MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002928	GAT	2	6	664428	664433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595326
16003	NC_002928	CGG	2	6	664451	664456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595326
16004	NC_002928	CCT	2	6	664496	664501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595326
16005	NC_002928	TCA	2	6	664526	664531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595326
16006	NC_002928	CTT	2	6	664532	664537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595326
16007	NC_002928	TGG	2	6	664574	664579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595326
16008	NC_002928	GGC	2	6	664620	664625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595326
16009	NC_002928	GC	3	6	664660	664665	0 %	0 %	50 %	50 %	33595326
16010	NC_002928	GCCTT	2	10	664693	664702	0 %	40 %	20 %	40 %	33595326
16011	NC_002928	TGG	2	6	665082	665087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595327
16012	NC_002928	GAA	2	6	665110	665115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595327
16013	NC_002928	TCGT	2	8	665129	665136	0 %	50 %	25 %	25 %	33595327
16014	NC_002928	A	6	6	665195	665200	100 %	0 %	0 %	0 %	33595327
16015	NC_002928	GGC	3	9	665251	665259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595327
16016	NC_002928	CCG	2	6	665262	665267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595327
16017	NC_002928	GAT	2	6	665287	665292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595327
16018	NC_002928	CAA	2	6	665323	665328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33595327
16019	NC_002928	TGGC	2	8	665369	665376	0 %	25 %	50 %	25 %	33595327
16020	NC_002928	GAG	2	6	665567	665572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595327
16021	NC_002928	CCTGCA	2	12	665626	665637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33595327
16022	NC_002928	CG	3	6	665643	665648	0 %	0 %	50 %	50 %	33595327
16023	NC_002928	GGC	2	6	665656	665661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595327
16024	NC_002928	GCC	2	6	665672	665677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595327
16025	NC_002928	CGG	2	6	665713	665718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595327
16026	NC_002928	GGC	2	6	665723	665728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595327
16027	NC_002928	GAG	2	6	665864	665869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595327
16028	NC_002928	ATC	2	6	665870	665875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595327
16029	NC_002928	GC	3	6	665926	665931	0 %	0 %	50 %	50 %	33595327
16030	NC_002928	CCAGGC	2	12	665941	665952	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595327
16031	NC_002928	GCT	2	6	665976	665981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595328
16032	NC_002928	GAC	2	6	665992	665997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595328
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16034	NC_002928	CGG	2	6	666128	666133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595328
16035	NC_002928	AGG	2	6	666167	666172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595328
16036	NC_002928	CG	4	8	666174	666181	0 %	0 %	50 %	50 %	33595328
16037	NC_002928	GGA	2	6	666186	666191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595328
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16039	NC_002928	GC	3	6	666235	666240	0 %	0 %	50 %	50 %	33595328
16040	NC_002928	TCG	2	6	666263	666268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595328
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16042	NC_002928	ATG	2	6	666301	666306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595328
16043	NC_002928	TGC	2	6	666413	666418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595328
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16047	NC_002928	CATC	2	8	666654	666661	25 %	25 %	0 %	50 %	33595328
16048	NC_002928	GATT	2	8	666796	666803	25 %	50 %	25 %	0 %	33595329
16049	NC_002928	TCATC	2	10	666835	666844	20 %	40 %	0 %	40 %	33595329
16050	NC_002928	GCT	2	6	666846	666851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595329
16051	NC_002928	TGC	2	6	666908	666913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595329
16052	NC_002928	GGC	2	6	666955	666960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595329
16053	NC_002928	GCA	2	6	666974	666979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595329
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16056	NC_002928	CAG	2	6	667018	667023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595329
16057	NC_002928	CGA	2	6	667029	667034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595329
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16060	NC_002928	GCT	2	6	667125	667130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595329
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16089	NC_002928	GC	3	6	668392	668397	0 %	0 %	50 %	50 %	33595330
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16241	NC_002928	GC	5	10	673805	673814	0 %	0 %	50 %	50 %	33595335
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16488	NC_002928	CAT	2	6	682834	682839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595345
16489	NC_002928	GC	5	10	682856	682865	0 %	0 %	50 %	50 %	33595345
16490	NC_002928	GCT	3	9	682882	682890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595345
16491	NC_002928	ACCA	2	8	682895	682902	50 %	0 %	0 %	50 %	33595345
16492	NC_002928	ACG	2	6	682944	682949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595345
16493	NC_002928	GC	3	6	682982	682987	0 %	0 %	50 %	50 %	33595345
16494	NC_002928	GCA	2	6	682990	682995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595345
16495	NC_002928	TGG	2	6	683001	683006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595345
16496	NC_002928	TGG	2	6	683115	683120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595345
16497	NC_002928	CTG	2	6	683198	683203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595345
16498	NC_002928	TCA	2	6	683253	683258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595345
16499	NC_002928	CG	3	6	683300	683305	0 %	0 %	50 %	50 %	33595345
16500	NC_002928	AGG	2	6	683337	683342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595345

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