MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10S

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004253	AGGCCG	2	12	1269	1280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23307866
2	NC_004253	GCC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
3	NC_004253	CTG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
4	NC_004253	CCT	2	6	1399	1404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307866
5	NC_004253	GCG	2	6	1413	1418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
6	NC_004253	GCT	3	9	1438	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
7	NC_004253	GACGG	2	10	1469	1478	20 %	0 %	60 %	20 %	23307866
8	NC_004253	CG	3	6	1507	1512	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
9	NC_004253	GGGC	2	8	1546	1553	0 %	0 %	75 %	25 %	23307866
10	NC_004253	GGC	2	6	1580	1585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
11	NC_004253	GGC	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
12	NC_004253	TCCC	2	8	1652	1659	0 %	25 %	0 %	75 %	23307866
13	NC_004253	GGGA	2	8	1669	1676	25 %	0 %	75 %	0 %	23307866
14	NC_004253	GCC	2	6	1680	1685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
15	NC_004253	GACGG	2	10	1718	1727	20 %	0 %	60 %	20 %	23307866
16	NC_004253	GTCCCG	2	12	1769	1780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	23307866
17	NC_004253	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
18	NC_004253	GC	4	8	1900	1907	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
19	NC_004253	GTC	2	6	1910	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
20	NC_004253	TGG	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307866
21	NC_004253	GGT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307866
22	NC_004253	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
23	NC_004253	CAG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
24	NC_004253	TCT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307866
25	NC_004253	CGA	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
26	NC_004253	TCC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307866
27	NC_004253	CGC	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
28	NC_004253	CGG	2	6	2413	2418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
29	NC_004253	CG	3	6	2476	2481	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
30	NC_004253	CCA	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307866
31	NC_004253	TCT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307866
32	NC_004253	CCG	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
33	NC_004253	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
34	NC_004253	GC	3	6	2578	2583	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
35	NC_004253	CGT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
36	NC_004253	GCA	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
37	NC_004253	GAC	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
38	NC_004253	CGG	2	6	3261	3266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
39	NC_004253	ACG	3	9	3272	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
40	NC_004253	CAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307867
41	NC_004253	CGG	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
42	NC_004253	GCG	2	6	3430	3435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
43	NC_004253	CAC	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307867
44	NC_004253	AGCC	2	8	3467	3474	25 %	0 %	25 %	50 %	23307867
45	NC_004253	CAG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.