MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	GTTT	2	8	126	133	0 %	75 %	25 %	0 %	11496686
2	NC_001852	TA	3	6	135	140	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
3	NC_001852	ATT	2	6	142	147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
4	NC_001852	GGA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496686
5	NC_001852	A	7	7	204	210	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
6	NC_001852	AAT	2	6	215	220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
7	NC_001852	AAG	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
8	NC_001852	AAG	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
9	NC_001852	TA	3	6	267	272	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
10	NC_001852	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
11	NC_001852	TAAT	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
12	NC_001852	A	8	8	417	424	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
13	NC_001852	AGG	2	6	435	440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496686
14	NC_001852	CTA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496686
15	NC_001852	GAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
16	NC_001852	TGA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496686
17	NC_001852	AGA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
18	NC_001852	TTC	2	6	507	512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496686
19	NC_001852	AATT	2	8	531	538	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
20	NC_001852	TAA	2	6	573	578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
21	NC_001852	ATG	2	6	591	596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496686
22	NC_001852	A	7	7	617	623	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
23	NC_001852	CAT	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496686
24	NC_001852	AGATA	2	10	655	664	60 %	20 %	20 %	0 %	11496686
25	NC_001852	AAT	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
26	NC_001852	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496686
27	NC_001852	TGAT	2	8	729	736	25 %	50 %	25 %	0 %	11496686
28	NC_001852	CTTT	2	8	765	772	0 %	75 %	0 %	25 %	11496686
29	NC_001852	T	6	6	770	775	0 %	100 %	0 %	0 %	11496686
30	NC_001852	TAT	2	6	805	810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
31	NC_001852	AG	3	6	820	825	50 %	0 %	50 %	0 %	11496686
32	NC_001852	ATA	2	6	831	836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
33	NC_001852	TTA	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
34	NC_001852	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
35	NC_001852	AAGA	2	8	940	947	75 %	0 %	25 %	0 %	11496686
36	NC_001852	A	7	7	947	953	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
37	NC_001852	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
38	NC_001852	A	6	6	1001	1006	100 %	0 %	0 %	0 %	11496686
39	NC_001852	AAAT	2	8	1051	1058	75 %	25 %	0 %	0 %	11496666
40	NC_001852	TAAAT	2	10	1067	1076	60 %	40 %	0 %	0 %	11496666
41	NC_001852	ATA	3	9	1084	1092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
42	NC_001852	T	8	8	1099	1106	0 %	100 %	0 %	0 %	11496666
43	NC_001852	CTA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496666
44	NC_001852	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
45	NC_001852	G	6	6	1177	1182	0 %	0 %	100 %	0 %	11496666
46	NC_001852	AAT	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
47	NC_001852	ATA	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
48	NC_001852	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
49	NC_001852	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496666
50	NC_001852	ATT	2	6	1320	1325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
51	NC_001852	TA	3	6	1350	1355	50 %	50 %	0 %	0 %	11496666
52	NC_001852	AAG	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
53	NC_001852	GA	3	6	1377	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	11496666
54	NC_001852	A	6	6	1386	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	11496666
55	NC_001852	AAAT	2	8	1403	1410	75 %	25 %	0 %	0 %	11496666
56	NC_001852	A	6	6	1440	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	11496666
57	NC_001852	AGA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
58	NC_001852	ATT	2	6	1545	1550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
59	NC_001852	GTT	2	6	1626	1631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496666
60	NC_001852	CAA	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496666
61	NC_001852	AAAAC	2	10	1685	1694	80 %	0 %	0 %	20 %	11496666
62	NC_001852	T	6	6	1711	1716	0 %	100 %	0 %	0 %	11496666
63	NC_001852	AGA	2	6	1721	1726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
64	NC_001852	TTA	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
65	NC_001852	ACTAT	2	10	1789	1798	40 %	40 %	0 %	20 %	11496666
66	NC_001852	ACTTA	2	10	1825	1834	40 %	40 %	0 %	20 %	11496666
67	NC_001852	AAG	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
68	NC_001852	TCA	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496666
69	NC_001852	A	8	8	1918	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	11496666
70	NC_001852	A	6	6	5435	5440	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
71	NC_001852	TTA	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
72	NC_001852	AT	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	11496668
73	NC_001852	CA	3	6	5486	5491	50 %	0 %	0 %	50 %	11496668
74	NC_001852	ATG	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496668
75	NC_001852	TAA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496668
76	NC_001852	A	8	8	5531	5538	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
77	NC_001852	ATT	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
78	NC_001852	AATC	2	8	5570	5577	50 %	25 %	0 %	25 %	11496668
79	NC_001852	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496668
80	NC_001852	ATTT	2	8	5595	5602	25 %	75 %	0 %	0 %	11496668
81	NC_001852	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496668
82	NC_001852	TTA	2	6	5635	5640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
83	NC_001852	A	6	6	5648	5653	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
84	NC_001852	T	6	6	5757	5762	0 %	100 %	0 %	0 %	11496668
85	NC_001852	A	7	7	5791	5797	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
86	NC_001852	ATT	2	6	5827	5832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
87	NC_001852	A	6	6	5879	5884	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
88	NC_001852	A	6	6	5919	5924	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
89	NC_001852	A	6	6	5932	5937	100 %	0 %	0 %	0 %	11496668
90	NC_001852	TAT	2	6	5943	5948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
91	NC_001852	GAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496669
92	NC_001852	CTT	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496669
93	NC_001852	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496669
94	NC_001852	TAA	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
95	NC_001852	ATC	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496669
96	NC_001852	AATT	2	8	6104	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	11496669
97	NC_001852	ATTCTT	2	12	6122	6133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11496669
98	NC_001852	TAA	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
99	NC_001852	TGT	2	6	6162	6167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496669
100	NC_001852	AAG	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496669
101	NC_001852	TA	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	11496669
102	NC_001852	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
103	NC_001852	AGA	2	6	6285	6290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496669
104	NC_001852	TAA	2	6	6419	6424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
105	NC_001852	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
106	NC_001852	ATT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
107	NC_001852	TTA	2	6	6535	6540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
108	NC_001852	ATA	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
109	NC_001852	TAC	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496669
110	NC_001852	A	6	6	6668	6673	100 %	0 %	0 %	0 %	11496669
111	NC_001852	A	6	6	6732	6737	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
112	NC_001852	A	6	6	6742	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
113	NC_001852	TAA	3	9	6756	6764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496670
114	NC_001852	GAA	2	6	6803	6808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
115	NC_001852	A	6	6	6815	6820	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
116	NC_001852	A	6	6	6835	6840	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
117	NC_001852	ATAGA	2	10	6852	6861	60 %	20 %	20 %	0 %	11496670
118	NC_001852	GAT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496670
119	NC_001852	AAATA	2	10	6874	6883	80 %	20 %	0 %	0 %	11496670
120	NC_001852	TAGAAA	2	12	6910	6921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496670
121	NC_001852	ATTTT	2	10	6957	6966	20 %	80 %	0 %	0 %	11496670
122	NC_001852	GAA	2	6	7040	7045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
123	NC_001852	TTTA	2	8	7078	7085	25 %	75 %	0 %	0 %	11496670
124	NC_001852	TGA	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496670
125	NC_001852	A	7	7	7100	7106	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
126	NC_001852	TAA	2	6	7125	7130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496670
127	NC_001852	CAC	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496670
128	NC_001852	A	7	7	7224	7230	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
129	NC_001852	TTA	2	6	7242	7247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496670
130	NC_001852	A	6	6	7247	7252	100 %	0 %	0 %	0 %	11496670
131	NC_001852	AGA	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
132	NC_001852	T	6	6	11067	11072	0 %	100 %	0 %	0 %	11496690
133	NC_001852	AATT	2	8	11107	11114	50 %	50 %	0 %	0 %	11496690
134	NC_001852	TTG	2	6	11192	11197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
135	NC_001852	CGA	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496690
136	NC_001852	T	8	8	11239	11246	0 %	100 %	0 %	0 %	11496690
137	NC_001852	TTG	2	6	11266	11271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
138	NC_001852	T	6	6	11318	11323	0 %	100 %	0 %	0 %	11496690
139	NC_001852	TCT	3	9	11400	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496690
140	NC_001852	ATTA	2	8	11480	11487	50 %	50 %	0 %	0 %	11496690
141	NC_001852	TTG	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
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149	NC_001852	TA	3	6	11792	11797	50 %	50 %	0 %	0 %	364556647
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272	NC_001852	AAT	2	6	17768	17773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556650
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