MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 chromosome

Total Repeats: 89515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003228	CAT	3	9	60	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679598
2	NC_003228	AGA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679598
3	NC_003228	AAG	2	6	119	124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679598
4	NC_003228	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679598
5	NC_003228	TG	3	6	230	235	0 %	50 %	50 %	0 %	60679598
6	NC_003228	CTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60679598
7	NC_003228	TAA	2	6	315	320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679598
8	NC_003228	GAA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679598
9	NC_003228	GCA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679598
10	NC_003228	CATT	2	8	529	536	25 %	50 %	0 %	25 %	60679598
11	NC_003228	CAG	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679598
12	NC_003228	ATTT	2	8	572	579	25 %	75 %	0 %	0 %	60679598
13	NC_003228	ATT	2	6	757	762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679599
14	NC_003228	TA	3	6	767	772	50 %	50 %	0 %	0 %	60679599
15	NC_003228	ATC	3	9	865	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679599
16	NC_003228	ATT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679599
17	NC_003228	CAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679599
18	NC_003228	CGAT	2	8	1008	1015	25 %	25 %	25 %	25 %	60679599
19	NC_003228	ATA	2	6	1047	1052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679599
20	NC_003228	TAC	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679599
21	NC_003228	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679599
22	NC_003228	ATT	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679599
23	NC_003228	AAACA	2	10	1148	1157	80 %	0 %	0 %	20 %	60679599
24	NC_003228	T	6	6	1175	1180	0 %	100 %	0 %	0 %	60679599
25	NC_003228	GCA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679599
26	NC_003228	GAG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679599
27	NC_003228	AAAAT	2	10	1230	1239	80 %	20 %	0 %	0 %	60679599
28	NC_003228	CAA	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679599
29	NC_003228	TTTA	2	8	1317	1324	25 %	75 %	0 %	0 %	60679599
30	NC_003228	T	6	6	1534	1539	0 %	100 %	0 %	0 %	60679599
31	NC_003228	AAT	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679599
32	NC_003228	CTA	2	6	1615	1620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679599
33	NC_003228	A	8	8	1625	1632	100 %	0 %	0 %	0 %	60679599
34	NC_003228	CAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679599
35	NC_003228	ATA	2	6	1851	1856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679599
36	NC_003228	AAT	2	6	1871	1876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679599
37	NC_003228	ATG	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679599
38	NC_003228	A	9	9	1902	1910	100 %	0 %	0 %	0 %	60679599
39	NC_003228	AAAAG	2	10	1933	1942	80 %	0 %	20 %	0 %	60679599
40	NC_003228	ATG	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679599
41	NC_003228	TAC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679599
42	NC_003228	CTT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679599
43	NC_003228	A	8	8	2177	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	60679599
44	NC_003228	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	60679599
45	NC_003228	TTG	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60679600
46	NC_003228	TAA	2	6	2392	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679600
47	NC_003228	TTAT	2	8	2452	2459	25 %	75 %	0 %	0 %	60679600
48	NC_003228	TAA	2	6	2461	2466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679600
49	NC_003228	AAAT	2	8	2468	2475	75 %	25 %	0 %	0 %	60679600
50	NC_003228	TTTG	2	8	2498	2505	0 %	75 %	25 %	0 %	60679600
51	NC_003228	AAT	2	6	2522	2527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679600
52	NC_003228	AGC	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679600
53	NC_003228	ATT	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679600
54	NC_003228	T	6	6	2591	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	60679600
55	NC_003228	GA	3	6	2628	2633	50 %	0 %	50 %	0 %	60679600
56	NC_003228	AT	3	6	2634	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	60679600
57	NC_003228	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679600
58	NC_003228	TTTA	2	8	2674	2681	25 %	75 %	0 %	0 %	60679600
59	NC_003228	TTA	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679600
60	NC_003228	GTTAC	2	10	2815	2824	20 %	40 %	20 %	20 %	60679600
61	NC_003228	TA	3	6	2827	2832	50 %	50 %	0 %	0 %	60679600
62	NC_003228	GAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679600
63	NC_003228	TAT	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679600
64	NC_003228	ATA	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679600
65	NC_003228	ATG	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679600
66	NC_003228	TAA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679600
67	NC_003228	TGA	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679600
68	NC_003228	TTTG	2	8	3056	3063	0 %	75 %	25 %	0 %	60679600
69	NC_003228	A	6	6	3162	3167	100 %	0 %	0 %	0 %	60679600
70	NC_003228	CTTTA	2	10	3172	3181	20 %	60 %	0 %	20 %	60679600
71	NC_003228	TG	3	6	3197	3202	0 %	50 %	50 %	0 %	60679601
72	NC_003228	TGT	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60679601
73	NC_003228	TCT	2	6	3331	3336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679601
74	NC_003228	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679601
75	NC_003228	ATGG	2	8	3448	3455	25 %	25 %	50 %	0 %	60679601
76	NC_003228	GAT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679601
77	NC_003228	GTGG	2	8	3593	3600	0 %	25 %	75 %	0 %	60679601
78	NC_003228	AAC	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679601
79	NC_003228	ACT	2	6	3652	3657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679601
80	NC_003228	GGAT	2	8	3665	3672	25 %	25 %	50 %	0 %	60679601
81	NC_003228	T	6	6	3672	3677	0 %	100 %	0 %	0 %	60679601
82	NC_003228	AGG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679601
83	NC_003228	GTCAG	2	10	3809	3818	20 %	20 %	40 %	20 %	60679601
84	NC_003228	A	6	6	3824	3829	100 %	0 %	0 %	0 %	60679601
85	NC_003228	CAA	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679601
86	NC_003228	TAAT	2	8	3860	3867	50 %	50 %	0 %	0 %	60679601
87	NC_003228	GCA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679601
88	NC_003228	TTAC	2	8	3961	3968	25 %	50 %	0 %	25 %	60679601
89	NC_003228	AAG	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679601
90	NC_003228	TAA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679601
91	NC_003228	CAA	3	9	4061	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60679602
92	NC_003228	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	60679602
93	NC_003228	GGA	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679602
94	NC_003228	GGT	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60679602
95	NC_003228	TAT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679602
96	NC_003228	TC	3	6	4374	4379	0 %	50 %	0 %	50 %	60679602
97	NC_003228	GA	3	6	4461	4466	50 %	0 %	50 %	0 %	60679602
98	NC_003228	TCT	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679602
99	NC_003228	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679602
100	NC_003228	TGAA	2	8	4596	4603	50 %	25 %	25 %	0 %	60679602
101	NC_003228	TAT	2	6	4676	4681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679603
102	NC_003228	T	7	7	4694	4700	0 %	100 %	0 %	0 %	60679603
103	NC_003228	ATAG	2	8	4792	4799	50 %	25 %	25 %	0 %	60679603
104	NC_003228	T	6	6	4874	4879	0 %	100 %	0 %	0 %	60679603
105	NC_003228	A	8	8	4891	4898	100 %	0 %	0 %	0 %	60679603
106	NC_003228	CTG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60679603
107	NC_003228	CCG	2	6	5043	5048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60679603
108	NC_003228	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60679603
109	NC_003228	CAT	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679603
110	NC_003228	GA	3	6	5351	5356	50 %	0 %	50 %	0 %	60679603
111	NC_003228	ATGA	2	8	5377	5384	50 %	25 %	25 %	0 %	60679603
112	NC_003228	AAT	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679603
113	NC_003228	TCT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679603
114	NC_003228	GAA	2	6	5605	5610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679603
115	NC_003228	CTT	2	6	5619	5624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679603
116	NC_003228	CTT	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679603
117	NC_003228	CGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60679603
118	NC_003228	TCT	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679603
119	NC_003228	AAT	2	6	5835	5840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679603
120	NC_003228	GGA	3	9	5859	5867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679603
121	NC_003228	TGA	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679603
122	NC_003228	A	6	6	5953	5958	100 %	0 %	0 %	0 %	60679603
123	NC_003228	AT	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	60679603
124	NC_003228	TGA	2	6	6072	6077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679603
125	NC_003228	CCG	2	6	6083	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60679603
126	NC_003228	TCG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60679603
127	NC_003228	AT	3	6	6267	6272	50 %	50 %	0 %	0 %	60679603
128	NC_003228	ATG	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679603
129	NC_003228	A	6	6	6348	6353	100 %	0 %	0 %	0 %	60679603
130	NC_003228	ATAA	2	8	6364	6371	75 %	25 %	0 %	0 %	60679603
131	NC_003228	T	6	6	6382	6387	0 %	100 %	0 %	0 %	60679603
132	NC_003228	GAAAA	3	15	6442	6456	80 %	0 %	20 %	0 %	60679603
133	NC_003228	AAAC	2	8	6739	6746	75 %	0 %	0 %	25 %	60679604
134	NC_003228	GGT	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60679604
135	NC_003228	TA	3	6	6850	6855	50 %	50 %	0 %	0 %	60679604
136	NC_003228	A	6	6	6883	6888	100 %	0 %	0 %	0 %	60679604
137	NC_003228	AAT	2	6	6955	6960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679604
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139	NC_003228	ATA	2	6	7001	7006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679604
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264	NC_003228	AAAAT	2	10	13292	13301	80 %	20 %	0 %	0 %	60679608
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273	NC_003228	TTG	2	6	13651	13656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60679608
274	NC_003228	TGT	3	9	13779	13787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60679608
275	NC_003228	ATT	2	6	13898	13903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679608
276	NC_003228	TTC	2	6	13914	13919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679608
277	NC_003228	TCT	2	6	14101	14106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679609
278	NC_003228	T	7	7	14124	14130	0 %	100 %	0 %	0 %	60679609
279	NC_003228	AG	3	6	14268	14273	50 %	0 %	50 %	0 %	60679609
280	NC_003228	ATG	2	6	14383	14388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679609
281	NC_003228	TTC	2	6	14422	14427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679609
282	NC_003228	TTTCTG	2	12	14464	14475	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	60679609
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285	NC_003228	T	6	6	14576	14581	0 %	100 %	0 %	0 %	60679609
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288	NC_003228	GAA	2	6	14903	14908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60679610
289	NC_003228	GAAT	2	8	14929	14936	50 %	25 %	25 %	0 %	60679610
290	NC_003228	GGA	2	6	14938	14943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60679610
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295	NC_003228	AAGA	2	8	15164	15171	75 %	0 %	25 %	0 %	60679610
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300	NC_003228	CTT	2	6	15419	15424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60679610
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351	NC_003228	GAAA	2	8	18072	18079	75 %	0 %	25 %	0 %	60679612
352	NC_003228	TAC	2	6	18114	18119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679612
353	NC_003228	CAT	2	6	18133	18138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679612
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355	NC_003228	AC	4	8	18371	18378	50 %	0 %	0 %	50 %	60679613
356	NC_003228	GGC	2	6	18455	18460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60679613
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389	NC_003228	GATC	2	8	20580	20587	25 %	25 %	25 %	25 %	60679615
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391	NC_003228	ATA	2	6	20608	20613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60679615
392	NC_003228	GTT	2	6	20641	20646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60679615
393	NC_003228	GTA	2	6	20702	20707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679615
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395	NC_003228	ATCC	2	8	20858	20865	25 %	25 %	0 %	50 %	60679615
396	NC_003228	CAT	2	6	20956	20961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60679615
397	NC_003228	CTTTT	2	10	21009	21018	0 %	80 %	0 %	20 %	60679615
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399	NC_003228	GAT	2	6	21066	21071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679615
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401	NC_003228	GTA	2	6	21236	21241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679615
402	NC_003228	ATG	2	6	21287	21292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60679615
403	NC_003228	CTG	2	6	21350	21355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60679615
404	NC_003228	TA	3	6	21388	21393	50 %	50 %	0 %	0 %	60679615
405	NC_003228	TTA	2	6	21395	21400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60679615
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