MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-4

Total Repeats: 454

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001854	T	6	6	192	197	0 %	100 %	0 %	0 %	11496764
2	NC_001854	AAT	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496764
3	NC_001854	TA	3	6	227	232	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
4	NC_001854	TA	3	6	235	240	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
5	NC_001854	AAC	2	6	262	267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496764
6	NC_001854	CATG	2	8	285	292	25 %	25 %	25 %	25 %	11496764
7	NC_001854	AAAT	2	8	325	332	75 %	25 %	0 %	0 %	11496764
8	NC_001854	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
9	NC_001854	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
10	NC_001854	CAAAAA	2	12	389	400	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11496764
11	NC_001854	CCT	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496764
12	NC_001854	AT	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
13	NC_001854	CAA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496764
14	NC_001854	A	6	6	429	434	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
15	NC_001854	TAT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
16	NC_001854	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
17	NC_001854	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
18	NC_001854	ACT	3	9	597	605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496764
19	NC_001854	ATGG	2	8	736	743	25 %	25 %	50 %	0 %	11496742
20	NC_001854	AAATT	2	10	782	791	60 %	40 %	0 %	0 %	11496742
21	NC_001854	TAA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496742
22	NC_001854	A	7	7	974	980	100 %	0 %	0 %	0 %	11496742
23	NC_001854	TTG	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496742
24	NC_001854	T	8	8	2569	2576	0 %	100 %	0 %	0 %	11496743
25	NC_001854	AAAT	2	8	2612	2619	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
26	NC_001854	TAA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
27	NC_001854	AGA	2	6	2679	2684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
28	NC_001854	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496743
29	NC_001854	CAAAA	2	10	2701	2710	80 %	0 %	0 %	20 %	11496743
30	NC_001854	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
31	NC_001854	AGA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
32	NC_001854	AGA	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
33	NC_001854	A	9	9	2739	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
34	NC_001854	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
35	NC_001854	AAAT	2	8	2807	2814	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
36	NC_001854	TATAT	2	10	2833	2842	40 %	60 %	0 %	0 %	11496743
37	NC_001854	AAAT	2	8	2904	2911	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
38	NC_001854	ACA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496743
39	NC_001854	A	6	6	3013	3018	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
40	NC_001854	TAAAA	2	10	3054	3063	80 %	20 %	0 %	0 %	11496743
41	NC_001854	AT	3	6	3081	3086	50 %	50 %	0 %	0 %	11496743
42	NC_001854	TAA	2	6	3092	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
43	NC_001854	ATC	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496743
44	NC_001854	AGA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
45	NC_001854	CGCAAT	2	12	3159	3170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	11496743
46	NC_001854	ATC	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496743
47	NC_001854	AAT	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
48	NC_001854	AAT	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
49	NC_001854	GAT	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496743
50	NC_001854	A	6	6	3283	3288	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
51	NC_001854	A	7	7	3294	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
52	NC_001854	CTT	2	6	3302	3307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496743
53	NC_001854	TAG	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496743
54	NC_001854	TTAA	2	8	3334	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	11496743
55	NC_001854	AT	3	6	5150	5155	50 %	50 %	0 %	0 %	11496753
56	NC_001854	ATT	2	6	5217	5222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496753
57	NC_001854	AGA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496753
58	NC_001854	A	6	6	5291	5296	100 %	0 %	0 %	0 %	11496753
59	NC_001854	AAAT	2	8	5310	5317	75 %	25 %	0 %	0 %	11496753
60	NC_001854	A	7	7	5323	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	11496753
61	NC_001854	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496755
62	NC_001854	T	7	7	6651	6657	0 %	100 %	0 %	0 %	11496755
63	NC_001854	CAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496755
64	NC_001854	A	7	7	6691	6697	100 %	0 %	0 %	0 %	11496755
65	NC_001854	AGA	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496755
66	NC_001854	A	7	7	6769	6775	100 %	0 %	0 %	0 %	11496755
67	NC_001854	GAA	2	6	6794	6799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496755
68	NC_001854	AGA	3	9	7338	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
69	NC_001854	A	6	6	7354	7359	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
70	NC_001854	CAA	2	6	7360	7365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
71	NC_001854	GAA	2	6	7366	7371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
72	NC_001854	A	6	6	7381	7386	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
73	NC_001854	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
74	NC_001854	GAA	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
75	NC_001854	A	6	6	7408	7413	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
76	NC_001854	CAA	2	6	7414	7419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
77	NC_001854	GAA	2	6	7420	7425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
78	NC_001854	A	6	6	7435	7440	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
79	NC_001854	CAA	2	6	7441	7446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
80	NC_001854	GAA	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
81	NC_001854	A	6	6	7462	7467	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
82	NC_001854	CAA	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
83	NC_001854	GAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
84	NC_001854	A	6	6	7489	7494	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
85	NC_001854	CAA	2	6	7495	7500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
86	NC_001854	GAA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
87	NC_001854	A	6	6	7516	7521	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
88	NC_001854	CAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
89	NC_001854	GAA	2	6	7528	7533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
90	NC_001854	A	6	6	7543	7548	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
91	NC_001854	CAA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
92	NC_001854	GAA	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
93	NC_001854	A	6	6	7570	7575	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
94	NC_001854	CAA	2	6	7576	7581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
95	NC_001854	GAA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
96	NC_001854	A	6	6	7597	7602	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
97	NC_001854	CAA	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
98	NC_001854	GAA	2	6	7609	7614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
99	NC_001854	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
100	NC_001854	CAA	2	6	7630	7635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
101	NC_001854	GAA	2	6	7636	7641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
102	NC_001854	A	6	6	7651	7656	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
103	NC_001854	CAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
104	NC_001854	GAA	2	6	7663	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
105	NC_001854	A	6	6	7678	7683	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
106	NC_001854	CAA	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
107	NC_001854	GAA	2	6	7690	7695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
108	NC_001854	A	6	6	7705	7710	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
109	NC_001854	CAA	2	6	7711	7716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
110	NC_001854	GAA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
111	NC_001854	A	6	6	7732	7737	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
112	NC_001854	CAA	2	6	7738	7743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
113	NC_001854	GAA	2	6	7744	7749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
114	NC_001854	A	6	6	7759	7764	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
115	NC_001854	CAA	2	6	7765	7770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
116	NC_001854	GAA	2	6	7771	7776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
117	NC_001854	A	6	6	7786	7791	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
118	NC_001854	CAA	2	6	7792	7797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
119	NC_001854	GAA	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
120	NC_001854	A	6	6	7813	7818	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
121	NC_001854	CAA	2	6	7819	7824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
122	NC_001854	GAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
123	NC_001854	A	6	6	7840	7845	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
124	NC_001854	CAA	2	6	7846	7851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
125	NC_001854	GAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
126	NC_001854	A	6	6	7867	7872	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
127	NC_001854	CAA	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
128	NC_001854	GAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
129	NC_001854	A	6	6	7894	7899	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
130	NC_001854	CAA	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
131	NC_001854	GAA	2	6	7906	7911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
132	NC_001854	GAAG	2	8	7914	7921	50 %	0 %	50 %	0 %	11496756
133	NC_001854	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496756
134	NC_001854	A	6	6	7941	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
135	NC_001854	A	6	6	7965	7970	100 %	0 %	0 %	0 %	11496756
136	NC_001854	AT	3	6	8090	8095	50 %	50 %	0 %	0 %	11496756
137	NC_001854	AGA	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496756
138	NC_001854	ATT	2	6	8188	8193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496756
139	NC_001854	ATAA	2	8	8200	8207	75 %	25 %	0 %	0 %	11496756
140	NC_001854	GGA	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496756
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142	NC_001854	TA	4	8	8360	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	11496756
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411	NC_001854	GTTTAA	2	12	24654	24665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11496762
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414	NC_001854	T	6	6	24764	24769	0 %	100 %	0 %	0 %	11496762
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432	NC_001854	TAA	2	6	25909	25914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496763
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