MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002928	GCAAC	2	10	511781	511790	40 %	0 %	20 %	40 %	33595185
12502	NC_002928	CGTG	2	8	511810	511817	0 %	25 %	50 %	25 %	33595185
12503	NC_002928	CGT	2	6	511873	511878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595185
12504	NC_002928	TCC	2	6	511902	511907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595185
12505	NC_002928	AGG	2	6	511945	511950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595185
12506	NC_002928	GAAGCG	2	12	512054	512065	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33595185
12507	NC_002928	CGATC	2	10	512107	512116	20 %	20 %	20 %	40 %	33595185
12508	NC_002928	CGG	2	6	512122	512127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595185
12509	NC_002928	GAC	2	6	512137	512142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
12510	NC_002928	CGC	2	6	512171	512176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595185
12511	NC_002928	GTG	2	6	512180	512185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595185
12512	NC_002928	GC	3	6	512275	512280	0 %	0 %	50 %	50 %	33595185
12513	NC_002928	CGC	2	6	512317	512322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595185
12514	NC_002928	TTC	2	6	512357	512362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595185
12515	NC_002928	GAG	2	6	512378	512383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595185
12516	NC_002928	GAC	2	6	512425	512430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
12517	NC_002928	GAC	2	6	512459	512464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
12518	NC_002928	GCAAC	2	10	512584	512593	40 %	0 %	20 %	40 %	33595185
12519	NC_002928	GC	3	6	512688	512693	0 %	0 %	50 %	50 %	33595185
12520	NC_002928	GCT	2	6	512734	512739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595185
12521	NC_002928	CGA	2	6	512788	512793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
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12524	NC_002928	GCC	2	6	512891	512896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595185
12525	NC_002928	CGC	2	6	512903	512908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595185
12526	NC_002928	ATC	2	6	512946	512951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595185
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12528	NC_002928	CG	3	6	512995	513000	0 %	0 %	50 %	50 %	33595185
12529	NC_002928	GGCG	2	8	513131	513138	0 %	0 %	75 %	25 %	33595185
12530	NC_002928	GATG	2	8	513169	513176	25 %	25 %	50 %	0 %	33595185
12531	NC_002928	GGC	2	6	513199	513204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595185
12532	NC_002928	GCA	2	6	513234	513239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
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12534	NC_002928	CTG	2	6	513585	513590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595186
12535	NC_002928	CAT	2	6	513657	513662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595186
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12537	NC_002928	GCG	2	6	513719	513724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595186
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12544	NC_002928	TCG	2	6	513878	513883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595186
12545	NC_002928	CG	3	6	513920	513925	0 %	0 %	50 %	50 %	33595186
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12551	NC_002928	GCCGT	2	10	514557	514566	0 %	20 %	40 %	40 %	33595187
12552	NC_002928	CCG	2	6	514636	514641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595187
12553	NC_002928	GC	3	6	514700	514705	0 %	0 %	50 %	50 %	33595187
12554	NC_002928	GC	3	6	514712	514717	0 %	0 %	50 %	50 %	33595187
12555	NC_002928	GCA	2	6	514744	514749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595187
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12557	NC_002928	GTG	2	6	514802	514807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595187
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12559	NC_002928	GCG	2	6	514843	514848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595187
12560	NC_002928	CGCA	2	8	514949	514956	25 %	0 %	25 %	50 %	33595187
12561	NC_002928	CAT	2	6	514979	514984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595187
12562	NC_002928	GGC	2	6	515007	515012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595187
12563	NC_002928	CGCC	2	8	515014	515021	0 %	0 %	25 %	75 %	33595187
12564	NC_002928	TCC	2	6	515031	515036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595187
12565	NC_002928	CGGC	2	8	515065	515072	0 %	0 %	50 %	50 %	33595187
12566	NC_002928	GGC	3	9	515118	515126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595187
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12570	NC_002928	TCG	2	6	515329	515334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595187
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12591	NC_002928	GCGCC	2	10	516078	516087	0 %	0 %	40 %	60 %	33595188
12592	NC_002928	CGC	2	6	516088	516093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595188
12593	NC_002928	CTGG	2	8	516100	516107	0 %	25 %	50 %	25 %	33595188
12594	NC_002928	GCCA	2	8	516112	516119	25 %	0 %	25 %	50 %	33595188
12595	NC_002928	CG	3	6	516138	516143	0 %	0 %	50 %	50 %	33595188
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12605	NC_002928	GC	4	8	517323	517330	0 %	0 %	50 %	50 %	33595190
12606	NC_002928	TTG	2	6	517333	517338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33595190
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12609	NC_002928	A	6	6	517500	517505	100 %	0 %	0 %	0 %	33595190
12610	NC_002928	AG	3	6	517522	517527	50 %	0 %	50 %	0 %	33595190
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12612	NC_002928	TGC	2	6	517671	517676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595191
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12616	NC_002928	TA	3	6	517863	517868	50 %	50 %	0 %	0 %	33595191
12617	NC_002928	TGA	2	6	518021	518026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595191
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12621	NC_002928	TAA	2	6	518124	518129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33595191
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12745	NC_002928	GAAC	2	8	527020	527027	50 %	0 %	25 %	25 %	33595200
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12987	NC_002928	ATGTG	2	10	536672	536681	20 %	40 %	40 %	0 %	33595211
12988	NC_002928	TCG	2	6	536756	536761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595212
12989	NC_002928	GC	3	6	536833	536838	0 %	0 %	50 %	50 %	33595212
12990	NC_002928	CGT	2	6	536850	536855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595212
12991	NC_002928	CTT	2	6	536919	536924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595212
12992	NC_002928	AGT	2	6	536946	536951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595212
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