MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	GTTT	2	8	198	205	0 %	75 %	25 %	0 %	11496795
2	NC_001855	ATT	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
3	NC_001855	GGA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496795
4	NC_001855	A	7	7	276	282	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
5	NC_001855	AAT	2	6	287	292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
6	NC_001855	AAG	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
7	NC_001855	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
8	NC_001855	TA	3	6	339	344	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
9	NC_001855	A	6	6	360	365	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
10	NC_001855	TAAT	2	8	405	412	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
11	NC_001855	A	8	8	489	496	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
12	NC_001855	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
13	NC_001855	CTA	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496795
14	NC_001855	GAA	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
15	NC_001855	GCA	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496795
16	NC_001855	AGA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
17	NC_001855	AATT	2	8	603	610	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
18	NC_001855	TAA	2	6	645	650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
19	NC_001855	ATG	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496795
20	NC_001855	A	7	7	689	695	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
21	NC_001855	CAT	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496795
22	NC_001855	AGATA	2	10	727	736	60 %	20 %	20 %	0 %	11496795
23	NC_001855	TTG	2	6	752	757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496795
24	NC_001855	AAT	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
25	NC_001855	AGAT	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	11496795
26	NC_001855	AGC	2	6	789	794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496795
27	NC_001855	TGAT	2	8	804	811	25 %	50 %	25 %	0 %	11496795
28	NC_001855	CTTT	2	8	840	847	0 %	75 %	0 %	25 %	11496795
29	NC_001855	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	11496795
30	NC_001855	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
31	NC_001855	AG	3	6	895	900	50 %	0 %	50 %	0 %	11496795
32	NC_001855	ATA	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496795
33	NC_001855	AAG	2	6	955	960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
34	NC_001855	GAA	2	6	1019	1024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496795
35	NC_001855	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496795
36	NC_001855	A	6	6	1073	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
37	NC_001855	ATT	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496801
38	NC_001855	TGC	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496801
39	NC_001855	CTCA	2	8	5345	5352	25 %	25 %	0 %	50 %	11496801
40	NC_001855	GTC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496801
41	NC_001855	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
42	NC_001855	TAC	2	6	5473	5478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
43	NC_001855	TTC	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496801
44	NC_001855	ATTA	2	8	5675	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	11496801
45	NC_001855	T	6	6	5704	5709	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
46	NC_001855	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496801
47	NC_001855	GAG	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496801
48	NC_001855	T	7	7	5781	5787	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
49	NC_001855	T	6	6	5801	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
50	NC_001855	ATC	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
51	NC_001855	T	6	6	5875	5880	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
52	NC_001855	TCA	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496801
53	NC_001855	ATT	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496801
54	NC_001855	AAT	2	6	6455	6460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496803
55	NC_001855	AT	3	6	6488	6493	50 %	50 %	0 %	0 %	11496803
56	NC_001855	A	6	6	6512	6517	100 %	0 %	0 %	0 %	11496803
57	NC_001855	T	8	8	6520	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	11496803
58	NC_001855	T	6	6	6629	6634	0 %	100 %	0 %	0 %	11496803
59	NC_001855	TAAT	2	8	6644	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	11496803
60	NC_001855	ATA	2	6	8173	8178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556720
61	NC_001855	T	8	8	8205	8212	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
62	NC_001855	GAA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556720
63	NC_001855	C	6	6	8407	8412	0 %	0 %	0 %	100 %	364556720
64	NC_001855	TAAT	2	8	8421	8428	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
65	NC_001855	T	7	7	8456	8462	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
66	NC_001855	CTG	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556720
67	NC_001855	T	6	6	8486	8491	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
68	NC_001855	AT	4	8	8508	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
69	NC_001855	A	9	9	8606	8614	100 %	0 %	0 %	0 %	364556720
70	NC_001855	ATT	2	6	8638	8643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556720
71	NC_001855	TTA	2	6	8648	8653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556720
72	NC_001855	AGA	2	6	8701	8706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556720
73	NC_001855	T	6	6	8774	8779	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
74	NC_001855	TGA	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556720
75	NC_001855	AT	3	6	8836	8841	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
76	NC_001855	ATAA	2	8	9406	9413	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
77	NC_001855	TAA	3	9	9426	9434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
78	NC_001855	AGA	2	6	9546	9551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496781
79	NC_001855	AAG	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496781
80	NC_001855	TAA	2	6	9663	9668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
81	NC_001855	AAT	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496781
82	NC_001855	A	8	8	9736	9743	100 %	0 %	0 %	0 %	11496781
83	NC_001855	TTA	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
84	NC_001855	T	6	6	9801	9806	0 %	100 %	0 %	0 %	11496781
85	NC_001855	AAC	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496781
86	NC_001855	AG	3	6	9826	9831	50 %	0 %	50 %	0 %	11496781
87	NC_001855	ATT	2	6	9843	9848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
88	NC_001855	ATT	2	6	9905	9910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
89	NC_001855	TAAA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
90	NC_001855	ATT	2	6	9985	9990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496781
91	NC_001855	ATAA	2	8	10294	10301	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
92	NC_001855	ATTT	2	8	10305	10312	25 %	75 %	0 %	0 %	11496787
93	NC_001855	TAA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
94	NC_001855	A	6	6	10401	10406	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
95	NC_001855	TGC	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496787
96	NC_001855	CATATA	2	12	10454	10465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496787
97	NC_001855	TTCTT	2	10	10471	10480	0 %	80 %	0 %	20 %	11496787
98	NC_001855	TAG	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
99	NC_001855	ATAA	2	8	10589	10596	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
100	NC_001855	A	7	7	10601	10607	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
101	NC_001855	T	9	9	10619	10627	0 %	100 %	0 %	0 %	11496787
102	NC_001855	CTT	2	6	10635	10640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496787
103	NC_001855	TGA	2	6	10710	10715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
104	NC_001855	GAT	2	6	10721	10726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
105	NC_001855	TAAA	2	8	10788	10795	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
106	NC_001855	TAA	2	6	10816	10821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
107	NC_001855	GTT	2	6	10823	10828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
108	NC_001855	AGA	2	6	10915	10920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496787
109	NC_001855	GAAG	2	8	10964	10971	50 %	0 %	50 %	0 %	11496787
110	NC_001855	A	6	6	11021	11026	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
111	NC_001855	TGTTT	2	10	11043	11052	0 %	80 %	20 %	0 %	11496787
112	NC_001855	TGA	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
113	NC_001855	TTAAT	2	10	11091	11100	40 %	60 %	0 %	0 %	11496787
114	NC_001855	T	6	6	11132	11137	0 %	100 %	0 %	0 %	11496787
115	NC_001855	GCAT	2	8	11153	11160	25 %	25 %	25 %	25 %	11496787
116	NC_001855	GTT	2	6	11194	11199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
117	NC_001855	CTG	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496787
118	NC_001855	ATAA	2	8	11255	11262	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
119	NC_001855	ATG	2	6	11292	11297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
120	NC_001855	TAA	2	6	11316	11321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
121	NC_001855	A	6	6	11354	11359	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
122	NC_001855	GAT	2	6	11395	11400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
123	NC_001855	ATT	2	6	11429	11434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496787
124	NC_001855	TGAT	2	8	11448	11455	25 %	50 %	25 %	0 %	11496787
125	NC_001855	TAA	2	6	11517	11522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
126	NC_001855	A	6	6	11563	11568	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
127	NC_001855	CAT	2	6	11623	11628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496787
128	NC_001855	TTG	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496787
129	NC_001855	ATG	2	6	11643	11648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
130	NC_001855	ATC	2	6	11675	11680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496787
131	NC_001855	G	6	6	11689	11694	0 %	0 %	100 %	0 %	11496787
132	NC_001855	A	6	6	11715	11720	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
133	NC_001855	TAA	2	6	11724	11729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496787
134	NC_001855	AT	3	6	11788	11793	50 %	50 %	0 %	0 %	11496787
135	NC_001855	TGA	2	6	11836	11841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496787
136	NC_001855	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496787
137	NC_001855	ATT	2	6	11940	11945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496787
138	NC_001855	A	6	6	12605	12610	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
139	NC_001855	TAT	2	6	12613	12618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496820
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