MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 142491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002927	GT	3	6	123759	123764	0 %	50 %	50 %	0 %	33599113
3002	NC_002927	CAA	2	6	123768	123773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599113
3003	NC_002927	TCC	2	6	123796	123801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33599113
3004	NC_002927	GAG	2	6	123841	123846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599113
3005	NC_002927	CAA	2	6	123855	123860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599113
3006	NC_002927	CAT	2	6	124011	124016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599113
3007	NC_002927	CAA	2	6	124020	124025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599113
3008	NC_002927	TCA	2	6	124049	124054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599113
3009	NC_002927	CGAC	2	8	124136	124143	25 %	0 %	25 %	50 %	33599113
3010	NC_002927	GC	3	6	124261	124266	0 %	0 %	50 %	50 %	33599113
3011	NC_002927	GCG	2	6	124399	124404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599114
3012	NC_002927	GCA	2	6	124417	124422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3013	NC_002927	TGA	2	6	124480	124485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599114
3014	NC_002927	GGC	2	6	124514	124519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599114
3015	NC_002927	ACG	2	6	124581	124586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3016	NC_002927	CGA	2	6	124628	124633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3017	NC_002927	GCG	2	6	124687	124692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599114
3018	NC_002927	ACATCG	2	12	124732	124743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33599114
3019	NC_002927	CACG	2	8	124768	124775	25 %	0 %	25 %	50 %	33599114
3020	NC_002927	GCGG	2	8	124829	124836	0 %	0 %	75 %	25 %	33599114
3021	NC_002927	TCG	2	6	124858	124863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3022	NC_002927	GCC	2	6	124869	124874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599114
3023	NC_002927	GGCC	3	12	124899	124910	0 %	0 %	50 %	50 %	33599114
3024	NC_002927	TCT	2	6	124933	124938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599114
3025	NC_002927	G	6	6	124973	124978	0 %	0 %	100 %	0 %	33599114
3026	NC_002927	CAC	2	6	124985	124990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599114
3027	NC_002927	AGC	2	6	125056	125061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3028	NC_002927	CAC	2	6	125064	125069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599114
3029	NC_002927	CTG	2	6	125103	125108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3030	NC_002927	CGA	2	6	125183	125188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599114
3031	NC_002927	CGG	2	6	125251	125256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599114
3032	NC_002927	GCCG	2	8	125258	125265	0 %	0 %	50 %	50 %	33599114
3033	NC_002927	GC	3	6	125266	125271	0 %	0 %	50 %	50 %	33599114
3034	NC_002927	TCGT	2	8	125286	125293	0 %	50 %	25 %	25 %	33599114
3035	NC_002927	GTGG	2	8	125297	125304	0 %	25 %	75 %	0 %	33599114
3036	NC_002927	ATG	2	6	125337	125342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599114
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3040	NC_002927	TGG	2	6	125524	125529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599114
3041	NC_002927	CGG	2	6	125546	125551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599114
3042	NC_002927	TCGGCC	2	12	125803	125814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33599115
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3044	NC_002927	GTTCC	2	10	125957	125966	0 %	40 %	20 %	40 %	33599115
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3050	NC_002927	GCT	2	6	126260	126265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599115
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3052	NC_002927	GCCG	2	8	126284	126291	0 %	0 %	50 %	50 %	33599115
3053	NC_002927	CGG	2	6	126373	126378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599115
3054	NC_002927	CGC	2	6	126515	126520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599115
3055	NC_002927	AT	3	6	126533	126538	50 %	50 %	0 %	0 %	33599115
3056	NC_002927	CGA	2	6	126596	126601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599115
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3059	NC_002927	GAG	2	6	126711	126716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599115
3060	NC_002927	GTC	2	6	126780	126785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599115
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3062	NC_002927	GGC	2	6	126816	126821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599115
3063	NC_002927	GGT	2	6	126845	126850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599115
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3065	NC_002927	ATT	2	6	126883	126888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33599115
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3069	NC_002927	AATA	2	8	127248	127255	75 %	25 %	0 %	0 %	33599115
3070	NC_002927	A	6	6	127261	127266	100 %	0 %	0 %	0 %	33599115
3071	NC_002927	AGCA	2	8	127413	127420	50 %	0 %	25 %	25 %	33599115
3072	NC_002927	CGC	2	6	127497	127502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599115
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3095	NC_002927	ACGG	2	8	128965	128972	25 %	0 %	50 %	25 %	33599117
3096	NC_002927	TGTA	2	8	128975	128982	25 %	50 %	25 %	0 %	33599117
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3105	NC_002927	GC	4	8	129385	129392	0 %	0 %	50 %	50 %	33599118
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3107	NC_002927	CG	3	6	129449	129454	0 %	0 %	50 %	50 %	33599118
3108	NC_002927	GGCG	2	8	129470	129477	0 %	0 %	75 %	25 %	33599118
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3124	NC_002927	T	6	6	130509	130514	0 %	100 %	0 %	0 %	33599119
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3134	NC_002927	GGGGC	2	10	131083	131092	0 %	0 %	80 %	20 %	33599119
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3156	NC_002927	AGG	2	6	132341	132346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599121
3157	NC_002927	CGG	2	6	132359	132364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599121
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3232	NC_002927	GTC	2	6	136728	136733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599124
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3234	NC_002927	GC	3	6	136779	136784	0 %	0 %	50 %	50 %	33599124
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3244	NC_002927	ATG	2	6	137571	137576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599125
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3246	NC_002927	ATC	2	6	137619	137624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599125
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3248	NC_002927	TCTGG	2	10	137801	137810	0 %	40 %	40 %	20 %	33599126
3249	NC_002927	TCA	2	6	137829	137834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599126
3250	NC_002927	GGA	2	6	137857	137862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599126
3251	NC_002927	GGT	3	9	137914	137922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599126
3252	NC_002927	GGC	2	6	137969	137974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599126
3253	NC_002927	CTGG	2	8	138070	138077	0 %	25 %	50 %	25 %	33599126
3254	NC_002927	CG	3	6	138137	138142	0 %	0 %	50 %	50 %	33599126
3255	NC_002927	GGA	2	6	138146	138151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599126
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3265	NC_002927	GGGC	2	8	138755	138762	0 %	0 %	75 %	25 %	33599126
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3367	NC_002927	GC	3	6	144925	144930	0 %	0 %	50 %	50 %	33599128
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3493	NC_002927	ACG	3	9	151602	151610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599134
3494	NC_002927	TGC	2	6	151660	151665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599134
3495	NC_002927	GTC	2	6	151694	151699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599134
3496	NC_002927	GTC	2	6	151703	151708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599134
3497	NC_002927	TCG	2	6	151803	151808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599134
3498	NC_002927	CCAG	2	8	151846	151853	25 %	0 %	25 %	50 %	33599134
3499	NC_002927	GCC	2	6	151886	151891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599134
3500	NC_002927	GCG	2	6	151899	151904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599134

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