MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	A	7	7	1464	1470	100 %	0 %	0 %	0 %	11496894
2	NC_001857	ATT	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496894
3	NC_001857	ATG	2	6	1525	1530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
4	NC_001857	AAC	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496894
5	NC_001857	TGA	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
6	NC_001857	GAATT	2	10	1594	1603	40 %	40 %	20 %	0 %	11496894
7	NC_001857	AGCAA	2	10	1605	1614	60 %	0 %	20 %	20 %	11496894
8	NC_001857	TTAAAC	2	12	1641	1652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496894
9	NC_001857	TTA	2	6	1689	1694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496894
10	NC_001857	TAG	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496894
11	NC_001857	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
12	NC_001857	AGA	2	6	1799	1804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
13	NC_001857	A	6	6	1848	1853	100 %	0 %	0 %	0 %	11496894
14	NC_001857	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496894
15	NC_001857	TAA	2	6	1946	1951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496894
16	NC_001857	TA	3	6	1964	1969	50 %	50 %	0 %	0 %	11496894
17	NC_001857	T	7	7	2040	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
18	NC_001857	TTAA	2	8	2049	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	11496895
19	NC_001857	TTTTA	2	10	2081	2090	20 %	80 %	0 %	0 %	11496895
20	NC_001857	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
21	NC_001857	T	7	7	2107	2113	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
22	NC_001857	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
23	NC_001857	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
24	NC_001857	T	6	6	2258	2263	0 %	100 %	0 %	0 %	11496895
25	NC_001857	TTA	2	6	2386	2391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
26	NC_001857	CT	4	8	2424	2431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
27	NC_001857	AGT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496895
28	NC_001857	TAT	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
29	NC_001857	GGCAT	2	10	2454	2463	20 %	20 %	40 %	20 %	11496895
30	NC_001857	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496895
31	NC_001857	CAAA	2	8	2548	2555	75 %	0 %	0 %	25 %	11496895
32	NC_001857	ATTT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	11496895
33	NC_001857	A	6	6	2728	2733	100 %	0 %	0 %	0 %	11496895
34	NC_001857	TAA	2	6	2797	2802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496895
35	NC_001857	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496895
36	NC_001857	TC	3	6	2819	2824	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
37	NC_001857	ATC	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496895
38	NC_001857	TA	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	11496896
39	NC_001857	T	6	6	3063	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
40	NC_001857	TTG	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
41	NC_001857	TAA	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
42	NC_001857	ACT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496896
43	NC_001857	TCT	2	6	3244	3249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
44	NC_001857	CAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496896
45	NC_001857	TCT	3	9	3361	3369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
46	NC_001857	GTA	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496896
47	NC_001857	T	6	6	3436	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
48	NC_001857	AAG	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
49	NC_001857	TTG	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
50	NC_001857	T	6	6	3488	3493	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
51	NC_001857	CAA	2	6	3500	3505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496896
52	NC_001857	ACC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496896
53	NC_001857	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496896
54	NC_001857	AGA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
55	NC_001857	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
56	NC_001857	AAT	2	6	3611	3616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
57	NC_001857	CAAT	2	8	3620	3627	50 %	25 %	0 %	25 %	11496896
58	NC_001857	AGA	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
59	NC_001857	T	6	6	3670	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
60	NC_001857	CTGTAT	2	12	3712	3723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496896
61	NC_001857	TCA	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496896
62	NC_001857	CCAC	2	8	3753	3760	25 %	0 %	0 %	75 %	11496896
63	NC_001857	TCT	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
64	NC_001857	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496896
65	NC_001857	CTT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
66	NC_001857	T	6	6	3994	3999	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
67	NC_001857	T	7	7	4041	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
68	NC_001857	T	8	8	4060	4067	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
69	NC_001857	T	7	7	4126	4132	0 %	100 %	0 %	0 %	11496896
70	NC_001857	TTA	2	6	4139	4144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496896
71	NC_001857	GTG	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496896
72	NC_001857	TCT	3	9	4180	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496896
73	NC_001857	AACA	2	8	4209	4216	75 %	0 %	0 %	25 %	11496896
74	NC_001857	TAA	3	9	4226	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496896
75	NC_001857	TAAAT	2	10	4256	4265	60 %	40 %	0 %	0 %	11496896
76	NC_001857	CAT	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823347
77	NC_001857	T	6	6	4692	4697	0 %	100 %	0 %	0 %	365823347
78	NC_001857	TAG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823347
79	NC_001857	T	6	6	4765	4770	0 %	100 %	0 %	0 %	365823347
80	NC_001857	CTTT	2	8	4841	4848	0 %	75 %	0 %	25 %	365823347
81	NC_001857	AAC	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823347
82	NC_001857	TTAAA	2	10	4903	4912	60 %	40 %	0 %	0 %	365823347
83	NC_001857	A	6	6	4961	4966	100 %	0 %	0 %	0 %	365823347
84	NC_001857	CTT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365823347
85	NC_001857	ATC	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823347
86	NC_001857	AAT	2	6	5080	5085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823347
87	NC_001857	AAGAA	2	10	5098	5107	80 %	0 %	20 %	0 %	365823347
88	NC_001857	TAA	2	6	5108	5113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823347
89	NC_001857	ATA	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823347
90	NC_001857	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496898
91	NC_001857	AAC	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496898
92	NC_001857	GAA	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496898
93	NC_001857	T	7	7	5404	5410	0 %	100 %	0 %	0 %	11496898
94	NC_001857	T	9	9	5517	5525	0 %	100 %	0 %	0 %	11496898
95	NC_001857	ACAATA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496898
96	NC_001857	T	6	6	5601	5606	0 %	100 %	0 %	0 %	11496898
97	NC_001857	A	6	6	5683	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	11496899
98	NC_001857	AGA	2	6	5693	5698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496899
99	NC_001857	A	8	8	5710	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	11496899
100	NC_001857	CAATT	2	10	5756	5765	40 %	40 %	0 %	20 %	11496899
101	NC_001857	ATA	2	6	5772	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496899
102	NC_001857	ACAA	2	8	5800	5807	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
103	NC_001857	T	6	6	5830	5835	0 %	100 %	0 %	0 %	11496899
104	NC_001857	TAAAA	2	10	5837	5846	80 %	20 %	0 %	0 %	11496899
105	NC_001857	TAC	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496899
106	NC_001857	A	8	8	6028	6035	100 %	0 %	0 %	0 %	11496899
107	NC_001857	GCAA	2	8	6068	6075	50 %	0 %	25 %	25 %	11496899
108	NC_001857	CTA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496899
109	NC_001857	ATTGAG	2	12	6117	6128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496899
110	NC_001857	A	9	9	6148	6156	100 %	0 %	0 %	0 %	11496899
111	NC_001857	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496899
112	NC_001857	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496899
113	NC_001857	ACA	2	6	6268	6273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496899
114	NC_001857	ATT	2	6	6345	6350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496899
115	NC_001857	ATG	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496899
116	NC_001857	A	8	8	6401	6408	100 %	0 %	0 %	0 %	11496899
117	NC_001857	CA	3	6	6410	6415	50 %	0 %	0 %	50 %	11496899
118	NC_001857	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496899
119	NC_001857	ATT	3	9	6471	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496899
120	NC_001857	ACAA	2	8	6486	6493	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
121	NC_001857	CTT	2	6	6498	6503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496899
122	NC_001857	A	6	6	6593	6598	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
123	NC_001857	AG	3	6	6608	6613	50 %	0 %	50 %	0 %	11496900
124	NC_001857	GCT	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496900
125	NC_001857	CATTG	2	10	6676	6685	20 %	40 %	20 %	20 %	11496900
126	NC_001857	A	6	6	6719	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
127	NC_001857	TAT	2	6	6760	6765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496900
128	NC_001857	TGA	2	6	6790	6795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496900
129	NC_001857	ATA	3	9	6872	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496900
130	NC_001857	GCA	2	6	6923	6928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496900
131	NC_001857	A	6	6	6928	6933	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
132	NC_001857	A	8	8	6946	6953	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
133	NC_001857	A	6	6	6977	6982	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
134	NC_001857	TTA	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496900
135	NC_001857	GAA	2	6	7059	7064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496900
136	NC_001857	A	6	6	7082	7087	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
137	NC_001857	A	7	7	7114	7120	100 %	0 %	0 %	0 %	11496900
138	NC_001857	CAG	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496900
139	NC_001857	T	8	8	7138	7145	0 %	100 %	0 %	0 %	11496900
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