MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp5

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000957	AAC	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
2	NC_000957	AGAAAT	2	12	290	301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	364556595
3	NC_000957	CATG	2	8	306	313	25 %	25 %	25 %	25 %	364556595
4	NC_000957	CAA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
5	NC_000957	AAAT	2	8	346	353	75 %	25 %	0 %	0 %	364556595
6	NC_000957	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556595
7	NC_000957	A	6	6	376	381	100 %	0 %	0 %	0 %	364556595
8	NC_000957	CAAAAA	2	12	410	421	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	364556595
9	NC_000957	CCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	364556595
10	NC_000957	AT	3	6	436	441	50 %	50 %	0 %	0 %	364556595
11	NC_000957	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
12	NC_000957	A	6	6	450	455	100 %	0 %	0 %	0 %	364556595
13	NC_000957	A	6	6	553	558	100 %	0 %	0 %	0 %	364556595
14	NC_000957	TAA	2	6	571	576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556595
15	NC_000957	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	364556595
16	NC_000957	TAC	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556595
17	NC_000957	TAA	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
18	NC_000957	AC	3	6	820	825	50 %	0 %	0 %	50 %	11497446
19	NC_000957	TAGA	2	8	901	908	50 %	25 %	25 %	0 %	11497446
20	NC_000957	ATAGAC	2	12	936	947	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497446
21	NC_000957	TAA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
22	NC_000957	TAA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
23	NC_000957	A	7	7	1015	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	11497446
24	NC_000957	TAC	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497446
25	NC_000957	ACT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497446
26	NC_000957	AAT	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497451
27	NC_000957	AAATT	2	10	1254	1263	60 %	40 %	0 %	0 %	11497451
28	NC_000957	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497451
29	NC_000957	A	7	7	1446	1452	100 %	0 %	0 %	0 %	11497451
30	NC_000957	TTG	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497451
31	NC_000957	ACA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
32	NC_000957	TAA	2	6	2189	2194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
33	NC_000957	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
34	NC_000957	AAACA	2	10	2240	2249	80 %	0 %	0 %	20 %	11497447
35	NC_000957	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
36	NC_000957	A	6	6	2303	2308	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
37	NC_000957	CAA	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
38	NC_000957	ACT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497447
39	NC_000957	TTA	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
40	NC_000957	A	6	6	2448	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
41	NC_000957	ATAAA	2	10	2464	2473	80 %	20 %	0 %	0 %	11497447
42	NC_000957	A	8	8	2488	2495	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
43	NC_000957	GAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
44	NC_000957	CAA	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
45	NC_000957	TAA	6	18	2579	2596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
46	NC_000957	AGA	2	6	2603	2608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
47	NC_000957	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
48	NC_000957	CAA	2	6	2654	2659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
49	NC_000957	TTC	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497447
50	NC_000957	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
51	NC_000957	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
52	NC_000957	A	6	6	2768	2773	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
53	NC_000957	CTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497447
54	NC_000957	A	9	9	2805	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
55	NC_000957	AGA	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
56	NC_000957	AAAT	2	8	2890	2897	75 %	25 %	0 %	0 %	11497447
57	NC_000957	A	6	6	2902	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
58	NC_000957	TAT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
59	NC_000957	ACA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
60	NC_000957	GAAA	2	8	3003	3010	75 %	0 %	25 %	0 %	11497447
61	NC_000957	A	7	7	3008	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
62	NC_000957	CAA	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
63	NC_000957	AAC	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
64	NC_000957	A	7	7	3080	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
65	NC_000957	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
66	NC_000957	A	9	9	3139	3147	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
67	NC_000957	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
68	NC_000957	AT	3	6	3171	3176	50 %	50 %	0 %	0 %	11497447
69	NC_000957	ATA	2	6	3195	3200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
70	NC_000957	A	6	6	3200	3205	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
71	NC_000957	A	6	6	3240	3245	100 %	0 %	0 %	0 %	11497447
72	NC_000957	GTT	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497447
73	NC_000957	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
74	NC_000957	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
75	NC_000957	ATG	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
76	NC_000957	A	10	10	3492	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
77	NC_000957	A	6	6	3631	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
78	NC_000957	TAA	3	9	3660	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
79	NC_000957	GTA	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
80	NC_000957	TCA	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497448
81	NC_000957	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497448
82	NC_000957	AGG	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497448
83	NC_000957	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
84	NC_000957	A	9	9	3843	3851	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
85	NC_000957	TAT	2	6	3882	3887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
86	NC_000957	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
87	NC_000957	A	8	8	3939	3946	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
88	NC_000957	A	8	8	4011	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
89	NC_000957	ATTTT	2	10	4128	4137	20 %	80 %	0 %	0 %	11497448
90	NC_000957	T	7	7	4134	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497448
91	NC_000957	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	11497448
92	NC_000957	A	8	8	4156	4163	100 %	0 %	0 %	0 %	11497448
93	NC_000957	TAT	2	6	4164	4169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
94	NC_000957	ATT	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
95	NC_000957	GAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497448
96	NC_000957	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497448
97	NC_000957	TAG	2	6	4259	4264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
98	NC_000957	GAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497448
99	NC_000957	ATA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
100	NC_000957	AAT	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
101	NC_000957	A	7	7	4450	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	11497449
102	NC_000957	TTAT	2	8	4458	4465	25 %	75 %	0 %	0 %	11497449
103	NC_000957	ATG	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449
104	NC_000957	AATA	2	8	4510	4517	75 %	25 %	0 %	0 %	11497449
105	NC_000957	T	9	9	4555	4563	0 %	100 %	0 %	0 %	11497449
106	NC_000957	A	6	6	4575	4580	100 %	0 %	0 %	0 %	11497449
107	NC_000957	TAAAG	2	10	4614	4623	60 %	20 %	20 %	0 %	11497449
108	NC_000957	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449
109	NC_000957	T	7	7	4686	4692	0 %	100 %	0 %	0 %	11497449
110	NC_000957	TGA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.