MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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143002	NC_004463	CTC	2	6	6529891	6529896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27381047
143003	NC_004463	CG	3	6	6529909	6529914	0 %	0 %	50 %	50 %	27381047
143004	NC_004463	CAG	2	6	6529921	6529926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381047
143005	NC_004463	GCA	2	6	6529980	6529985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381047
143006	NC_004463	ACC	2	6	6530000	6530005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27381047
143007	NC_004463	CG	4	8	6530038	6530045	0 %	0 %	50 %	50 %	27381047
143008	NC_004463	GTC	2	6	6530059	6530064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381047
143009	NC_004463	CCT	2	6	6530067	6530072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27381047
143010	NC_004463	CGG	2	6	6530090	6530095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381047
143011	NC_004463	CGT	2	6	6530143	6530148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381047
143012	NC_004463	GCA	2	6	6530154	6530159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381047
143013	NC_004463	CTC	2	6	6530176	6530181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27381047
143014	NC_004463	CCG	3	9	6530205	6530213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381047
143015	NC_004463	CGG	3	9	6530235	6530243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381047
143016	NC_004463	CAT	2	6	6530538	6530543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381048
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143018	NC_004463	CGT	2	6	6530607	6530612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381048
143019	NC_004463	GC	3	6	6530620	6530625	0 %	0 %	50 %	50 %	27381048
143020	NC_004463	CGA	3	9	6530643	6530651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381048
143021	NC_004463	CCG	2	6	6530690	6530695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381048
143022	NC_004463	CAA	2	6	6530748	6530753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27381048
143023	NC_004463	TCG	2	6	6530765	6530770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381048
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143025	NC_004463	GCG	2	6	6530806	6530811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381048
143026	NC_004463	CTT	2	6	6530835	6530840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381048
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143031	NC_004463	TCA	2	6	6531050	6531055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27381048
143032	NC_004463	GC	3	6	6531095	6531100	0 %	0 %	50 %	50 %	27381048
143033	NC_004463	TCG	2	6	6531137	6531142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381048
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143035	NC_004463	GAGAG	2	10	6531230	6531239	40 %	0 %	60 %	0 %	27381049
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143038	NC_004463	TCAC	2	8	6531299	6531306	25 %	25 %	0 %	50 %	27381049
143039	NC_004463	TCG	2	6	6531387	6531392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381049
143040	NC_004463	TGGGGC	2	12	6531419	6531430	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	27381049
143041	NC_004463	CGC	2	6	6531458	6531463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381049
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143043	NC_004463	GAT	2	6	6531477	6531482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381049
143044	NC_004463	CG	4	8	6531484	6531491	0 %	0 %	50 %	50 %	27381050
143045	NC_004463	GC	3	6	6531497	6531502	0 %	0 %	50 %	50 %	27381050
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143050	NC_004463	CGGCG	2	10	6531717	6531726	0 %	0 %	60 %	40 %	27381050
143051	NC_004463	TGCG	2	8	6531800	6531807	0 %	25 %	50 %	25 %	27381050
143052	NC_004463	ATG	2	6	6531808	6531813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381050
143053	NC_004463	CT	3	6	6531826	6531831	0 %	50 %	0 %	50 %	27381050
143054	NC_004463	TTC	2	6	6531868	6531873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27381050
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143106	NC_004463	CGAG	2	8	6533576	6533583	25 %	0 %	50 %	25 %	27381052
143107	NC_004463	C	8	8	6533613	6533620	0 %	0 %	0 %	100 %	27381052
143108	NC_004463	GC	3	6	6533755	6533760	0 %	0 %	50 %	50 %	27381052
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143111	NC_004463	CGT	2	6	6534207	6534212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381053
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143115	NC_004463	TGA	2	6	6534414	6534419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381053
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143231	NC_004463	TCG	2	6	6540441	6540446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381057
143232	NC_004463	GGT	2	6	6540464	6540469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27381057
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143338	NC_004463	CG	4	8	6544364	6544371	0 %	0 %	50 %	50 %	27381061
143339	NC_004463	CGGG	2	8	6544379	6544386	0 %	0 %	75 %	25 %	27381061
143340	NC_004463	AGC	2	6	6544396	6544401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381061
143341	NC_004463	GC	3	6	6544400	6544405	0 %	0 %	50 %	50 %	27381061
143342	NC_004463	CAG	2	6	6544467	6544472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27381061
143343	NC_004463	CG	3	6	6544484	6544489	0 %	0 %	50 %	50 %	27381061
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143462	NC_004463	GAAG	2	8	6549101	6549108	50 %	0 %	50 %	0 %	27381065
143463	NC_004463	AGA	2	6	6549118	6549123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27381065
143464	NC_004463	GCG	2	6	6549145	6549150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381065
143465	NC_004463	GTC	2	6	6549368	6549373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381066
143466	NC_004463	CG	4	8	6549389	6549396	0 %	0 %	50 %	50 %	27381066
143467	NC_004463	GAT	2	6	6549482	6549487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381066
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143469	NC_004463	CG	3	6	6549505	6549510	0 %	0 %	50 %	50 %	27381066
143470	NC_004463	CGC	2	6	6549544	6549549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381066
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143483	NC_004463	CGT	2	6	6550063	6550068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27381066
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143485	NC_004463	CCG	2	6	6550123	6550128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27381066
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143492	NC_004463	TGA	2	6	6550542	6550547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27381067
143493	NC_004463	GCG	2	6	6550561	6550566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381067
143494	NC_004463	CG	3	6	6550579	6550584	0 %	0 %	50 %	50 %	27381067
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143497	NC_004463	GCG	2	6	6550759	6550764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27381067
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