MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_002928	CGG	2	6	582085	582090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595253
14003	NC_002928	GCGGT	2	10	582228	582237	0 %	20 %	60 %	20 %	33595254
14004	NC_002928	GC	3	6	582299	582304	0 %	0 %	50 %	50 %	33595254
14005	NC_002928	GCCAGC	2	12	582321	582332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595254
14006	NC_002928	GC	4	8	582339	582346	0 %	0 %	50 %	50 %	33595254
14007	NC_002928	GGC	2	6	582390	582395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595254
14008	NC_002928	GTA	2	6	582461	582466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595254
14009	NC_002928	GC	4	8	582471	582478	0 %	0 %	50 %	50 %	33595254
14010	NC_002928	TGC	2	6	582508	582513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595254
14011	NC_002928	CGC	2	6	582514	582519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595254
14012	NC_002928	TCG	2	6	582546	582551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595254
14013	NC_002928	TCG	2	6	582564	582569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595254
14014	NC_002928	GAT	2	6	582578	582583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595254
14015	NC_002928	GCCAGC	2	12	582591	582602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595254
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14017	NC_002928	GCG	2	6	582652	582657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595254
14018	NC_002928	TGG	2	6	582705	582710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595254
14019	NC_002928	GCG	2	6	582711	582716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595254
14020	NC_002928	GTC	2	6	582719	582724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595254
14021	NC_002928	CGC	2	6	582730	582735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595254
14022	NC_002928	GCC	2	6	582738	582743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595254
14023	NC_002928	CGC	2	6	582781	582786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595254
14024	NC_002928	GC	3	6	582848	582853	0 %	0 %	50 %	50 %	33595254
14025	NC_002928	GCGG	2	8	582886	582893	0 %	0 %	75 %	25 %	33595254
14026	NC_002928	TGA	2	6	582901	582906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595254
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14031	NC_002928	CGG	3	9	583199	583207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595255
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14033	NC_002928	TCG	2	6	583255	583260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595255
14034	NC_002928	GCCGG	2	10	583263	583272	0 %	0 %	60 %	40 %	33595255
14035	NC_002928	ACC	2	6	583297	583302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595255
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14037	NC_002928	TGC	2	6	583414	583419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595255
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14039	NC_002928	CTG	2	6	583434	583439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595255
14040	NC_002928	GCC	2	6	583453	583458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595255
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14053	NC_002928	GCT	2	6	583884	583889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595255
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14070	NC_002928	CAC	2	6	584299	584304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595256
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14087	NC_002928	GC	3	6	585067	585072	0 %	0 %	50 %	50 %	33595256
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14102	NC_002928	GCAA	2	8	585946	585953	50 %	0 %	25 %	25 %	33595257
14103	NC_002928	GGC	2	6	585989	585994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595257
14104	NC_002928	TGG	2	6	586006	586011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595257
14105	NC_002928	CCGG	2	8	586040	586047	0 %	0 %	50 %	50 %	33595257
14106	NC_002928	CTGT	2	8	586082	586089	0 %	50 %	25 %	25 %	33595257
14107	NC_002928	CTCG	2	8	586100	586107	0 %	25 %	25 %	50 %	33595257
14108	NC_002928	CG	3	6	586116	586121	0 %	0 %	50 %	50 %	33595257
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14110	NC_002928	GC	3	6	586222	586227	0 %	0 %	50 %	50 %	33595257
14111	NC_002928	C	6	6	586232	586237	0 %	0 %	0 %	100 %	33595257
14112	NC_002928	CGG	2	6	586262	586267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595257
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14118	NC_002928	AGC	2	6	586365	586370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595257
14119	NC_002928	GCGCG	2	10	586421	586430	0 %	0 %	60 %	40 %	33595257
14120	NC_002928	GGC	2	6	586443	586448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595257
14121	NC_002928	GC	3	6	586447	586452	0 %	0 %	50 %	50 %	33595257
14122	NC_002928	TAC	2	6	586455	586460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595257
14123	NC_002928	TTC	2	6	586518	586523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595257
14124	NC_002928	GCA	2	6	586571	586576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595257
14125	NC_002928	CG	4	8	586581	586588	0 %	0 %	50 %	50 %	33595257
14126	NC_002928	CGC	2	6	586613	586618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595257
14127	NC_002928	AC	3	6	586631	586636	50 %	0 %	0 %	50 %	33595257
14128	NC_002928	CGA	2	6	586640	586645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595257
14129	NC_002928	GCG	2	6	586650	586655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595257
14130	NC_002928	GCA	2	6	586712	586717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595257
14131	NC_002928	CCCGCG	2	12	586770	586781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595257
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14135	NC_002928	T	7	7	587142	587148	0 %	100 %	0 %	0 %	33595258
14136	NC_002928	CGC	2	6	587154	587159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595258
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14141	NC_002928	CCTTC	2	10	587445	587454	0 %	40 %	0 %	60 %	33595258
14142	NC_002928	GACC	2	8	587460	587467	25 %	0 %	25 %	50 %	33595258
14143	NC_002928	GC	3	6	587512	587517	0 %	0 %	50 %	50 %	33595258
14144	NC_002928	CGGC	2	8	587528	587535	0 %	0 %	50 %	50 %	33595258
14145	NC_002928	CGA	2	6	587606	587611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595258
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14147	NC_002928	GCCGT	2	10	587665	587674	0 %	20 %	40 %	40 %	33595258
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14155	NC_002928	CCGG	2	8	587896	587903	0 %	0 %	50 %	50 %	33595258
14156	NC_002928	CGC	2	6	587906	587911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595258
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14159	NC_002928	CGAG	2	8	588041	588048	25 %	0 %	50 %	25 %	33595258
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14163	NC_002928	GC	3	6	588314	588319	0 %	0 %	50 %	50 %	33595259
14164	NC_002928	ATC	2	6	588451	588456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595259
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14171	NC_002928	CGA	2	6	588653	588658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595259
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14182	NC_002928	CGC	2	6	589502	589507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595260
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14187	NC_002928	TCGA	2	8	589624	589631	25 %	25 %	25 %	25 %	33595260
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14226	NC_002928	CGA	2	6	591665	591670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
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14229	NC_002928	GTACG	2	10	591791	591800	20 %	20 %	40 %	20 %	33595262
14230	NC_002928	CGGT	2	8	591811	591818	0 %	25 %	50 %	25 %	33595262
14231	NC_002928	GCGG	2	8	591842	591849	0 %	0 %	75 %	25 %	33595262
14232	NC_002928	CG	3	6	591856	591861	0 %	0 %	50 %	50 %	33595262
14233	NC_002928	TTC	2	6	591867	591872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595262
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14235	NC_002928	CGG	2	6	591908	591913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595262
14236	NC_002928	CGC	2	6	591914	591919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595262
14237	NC_002928	AGC	2	6	592033	592038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
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14239	NC_002928	GCG	2	6	592140	592145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595262
14240	NC_002928	GCC	2	6	592173	592178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595262
14241	NC_002928	CGG	2	6	592250	592255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595262
14242	NC_002928	ATGG	2	8	592266	592273	25 %	25 %	50 %	0 %	33595262
14243	NC_002928	CAT	2	6	592316	592321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595262
14244	NC_002928	ATC	2	6	592350	592355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595262
14245	NC_002928	GAT	2	6	592503	592508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595263
14246	NC_002928	TTTC	2	8	592522	592529	0 %	75 %	0 %	25 %	33595263
14247	NC_002928	GCC	2	6	592537	592542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595263
14248	NC_002928	CG	4	8	592560	592567	0 %	0 %	50 %	50 %	33595263
14249	NC_002928	GCCT	2	8	592578	592585	0 %	25 %	25 %	50 %	33595263
14250	NC_002928	CGAC	2	8	592640	592647	25 %	0 %	25 %	50 %	33595263
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14252	NC_002928	TCG	2	6	592661	592666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595263
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14273	NC_002928	GGC	2	6	593639	593644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595264
14274	NC_002928	GCC	2	6	593648	593653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595264
14275	NC_002928	TCG	2	6	593701	593706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595264
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14352	NC_002928	GTC	2	6	597142	597147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595267
14353	NC_002928	CAG	2	6	597166	597171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595267
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14355	NC_002928	GCA	2	6	597300	597305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595267
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14357	NC_002928	TGGCG	2	10	597360	597369	0 %	20 %	60 %	20 %	33595267
14358	NC_002928	CG	3	6	597368	597373	0 %	0 %	50 %	50 %	33595267
14359	NC_002928	CAG	2	6	597418	597423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595267
14360	NC_002928	CG	4	8	597432	597439	0 %	0 %	50 %	50 %	33595267
14361	NC_002928	CGC	3	9	597501	597509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595267
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14485	NC_002928	TGC	2	6	601971	601976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595273
14486	NC_002928	AGCG	2	8	601992	601999	25 %	0 %	50 %	25 %	33595273
14487	NC_002928	CAG	2	6	602045	602050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595273
14488	NC_002928	GAGC	2	8	602090	602097	25 %	0 %	50 %	25 %	33595273
14489	NC_002928	GAT	2	6	602099	602104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595273
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14491	NC_002928	CAG	3	9	602153	602161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595273
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14499	NC_002928	AGC	2	6	602474	602479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595274
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