MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_022659	CGC	2	6	3877644	3877649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575392
125002	NC_022659	TTC	2	6	3877736	3877741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556575392
125003	NC_022659	CGT	2	6	3877746	3877751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125004	NC_022659	GCT	3	9	3877759	3877767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125005	NC_022659	CGC	2	6	3877777	3877782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575392
125006	NC_022659	CGC	2	6	3877834	3877839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575392
125007	NC_022659	AAC	2	6	3877922	3877927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556575392
125008	NC_022659	TCG	2	6	3877941	3877946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125009	NC_022659	TCT	2	6	3877956	3877961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556575392
125010	NC_022659	CGA	2	6	3878100	3878105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125011	NC_022659	ACG	2	6	3878108	3878113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125012	NC_022659	TCGCGC	2	12	3878166	3878177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556575392
125013	NC_022659	CTG	2	6	3878264	3878269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125014	NC_022659	TGC	2	6	3878361	3878366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125015	NC_022659	GAT	2	6	3878398	3878403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575392
125016	NC_022659	TGC	2	6	3878484	3878489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125017	NC_022659	GGCG	2	8	3878512	3878519	0 %	0 %	75 %	25 %	556575392
125018	NC_022659	CG	4	8	3878523	3878530	0 %	0 %	50 %	50 %	556575392
125019	NC_022659	TCG	2	6	3878535	3878540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125020	NC_022659	CTG	3	9	3878585	3878593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
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125022	NC_022659	GTC	2	6	3878669	3878674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575392
125023	NC_022659	CG	3	6	3878703	3878708	0 %	0 %	50 %	50 %	556575392
125024	NC_022659	CGG	2	6	3878731	3878736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575392
125025	NC_022659	CG	3	6	3878745	3878750	0 %	0 %	50 %	50 %	556575392
125026	NC_022659	CGC	2	6	3878754	3878759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575392
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125028	NC_022659	GC	3	6	3878790	3878795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125029	NC_022659	GCG	2	6	3878808	3878813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125030	NC_022659	CGCTC	2	10	3878861	3878870	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125031	NC_022659	GC	3	6	3878895	3878900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125032	NC_022659	AGGC	2	8	3878915	3878922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125033	NC_022659	CGGCG	2	10	3878943	3878952	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125034	NC_022659	CGCC	2	8	3878960	3878967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125035	NC_022659	CGG	2	6	3878974	3878979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125036	NC_022659	GCCG	2	8	3879007	3879014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125037	NC_022659	CGG	3	9	3879025	3879033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125038	NC_022659	GC	3	6	3879096	3879101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125039	NC_022659	GC	3	6	3879124	3879129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125040	NC_022659	CG	3	6	3879159	3879164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125041	NC_022659	AGCG	2	8	3879210	3879217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125042	NC_022659	GC	3	6	3879230	3879235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125043	NC_022659	GC	4	8	3879266	3879273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125044	NC_022659	CGC	2	6	3879287	3879292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125045	NC_022659	CCGCC	2	10	3879357	3879366	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125046	NC_022659	GAT	2	6	3879415	3879420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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125050	NC_022659	GC	3	6	3879504	3879509	0 %	0 %	50 %	50 %	556575584
125051	NC_022659	CG	3	6	3879526	3879531	0 %	0 %	50 %	50 %	556575584
125052	NC_022659	CGA	2	6	3879550	3879555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575584
125053	NC_022659	CGTTG	2	10	3879562	3879571	0 %	40 %	40 %	20 %	556575584
125054	NC_022659	GGC	2	6	3879578	3879583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575584
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125058	NC_022659	TGA	2	6	3879705	3879710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575584
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125060	NC_022659	TCG	2	6	3879831	3879836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575584
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125062	NC_022659	TCG	2	6	3879867	3879872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575584
125063	NC_022659	CG	3	6	3879877	3879882	0 %	0 %	50 %	50 %	556575584
125064	NC_022659	CCG	2	6	3879929	3879934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575584
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125068	NC_022659	CGA	2	6	3880015	3880020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575584
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125072	NC_022659	CG	3	6	3880140	3880145	0 %	0 %	50 %	50 %	556575584
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125090	NC_022659	CGT	2	6	3880592	3880597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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125092	NC_022659	CG	3	6	3880686	3880691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125093	NC_022659	CCG	2	6	3880698	3880703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125104	NC_022659	CG	3	6	3881103	3881108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125105	NC_022659	TTA	2	6	3881141	3881146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125107	NC_022659	CG	3	6	3881243	3881248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125108	NC_022659	CGGCG	2	10	3881250	3881259	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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125111	NC_022659	TCGAA	2	10	3881332	3881341	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125112	NC_022659	CCG	2	6	3881398	3881403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577044
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125120	NC_022659	CCG	2	6	3881679	3881684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125121	NC_022659	CGT	2	6	3881723	3881728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575065
125122	NC_022659	CGT	2	6	3881771	3881776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575065
125123	NC_022659	CTC	2	6	3881784	3881789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575065
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125125	NC_022659	CCG	2	6	3881898	3881903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125126	NC_022659	AAC	2	6	3881943	3881948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125127	NC_022659	GC	4	8	3881955	3881962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125128	NC_022659	CGGGC	2	10	3881984	3881993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125129	NC_022659	G	7	7	3881996	3882002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125130	NC_022659	CGG	2	6	3882005	3882010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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125134	NC_022659	CGT	2	6	3882105	3882110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576160
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125137	NC_022659	ACG	2	6	3882160	3882165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576160
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125141	NC_022659	CGC	2	6	3882308	3882313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125152	NC_022659	TCG	2	6	3882677	3882682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574857
125153	NC_022659	AGC	2	6	3882683	3882688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574857
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125224	NC_022659	CG	6	12	3884672	3884683	0 %	0 %	50 %	50 %	556574994
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125232	NC_022659	CGGG	2	8	3884818	3884825	0 %	0 %	75 %	25 %	556574994
125233	NC_022659	CAG	2	6	3884828	3884833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574994
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125237	NC_022659	GTC	2	6	3884927	3884932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574994
125238	NC_022659	CGC	2	6	3884995	3885000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574994
125239	NC_022659	ACG	2	6	3885006	3885011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574994
125240	NC_022659	CG	3	6	3885060	3885065	0 %	0 %	50 %	50 %	556574994
125241	NC_022659	CGA	2	6	3885077	3885082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574994
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125250	NC_022659	GCCGC	2	10	3885375	3885384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125251	NC_022659	GC	4	8	3885398	3885405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125252	NC_022659	CG	3	6	3885446	3885451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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125255	NC_022659	GC	3	6	3885469	3885474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125256	NC_022659	CG	3	6	3885475	3885480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125257	NC_022659	G	7	7	3885480	3885486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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125259	NC_022659	T	7	7	3885544	3885550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125260	NC_022659	GC	3	6	3885579	3885584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125261	NC_022659	GC	3	6	3885600	3885605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125262	NC_022659	GC	4	8	3885647	3885654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125263	NC_022659	GCGCC	2	10	3885661	3885670	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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125286	NC_022659	CG	3	6	3886150	3886155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125287	NC_022659	GAG	2	6	3886170	3886175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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125290	NC_022659	GTCGC	2	10	3886216	3886225	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125291	NC_022659	TGTCGA	2	12	3886247	3886258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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125293	NC_022659	CGG	2	6	3886272	3886277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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125295	NC_022659	GCTT	2	8	3886322	3886329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125296	NC_022659	ATCG	2	8	3886336	3886343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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125298	NC_022659	CGC	2	6	3886405	3886410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125301	NC_022659	CGG	2	6	3886488	3886493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125302	NC_022659	CCG	2	6	3886549	3886554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125303	NC_022659	CG	3	6	3886553	3886558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125304	NC_022659	GC	4	8	3886604	3886611	0 %	0 %	50 %	50 %	556574761
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125344	NC_022659	CGC	2	6	3887495	3887500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574761
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125346	NC_022659	CGT	2	6	3887555	3887560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574761
125347	NC_022659	GC	3	6	3887576	3887581	0 %	0 %	50 %	50 %	556574761
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125349	NC_022659	GTCG	2	8	3887601	3887608	0 %	25 %	50 %	25 %	556574761
125350	NC_022659	GC	3	6	3887669	3887674	0 %	0 %	50 %	50 %	556574761
125351	NC_022659	GGAAT	2	10	3887697	3887706	40 %	20 %	40 %	0 %	556574761
125352	NC_022659	GGGC	2	8	3887728	3887735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125353	NC_022659	CAC	2	6	3887777	3887782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556576698
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125355	NC_022659	CGA	2	6	3887809	3887814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576698
125356	NC_022659	CGA	2	6	3887854	3887859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576698
125357	NC_022659	TGA	2	6	3887863	3887868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576698
125358	NC_022659	TGAGCG	2	12	3887923	3887934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556576698
125359	NC_022659	CGA	3	9	3887968	3887976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576698
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125370	NC_022659	TGC	2	6	3888301	3888306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575908
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125383	NC_022659	CGGC	2	8	3888675	3888682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125384	NC_022659	GAA	2	6	3888693	3888698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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125386	NC_022659	GCA	2	6	3888741	3888746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125387	NC_022659	CGAA	2	8	3888787	3888794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125388	NC_022659	GTC	2	6	3888796	3888801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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125391	NC_022659	T	7	7	3888938	3888944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125392	NC_022659	GCCC	2	8	3889013	3889020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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125400	NC_022659	CG	3	6	3889245	3889250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125401	NC_022659	CG	3	6	3889343	3889348	0 %	0 %	50 %	50 %	556577584
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125467	NC_022659	GCC	2	6	3891520	3891525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125468	NC_022659	CGC	2	6	3891585	3891590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125469	NC_022659	CG	3	6	3891625	3891630	0 %	0 %	50 %	50 %	556577928
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125472	NC_022659	CAT	2	6	3891661	3891666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577928
125473	NC_022659	GC	3	6	3891713	3891718	0 %	0 %	50 %	50 %	556577928
125474	NC_022659	CGCGC	2	10	3891738	3891747	0 %	0 %	40 %	60 %	556577928
125475	NC_022659	CGGC	2	8	3891788	3891795	0 %	0 %	50 %	50 %	556577928
125476	NC_022659	CGGCG	2	10	3891807	3891816	0 %	0 %	60 %	40 %	556577928
125477	NC_022659	CGC	2	6	3891828	3891833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577928
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125499	NC_022659	CGA	2	6	3892386	3892391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577928
125500	NC_022659	GGCG	2	8	3892392	3892399	0 %	0 %	75 %	25 %	556577928

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