MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pLeu

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002253	ATA	3	9	385	393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957104
2	NC_002253	CTA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957104
3	NC_002253	GAA	2	6	474	479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957104
4	NC_002253	CTT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957104
5	NC_002253	T	8	8	533	540	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
6	NC_002253	ATCA	2	8	613	620	50 %	25 %	0 %	25 %	10957104
7	NC_002253	TTG	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957104
8	NC_002253	T	8	8	697	704	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
9	NC_002253	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	10957104
10	NC_002253	T	7	7	786	792	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
11	NC_002253	TAAT	2	8	828	835	50 %	50 %	0 %	0 %	10957104
12	NC_002253	TTA	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
13	NC_002253	TCA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957104
14	NC_002253	AGA	2	6	931	936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957104
15	NC_002253	TCT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957104
16	NC_002253	TAT	2	6	1134	1139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
17	NC_002253	GGT	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957104
18	NC_002253	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	10957104
19	NC_002253	ATT	2	6	1168	1173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
20	NC_002253	TA	3	6	1174	1179	50 %	50 %	0 %	0 %	10957104
21	NC_002253	TTA	2	6	1188	1193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
22	NC_002253	A	7	7	1508	1514	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
23	NC_002253	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
24	NC_002253	A	6	6	1530	1535	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
25	NC_002253	TA	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	10957105
26	NC_002253	TTTTA	2	10	1591	1600	20 %	80 %	0 %	0 %	10957105
27	NC_002253	CAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957105
28	NC_002253	GTT	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957105
29	NC_002253	TAG	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957105
30	NC_002253	GTTATG	2	12	1724	1735	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10957105
31	NC_002253	A	6	6	1828	1833	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
32	NC_002253	TCT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957105
33	NC_002253	A	6	6	1899	1904	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
34	NC_002253	GAT	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957105
35	NC_002253	TTATG	2	10	1920	1929	20 %	60 %	20 %	0 %	10957105
36	NC_002253	TTA	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957105
37	NC_002253	TAT	2	6	1953	1958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957105
38	NC_002253	AT	3	6	1975	1980	50 %	50 %	0 %	0 %	10957105
39	NC_002253	A	9	9	1994	2002	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
40	NC_002253	TGT	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957106
41	NC_002253	ATT	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957106
42	NC_002253	TAA	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957106
43	NC_002253	TAA	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957106
44	NC_002253	A	7	7	2543	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
45	NC_002253	TA	3	6	2573	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
46	NC_002253	A	7	7	2582	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
47	NC_002253	T	7	7	2589	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
48	NC_002253	T	6	6	2606	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
49	NC_002253	AAAT	2	8	2637	2644	75 %	25 %	0 %	0 %	10957106
50	NC_002253	T	6	6	2647	2652	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
51	NC_002253	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
52	NC_002253	A	7	7	2674	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
53	NC_002253	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
54	NC_002253	A	6	6	2694	2699	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
55	NC_002253	ATTT	2	8	2704	2711	25 %	75 %	0 %	0 %	10957106
56	NC_002253	TAAT	2	8	2781	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
57	NC_002253	A	9	9	2833	2841	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
58	NC_002253	GATA	2	8	2842	2849	50 %	25 %	25 %	0 %	10957106
59	NC_002253	TA	3	6	2874	2879	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
60	NC_002253	A	9	9	2879	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
61	NC_002253	ATAAA	2	10	2890	2899	80 %	20 %	0 %	0 %	10957106
62	NC_002253	GTT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957107
63	NC_002253	CAAG	2	8	3089	3096	50 %	0 %	25 %	25 %	10957107
64	NC_002253	TCA	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957107
65	NC_002253	T	7	7	3324	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
66	NC_002253	ATA	2	6	3383	3388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
67	NC_002253	T	6	6	3399	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
68	NC_002253	A	7	7	3409	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
69	NC_002253	TGA	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
70	NC_002253	CTA	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957107
71	NC_002253	ATTA	2	8	3502	3509	50 %	50 %	0 %	0 %	10957107
72	NC_002253	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
73	NC_002253	A	6	6	3583	3588	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
74	NC_002253	TTTG	2	8	3589	3596	0 %	75 %	25 %	0 %	10957107
75	NC_002253	CAGG	2	8	3686	3693	25 %	0 %	50 %	25 %	10957107
76	NC_002253	AGA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
77	NC_002253	AAT	2	6	3760	3765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
78	NC_002253	AGA	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
79	NC_002253	ATTA	2	8	3812	3819	50 %	50 %	0 %	0 %	10957107
80	NC_002253	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
81	NC_002253	TAG	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
82	NC_002253	GTA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
83	NC_002253	TTC	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957107
84	NC_002253	CCA	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957107
85	NC_002253	A	6	6	3946	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
86	NC_002253	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
87	NC_002253	AGT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
88	NC_002253	AAG	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
89	NC_002253	ACTTA	2	10	4006	4015	40 %	40 %	0 %	20 %	10957107
90	NC_002253	AGC	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957107
91	NC_002253	TAA	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
92	NC_002253	T	6	6	4108	4113	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
93	NC_002253	A	6	6	4127	4132	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
94	NC_002253	TAA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
95	NC_002253	ACA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957107
96	NC_002253	ATT	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957107
97	NC_002253	A	7	7	4277	4283	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
98	NC_002253	TCT	2	6	4295	4300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957107
99	NC_002253	TAT	2	6	4363	4368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957107
100	NC_002253	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
101	NC_002253	ATT	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957107
102	NC_002253	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
103	NC_002253	A	9	9	4580	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
104	NC_002253	A	8	8	4655	4662	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
105	NC_002253	TATCG	2	10	4664	4673	20 %	40 %	20 %	20 %	10957108
106	NC_002253	TAT	2	6	4677	4682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957108
107	NC_002253	AAG	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957108
108	NC_002253	A	7	7	4741	4747	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
109	NC_002253	T	7	7	4750	4756	0 %	100 %	0 %	0 %	10957108
110	NC_002253	TGG	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957108
111	NC_002253	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957108
112	NC_002253	GGT	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957108
113	NC_002253	AAG	2	6	4886	4891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957108
114	NC_002253	AAC	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957108
115	NC_002253	T	6	6	4962	4967	0 %	100 %	0 %	0 %	10957108
116	NC_002253	A	6	6	5035	5040	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
117	NC_002253	AT	3	6	5049	5054	50 %	50 %	0 %	0 %	10957108
118	NC_002253	ATTT	2	8	5081	5088	25 %	75 %	0 %	0 %	10957108
119	NC_002253	TAAA	2	8	5109	5116	75 %	25 %	0 %	0 %	10957108
120	NC_002253	GAA	3	9	5209	5217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957108
121	NC_002253	TTC	2	6	5244	5249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957108
122	NC_002253	GA	3	6	5266	5271	50 %	0 %	50 %	0 %	10957108
123	NC_002253	AGT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957108
124	NC_002253	A	6	6	5291	5296	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
125	NC_002253	TA	3	6	5322	5327	50 %	50 %	0 %	0 %	10957108
126	NC_002253	TGC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957108
127	NC_002253	AAT	2	6	5347	5352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957108
128	NC_002253	TAT	3	9	5376	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957108
129	NC_002253	ATT	2	6	5405	5410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957108
130	NC_002253	TGA	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957108
131	NC_002253	A	7	7	5472	5478	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
132	NC_002253	ACTTTC	2	12	5557	5568	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10957108
133	NC_002253	GTTA	2	8	5572	5579	25 %	50 %	25 %	0 %	10957108
134	NC_002253	TAA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957108
135	NC_002253	A	7	7	5641	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	10957108
136	NC_002253	AT	3	6	5664	5669	50 %	50 %	0 %	0 %	10957108
137	NC_002253	ATA	2	6	5676	5681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957108
138	NC_002253	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	10957108
139	NC_002253	TTG	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957108
140	NC_002253	TAAT	2	8	5727	5734	50 %	50 %	0 %	0 %	10957108
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142	NC_002253	AT	3	6	5769	5774	50 %	50 %	0 %	0 %	10957109
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.