MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002928	GCC	2	6	622594	622599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595293
15002	NC_002928	GAA	2	6	622602	622607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595293
15003	NC_002928	CGC	2	6	622740	622745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595293
15004	NC_002928	GCC	2	6	622808	622813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595293
15005	NC_002928	GC	3	6	622815	622820	0 %	0 %	50 %	50 %	33595293
15006	NC_002928	ACC	2	6	622831	622836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595293
15007	NC_002928	CG	3	6	622931	622936	0 %	0 %	50 %	50 %	33595293
15008	NC_002928	CGC	2	6	622940	622945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595293
15009	NC_002928	TCG	2	6	622952	622957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595293
15010	NC_002928	GCC	2	6	622984	622989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595293
15011	NC_002928	GCA	2	6	623019	623024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595293
15012	NC_002928	GGC	2	6	623064	623069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595293
15013	NC_002928	TGA	2	6	623102	623107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595293
15014	NC_002928	CGGC	2	8	623111	623118	0 %	0 %	50 %	50 %	33595293
15015	NC_002928	GC	3	6	623117	623122	0 %	0 %	50 %	50 %	33595293
15016	NC_002928	GAG	2	6	623132	623137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595293
15017	NC_002928	CG	3	6	623204	623209	0 %	0 %	50 %	50 %	33595294
15018	NC_002928	GC	3	6	623211	623216	0 %	0 %	50 %	50 %	33595294
15019	NC_002928	GCC	2	6	623237	623242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595294
15020	NC_002928	CTG	2	6	623261	623266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595294
15021	NC_002928	ACG	2	6	623328	623333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595294
15022	NC_002928	CGG	2	6	623347	623352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595294
15023	NC_002928	GT	3	6	623417	623422	0 %	50 %	50 %	0 %	33595294
15024	NC_002928	GGCC	2	8	623437	623444	0 %	0 %	50 %	50 %	33595294
15025	NC_002928	GC	3	6	623467	623472	0 %	0 %	50 %	50 %	33595294
15026	NC_002928	TGC	2	6	623481	623486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595294
15027	NC_002928	TCC	2	6	623511	623516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595294
15028	NC_002928	TCC	2	6	623528	623533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595294
15029	NC_002928	CGG	2	6	623538	623543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595294
15030	NC_002928	CGC	3	9	623544	623552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595294
15031	NC_002928	TCG	2	6	623695	623700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595295
15032	NC_002928	GCG	2	6	623708	623713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595295
15033	NC_002928	GTG	2	6	623723	623728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595295
15034	NC_002928	TGG	2	6	623749	623754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595295
15035	NC_002928	ACCG	2	8	623772	623779	25 %	0 %	25 %	50 %	33595295
15036	NC_002928	GC	3	6	623805	623810	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15037	NC_002928	GAC	2	6	623925	623930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595295
15038	NC_002928	GC	3	6	623934	623939	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15039	NC_002928	CG	3	6	623940	623945	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15040	NC_002928	GC	3	6	623977	623982	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15041	NC_002928	CG	3	6	624005	624010	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15042	NC_002928	GGC	2	6	624042	624047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595295
15043	NC_002928	GCC	2	6	624069	624074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595295
15044	NC_002928	CGG	2	6	624135	624140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595295
15045	NC_002928	GC	3	6	624161	624166	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15046	NC_002928	GTG	2	6	624168	624173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595295
15047	NC_002928	TTCG	2	8	624182	624189	0 %	50 %	25 %	25 %	33595295
15048	NC_002928	CG	3	6	624201	624206	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15049	NC_002928	TACCG	2	10	624222	624231	20 %	20 %	20 %	40 %	33595295
15050	NC_002928	CG	3	6	624234	624239	0 %	0 %	50 %	50 %	33595295
15051	NC_002928	GAC	2	6	624246	624251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595295
15052	NC_002928	ATCC	2	8	624269	624276	25 %	25 %	0 %	50 %	33595295
15053	NC_002928	TTG	2	6	624310	624315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33595296
15054	NC_002928	GCG	2	6	624339	624344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15055	NC_002928	GGAC	2	8	624381	624388	25 %	0 %	50 %	25 %	33595296
15056	NC_002928	GCG	2	6	624425	624430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15057	NC_002928	GC	3	6	624471	624476	0 %	0 %	50 %	50 %	33595296
15058	NC_002928	TGGC	2	8	624502	624509	0 %	25 %	50 %	25 %	33595296
15059	NC_002928	CGG	2	6	624510	624515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15060	NC_002928	CG	3	6	624529	624534	0 %	0 %	50 %	50 %	33595296
15061	NC_002928	CCA	2	6	624546	624551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595296
15062	NC_002928	CGC	2	6	624590	624595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595296
15063	NC_002928	GGCG	2	8	624630	624637	0 %	0 %	75 %	25 %	33595296
15064	NC_002928	GCTGGC	2	12	624645	624656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595296
15065	NC_002928	TGA	2	6	624665	624670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595296
15066	NC_002928	GCCCAG	2	12	624679	624690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595296
15067	NC_002928	CGA	2	6	624696	624701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595296
15068	NC_002928	CCG	2	6	624708	624713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595296
15069	NC_002928	GCG	2	6	624728	624733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15070	NC_002928	GC	3	6	624771	624776	0 %	0 %	50 %	50 %	33595296
15071	NC_002928	TAC	2	6	624781	624786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595296
15072	NC_002928	AGG	2	6	624815	624820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595296
15073	NC_002928	GGC	2	6	624837	624842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15074	NC_002928	CCG	2	6	624854	624859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595296
15075	NC_002928	GC	3	6	624870	624875	0 %	0 %	50 %	50 %	33595296
15076	NC_002928	GCGCTG	2	12	624913	624924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595296
15077	NC_002928	GCA	2	6	624999	625004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595296
15078	NC_002928	GGCG	2	8	625035	625042	0 %	0 %	75 %	25 %	33595296
15079	NC_002928	GC	3	6	625045	625050	0 %	0 %	50 %	50 %	33595296
15080	NC_002928	CGG	2	6	625056	625061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595296
15081	NC_002928	CAT	2	6	625229	625234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595297
15082	NC_002928	GGC	2	6	625292	625297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595297
15083	NC_002928	TCCGGC	2	12	625350	625361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33595297
15084	NC_002928	ACA	2	6	625477	625482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33595297
15085	NC_002928	CGC	2	6	625490	625495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595297
15086	NC_002928	CG	3	6	625528	625533	0 %	0 %	50 %	50 %	33595297
15087	NC_002928	GCA	2	6	625555	625560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595297
15088	NC_002928	GC	3	6	625577	625582	0 %	0 %	50 %	50 %	33595297
15089	NC_002928	TGC	2	6	625612	625617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595297
15090	NC_002928	AAG	2	6	625725	625730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595297
15091	NC_002928	GTG	2	6	625752	625757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595297
15092	NC_002928	ACG	2	6	625771	625776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595297
15093	NC_002928	GCC	2	6	625809	625814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595297
15094	NC_002928	CGC	2	6	625886	625891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595297
15095	NC_002928	CGC	2	6	625936	625941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595297
15096	NC_002928	GGT	2	6	626000	626005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595297
15097	NC_002928	GC	3	6	626101	626106	0 %	0 %	50 %	50 %	33595297
15098	NC_002928	ACG	2	6	626122	626127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595297
15099	NC_002928	GAA	2	6	626132	626137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595297
15100	NC_002928	GGC	2	6	626201	626206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595297
15101	NC_002928	CTT	2	6	626276	626281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595297
15102	NC_002928	CAG	2	6	626325	626330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595297
15103	NC_002928	TCA	2	6	626344	626349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595297
15104	NC_002928	GAAG	2	8	626375	626382	50 %	0 %	50 %	0 %	33595297
15105	NC_002928	ATC	2	6	626497	626502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595298
15106	NC_002928	TTC	2	6	626542	626547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595298
15107	NC_002928	CTGG	2	8	626583	626590	0 %	25 %	50 %	25 %	33595298
15108	NC_002928	GCCT	2	8	626650	626657	0 %	25 %	25 %	50 %	33595298
15109	NC_002928	CGGC	2	8	626732	626739	0 %	0 %	50 %	50 %	33595298
15110	NC_002928	TTC	2	6	626749	626754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595298
15111	NC_002928	CGG	2	6	626778	626783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595298
15112	NC_002928	TGTTCG	2	12	626864	626875	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	33595298
15113	NC_002928	GAC	2	6	626886	626891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595298
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15117	NC_002928	AGG	2	6	626957	626962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595298
15118	NC_002928	TGC	2	6	626969	626974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595298
15119	NC_002928	GGC	2	6	627030	627035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595298
15120	NC_002928	GGC	2	6	627063	627068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595298
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15122	NC_002928	GCA	2	6	627137	627142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595298
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15228	NC_002928	CGGCAC	2	12	632816	632827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595302
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15231	NC_002928	GC	3	6	632980	632985	0 %	0 %	50 %	50 %	33595302
15232	NC_002928	TGC	2	6	632992	632997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595302
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15238	NC_002928	TCG	2	6	633439	633444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595302
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15240	NC_002928	CGG	4	12	633514	633525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595302
15241	NC_002928	GCCG	2	8	633584	633591	0 %	0 %	50 %	50 %	33595302
15242	NC_002928	GATC	2	8	633697	633704	25 %	25 %	25 %	25 %	33595303
15243	NC_002928	CTG	2	6	633716	633721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
15244	NC_002928	TGG	2	6	633740	633745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
15245	NC_002928	GAC	2	6	633751	633756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595303
15246	NC_002928	CGG	2	6	633814	633819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
15247	NC_002928	TCG	2	6	633834	633839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
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15251	NC_002928	GCCG	2	8	634003	634010	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
15252	NC_002928	GTG	2	6	634013	634018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
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15255	NC_002928	GCCTGG	2	12	634059	634070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595303
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15263	NC_002928	GGCG	2	8	634408	634415	0 %	0 %	75 %	25 %	33595303
15264	NC_002928	GC	3	6	634427	634432	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
15265	NC_002928	CGA	2	6	634441	634446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595303
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15268	NC_002928	TGC	2	6	634521	634526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
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15271	NC_002928	GCG	2	6	634665	634670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
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15274	NC_002928	GCG	2	6	634707	634712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
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15280	NC_002928	GC	3	6	635054	635059	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
15281	NC_002928	CCGGA	2	10	635073	635082	20 %	0 %	40 %	40 %	33595304
15282	NC_002928	GGC	2	6	635103	635108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
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15284	NC_002928	GC	3	6	635150	635155	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
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15290	NC_002928	CCG	2	6	635320	635325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
15291	NC_002928	GCC	2	6	635337	635342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
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15309	NC_002928	TCG	2	6	635998	636003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
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15350	NC_002928	TGC	2	6	637383	637388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595306
15351	NC_002928	GGCCG	2	10	637443	637452	0 %	0 %	60 %	40 %	33595306
15352	NC_002928	CCA	2	6	637467	637472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595306
15353	NC_002928	CGG	2	6	637584	637589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595306
15354	NC_002928	GC	3	6	637604	637609	0 %	0 %	50 %	50 %	33595306
15355	NC_002928	GCAG	2	8	637635	637642	25 %	0 %	50 %	25 %	33595306
15356	NC_002928	CAG	2	6	637645	637650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595306
15357	NC_002928	GCCG	2	8	637657	637664	0 %	0 %	50 %	50 %	33595306
15358	NC_002928	CGA	2	6	637666	637671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595306
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15360	NC_002928	CAGCT	2	10	637769	637778	20 %	20 %	20 %	40 %	33595306
15361	NC_002928	TGG	2	6	637790	637795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595306
15362	NC_002928	TGGT	2	8	637820	637827	0 %	50 %	50 %	0 %	33595306
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