MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
150001	NC_004463	TCTGC	2	10	6841772	6841781	0 %	40 %	20 %	40 %	27381332
150002	NC_004463	GC	3	6	6841843	6841848	0 %	0 %	50 %	50 %	27381332
150003	NC_004463	ACGTG	2	10	6842113	6842122	20 %	20 %	40 %	20 %	27381333
150004	NC_004463	GCC	2	6	6842206	6842211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381333
150005	NC_004463	GCGG	2	8	6842212	6842219	0 %	0 %	75 %	25 %	27381333
150006	NC_004463	CG	4	8	6842228	6842235	0 %	0 %	50 %	50 %	27381333
150007	NC_004463	TCA	2	6	6842330	6842335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381333
150008	NC_004463	GAC	2	6	6842344	6842349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381333
150009	NC_004463	CAG	2	6	6842412	6842417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381333
150010	NC_004463	ATC	2	6	6842464	6842469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381333
150011	NC_004463	CAG	2	6	6842508	6842513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381333
150012	NC_004463	GC	3	6	6842520	6842525	0 %	0 %	50 %	50 %	27381333
150013	NC_004463	GCC	2	6	6842530	6842535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381333
150014	NC_004463	TCA	2	6	6842701	6842706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381334
150015	NC_004463	ACA	2	6	6842835	6842840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27381334
150016	NC_004463	CCG	2	6	6842925	6842930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381334
150017	NC_004463	CCT	2	6	6842940	6842945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27381334
150018	NC_004463	ATC	2	6	6842969	6842974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381334
150019	NC_004463	GTC	2	6	6843073	6843078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381334
150020	NC_004463	AGC	2	6	6843107	6843112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381334
150021	NC_004463	GAA	2	6	6843133	6843138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27381334
150022	NC_004463	GCG	2	6	6843173	6843178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381334
150023	NC_004463	GATCGA	2	12	6843190	6843201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27381334
150024	NC_004463	GCG	2	6	6843228	6843233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381334
150025	NC_004463	CTC	2	6	6843274	6843279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27381334
150026	NC_004463	GGC	2	6	6843289	6843294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381334
150027	NC_004463	GGT	2	6	6843334	6843339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27381334
150028	NC_004463	GCC	2	6	6843374	6843379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381334
150029	NC_004463	TCT	2	6	6843384	6843389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381334
150030	NC_004463	CTT	2	6	6843391	6843396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381334
150031	NC_004463	GCC	2	6	6843415	6843420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381334
150032	NC_004463	CCG	2	6	6843444	6843449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381334
150033	NC_004463	GAT	2	6	6843532	6843537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381334
150034	NC_004463	ATG	2	6	6843851	6843856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381335
150035	NC_004463	ATG	2	6	6843890	6843895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381335
150036	NC_004463	TCG	2	6	6843929	6843934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150037	NC_004463	CGATGC	2	12	6843942	6843953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150038	NC_004463	GAC	2	6	6844000	6844005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150039	NC_004463	TCG	2	6	6844119	6844124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150040	NC_004463	CGAC	2	8	6844185	6844192	25 %	0 %	25 %	50 %	27381335
150041	NC_004463	CGT	2	6	6844194	6844199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150042	NC_004463	GGCCC	2	10	6844206	6844215	0 %	0 %	40 %	60 %	27381335
150043	NC_004463	GC	3	6	6844220	6844225	0 %	0 %	50 %	50 %	27381335
150044	NC_004463	TCCGG	2	10	6844344	6844353	0 %	20 %	40 %	40 %	27381335
150045	NC_004463	GCC	2	6	6844363	6844368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381335
150046	NC_004463	GGCCG	2	10	6844379	6844388	0 %	0 %	60 %	40 %	27381335
150047	NC_004463	GCA	2	6	6844458	6844463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150048	NC_004463	GTC	2	6	6844510	6844515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150049	NC_004463	CGC	2	6	6844549	6844554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381335
150050	NC_004463	TGA	2	6	6844629	6844634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381335
150051	NC_004463	CTT	2	6	6844693	6844698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381335
150052	NC_004463	GC	3	6	6844703	6844708	0 %	0 %	50 %	50 %	27381335
150053	NC_004463	GCA	2	6	6844782	6844787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381335
150054	NC_004463	CGC	2	6	6844794	6844799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381335
150055	NC_004463	TGG	2	6	6844806	6844811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27381335
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150058	NC_004463	GC	3	6	6844876	6844881	0 %	0 %	50 %	50 %	27381335
150059	NC_004463	GGA	2	6	6844902	6844907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27381335
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150061	NC_004463	GCC	2	6	6845038	6845043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381335
150062	NC_004463	GAC	2	6	6845083	6845088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381335
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150066	NC_004463	GGAG	2	8	6845266	6845273	25 %	0 %	75 %	0 %	27381335
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150072	NC_004463	TCG	2	6	6845764	6845769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381336
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150100	NC_004463	CTG	2	6	6846992	6846997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381337
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150106	NC_004463	GC	3	6	6847201	6847206	0 %	0 %	50 %	50 %	27381337
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150117	NC_004463	GCCT	2	8	6847721	6847728	0 %	25 %	25 %	50 %	27381338
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150219	NC_004463	CGG	2	6	6852386	6852391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381342
150220	NC_004463	CGA	2	6	6852392	6852397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381342
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150225	NC_004463	CGAG	2	8	6852637	6852644	25 %	0 %	50 %	25 %	27381342
150226	NC_004463	CTG	2	6	6852684	6852689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381342
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150228	NC_004463	GAGC	2	8	6852749	6852756	25 %	0 %	50 %	25 %	27381342
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150230	NC_004463	GCCG	2	8	6852815	6852822	0 %	0 %	50 %	50 %	27381342
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150339	NC_004463	TGA	2	6	6856948	6856953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381347
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150342	NC_004463	TGTCGG	2	12	6857024	6857035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	27381347
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150460	NC_004463	AGCGA	2	10	6862014	6862023	40 %	0 %	40 %	20 %	27381351
150461	NC_004463	CGA	2	6	6862030	6862035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381351
150462	NC_004463	GCA	2	6	6862049	6862054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381351
150463	NC_004463	GC	3	6	6862080	6862085	0 %	0 %	50 %	50 %	27381351
150464	NC_004463	GC	3	6	6862098	6862103	0 %	0 %	50 %	50 %	27381351
150465	NC_004463	CTT	2	6	6862125	6862130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381351
150466	NC_004463	AGG	2	6	6862247	6862252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27381351
150467	NC_004463	GAT	2	6	6862287	6862292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381351
150468	NC_004463	CGCT	2	8	6862300	6862307	0 %	25 %	25 %	50 %	27381351
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150470	NC_004463	CCG	2	6	6862440	6862445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381351
150471	NC_004463	ATC	2	6	6862450	6862455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381351
150472	NC_004463	GCC	2	6	6862465	6862470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381351
150473	NC_004463	TGAG	2	8	6862517	6862524	25 %	25 %	50 %	0 %	27381351
150474	NC_004463	TCT	2	6	6862562	6862567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381351
150475	NC_004463	CCCG	2	8	6862605	6862612	0 %	0 %	25 %	75 %	27381351
150476	NC_004463	GAC	2	6	6862665	6862670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381351
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150479	NC_004463	CG	4	8	6862812	6862819	0 %	0 %	50 %	50 %	27381352
150480	NC_004463	CGA	2	6	6862851	6862856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381352
150481	NC_004463	TGC	2	6	6862871	6862876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381352
150482	NC_004463	CGC	3	9	6862893	6862901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381352
150483	NC_004463	ATG	2	6	6862903	6862908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381352
150484	NC_004463	CGC	2	6	6862926	6862931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381352
150485	NC_004463	AGC	2	6	6862943	6862948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381352
150486	NC_004463	AGC	2	6	6862955	6862960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381352
150487	NC_004463	CG	3	6	6863079	6863084	0 %	0 %	50 %	50 %	27381352
150488	NC_004463	CCA	2	6	6863085	6863090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27381352
150489	NC_004463	AAGGC	2	10	6863099	6863108	40 %	0 %	40 %	20 %	27381352
150490	NC_004463	CAG	2	6	6863138	6863143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381352
150491	NC_004463	GC	3	6	6863146	6863151	0 %	0 %	50 %	50 %	27381352
150492	NC_004463	TCA	2	6	6863213	6863218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381352
150493	NC_004463	CGC	2	6	6863301	6863306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381352
150494	NC_004463	TTC	2	6	6863360	6863365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381352
150495	NC_004463	TGT	2	6	6863394	6863399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27381352
150496	NC_004463	GC	3	6	6863480	6863485	0 %	0 %	50 %	50 %	27381352
150497	NC_004463	TCGGA	2	10	6863496	6863505	20 %	20 %	40 %	20 %	27381352
150498	NC_004463	CG	3	6	6863506	6863511	0 %	0 %	50 %	50 %	27381352
150499	NC_004463	CTGGT	2	10	6863576	6863585	0 %	40 %	40 %	20 %	27381352
150500	NC_004463	CGC	2	6	6863607	6863612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381352

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