MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	CTCA	2	8	53	60	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187140	AATT	2	8	80	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187140	TTG	2	6	131	136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187140	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187140	AAG	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187140	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187140	AGA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187140	TGA	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187140	TTA	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187140	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187140	TTC	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187140	GGA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187140	T	7	7	519	525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187140	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187140	CAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187140	ATT	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187140	AGA	2	6	619	624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187140	ATT	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187140	T	6	6	689	694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187140	AGA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187140	TTAC	2	8	775	782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187140	A	6	6	877	882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187140	ATA	2	6	944	949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187140	ACC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187140	TTA	2	6	1010	1015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
26	NT_187140	T	8	8	1022	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
27	NT_187140	AT	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	426202341
28	NT_187140	TCA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
29	NT_187140	T	6	6	1121	1126	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
30	NT_187140	CTTTT	2	10	1145	1154	0 %	80 %	0 %	20 %	426202341
31	NT_187140	T	6	6	1151	1156	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
32	NT_187140	ATA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
33	NT_187140	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	426202341
34	NT_187140	ATA	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
35	NT_187140	TTC	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
36	NT_187140	ATA	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
37	NT_187140	TTA	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
38	NT_187140	T	6	6	1368	1373	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
39	NT_187140	CTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
40	NT_187140	ATA	2	6	1392	1397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
41	NT_187140	A	6	6	1397	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	426202341
42	NT_187140	TTA	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
43	NT_187140	TG	3	6	1457	1462	0 %	50 %	50 %	0 %	426202341
44	NT_187140	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
45	NT_187140	T	8	8	1479	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
46	NT_187140	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
47	NT_187140	T	8	8	1512	1519	0 %	100 %	0 %	0 %	426202341
48	NT_187140	CTTT	2	8	1542	1549	0 %	75 %	0 %	25 %	426202341
49	NT_187140	TTC	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187140	TCA	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187140	TTTTA	2	10	1699	1708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187140	TTTCT	2	10	1785	1794	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NT_187140	T	6	6	1797	1802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187140	TAT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187140	TAT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187140	TAT	2	6	1833	1838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187140	T	8	8	1900	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187140	TA	3	6	1926	1931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187140	AGT	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187140	TATG	2	8	2020	2027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187140	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187140	TAA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187140	TGT	2	6	2076	2081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187140	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187140	T	7	7	2195	2201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187140	CTA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187140	TAA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187140	ATTA	2	8	2327	2334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187140	AGT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187140	T	6	6	2387	2392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187140	T	8	8	2400	2407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187140	AGTT	2	8	2434	2441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187140	A	6	6	2444	2449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187140	AT	3	6	2603	2608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187140	AT	3	6	2626	2631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187140	TAG	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187140	AT	4	8	2669	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187140	TTC	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187140	TCTT	2	8	2765	2772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NT_187140	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187140	TGATA	2	10	2794	2803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187140	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187140	TGT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187140	TAATT	2	10	2879	2888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187140	T	7	7	2938	2944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187140	ATC	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187140	ATC	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187140	TAT	3	9	3022	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187140	TTA	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187140	ATCT	2	8	3045	3052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NT_187140	TTC	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187140	CATTT	2	10	3080	3089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NT_187140	ATC	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187140	A	6	6	3186	3191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187140	T	6	6	3208	3213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187140	CAT	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187140	TTC	2	6	3252	3257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187140	T	7	7	3258	3264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187140	TAATT	2	10	3305	3314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187140	AT	3	6	3368	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187140	GTA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187140	TTA	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187140	TGG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187140	T	6	6	3461	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187140	GTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187140	TTA	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187140	TA	3	6	3558	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187140	TCA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187140	TAG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187140	TA	3	6	3640	3645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187140	AG	3	6	3745	3750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187140	TAACTT	2	12	3751	3762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NT_187140	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187140	TAA	2	6	3850	3855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187140	AT	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187140	CTA	3	9	3994	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187140	ATA	2	6	4021	4026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187140	A	6	6	4142	4147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187140	AAT	3	9	4166	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187140	TTTA	2	8	4178	4185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187140	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187140	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187140	ACT	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187140	GCA	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187140	AAG	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187140	TTAA	2	8	4333	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187140	TCT	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187140	CGG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187140	AGTT	2	8	4433	4440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187140	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187140	TTA	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187140	A	6	6	4606	4611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187140	A	7	7	4623	4629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187140	CAG	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187140	TGA	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187140	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187140	GCT	2	6	4702	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187140	TGC	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187140	AATA	2	8	4769	4776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187140	AGT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187140	TAT	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187140	TTAA	2	8	4802	4809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187140	A	6	6	4982	4987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187140	TG	3	6	4988	4993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187140	TAA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187140	A	7	7	5016	5022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187140	ATA	2	6	5032	5037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187140	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NT_187140	AAG	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187140	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187140	A	7	7	5486	5492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187140	CTG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NT_187140	GTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187140	GTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187140	GCT	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NT_187140	GCA	3	9	5589	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NT_187140	AATA	2	8	5647	5654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NT_187140	AGT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NT_187140	TTAA	2	8	5681	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NT_187140	TGA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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170	NT_187140	TTG	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NT_187140	AAG	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NT_187140	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NT_187140	ATT	2	6	15236	15241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NT_187140	AAG	2	6	15317	15322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NT_187140	AAT	2	6	15508	15513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NT_187140	GAA	2	6	15579	15584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NT_187140	A	6	6	15583	15588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NT_187140	ATG	2	6	15670	15675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NT_187140	TGA	2	6	15768	15773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NT_187140	GAA	2	6	15780	15785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NT_187140	TTA	2	6	15812	15817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NT_187140	GCT	2	6	15821	15826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NT_187140	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NT_187140	T	6	6	15893	15898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NT_187140	A	8	8	15910	15917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NT_187140	ATTT	2	8	15975	15982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NT_187140	GA	3	6	16041	16046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NT_187140	CTTA	2	8	16127	16134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
444	NT_187140	G	6	6	16155	16160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
445	NT_187140	AAG	2	6	16189	16194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NT_187140	GA	3	6	16224	16229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NT_187140	ATA	3	9	16297	16305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NT_187140	GCA	2	6	16342	16347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NT_187140	ATG	2	6	16401	16406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NT_187140	AG	3	6	16409	16414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NT_187140	TAG	2	6	16421	16426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NT_187140	CAC	2	6	16537	16542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NT_187140	CAT	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NT_187140	A	7	7	16714	16720	100 %	0 %	0 %	0 %	426202347
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460	NT_187140	AAG	2	6	17045	17050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
461	NT_187140	AAAG	2	8	17076	17083	75 %	0 %	25 %	0 %	426202347
462	NT_187140	GTG	2	6	17090	17095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202347
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464	NT_187140	TTG	2	6	17180	17185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202347
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472	NT_187140	ATG	2	6	17489	17494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202347
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485	NT_187140	TA	3	6	17953	17958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NT_187140	ATAA	2	8	17987	17994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NT_187140	TAAT	2	8	18037	18044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NT_187140	TG	3	6	18064	18069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NT_187140	GCA	2	6	18076	18081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
490	NT_187140	GGAA	2	8	18105	18112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NT_187140	ATA	2	6	18127	18132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NT_187140	CTA	2	6	18443	18448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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