686	50 %	50 %	0 %	0 %	28191368
21	NC_004555	AT	3	6	760	765	50 %	50 %	0 %	0 %	28191368
22	NC_004555	AAATAG	2	12	785	796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	28191368
23	NC_004555	TTGC	2	8	798	805	0 %	50 %	25 %	25 %	28191368
24	NC_004555	AAT	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
25	NC_004555	GAA	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191368
26	NC_004555	AAAT	2	8	923	930	75 %	25 %	0 %	0 %	28191368
27	NC_004555	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28191368
28	NC_004555	ATA	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
29	NC_004555	ATT	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191368
30	NC_004555	T	6	6	1050	1055	0 %	100 %	0 %	0 %	28191368
31	NC_004555	TTC	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28191368
32	NC_004555	A	8	8	1181	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
33	NC_004555	TAA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
34	NC_004555	A	7	7	1217	1223	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
35	NC_004555	A	8	8	1232	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
36	NC_004555	A	6	6	1246	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	28191368
37	NC_004555	AAAT	2	8	1278	1285	75 %	25 %	0 %	0 %	28191368
38	NC_004555	A	6	6	1368	1373	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
39	NC_004555	A	6	6	1384	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
40	NC_004555	ATA	2	6	1398	1403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
41	NC_004555	C	6	6	1407	1412	0 %	0 %	0 %	100 %	28191366
42	NC_004555	CTC	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28191366
43	NC_004555	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366
44	NC_004555	ATTA	2	8	1454	1461	50 %	50 %	0 %	0 %	28191366
45	NC_004555	A	7	7	1478	1484	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
46	NC_004555	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366
47	NC_004555	AATTA	2	10	1503	1512	60 %	40 %	0 %	0 %	28191366
48	NC_004555	TAT	2	6	1546	1551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191366
49	NC_004555	AT	3	6	1616	1621	50 %	50 %	0 %	0 %	28191366
50	NC_004555	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
51	NC_004555	GTT	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28191366
52	NC_004555	AAT	2	6	1819	1824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
53	NC_004555	T	6	6	1841	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	28191366
54	NC_004555	AAT	2	6	1877	1882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
55	NC_004555	A	6	6	1886	1891	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
56	NC_004555	GGT	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28191366
57	NC_004555	TAA	2	6	1987	1992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
58	NC_004555	AAT	2	6	2009	2014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
59	NC_004555	TTA	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191366
60	NC_004555	A	8	8	2032	2039	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
61	NC_004555	A	6	6	2047	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
62	NC_004555	A	6	6	2156	2161	100 %	0 %	0 %	0 %	28191366
63	NC_004555	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.