MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp17

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001849	ATT	2	6	220	225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
2	NC_001849	ATT	2	6	233	238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
3	NC_001849	TTA	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
4	NC_001849	AAT	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823333
5	NC_001849	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	365823333
6	NC_001849	AAAT	2	8	324	331	75 %	25 %	0 %	0 %	365823333
7	NC_001849	GTC	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823333
8	NC_001849	ATT	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
9	NC_001849	ATA	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
10	NC_001849	CTA	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496586
11	NC_001849	ATT	3	9	492	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
12	NC_001849	AAAG	2	8	513	520	75 %	0 %	25 %	0 %	11496586
13	NC_001849	GGA	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496586
14	NC_001849	ACA	2	6	646	651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496586
15	NC_001849	ATAC	2	8	686	693	50 %	25 %	0 %	25 %	11496586
16	NC_001849	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
17	NC_001849	TAG	4	12	728	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496586
18	NC_001849	TTA	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
19	NC_001849	ATA	2	6	759	764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
20	NC_001849	ATT	2	6	786	791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
21	NC_001849	A	6	6	802	807	100 %	0 %	0 %	0 %	11496586
22	NC_001849	TAA	2	6	1471	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496585
23	NC_001849	AC	3	6	1486	1491	50 %	0 %	0 %	50 %	11496585
24	NC_001849	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496585
25	NC_001849	A	6	6	1514	1519	100 %	0 %	0 %	0 %	11496585
26	NC_001849	TAG	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496585
27	NC_001849	ATAG	2	8	1569	1576	50 %	25 %	25 %	0 %	11496585
28	NC_001849	ATAGAC	2	12	1605	1616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11496585
29	NC_001849	TTA	2	6	1617	1622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496585
30	NC_001849	T	6	6	1637	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	11496585
31	NC_001849	AAC	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496585
32	NC_001849	TAA	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496585
33	NC_001849	A	7	7	1684	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	11496585
34	NC_001849	TAC	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496585
35	NC_001849	ACT	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496585
36	NC_001849	ATG	2	6	3652	3657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823334
37	NC_001849	TTA	2	6	3667	3672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823334
38	NC_001849	ATA	2	6	3683	3688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823334
39	NC_001849	AGA	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823334
40	NC_001849	A	6	6	3758	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	365823334
41	NC_001849	AAG	2	6	3767	3772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823334
42	NC_001849	A	6	6	3783	3788	100 %	0 %	0 %	0 %	365823334
43	NC_001849	AT	3	6	3793	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	365823334
44	NC_001849	AT	3	6	3802	3807	50 %	50 %	0 %	0 %	365823334
45	NC_001849	AT	3	6	5107	5112	50 %	50 %	0 %	0 %	11496595
46	NC_001849	ATTA	2	8	5173	5180	50 %	50 %	0 %	0 %	11496595
47	NC_001849	TCTA	2	8	5186	5193	25 %	50 %	0 %	25 %	11496595
48	NC_001849	AATC	2	8	5250	5257	50 %	25 %	0 %	25 %	11496595
49	NC_001849	A	7	7	5269	5275	100 %	0 %	0 %	0 %	11496595
50	NC_001849	AATG	2	8	5320	5327	50 %	25 %	25 %	0 %	11496595
51	NC_001849	TCA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496595
52	NC_001849	AT	3	6	5391	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	11496595
53	NC_001849	CAAT	2	8	5435	5442	50 %	25 %	0 %	25 %	11496595
54	NC_001849	T	7	7	5477	5483	0 %	100 %	0 %	0 %	11496595
55	NC_001849	ATA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496595
56	NC_001849	TTA	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496595
57	NC_001849	GAT	2	6	5608	5613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496595
58	NC_001849	GAA	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496595
59	NC_001849	AAGGG	2	10	5670	5679	40 %	0 %	60 %	0 %	11496595
60	NC_001849	TTA	2	6	5717	5722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496595
61	NC_001849	CCA	2	6	5881	5886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496594
62	NC_001849	ATC	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496594
63	NC_001849	TTA	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
64	NC_001849	CAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496594
65	NC_001849	TGC	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496594
66	NC_001849	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
67	NC_001849	CAA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496594
68	NC_001849	ATA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
69	NC_001849	T	7	7	6070	6076	0 %	100 %	0 %	0 %	11496594
70	NC_001849	TGT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496594
71	NC_001849	TAA	2	6	6130	6135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
72	NC_001849	ACA	2	6	6136	6141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496594
73	NC_001849	TTA	2	6	6194	6199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
74	NC_001849	CTAA	2	8	6241	6248	50 %	25 %	0 %	25 %	11496594
75	NC_001849	AAT	2	6	6323	6328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
76	NC_001849	A	8	8	6406	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	11496594
77	NC_001849	AAAAT	2	10	6418	6427	80 %	20 %	0 %	0 %	11496594
78	NC_001849	AAAT	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	11496594
79	NC_001849	AT	3	6	7834	7839	50 %	50 %	0 %	0 %	11496592
80	NC_001849	AGA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
81	NC_001849	A	6	6	7884	7889	100 %	0 %	0 %	0 %	11496592
82	NC_001849	AGA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
83	NC_001849	AGA	2	6	7974	7979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
84	NC_001849	GAAA	2	8	8003	8010	75 %	0 %	25 %	0 %	11496592
85	NC_001849	CAATT	2	10	8011	8020	40 %	40 %	0 %	20 %	11496592
86	NC_001849	A	8	8	8036	8043	100 %	0 %	0 %	0 %	11496592
87	NC_001849	A	6	6	8087	8092	100 %	0 %	0 %	0 %	11496592
88	NC_001849	GATAA	2	10	8258	8267	60 %	20 %	20 %	0 %	11496591
89	NC_001849	ATA	2	6	8270	8275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
90	NC_001849	A	6	6	8281	8286	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
91	NC_001849	TAA	2	6	8305	8310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
92	NC_001849	AGA	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496591
93	NC_001849	A	7	7	8346	8352	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
94	NC_001849	A	7	7	8408	8414	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
95	NC_001849	ACAA	2	8	8466	8473	75 %	0 %	0 %	25 %	11496591
96	NC_001849	ATA	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
97	NC_001849	TAA	2	6	8530	8535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
98	NC_001849	ATA	2	6	8550	8555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
99	NC_001849	A	7	7	8555	8561	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
100	NC_001849	ATCA	2	8	8563	8570	50 %	25 %	0 %	25 %	11496591
101	NC_001849	AT	3	6	8586	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
102	NC_001849	TAA	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
103	NC_001849	TA	3	6	8666	8671	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
104	NC_001849	CAAAA	2	10	8672	8681	80 %	0 %	0 %	20 %	11496591
105	NC_001849	ATT	2	6	8705	8710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496591
106	NC_001849	TAA	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
107	NC_001849	A	7	7	8753	8759	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
108	NC_001849	T	6	6	8770	8775	0 %	100 %	0 %	0 %	11496591
109	NC_001849	CAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496591
110	NC_001849	AAT	2	6	8804	8809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
111	NC_001849	A	7	7	8910	8916	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
112	NC_001849	ATAA	2	8	8927	8934	75 %	25 %	0 %	0 %	11496591
113	NC_001849	AT	3	6	8950	8955	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
114	NC_001849	TAG	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496591
115	NC_001849	A	6	6	8988	8993	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
116	NC_001849	CAA	2	6	9022	9027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496591
117	NC_001849	A	6	6	9030	9035	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
118	NC_001849	TA	3	6	9038	9043	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
119	NC_001849	GAA	2	6	9086	9091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496591
120	NC_001849	A	7	7	9149	9155	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
121	NC_001849	GAT	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496591
122	NC_001849	A	6	6	9210	9215	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
123	NC_001849	A	7	7	9221	9227	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
124	NC_001849	TAAA	2	8	9234	9241	75 %	25 %	0 %	0 %	11496591
125	NC_001849	A	7	7	9247	9253	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
126	NC_001849	ATT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496591
127	NC_001849	A	6	6	9303	9308	100 %	0 %	0 %	0 %	11496591
128	NC_001849	AGTA	2	8	9310	9317	50 %	25 %	25 %	0 %	11496591
129	NC_001849	T	6	6	9321	9326	0 %	100 %	0 %	0 %	11496591
130	NC_001849	AAAATT	2	12	9356	9367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
131	NC_001849	AATT	2	8	9374	9381	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
132	NC_001849	T	8	8	9598	9605	0 %	100 %	0 %	0 %	365823335
133	NC_001849	AT	3	6	9611	9616	50 %	50 %	0 %	0 %	365823335
134	NC_001849	GAA	2	6	9655	9660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823335
135	NC_001849	TAT	3	9	9674	9682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
136	NC_001849	T	6	6	9723	9728	0 %	100 %	0 %	0 %	365823335
137	NC_001849	AT	3	6	9757	9762	50 %	50 %	0 %	0 %	365823335
138	NC_001849	ATCT	2	8	9786	9793	25 %	50 %	0 %	25 %	365823335
139	NC_001849	TTAT	2	8	9805	9812	25 %	75 %	0 %	0 %	365823335
140	NC_001849	TAA	2	6	9834	9839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823335
141	NC_001849	A	6	6	9838	9843	100 %	0 %	0 %	0 %	365823335
142	NC_001849	ATA	2	6	9857	9862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823335
143	NC_001849	TTTC	2	8	9891	9898	0 %	75 %	0 %	25 %	365823335
144	NC_001849	ATT	2	6	9910	9915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
145	NC_001849	ATT	2	6	9979	9984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
146	NC_001849	T	6	6	10995	11000	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
147	NC_001849	T	6	6	11020	11025	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
148	NC_001849	TAG	2	6	11043	11048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496588
149	NC_001849	TGT	3	9	11051	11059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496588
150	NC_001849	TTA	2	6	11108	11113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
151	NC_001849	T	9	9	11117	11125	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
152	NC_001849	ATT	2	6	11162	11167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
153	NC_001849	TCT	2	6	11183	11188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496588
154	NC_001849	T	6	6	11212	11217	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
155	NC_001849	ATA	2	6	11242	11247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496588
156	NC_001849	GTTTT	2	10	11264	11273	0 %	80 %	20 %	0 %	11496588
157	NC_001849	TCG	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496588
158	NC_001849	ATT	2	6	11303	11308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
159	NC_001849	T	6	6	11328	11333	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
160	NC_001849	TAA	2	6	11349	11354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496588
161	NC_001849	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	11496588
162	NC_001849	A	6	6	11518	11523	100 %	0 %	0 %	0 %	11496588
163	NC_001849	ATTT	2	8	11539	11546	25 %	75 %	0 %	0 %	11496588
164	NC_001849	AAAG	2	8	11581	11588	75 %	0 %	25 %	0 %	11496588
165	NC_001849	A	7	7	13342	13348	100 %	0 %	0 %	0 %	11496587
166	NC_001849	GGT	2	6	13369	13374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496587
167	NC_001849	TTAT	2	8	13410	13417	25 %	75 %	0 %	0 %	11496587
168	NC_001849	A	7	7	13425	13431	100 %	0 %	0 %	0 %	11496587
169	NC_001849	AGCA	2	8	13457	13464	50 %	0 %	25 %	25 %	11496587
170	NC_001849	TTC	2	6	13467	13472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496587
171	NC_001849	GAA	2	6	13527	13532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
172	NC_001849	GATG	2	8	13533	13540	25 %	25 %	50 %	0 %	11496587
173	NC_001849	AGT	2	6	13548	13553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496587
174	NC_001849	A	7	7	13565	13571	100 %	0 %	0 %	0 %	11496587
175	NC_001849	TG	3	6	13588	13593	0 %	50 %	50 %	0 %	11496587
176	NC_001849	AGA	2	6	13609	13614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
177	NC_001849	GAT	2	6	13654	13659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496587
178	NC_001849	TTTG	2	8	13661	13668	0 %	75 %	25 %	0 %	11496587
179	NC_001849	GAA	2	6	13736	13741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
180	NC_001849	TG	3	6	13754	13759	0 %	50 %	50 %	0 %	11496587
181	NC_001849	TTA	2	6	13763	13768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
182	NC_001849	AGA	2	6	13818	13823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
183	NC_001849	A	6	6	13851	13856	100 %	0 %	0 %	0 %	11496587
184	NC_001849	ATT	2	6	13873	13878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
185	NC_001849	TAA	2	6	13890	13895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496587
186	NC_001849	TA	3	6	13994	13999	50 %	50 %	0 %	0 %	11496587
187	NC_001849	ATT	2	6	14015	14020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
188	NC_001849	AGA	2	6	14096	14101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496589
189	NC_001849	ATT	2	6	14103	14108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496589
190	NC_001849	ATG	2	6	14149	14154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496589
191	NC_001849	TTA	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496589
192	NC_001849	AT	3	6	14315	14320	50 %	50 %	0 %	0 %	11496589
193	NC_001849	A	6	6	14331	14336	100 %	0 %	0 %	0 %	11496589
194	NC_001849	TAA	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496589
195	NC_001849	TAA	2	6	15763	15768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823336
196	NC_001849	A	6	6	15767	15772	100 %	0 %	0 %	0 %	365823336
197	NC_001849	TAG	2	6	15837	15842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823336
198	NC_001849	TTG	2	6	15848	15853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365823336
199	NC_001849	CAAT	2	8	15873	15880	50 %	25 %	0 %	25 %	365823336
200	NC_001849	ATTG	2	8	15901	15908	25 %	50 %	25 %	0 %	11496597
201	NC_001849	TAA	2	6	15930	15935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496597
202	NC_001849	AT	3	6	15936	15941	50 %	50 %	0 %	0 %	11496597
203	NC_001849	TTA	3	9	15947	15955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496597
204	NC_001849	TAAT	2	8	15957	15964	50 %	50 %	0 %	0 %	11496597
205	NC_001849	A	6	6	15969	15974	100 %	0 %	0 %	0 %	11496597
206	NC_001849	TAA	3	9	15994	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496597
207	NC_001849	A	7	7	16001	16007	100 %	0 %	0 %	0 %	11496597
208	NC_001849	T	6	6	16018	16023	0 %	100 %	0 %	0 %	11496597
209	NC_001849	AT	3	6	16072	16077	50 %	50 %	0 %	0 %	11496597
210	NC_001849	AC	3	6	16079	16084	50 %	0 %	0 %	50 %	11496597
211	NC_001849	ATT	2	6	16106	16111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.