MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_022659	CAG	2	6	550255	550260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18003	NC_022659	CGA	2	6	550278	550283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18004	NC_022659	CGCGA	2	10	550291	550300	20 %	0 %	40 %	40 %	556576864
18005	NC_022659	CG	3	6	550309	550314	0 %	0 %	50 %	50 %	556576864
18006	NC_022659	CGTG	2	8	550317	550324	0 %	25 %	50 %	25 %	556576864
18007	NC_022659	GAA	2	6	550327	550332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556576864
18008	NC_022659	CG	3	6	550339	550344	0 %	0 %	50 %	50 %	556576864
18009	NC_022659	CGA	2	6	550350	550355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18010	NC_022659	TGGT	2	8	550394	550401	0 %	50 %	50 %	0 %	556576864
18011	NC_022659	TCG	2	6	550406	550411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18012	NC_022659	AGC	2	6	550415	550420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18013	NC_022659	ACG	2	6	550433	550438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18014	NC_022659	GC	5	10	550440	550449	0 %	0 %	50 %	50 %	556576864
18015	NC_022659	GCGCG	2	10	550452	550461	0 %	0 %	60 %	40 %	556576864
18016	NC_022659	CCCG	2	8	550471	550478	0 %	0 %	25 %	75 %	556576864
18017	NC_022659	CGT	2	6	550525	550530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18018	NC_022659	CGTC	2	8	550557	550564	0 %	25 %	25 %	50 %	556576864
18019	NC_022659	CGA	2	6	550573	550578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18020	NC_022659	AGC	2	6	550601	550606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18021	NC_022659	CGT	2	6	550608	550613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18022	NC_022659	TCG	2	6	550655	550660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18023	NC_022659	AGC	2	6	550670	550675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18024	NC_022659	GC	4	8	550674	550681	0 %	0 %	50 %	50 %	556576864
18025	NC_022659	CGG	2	6	550725	550730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576864
18026	NC_022659	TGC	3	9	550769	550777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18027	NC_022659	CGT	2	6	550791	550796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18028	NC_022659	CGA	2	6	550815	550820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
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18032	NC_022659	AGC	2	6	550907	550912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576864
18033	NC_022659	GC	3	6	550935	550940	0 %	0 %	50 %	50 %	556576864
18034	NC_022659	CGG	2	6	550971	550976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_022659	A	6	6	550979	550984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_022659	GCG	2	6	551009	551014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_022659	GC	5	10	551063	551072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_022659	CGG	2	6	551079	551084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_022659	GC	3	6	551183	551188	0 %	0 %	50 %	50 %	556576701
18040	NC_022659	CAGCGT	2	12	551202	551213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556576701
18041	NC_022659	CAG	2	6	551325	551330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576701
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18043	NC_022659	GACG	2	8	551421	551428	25 %	0 %	50 %	25 %	556576701
18044	NC_022659	CGGC	2	8	551435	551442	0 %	0 %	50 %	50 %	556576701
18045	NC_022659	CGA	2	6	551444	551449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576701
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18049	NC_022659	CG	3	6	551590	551595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18050	NC_022659	GC	5	10	551607	551616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18051	NC_022659	GC	3	6	551620	551625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18052	NC_022659	ATG	2	6	551644	551649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_022659	GC	3	6	551660	551665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18054	NC_022659	GGC	2	6	551669	551674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_022659	CGG	2	6	551733	551738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_022659	CGG	2	6	551757	551762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_022659	GCG	2	6	551889	551894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_022659	CGGG	2	8	551903	551910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18059	NC_022659	CG	3	6	551961	551966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18060	NC_022659	TTC	2	6	551991	551996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_022659	GTC	2	6	552017	552022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576731
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18063	NC_022659	TCG	3	9	552171	552179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576731
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18065	NC_022659	CGG	2	6	552204	552209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_022659	CG	3	6	552218	552223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18067	NC_022659	CG	3	6	552242	552247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18068	NC_022659	GC	3	6	552251	552256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18069	NC_022659	CCCGC	2	10	552257	552266	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18070	NC_022659	CGAA	2	8	552294	552301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18071	NC_022659	CGATGC	2	12	552330	552341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18074	NC_022659	C	6	6	552405	552410	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18083	NC_022659	GAG	2	6	552640	552645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18087	NC_022659	CTCG	2	8	552728	552735	0 %	25 %	25 %	50 %	556575558
18088	NC_022659	CTG	2	6	552741	552746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575558
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18090	NC_022659	TCCG	2	8	552864	552871	0 %	25 %	25 %	50 %	556575558
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18092	NC_022659	GTCA	2	8	552938	552945	25 %	25 %	25 %	25 %	556575558
18093	NC_022659	ACG	2	6	552990	552995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575558
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18097	NC_022659	CTGC	2	8	553337	553344	0 %	25 %	25 %	50 %	556575558
18098	NC_022659	CTG	2	6	553356	553361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575558
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18103	NC_022659	ACGC	2	8	553514	553521	25 %	0 %	25 %	50 %	556575558
18104	NC_022659	CG	3	6	553539	553544	0 %	0 %	50 %	50 %	556575558
18105	NC_022659	TG	3	6	553610	553615	0 %	50 %	50 %	0 %	556575558
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18123	NC_022659	CGT	2	6	554416	554421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18124	NC_022659	GGCC	2	8	554534	554541	0 %	0 %	50 %	50 %	556577756
18125	NC_022659	TCG	2	6	554550	554555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18126	NC_022659	GC	3	6	554609	554614	0 %	0 %	50 %	50 %	556577756
18127	NC_022659	CGCAT	2	10	554615	554624	20 %	20 %	20 %	40 %	556577756
18128	NC_022659	CAC	2	6	554629	554634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556577756
18129	NC_022659	GCC	2	6	554673	554678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577756
18130	NC_022659	TGC	2	6	554682	554687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18131	NC_022659	CGC	2	6	554694	554699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577756
18132	NC_022659	TGA	2	6	554742	554747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577756
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18134	NC_022659	TGC	2	6	554766	554771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18135	NC_022659	GCT	2	6	554776	554781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18136	NC_022659	ATC	2	6	554819	554824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577756
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18138	NC_022659	CTG	2	6	554912	554917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18139	NC_022659	ACG	2	6	554951	554956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577756
18140	NC_022659	ACG	2	6	555029	555034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577756
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18143	NC_022659	AGCC	2	8	555127	555134	25 %	0 %	25 %	50 %	556577756
18144	NC_022659	GAAG	2	8	555170	555177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18145	NC_022659	CG	3	6	555182	555187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18146	NC_022659	TGC	2	6	555201	555206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18147	NC_022659	ACGCG	2	10	555223	555232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18148	NC_022659	CGA	2	6	555270	555275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18149	NC_022659	CGG	2	6	555325	555330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18150	NC_022659	CGA	2	6	555428	555433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18151	NC_022659	CCG	2	6	555520	555525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18152	NC_022659	GCATC	2	10	555542	555551	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18153	NC_022659	CCGC	2	8	555585	555592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18154	NC_022659	GCC	3	9	555612	555620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18155	NC_022659	ACG	3	9	555632	555640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576400
18156	NC_022659	CTT	2	6	555666	555671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556576400
18157	NC_022659	CAC	3	9	555800	555808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556576400
18158	NC_022659	CGA	2	6	555856	555861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576400
18159	NC_022659	TTC	2	6	555881	555886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556576400
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18161	NC_022659	GCC	2	6	556013	556018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18162	NC_022659	CGA	2	6	556035	556040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18163	NC_022659	CG	4	8	556054	556061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18164	NC_022659	CGG	2	6	556083	556088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18165	NC_022659	GCG	2	6	556093	556098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18166	NC_022659	ACG	2	6	556153	556158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18167	NC_022659	CGG	2	6	556167	556172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18168	NC_022659	CG	4	8	556262	556269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18169	NC_022659	GCG	2	6	556281	556286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18170	NC_022659	ACGC	2	8	556289	556296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18171	NC_022659	AAC	2	6	556341	556346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18172	NC_022659	GCG	2	6	556385	556390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18173	NC_022659	CGT	2	6	556392	556397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18174	NC_022659	GCG	2	6	556403	556408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18175	NC_022659	TCT	2	6	556445	556450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556575940
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18181	NC_022659	ACG	2	6	556769	556774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18182	NC_022659	CGG	2	6	556822	556827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18183	NC_022659	GGCA	2	8	556841	556848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18184	NC_022659	CCG	2	6	556902	556907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18185	NC_022659	GC	3	6	556918	556923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18186	NC_022659	CGC	2	6	556966	556971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574918
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18193	NC_022659	ACTG	2	8	557283	557290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18194	NC_022659	GCG	2	6	557313	557318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18195	NC_022659	GCG	3	9	557346	557354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18196	NC_022659	CGG	2	6	557355	557360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18197	NC_022659	GTG	2	6	557368	557373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18198	NC_022659	CAT	2	6	557402	557407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18200	NC_022659	GCG	2	6	557450	557455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18201	NC_022659	GCCG	2	8	557457	557464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18202	NC_022659	AAC	2	6	557475	557480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18203	NC_022659	CGC	2	6	557516	557521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18204	NC_022659	CGC	2	6	557530	557535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18205	NC_022659	GGGC	2	8	557551	557558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18206	NC_022659	CGTTT	2	10	557629	557638	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18207	NC_022659	GGC	2	6	557649	557654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18208	NC_022659	CAGT	2	8	557680	557687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18209	NC_022659	CGG	2	6	557691	557696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18210	NC_022659	GGC	2	6	557744	557749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18211	NC_022659	TCG	2	6	557775	557780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18214	NC_022659	GTCG	2	8	557833	557840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18215	NC_022659	GGA	2	6	557906	557911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18216	NC_022659	GCAT	2	8	557928	557935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18217	NC_022659	CTGC	2	8	557943	557950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18218	NC_022659	GCA	2	6	557961	557966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18219	NC_022659	CGA	2	6	558034	558039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18220	NC_022659	CGG	2	6	558112	558117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18221	NC_022659	CCG	2	6	558126	558131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18222	NC_022659	GAT	2	6	558147	558152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18223	NC_022659	CGA	2	6	558185	558190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18224	NC_022659	GCATG	2	10	558198	558207	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18225	NC_022659	TCA	2	6	558282	558287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18226	NC_022659	CCT	2	6	558406	558411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18227	NC_022659	G	6	6	558441	558446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18228	NC_022659	TC	3	6	558572	558577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18229	NC_022659	GTT	2	6	558669	558674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556577506
18230	NC_022659	CGG	3	9	558678	558686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577506
18231	NC_022659	CCGG	2	8	558706	558713	0 %	0 %	50 %	50 %	556577506
18232	NC_022659	GGC	2	6	558725	558730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577506
18233	NC_022659	CGCA	2	8	558801	558808	25 %	0 %	25 %	50 %	556577506
18234	NC_022659	GCG	2	6	558838	558843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577506
18235	NC_022659	AG	3	6	558866	558871	50 %	0 %	50 %	0 %	556577506
18236	NC_022659	AACG	2	8	558878	558885	50 %	0 %	25 %	25 %	556577506
18237	NC_022659	GTTC	2	8	558905	558912	0 %	50 %	25 %	25 %	556577506
18238	NC_022659	GC	3	6	558922	558927	0 %	0 %	50 %	50 %	556577506
18239	NC_022659	ATC	2	6	559063	559068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577506
18240	NC_022659	CG	3	6	559124	559129	0 %	0 %	50 %	50 %	556577506
18241	NC_022659	CAT	2	6	559146	559151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577506
18242	NC_022659	CTG	2	6	559178	559183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577506
18243	NC_022659	A	6	6	559206	559211	100 %	0 %	0 %	0 %	556577506
18244	NC_022659	GCA	2	6	559224	559229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577506
18245	NC_022659	CGC	2	6	559278	559283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577506
18246	NC_022659	CGA	2	6	559380	559385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577506
18247	NC_022659	GCA	2	6	559390	559395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577506
18248	NC_022659	CCCG	2	8	559407	559414	0 %	0 %	25 %	75 %	556577506
18249	NC_022659	TGG	2	6	559466	559471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556577506
18250	NC_022659	AAC	2	6	559549	559554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556577506
18251	NC_022659	CGC	2	6	559623	559628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577506
18252	NC_022659	CGT	2	6	559662	559667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577506
18253	NC_022659	CAG	2	6	559706	559711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577506
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18255	NC_022659	GAT	2	6	559749	559754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577506
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18257	NC_022659	ATC	2	6	559769	559774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577506
18258	NC_022659	TCA	2	6	559815	559820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18259	NC_022659	GCCATT	2	12	559840	559851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18260	NC_022659	AG	3	6	559900	559905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18261	NC_022659	CGA	2	6	559921	559926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18262	NC_022659	CA	3	6	559965	559970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18263	NC_022659	CCT	2	6	560038	560043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18264	NC_022659	GAC	2	6	560089	560094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18270	NC_022659	TTC	2	6	560296	560301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556576921
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18281	NC_022659	GCCGA	2	10	561022	561031	20 %	0 %	40 %	40 %	556576921
18282	NC_022659	GCG	2	6	561076	561081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576921
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18299	NC_022659	G	6	6	562153	562158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18300	NC_022659	TCAG	2	8	562173	562180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18301	NC_022659	G	6	6	562219	562224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18302	NC_022659	TCA	2	6	562230	562235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18307	NC_022659	TCT	2	6	562343	562348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18308	NC_022659	CTG	2	6	562360	562365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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