MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-7

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000952	GT	3	6	65	70	0 %	50 %	50 %	0 %	11497267
2	NC_000952	AGATA	2	10	94	103	60 %	20 %	20 %	0 %	11497267
3	NC_000952	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	11497267
4	NC_000952	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	11497267
5	NC_000952	TA	3	6	146	151	50 %	50 %	0 %	0 %	11497267
6	NC_000952	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497267
7	NC_000952	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
8	NC_000952	AAC	2	6	342	347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
9	NC_000952	CAA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
10	NC_000952	AT	3	6	503	508	50 %	50 %	0 %	0 %	11497267
11	NC_000952	ATTT	3	12	572	583	25 %	75 %	0 %	0 %	11497267
12	NC_000952	TAGAAA	2	12	597	608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497267
13	NC_000952	T	6	6	628	633	0 %	100 %	0 %	0 %	11497267
14	NC_000952	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
15	NC_000952	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497267
16	NC_000952	AAT	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497267
17	NC_000952	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497267
18	NC_000952	T	6	6	748	753	0 %	100 %	0 %	0 %	11497267
19	NC_000952	AAT	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497267
20	NC_000952	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
21	NC_000952	AGG	2	6	930	935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497267
22	NC_000952	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	11497267
23	NC_000952	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497267
24	NC_000952	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
25	NC_000952	GAA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497267
26	NC_000952	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497267
27	NC_000952	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
28	NC_000952	AGA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
29	NC_000952	AGA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
30	NC_000952	AGA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
31	NC_000952	GCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497268
32	NC_000952	GTTC	2	8	1676	1683	0 %	50 %	25 %	25 %	11497268
33	NC_000952	GA	3	6	1738	1743	50 %	0 %	50 %	0 %	11497268
34	NC_000952	ATTAA	2	10	1779	1788	60 %	40 %	0 %	0 %	11497268
35	NC_000952	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	11497268
36	NC_000952	TTC	3	9	1808	1816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497268
37	NC_000952	AGA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
38	NC_000952	ATAC	2	8	1927	1934	50 %	25 %	0 %	25 %	11497268
39	NC_000952	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497269
40	NC_000952	T	6	6	2140	2145	0 %	100 %	0 %	0 %	11497269
41	NC_000952	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497269
42	NC_000952	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497269
43	NC_000952	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497269
44	NC_000952	GT	3	6	2298	2303	0 %	50 %	50 %	0 %	11497269
45	NC_000952	AAGA	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	11497269
46	NC_000952	TAAAT	2	10	2414	2423	60 %	40 %	0 %	0 %	11497269
47	NC_000952	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	11497269
48	NC_000952	ATTT	2	8	2515	2522	25 %	75 %	0 %	0 %	11497269
49	NC_000952	TGCT	2	8	2527	2534	0 %	50 %	25 %	25 %	11497269
50	NC_000952	TAA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497269
51	NC_000952	GCT	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497270
52	NC_000952	GCAA	2	8	2675	2682	50 %	0 %	25 %	25 %	11497270
53	NC_000952	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497270
54	NC_000952	AGT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497270
55	NC_000952	TA	3	6	2963	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	11497270
56	NC_000952	CTGATA	2	12	2983	2994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497270
57	NC_000952	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	11497270
58	NC_000952	GTAT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	25 %	0 %	11497270
59	NC_000952	ATAA	2	8	3120	3127	75 %	25 %	0 %	0 %	11497270
60	NC_000952	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497270
61	NC_000952	CCA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497270
62	NC_000952	AT	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	11497270
63	NC_000952	CAAT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	0 %	25 %	11497270
64	NC_000952	TGG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497270
65	NC_000952	TAAA	2	8	3361	3368	75 %	25 %	0 %	0 %	11497271
66	NC_000952	AAG	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497271
67	NC_000952	T	6	6	3500	3505	0 %	100 %	0 %	0 %	11497271
68	NC_000952	ATC	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497271
69	NC_000952	TGG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497271
70	NC_000952	CTA	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497271
71	NC_000952	AAT	2	6	3725	3730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
72	NC_000952	TAA	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
73	NC_000952	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	11497271
74	NC_000952	TAA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
75	NC_000952	ATT	2	6	3967	3972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
76	NC_000952	TGA	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
77	NC_000952	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
78	NC_000952	TAT	2	6	4030	4035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
79	NC_000952	A	6	6	4092	4097	100 %	0 %	0 %	0 %	11497248
80	NC_000952	ACA	2	6	4133	4138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497248
81	NC_000952	ATT	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
82	NC_000952	AT	3	6	4270	4275	50 %	50 %	0 %	0 %	11497248
83	NC_000952	TAA	3	9	4285	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497248
84	NC_000952	AGT	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
85	NC_000952	ATT	2	6	4337	4342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
86	NC_000952	TTA	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
87	NC_000952	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	11497248
88	NC_000952	GCT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497248
89	NC_000952	AGA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497248
90	NC_000952	GTG	2	6	4473	4478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497248
91	NC_000952	A	6	6	4506	4511	100 %	0 %	0 %	0 %	11497248
92	NC_000952	CGA	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
93	NC_000952	GAT	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
94	NC_000952	GCA	3	9	4613	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
95	NC_000952	GCA	2	6	4628	4633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
96	NC_000952	AGT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
97	NC_000952	TAA	2	6	4684	4689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497248
98	NC_000952	AGA	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497248
99	NC_000952	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
100	NC_000952	AGTA	2	8	4781	4788	50 %	25 %	25 %	0 %	11497248
101	NC_000952	CTAC	2	8	4793	4800	25 %	25 %	0 %	50 %	11497248
102	NC_000952	TCAT	2	8	4840	4847	25 %	50 %	0 %	25 %	11497248
103	NC_000952	CTA	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497248
104	NC_000952	GAA	3	9	4980	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497249
105	NC_000952	GTT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497249
106	NC_000952	GAATTT	2	12	5202	5213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497249
107	NC_000952	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	11497249
108	NC_000952	TGAACT	2	12	5240	5251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497249
109	NC_000952	ATT	2	6	5254	5259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497249
110	NC_000952	TAG	2	6	5264	5269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497249
111	NC_000952	GAA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497249
112	NC_000952	GGC	2	6	5286	5291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497249
113	NC_000952	TG	3	6	5379	5384	0 %	50 %	50 %	0 %	11497249
114	NC_000952	AATG	2	8	5395	5402	50 %	25 %	25 %	0 %	11497249
115	NC_000952	TGT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497250
116	NC_000952	TTC	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497250
117	NC_000952	AG	3	6	5520	5525	50 %	0 %	50 %	0 %	11497250
118	NC_000952	TTA	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497250
119	NC_000952	ATTTA	2	10	5694	5703	40 %	60 %	0 %	0 %	11497250
120	NC_000952	TGG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497251
121	NC_000952	AT	3	6	5913	5918	50 %	50 %	0 %	0 %	11497251
122	NC_000952	AAT	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497251
123	NC_000952	TA	3	6	5929	5934	50 %	50 %	0 %	0 %	11497251
124	NC_000952	TAT	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497251
125	NC_000952	AAGT	2	8	6060	6067	50 %	25 %	25 %	0 %	11497251
126	NC_000952	GTA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497251
127	NC_000952	GCA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497251
128	NC_000952	TTG	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497251
129	NC_000952	AAT	2	6	6228	6233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497252
130	NC_000952	ATC	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497252
131	NC_000952	GCT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497252
132	NC_000952	ATA	2	6	6303	6308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497252
133	NC_000952	AT	4	8	6405	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	11497252
134	NC_000952	AT	3	6	6542	6547	50 %	50 %	0 %	0 %	11497252
135	NC_000952	TTA	2	6	6601	6606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497252
136	NC_000952	AGG	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497252
137	NC_000952	TAG	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497272
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139	NC_000952	TAA	2	6	6810	6815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497272
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274	NC_000952	TAA	2	6	12541	12546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497253
275	NC_000952	AT	3	6	12549	12554	50 %	50 %	0 %	0 %	11497253
276	NC_000952	TTG	2	6	12558	12563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497253
277	NC_000952	TGA	2	6	12571	12576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497253
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280	NC_000952	TAA	2	6	12744	12749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497253
281	NC_000952	ACT	2	6	12758	12763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497253
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283	NC_000952	AT	3	6	12783	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	11497253
284	NC_000952	T	8	8	12791	12798	0 %	100 %	0 %	0 %	11497253
285	NC_000952	GAC	2	6	12937	12942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497254
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289	NC_000952	TAAT	2	8	13001	13008	50 %	50 %	0 %	0 %	11497254
290	NC_000952	T	7	7	13021	13027	0 %	100 %	0 %	0 %	11497254
291	NC_000952	TGG	2	6	13041	13046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497254
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391	NC_000952	AAG	2	6	17360	17365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497262
392	NC_000952	CTAAAT	2	12	17381	17392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11497262
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398	NC_000952	A	6	6	17577	17582	100 %	0 %	0 %	0 %	11497262
399	NC_000952	T	6	6	17608	17613	0 %	100 %	0 %	0 %	11497262
400	NC_000952	GCG	2	6	17615	17620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497262
401	NC_000952	TGC	2	6	17715	17720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497280
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