MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus halodurans C-125 chromosome

Total Repeats: 70962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002570	GC	3	6	610	615	0 %	0 %	50 %	50 %	15612564
2	NC_002570	A	7	7	630	636	100 %	0 %	0 %	0 %	15612564
3	NC_002570	CAAA	2	8	671	678	75 %	0 %	0 %	25 %	15612564
4	NC_002570	ATC	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612564
5	NC_002570	ACG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612564
6	NC_002570	TGA	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612564
7	NC_002570	TGA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612564
8	NC_002570	TAA	2	6	910	915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612564
9	NC_002570	GCA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612564
10	NC_002570	TGG	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612564
11	NC_002570	GTC	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612564
12	NC_002570	GAAT	2	8	1147	1154	50 %	25 %	25 %	0 %	15612564
13	NC_002570	TTA	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612564
14	NC_002570	ACA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612564
15	NC_002570	TTC	2	6	1274	1279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612564
16	NC_002570	CCT	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15612564
17	NC_002570	CCA	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612564
18	NC_002570	CGT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612564
19	NC_002570	AGC	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612564
20	NC_002570	CG	3	6	1641	1646	0 %	0 %	50 %	50 %	15612564
21	NC_002570	A	6	6	1668	1673	100 %	0 %	0 %	0 %	15612564
22	NC_002570	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	15612564
23	NC_002570	TATC	2	8	1763	1770	25 %	50 %	0 %	25 %	15612564
24	NC_002570	TCAT	2	8	1839	1846	25 %	50 %	0 %	25 %	15612564
25	NC_002570	A	6	6	1854	1859	100 %	0 %	0 %	0 %	15612564
26	NC_002570	CTT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612564
27	NC_002570	TTG	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612565
28	NC_002570	GAA	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612565
29	NC_002570	AAG	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612565
30	NC_002570	TTC	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612565
31	NC_002570	A	6	6	2361	2366	100 %	0 %	0 %	0 %	15612565
32	NC_002570	GAAATT	2	12	2379	2390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15612565
33	NC_002570	TTC	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612565
34	NC_002570	TTTAA	2	10	2439	2448	40 %	60 %	0 %	0 %	15612565
35	NC_002570	A	6	6	2518	2523	100 %	0 %	0 %	0 %	15612565
36	NC_002570	CAT	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612565
37	NC_002570	AGA	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612565
38	NC_002570	A	7	7	2677	2683	100 %	0 %	0 %	0 %	15612565
39	NC_002570	GAT	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612565
40	NC_002570	CGT	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612565
41	NC_002570	TGAA	2	8	2731	2738	50 %	25 %	25 %	0 %	15612565
42	NC_002570	GCT	2	6	2768	2773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612565
43	NC_002570	A	6	6	2813	2818	100 %	0 %	0 %	0 %	15612565
44	NC_002570	AAG	2	6	2881	2886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612565
45	NC_002570	CAT	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612565
46	NC_002570	GA	3	6	2954	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	15612565
47	NC_002570	GAA	2	6	3078	3083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612565
48	NC_002570	CGATCA	2	12	3197	3208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15612565
49	NC_002570	CAA	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612566
50	NC_002570	TGAT	2	8	3496	3503	25 %	50 %	25 %	0 %	15612566
51	NC_002570	GCTG	2	8	3608	3615	0 %	25 %	50 %	25 %	15612566
52	NC_002570	ATG	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612567
53	NC_002570	ATC	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612567
54	NC_002570	ATTT	2	8	3788	3795	25 %	75 %	0 %	0 %	15612567
55	NC_002570	T	6	6	3793	3798	0 %	100 %	0 %	0 %	15612567
56	NC_002570	TGT	2	6	3913	3918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612567
57	NC_002570	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	15612567
58	NC_002570	AAC	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612567
59	NC_002570	CGT	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612567
60	NC_002570	AGA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612567
61	NC_002570	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15612567
62	NC_002570	TTTA	2	8	4095	4102	25 %	75 %	0 %	0 %	15612567
63	NC_002570	A	6	6	4122	4127	100 %	0 %	0 %	0 %	15612567
64	NC_002570	AGC	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612567
65	NC_002570	ATTC	2	8	4252	4259	25 %	50 %	0 %	25 %	15612567
66	NC_002570	GAA	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612567
67	NC_002570	CCGT	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	15612567
68	NC_002570	AAAG	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	15612567
69	NC_002570	ATT	2	6	4441	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612567
70	NC_002570	GAT	2	6	4460	4465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612567
71	NC_002570	T	6	6	4472	4477	0 %	100 %	0 %	0 %	15612567
72	NC_002570	CAA	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612567
73	NC_002570	GAC	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612567
74	NC_002570	CT	3	6	4533	4538	0 %	50 %	0 %	50 %	15612567
75	NC_002570	ATTGA	2	10	4556	4565	40 %	40 %	20 %	0 %	15612567
76	NC_002570	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612567
77	NC_002570	TGA	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612567
78	NC_002570	ATC	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612567
79	NC_002570	AAG	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612567
80	NC_002570	ATC	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612568
81	NC_002570	TTA	2	6	4939	4944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612568
82	NC_002570	ATCG	2	8	4946	4953	25 %	25 %	25 %	25 %	15612568
83	NC_002570	AAC	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612569
84	NC_002570	CGA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612569
85	NC_002570	TCA	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612569
86	NC_002570	ACA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612569
87	NC_002570	TGGC	2	8	5290	5297	0 %	25 %	50 %	25 %	15612569
88	NC_002570	TGA	2	6	5303	5308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612569
89	NC_002570	ATA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612569
90	NC_002570	AGG	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612569
91	NC_002570	CGG	3	9	5447	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15612569
92	NC_002570	TGG	2	6	5471	5476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612569
93	NC_002570	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612569
94	NC_002570	CGA	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612569
95	NC_002570	CTG	3	9	5584	5592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612569
96	NC_002570	AAC	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612569
97	NC_002570	TAAA	2	8	5725	5732	75 %	25 %	0 %	0 %	15612569
98	NC_002570	GAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612569
99	NC_002570	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	15612569
100	NC_002570	TAA	2	6	5948	5953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612569
101	NC_002570	AAAG	2	8	6048	6055	75 %	0 %	25 %	0 %	15612569
102	NC_002570	AAACGA	2	12	6142	6153	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15612569
103	NC_002570	AGC	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612569
104	NC_002570	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	15612569
105	NC_002570	CT	3	6	6341	6346	0 %	50 %	0 %	50 %	15612569
106	NC_002570	CTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612569
107	NC_002570	CG	3	6	6540	6545	0 %	0 %	50 %	50 %	15612569
108	NC_002570	TGA	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612569
109	NC_002570	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612569
110	NC_002570	TGGA	2	8	6637	6644	25 %	25 %	50 %	0 %	15612569
111	NC_002570	TTC	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612569
112	NC_002570	ACA	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612569
113	NC_002570	AAC	2	6	6884	6889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612569
114	NC_002570	AGA	2	6	6929	6934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612569
115	NC_002570	TGA	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612569
116	NC_002570	CGT	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612569
117	NC_002570	ATCA	2	8	7078	7085	50 %	25 %	0 %	25 %	15612570
118	NC_002570	TCG	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612570
119	NC_002570	ATGA	2	8	7221	7228	50 %	25 %	25 %	0 %	15612570
120	NC_002570	TCG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612570
121	NC_002570	ATC	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
122	NC_002570	TAA	2	6	7481	7486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612570
123	NC_002570	CGAT	2	8	7492	7499	25 %	25 %	25 %	25 %	15612570
124	NC_002570	CCA	2	6	7614	7619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612570
125	NC_002570	GATC	2	8	7780	7787	25 %	25 %	25 %	25 %	15612570
126	NC_002570	CAT	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
127	NC_002570	A	6	6	7885	7890	100 %	0 %	0 %	0 %	15612570
128	NC_002570	A	7	7	7911	7917	100 %	0 %	0 %	0 %	15612570
129	NC_002570	ATGCCA	2	12	7990	8001	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15612570
130	NC_002570	TCA	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
131	NC_002570	TCG	3	9	8147	8155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612570
132	NC_002570	ATC	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
133	NC_002570	AAC	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612570
134	NC_002570	ACAAGC	2	12	8318	8329	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15612570
135	NC_002570	ATT	2	6	8460	8465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612570
136	NC_002570	GAG	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612570
137	NC_002570	CTT	2	6	8475	8480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612570
138	NC_002570	ATG	2	6	8500	8505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612570
139	NC_002570	TGAGGA	2	12	8543	8554	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15612570
140	NC_002570	TCA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
141	NC_002570	TCA	2	6	8591	8596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
142	NC_002570	GAAC	2	8	8671	8678	50 %	0 %	25 %	25 %	15612570
143	NC_002570	CCA	2	6	8717	8722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612570
144	NC_002570	TGC	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612570
145	NC_002570	ATT	2	6	8859	8864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612570
146	NC_002570	GGA	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612570
147	NC_002570	CTT	2	6	8897	8902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612570
148	NC_002570	TCG	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612570
149	NC_002570	AACG	2	8	9020	9027	50 %	0 %	25 %	25 %	15612570
150	NC_002570	AGG	2	6	9034	9039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612570
151	NC_002570	TTG	2	6	9043	9048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612570
152	NC_002570	GAC	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612570
153	NC_002570	ATTG	2	8	9191	9198	25 %	50 %	25 %	0 %	15612570
154	NC_002570	GTA	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612570
155	NC_002570	CAT	3	9	9365	9373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612570
156	NC_002570	AGATGA	2	12	9497	9508	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15612570
157	NC_002570	TCGA	2	8	9510	9517	25 %	25 %	25 %	25 %	15612570
158	NC_002570	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612570
159	NC_002570	GAAGT	2	10	9535	9544	40 %	20 %	40 %	0 %	15612570
160	NC_002570	CTC	2	6	9833	9838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15612571
161	NC_002570	TTTG	2	8	10113	10120	0 %	75 %	25 %	0 %	15612571
162	NC_002570	A	6	6	10135	10140	100 %	0 %	0 %	0 %	15612571
163	NC_002570	TCA	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612571
164	NC_002570	AGA	2	6	10176	10181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612571
165	NC_002570	ATC	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612571
166	NC_002570	TC	3	6	10215	10220	0 %	50 %	0 %	50 %	15612571
167	NC_002570	TA	3	6	10343	10348	50 %	50 %	0 %	0 %	15612571
168	NC_002570	GAAA	2	8	10353	10360	75 %	0 %	25 %	0 %	15612571
169	NC_002570	ATC	2	6	10376	10381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612571
170	NC_002570	CAG	2	6	10439	10444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612571
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172	NC_002570	A	6	6	10502	10507	100 %	0 %	0 %	0 %	15612571
173	NC_002570	GGA	2	6	10605	10610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612571
174	NC_002570	TTCGG	2	10	10683	10692	0 %	40 %	40 %	20 %	15612571
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178	NC_002570	CTT	2	6	10988	10993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612572
179	NC_002570	TTC	3	9	11006	11014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612572
180	NC_002570	CAT	2	6	11026	11031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612572
181	NC_002570	AGT	2	6	11034	11039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612572
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183	NC_002570	TCA	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612572
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188	NC_002570	ATC	2	6	11189	11194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612572
189	NC_002570	CTGCTT	2	12	11208	11219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15612572
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192	NC_002570	TGC	2	6	11290	11295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612572
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197	NC_002570	GAT	2	6	11708	11713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612572
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199	NC_002570	GA	3	6	12286	12291	50 %	0 %	50 %	0 %	15612573
200	NC_002570	GAT	2	6	12321	12326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612573
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250	NC_002570	GTCG	2	8	16093	16100	0 %	25 %	50 %	25 %	15612577
251	NC_002570	AATG	2	8	16110	16117	50 %	25 %	25 %	0 %	15612577
252	NC_002570	G	7	7	16189	16195	0 %	0 %	100 %	0 %	15612577
253	NC_002570	GCT	2	6	16261	16266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612577
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259	NC_002570	ATGGC	2	10	16657	16666	20 %	20 %	40 %	20 %	15612577
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266	NC_002570	CGG	2	6	17037	17042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15612577
267	NC_002570	ATG	2	6	17072	17077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612577
268	NC_002570	AGA	2	6	17085	17090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612577
269	NC_002570	AGG	3	9	17118	17126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612577
270	NC_002570	TGATG	2	10	17238	17247	20 %	40 %	40 %	0 %	15612578
271	NC_002570	AGG	2	6	17253	17258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612578
272	NC_002570	AGC	2	6	17294	17299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612578
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274	NC_002570	GTGC	2	8	17387	17394	0 %	25 %	50 %	25 %	15612579
275	NC_002570	AGT	2	6	17519	17524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612579
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277	NC_002570	GTG	2	6	17577	17582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612579
278	NC_002570	GAA	2	6	17669	17674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612579
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280	NC_002570	AAC	2	6	17698	17703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612579
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282	NC_002570	ATTTG	2	10	17737	17746	20 %	60 %	20 %	0 %	15612579
283	NC_002570	GCC	2	6	17924	17929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15612579
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300	NC_002570	CGG	2	6	19055	19060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15612580
301	NC_002570	AACAT	2	10	19103	19112	60 %	20 %	0 %	20 %	15612580
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382	NC_002570	TGA	2	6	30435	30440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612583
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389	NC_002570	TGTCAT	2	12	30606	30617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15612583
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391	NC_002570	CAA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612583
392	NC_002570	TGT	2	6	30756	30761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612583
393	NC_002570	TTG	2	6	30803	30808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612583
394	NC_002570	ATT	2	6	30880	30885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612583
395	NC_002570	GGA	2	6	30892	30897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15612583
396	NC_002570	AG	3	6	30981	30986	50 %	0 %	50 %	0 %	15612583
397	NC_002570	GA	4	8	30994	31001	50 %	0 %	50 %	0 %	15612583
398	NC_002570	TC	3	6	31045	31050	0 %	50 %	0 %	50 %	15612583
399	NC_002570	AAT	2	6	31093	31098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612583
400	NC_002570	GAAG	2	8	31123	31130	50 %	0 %	50 %	0 %	15612583
401	NC_002570	TCA	2	6	31164	31169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612583
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403	NC_002570	TGA	2	6	31221	31226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612583
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433	NC_002570	CTCC	2	8	32690	32697	0 %	25 %	0 %	75 %	15612584
434	NC_002570	GGTT	2	8	32760	32767	0 %	50 %	50 %	0 %	15612584
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