MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia hermsii DAH

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187145	GA	3	6	31	36	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
2	NT_187145	AG	3	6	37	42	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
3	NT_187145	AAAAG	2	10	55	64	80 %	0 %	20 %	0 %	426202380
4	NT_187145	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202380
5	NT_187145	TAA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202380
6	NT_187145	AT	3	6	212	217	50 %	50 %	0 %	0 %	426202380
7	NT_187145	AGTT	2	8	228	235	25 %	50 %	25 %	0 %	426202380
8	NT_187145	GATT	2	8	256	263	25 %	50 %	25 %	0 %	426202380
9	NT_187145	TGATT	2	10	265	274	20 %	60 %	20 %	0 %	426202380
10	NT_187145	GAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202380
11	NT_187145	AG	3	6	382	387	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
12	NT_187145	T	7	7	460	466	0 %	100 %	0 %	0 %	426202380
13	NT_187145	GATA	2	8	479	486	50 %	25 %	25 %	0 %	426202380
14	NT_187145	ATA	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187145	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187145	A	6	6	609	614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187145	A	7	7	623	629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187145	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187145	GGTA	2	8	710	717	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187145	TA	4	8	805	812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187145	TAAT	2	8	869	876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187145	TA	3	6	978	983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187145	TTA	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187145	ATA	2	6	1011	1016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187145	A	6	6	1016	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187145	ATT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202381
27	NT_187145	TTTG	2	8	1087	1094	0 %	75 %	25 %	0 %	426202381
28	NT_187145	TA	3	6	1219	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
29	NT_187145	AGG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202381
30	NT_187145	GTA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
31	NT_187145	GTTT	2	8	1374	1381	0 %	75 %	25 %	0 %	426202381
32	NT_187145	TA	3	6	1408	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
33	NT_187145	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
34	NT_187145	AT	3	6	1484	1489	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
35	NT_187145	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202381
36	NT_187145	TGC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202381
37	NT_187145	GAAA	2	8	1586	1593	75 %	0 %	25 %	0 %	426202381
38	NT_187145	CCT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NT_187145	AT	3	6	1626	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187145	TAT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187145	CAT	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187145	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187145	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187145	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187145	TTAAA	2	10	1732	1741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187145	TTTAA	2	10	1764	1773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187145	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187145	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187145	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187145	AGT	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187145	ATTT	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187145	TAG	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187145	ATGT	2	8	1995	2002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187145	TGCTT	2	10	2006	2015	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NT_187145	ATA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187145	TA	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187145	TA	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187145	TTA	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187145	ATT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187145	TAAT	2	8	2112	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187145	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187145	TAT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187145	T	6	6	2215	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187145	ATT	2	6	2227	2232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187145	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187145	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187145	ATT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187145	T	7	7	2289	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187145	T	8	8	2300	2307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187145	ATGT	2	8	2341	2348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187145	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187145	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187145	GAA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
74	NT_187145	TGA	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
75	NT_187145	TTTATT	2	12	2404	2415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	426202382
76	NT_187145	TAA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
77	NT_187145	A	6	6	2512	2517	100 %	0 %	0 %	0 %	426202382
78	NT_187145	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
79	NT_187145	AAG	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
80	NT_187145	TGA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
81	NT_187145	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
82	NT_187145	GTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
83	NT_187145	GCT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
84	NT_187145	AAG	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
85	NT_187145	TGA	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
86	NT_187145	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202382
87	NT_187145	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
88	NT_187145	AAAG	2	8	2839	2846	75 %	0 %	25 %	0 %	426202382
89	NT_187145	GAA	2	6	2873	2878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
90	NT_187145	GTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
91	NT_187145	GCT	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
92	NT_187145	GCT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
93	NT_187145	TA	4	8	3005	3012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187145	ATT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187145	GTAA	2	8	3052	3059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187145	AATA	2	8	3076	3083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187145	ATT	2	6	3118	3123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187145	CTTTA	2	10	3140	3149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NT_187145	AGATTA	2	12	3168	3179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187145	T	6	6	3182	3187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187145	AAT	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187145	ATTT	2	8	3268	3275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187145	TAAAT	2	10	3284	3293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187145	TA	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187145	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187145	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187145	AGG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187145	A	7	7	3376	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
109	NT_187145	GTAT	2	8	3394	3401	25 %	50 %	25 %	0 %	426202383
110	NT_187145	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
111	NT_187145	AAGCA	2	10	3456	3465	60 %	0 %	20 %	20 %	426202383
112	NT_187145	AGA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
113	NT_187145	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
114	NT_187145	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202383
115	NT_187145	GAA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
116	NT_187145	AGT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
117	NT_187145	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
118	NT_187145	CAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202383
119	NT_187145	AGA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
120	NT_187145	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
121	NT_187145	AAG	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
122	NT_187145	AATT	2	8	3755	3762	50 %	50 %	0 %	0 %	426202383
123	NT_187145	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
124	NT_187145	TGA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
125	NT_187145	AAG	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
126	NT_187145	T	6	6	4009	4014	0 %	100 %	0 %	0 %	426202383
127	NT_187145	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
128	NT_187145	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
129	NT_187145	AAG	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
130	NT_187145	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
131	NT_187145	AGA	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
132	NT_187145	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
133	NT_187145	ACG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202383
134	NT_187145	TTA	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
135	NT_187145	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202383
136	NT_187145	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
137	NT_187145	TATC	2	8	4240	4247	25 %	50 %	0 %	25 %	426202383
138	NT_187145	AAG	2	6	4305	4310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187145	CT	3	6	4328	4333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187145	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187145	T	6	6	4387	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187145	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187145	TAA	2	6	4472	4477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187145	AATA	2	8	4494	4501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187145	AGC	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202384
146	NT_187145	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
147	NT_187145	AGT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
148	NT_187145	ATGA	2	8	4802	4809	50 %	25 %	25 %	0 %	426202384
149	NT_187145	TGA	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
150	NT_187145	AGA	3	9	4858	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202384
151	NT_187145	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
152	NT_187145	TA	3	6	5046	5051	50 %	50 %	0 %	0 %	426202384
153	NT_187145	GATT	2	8	5068	5075	25 %	50 %	25 %	0 %	426202384
154	NT_187145	AAT	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
155	NT_187145	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
156	NT_187145	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
157	NT_187145	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
158	NT_187145	TAA	2	6	5357	5362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.