MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 128872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124001	NC_022659	GGC	3	9	3847152	3847160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124002	NC_022659	TGCGC	2	10	3847164	3847173	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124003	NC_022659	GC	3	6	3847182	3847187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124004	NC_022659	CG	3	6	3847218	3847223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124005	NC_022659	TCG	2	6	3847224	3847229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124006	NC_022659	CGG	2	6	3847312	3847317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124007	NC_022659	CG	3	6	3847323	3847328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124008	NC_022659	GCC	2	6	3847335	3847340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124009	NC_022659	GC	4	8	3847342	3847349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124010	NC_022659	CGT	2	6	3847355	3847360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124011	NC_022659	TCG	2	6	3847425	3847430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124012	NC_022659	CGC	2	6	3847549	3847554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577494
124013	NC_022659	GACC	2	8	3847562	3847569	25 %	0 %	25 %	50 %	556577494
124014	NC_022659	GAT	2	6	3847591	3847596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577494
124015	NC_022659	TCG	2	6	3847647	3847652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124016	NC_022659	GTC	3	9	3847685	3847693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124017	NC_022659	GCG	2	6	3847729	3847734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577494
124018	NC_022659	TCGG	2	8	3847842	3847849	0 %	25 %	50 %	25 %	556577494
124019	NC_022659	CGG	2	6	3847863	3847868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577494
124020	NC_022659	TCA	2	6	3847876	3847881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577494
124021	NC_022659	GTA	2	6	3847916	3847921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577494
124022	NC_022659	GGC	2	6	3847935	3847940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577494
124023	NC_022659	GGA	2	6	3847966	3847971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556577494
124024	NC_022659	CAT	2	6	3847976	3847981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577494
124025	NC_022659	AGC	2	6	3848022	3848027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124026	NC_022659	TCA	2	6	3848059	3848064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577494
124027	NC_022659	TTC	2	6	3848154	3848159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577494
124028	NC_022659	CAG	2	6	3848171	3848176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124029	NC_022659	CTC	2	6	3848213	3848218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577494
124030	NC_022659	CTT	2	6	3848234	3848239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577494
124031	NC_022659	CTCGCG	2	12	3848288	3848299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556577494
124032	NC_022659	TCA	2	6	3848365	3848370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577494
124033	NC_022659	CTC	2	6	3848420	3848425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577494
124034	NC_022659	TTC	2	6	3848442	3848447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577494
124035	NC_022659	GAT	2	6	3848465	3848470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577494
124036	NC_022659	GAA	2	6	3848513	3848518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556577494
124037	NC_022659	CGC	2	6	3848534	3848539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577494
124038	NC_022659	CATCGT	2	12	3848561	3848572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556577494
124039	NC_022659	TGA	2	6	3848611	3848616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577494
124040	NC_022659	CGG	2	6	3848646	3848651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577494
124041	NC_022659	ACGCGT	2	12	3848722	3848733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124042	NC_022659	CAT	2	6	3848735	3848740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577494
124043	NC_022659	CTC	2	6	3848825	3848830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577494
124044	NC_022659	CGGA	2	8	3848851	3848858	25 %	0 %	50 %	25 %	556577494
124045	NC_022659	TGC	2	6	3848928	3848933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124046	NC_022659	GCC	2	6	3848934	3848939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577494
124047	NC_022659	GCG	2	6	3848967	3848972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577494
124048	NC_022659	TCG	2	6	3848985	3848990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124049	NC_022659	CG	3	6	3849013	3849018	0 %	0 %	50 %	50 %	556577494
124050	NC_022659	GTC	2	6	3849039	3849044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577494
124051	NC_022659	TTC	2	6	3849113	3849118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556575494
124052	NC_022659	CTC	2	6	3849175	3849180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575494
124053	NC_022659	TCG	2	6	3849230	3849235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124054	NC_022659	TCG	2	6	3849260	3849265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124055	NC_022659	GC	3	6	3849291	3849296	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124056	NC_022659	TCGG	2	8	3849311	3849318	0 %	25 %	50 %	25 %	556575494
124057	NC_022659	CTC	2	6	3849328	3849333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575494
124058	NC_022659	GC	3	6	3849357	3849362	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124059	NC_022659	ACC	2	6	3849368	3849373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556575494
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124061	NC_022659	GAA	2	6	3849397	3849402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556575494
124062	NC_022659	TCG	2	6	3849410	3849415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124063	NC_022659	TCC	2	6	3849419	3849424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575494
124064	NC_022659	GC	3	6	3849425	3849430	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124065	NC_022659	GTG	2	6	3849433	3849438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556575494
124066	NC_022659	CAG	2	6	3849490	3849495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124067	NC_022659	GAA	2	6	3849499	3849504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556575494
124068	NC_022659	GCT	2	6	3849525	3849530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124069	NC_022659	CATC	2	8	3849549	3849556	25 %	25 %	0 %	50 %	556575494
124070	NC_022659	CGA	2	6	3849729	3849734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124071	NC_022659	GCG	2	6	3849768	3849773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575494
124072	NC_022659	GCCG	2	8	3849789	3849796	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124073	NC_022659	GC	3	6	3849798	3849803	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124074	NC_022659	ACG	2	6	3849818	3849823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575494
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124077	NC_022659	CG	3	6	3849859	3849864	0 %	0 %	50 %	50 %	556575494
124078	NC_022659	TTC	2	6	3849869	3849874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556575494
124079	NC_022659	CAG	2	6	3849889	3849894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124080	NC_022659	TCG	2	6	3849926	3849931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124081	NC_022659	AAG	2	6	3849932	3849937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556575494
124082	NC_022659	CTC	2	6	3849949	3849954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575494
124083	NC_022659	CCTTCG	2	12	3849986	3849997	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	556575494
124084	NC_022659	GCC	3	9	3850012	3850020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575494
124085	NC_022659	C	6	6	3850019	3850024	0 %	0 %	0 %	100 %	556575494
124086	NC_022659	GCC	2	6	3850027	3850032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575494
124087	NC_022659	GGGC	2	8	3850033	3850040	0 %	0 %	75 %	25 %	556575494
124088	NC_022659	CGC	2	6	3850053	3850058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575494
124089	NC_022659	GCC	2	6	3850099	3850104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575494
124090	NC_022659	TGC	2	6	3850182	3850187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575494
124091	NC_022659	CGGCG	2	10	3850209	3850218	0 %	0 %	60 %	40 %	556575494
124092	NC_022659	GAT	2	6	3850294	3850299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575494
124093	NC_022659	TGA	2	6	3850301	3850306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575494
124094	NC_022659	ACGC	2	8	3850346	3850353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124095	NC_022659	GCGG	2	8	3850377	3850384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124096	NC_022659	TC	3	6	3850387	3850392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124097	NC_022659	CG	4	8	3850401	3850408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124098	NC_022659	CG	3	6	3850411	3850416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124099	NC_022659	GCGTC	2	10	3850418	3850427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124100	NC_022659	GAC	2	6	3850439	3850444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577234
124101	NC_022659	TCC	2	6	3850544	3850549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577234
124102	NC_022659	CAA	2	6	3850582	3850587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556577234
124103	NC_022659	TCC	2	6	3850589	3850594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577234
124104	NC_022659	TCT	2	6	3850608	3850613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577234
124105	NC_022659	ACG	2	6	3850622	3850627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577234
124106	NC_022659	GCC	2	6	3850663	3850668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577234
124107	NC_022659	CGC	2	6	3850672	3850677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577234
124108	NC_022659	GC	3	6	3850682	3850687	0 %	0 %	50 %	50 %	556577234
124109	NC_022659	CCG	2	6	3850737	3850742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577234
124110	NC_022659	TCT	2	6	3850752	3850757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577234
124111	NC_022659	CG	3	6	3850777	3850782	0 %	0 %	50 %	50 %	556577234
124112	NC_022659	TCCTGA	2	12	3850817	3850828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556577234
124113	NC_022659	ACGA	2	8	3850958	3850965	50 %	0 %	25 %	25 %	556577234
124114	NC_022659	CGG	2	6	3850987	3850992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577234
124115	NC_022659	CTG	2	6	3851011	3851016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577234
124116	NC_022659	CGC	2	6	3851047	3851052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577234
124117	NC_022659	TCGAA	2	10	3851061	3851070	40 %	20 %	20 %	20 %	556577234
124118	NC_022659	CG	3	6	3851079	3851084	0 %	0 %	50 %	50 %	556577234
124119	NC_022659	TCG	2	6	3851129	3851134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577234
124120	NC_022659	CGT	2	6	3851202	3851207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577234
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124123	NC_022659	GCGA	2	8	3851315	3851322	25 %	0 %	50 %	25 %	556577234
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124164	NC_022659	CG	3	6	3852767	3852772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124165	NC_022659	CGA	2	6	3852774	3852779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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124174	NC_022659	GCGA	2	8	3853122	3853129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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124228	NC_022659	CGAGCG	2	12	3854496	3854507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556577097
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124230	NC_022659	CG	3	6	3854587	3854592	0 %	0 %	50 %	50 %	556577097
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124465	NC_022659	GCT	2	6	3860540	3860545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575900
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124468	NC_022659	CGA	2	6	3860573	3860578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575900
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124471	NC_022659	CGA	2	6	3860657	3860662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575900
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124475	NC_022659	CGG	2	6	3860780	3860785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575900
124476	NC_022659	ATC	2	6	3860818	3860823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575900
124477	NC_022659	CGA	2	6	3860828	3860833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575900
124478	NC_022659	GAA	2	6	3860943	3860948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556575900
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124481	NC_022659	GC	4	8	3861004	3861011	0 %	0 %	50 %	50 %	556575900
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124486	NC_022659	GAA	2	6	3861219	3861224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124487	NC_022659	CTGC	2	8	3861226	3861233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124488	NC_022659	CGGCG	2	10	3861375	3861384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124489	NC_022659	CGGC	2	8	3861406	3861413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124490	NC_022659	CGCC	2	8	3861418	3861425	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124491	NC_022659	CGCC	2	8	3861428	3861435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124492	NC_022659	GCG	2	6	3861497	3861502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577086
124493	NC_022659	CG	3	6	3861531	3861536	0 %	0 %	50 %	50 %	556577086
124494	NC_022659	CGC	2	6	3861545	3861550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577086
124495	NC_022659	CG	3	6	3861563	3861568	0 %	0 %	50 %	50 %	556577086
124496	NC_022659	TGC	2	6	3861589	3861594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577086
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124499	NC_022659	ACG	2	6	3861715	3861720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577086
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