MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 43446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_004307	GCT	2	6	1647173	1647178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465242
32003	NC_004307	GAG	2	6	1647217	1647222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465242
32004	NC_004307	GTT	2	6	1647267	1647272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23465242
32005	NC_004307	CGC	2	6	1647315	1647320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465242
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32009	NC_004307	TCA	2	6	1647466	1647471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465242
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32012	NC_004307	TCA	2	6	1647581	1647586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465242
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32014	NC_004307	GTC	2	6	1647723	1647728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465242
32015	NC_004307	TTGCT	2	10	1647790	1647799	0 %	60 %	20 %	20 %	23465242
32016	NC_004307	CTG	3	9	1647805	1647813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465242
32017	NC_004307	CCA	2	6	1647860	1647865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465242
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32020	NC_004307	CCA	2	6	1647881	1647886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465242
32021	NC_004307	GAT	2	6	1647897	1647902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465242
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32024	NC_004307	TGT	2	6	1647946	1647951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23465242
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32028	NC_004307	GGCGCC	2	12	1648309	1648320	0 %	0 %	50 %	50 %	23465243
32029	NC_004307	CCCA	2	8	1648338	1648345	25 %	0 %	0 %	75 %	23465243
32030	NC_004307	GC	3	6	1648358	1648363	0 %	0 %	50 %	50 %	23465243
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32036	NC_004307	CAT	2	6	1648502	1648507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465243
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32050	NC_004307	TTGC	2	8	1649023	1649030	0 %	50 %	25 %	25 %	23465243
32051	NC_004307	GCT	2	6	1649040	1649045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465243
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32115	NC_004307	CAC	2	6	1652644	1652649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465246
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32117	NC_004307	GCA	2	6	1652807	1652812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465246
32118	NC_004307	CAG	2	6	1652865	1652870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465246
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32194	NC_004307	GTGGC	2	10	1656672	1656681	0 %	20 %	60 %	20 %	23465252
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32196	NC_004307	GCG	2	6	1656744	1656749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465252
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32199	NC_004307	GGGCGC	2	12	1656814	1656825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465252
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32201	NC_004307	GA	3	6	1656879	1656884	50 %	0 %	50 %	0 %	23465252
32202	NC_004307	GTG	2	6	1656926	1656931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465252
32203	NC_004307	ACG	2	6	1656993	1656998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465252
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32205	NC_004307	CGA	2	6	1657066	1657071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465252
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32209	NC_004307	CG	3	6	1657178	1657183	0 %	0 %	50 %	50 %	23465252
32210	NC_004307	GATG	2	8	1657333	1657340	25 %	25 %	50 %	0 %	23465252
32211	NC_004307	CGC	2	6	1657427	1657432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465252
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32214	NC_004307	ACT	2	6	1657662	1657667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465252
32215	NC_004307	GTC	2	6	1657686	1657691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465252
32216	NC_004307	GCC	2	6	1657831	1657836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465252
32217	NC_004307	AAGG	2	8	1657910	1657917	50 %	0 %	50 %	0 %	23465252
32218	NC_004307	TAC	2	6	1657934	1657939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465252
32219	NC_004307	GCC	2	6	1657943	1657948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465252
32220	NC_004307	TAC	2	6	1657973	1657978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465252
32221	NC_004307	TCG	2	6	1658010	1658015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465252
32222	NC_004307	TTC	2	6	1658069	1658074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465252
32223	NC_004307	CCA	2	6	1658085	1658090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465252
32224	NC_004307	CTA	2	6	1658146	1658151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465252
32225	NC_004307	CATCCG	2	12	1658152	1658163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	23465252
32226	NC_004307	AGA	2	6	1658699	1658704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465253
32227	NC_004307	GAG	2	6	1658821	1658826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465253
32228	NC_004307	TCT	2	6	1658885	1658890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465253
32229	NC_004307	AGA	2	6	1658957	1658962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465253
32230	NC_004307	ACT	2	6	1658981	1658986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465253
32231	NC_004307	TCCT	2	8	1659037	1659044	0 %	50 %	0 %	50 %	23465253
32232	NC_004307	CCG	2	6	1659104	1659109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465253
32233	NC_004307	ATC	2	6	1659124	1659129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465253
32234	NC_004307	CTA	2	6	1659150	1659155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465253
32235	NC_004307	TGA	2	6	1659347	1659352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465253
32236	NC_004307	GCC	2	6	1659412	1659417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465253
32237	NC_004307	CGA	2	6	1659432	1659437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465253
32238	NC_004307	CTT	2	6	1659447	1659452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465253
32239	NC_004307	CTCCGG	2	12	1659453	1659464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	23465253
32240	NC_004307	CTC	2	6	1659465	1659470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23465253
32241	NC_004307	GAA	2	6	1659490	1659495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465253
32242	NC_004307	GAC	3	9	1659502	1659510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465253
32243	NC_004307	CAT	2	6	1659609	1659614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465254
32244	NC_004307	CGA	2	6	1659645	1659650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32245	NC_004307	TGC	2	6	1659666	1659671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32246	NC_004307	CTG	2	6	1659697	1659702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32247	NC_004307	CGA	2	6	1659705	1659710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32248	NC_004307	GCC	2	6	1659751	1659756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465254
32249	NC_004307	CGG	2	6	1659792	1659797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465254
32250	NC_004307	CGA	2	6	1659864	1659869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32251	NC_004307	TGG	2	6	1659887	1659892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465254
32252	NC_004307	AAC	2	6	1659964	1659969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465254
32253	NC_004307	GCT	2	6	1659975	1659980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32254	NC_004307	TC	3	6	1660152	1660157	0 %	50 %	0 %	50 %	23465254
32255	NC_004307	CG	3	6	1660187	1660192	0 %	0 %	50 %	50 %	23465254
32256	NC_004307	CGC	2	6	1660287	1660292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465254
32257	NC_004307	CGA	2	6	1660293	1660298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32258	NC_004307	GATC	2	8	1660422	1660429	25 %	25 %	25 %	25 %	23465254
32259	NC_004307	TCG	3	9	1660449	1660457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465254
32260	NC_004307	CCG	2	6	1660478	1660483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465254
32261	NC_004307	TGA	2	6	1660596	1660601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465254
32262	NC_004307	GAG	2	6	1660696	1660701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465254
32263	NC_004307	GCC	2	6	1660720	1660725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465254
32264	NC_004307	GAT	2	6	1661184	1661189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465255
32265	NC_004307	TCCTCG	2	12	1661218	1661229	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	23465255
32266	NC_004307	CAA	2	6	1661291	1661296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465255
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32268	NC_004307	ACA	2	6	1661407	1661412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465255
32269	NC_004307	GGT	2	6	1661532	1661537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465255
32270	NC_004307	CAGCGT	2	12	1661538	1661549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	23465255
32271	NC_004307	GCT	2	6	1661655	1661660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465255
32272	NC_004307	CAC	2	6	1661681	1661686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465255
32273	NC_004307	ATCGC	2	10	1661731	1661740	20 %	20 %	20 %	40 %	23465255
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32277	NC_004307	TCG	2	6	1661812	1661817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465255
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32286	NC_004307	CAC	2	6	1662131	1662136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465255
32287	NC_004307	TCAAGA	2	12	1662181	1662192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	23465255
32288	NC_004307	CGC	2	6	1663037	1663042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465256
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32292	NC_004307	TGCG	2	8	1663132	1663139	0 %	25 %	50 %	25 %	23465256
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32295	NC_004307	CT	3	6	1663206	1663211	0 %	50 %	0 %	50 %	23465256
32296	NC_004307	CGT	2	6	1663234	1663239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32297	NC_004307	ACT	2	6	1663402	1663407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465256
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32300	NC_004307	CAG	2	6	1663624	1663629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465256
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32302	NC_004307	GTC	2	6	1663653	1663658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32303	NC_004307	AGC	2	6	1663672	1663677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32304	NC_004307	AGCA	2	8	1663686	1663693	50 %	0 %	25 %	25 %	23465256
32305	NC_004307	CTT	2	6	1663706	1663711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465256
32306	NC_004307	TGA	2	6	1663735	1663740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465256
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32308	NC_004307	GTGG	2	8	1663869	1663876	0 %	25 %	75 %	0 %	23465256
32309	NC_004307	TCT	2	6	1663886	1663891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465256
32310	NC_004307	CTG	2	6	1663908	1663913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32311	NC_004307	GCCG	2	8	1664004	1664011	0 %	0 %	50 %	50 %	23465256
32312	NC_004307	GGT	2	6	1664085	1664090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465256
32313	NC_004307	CTA	2	6	1664264	1664269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465256
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32317	NC_004307	CGG	2	6	1664348	1664353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465256
32318	NC_004307	TCG	2	6	1664356	1664361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465256
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32324	NC_004307	AAT	2	6	1664643	1664648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23465256
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32334	NC_004307	ATC	2	6	1664974	1664979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465256
32335	NC_004307	ACA	2	6	1665004	1665009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465256
32336	NC_004307	CAG	2	6	1665027	1665032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32337	NC_004307	TCAG	2	8	1665060	1665067	25 %	25 %	25 %	25 %	23465256
32338	NC_004307	CGG	2	6	1665071	1665076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465256
32339	NC_004307	GGC	2	6	1665087	1665092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465256
32340	NC_004307	GTG	2	6	1665141	1665146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465256
32341	NC_004307	AAG	2	6	1665171	1665176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465256
32342	NC_004307	TGC	2	6	1665218	1665223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465256
32343	NC_004307	GGCT	2	8	1665248	1665255	0 %	25 %	50 %	25 %	23465256
32344	NC_004307	GCGG	2	8	1665264	1665271	0 %	0 %	75 %	25 %	23465256
32345	NC_004307	GGT	2	6	1665291	1665296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465256
32346	NC_004307	CGG	2	6	1665353	1665358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465256
32347	NC_004307	CGG	2	6	1665398	1665403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465256
32348	NC_004307	TTC	2	6	1665458	1665463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465256
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32469	NC_004307	AAG	2	6	1671229	1671234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465257
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32494	NC_004307	ACC	2	6	1672210	1672215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465257
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