MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea) plasmid

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022551	AATTT	2	10	24	33	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022551	TTTA	2	8	42	49	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022551	AAT	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022551	ATT	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022551	ATT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022551	T	6	6	98	103	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
7	NC_022551	TAA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
8	NC_022551	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
9	NC_022551	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
10	NC_022551	TAT	2	6	143	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
11	NC_022551	ATG	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734476
12	NC_022551	ATT	2	6	159	164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
13	NC_022551	TTCT	2	8	165	172	0 %	75 %	0 %	25 %	549734476
14	NC_022551	TAA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
15	NC_022551	TCT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
16	NC_022551	TTC	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
17	NC_022551	TA	3	6	225	230	50 %	50 %	0 %	0 %	549734476
18	NC_022551	AATA	2	8	252	259	75 %	25 %	0 %	0 %	549734476
19	NC_022551	CCAA	2	8	279	286	50 %	0 %	0 %	50 %	549734476
20	NC_022551	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
21	NC_022551	T	7	7	324	330	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
22	NC_022551	TAAA	2	8	336	343	75 %	25 %	0 %	0 %	549734476
23	NC_022551	T	7	7	371	377	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
24	NC_022551	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022551	TAT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022551	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022551	TGT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022551	TAA	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022551	T	9	9	531	539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022551	ATAC	2	8	540	547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022551	AG	3	6	556	561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022551	ATTC	2	8	570	577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022551	G	9	9	606	614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022551	G	9	9	623	631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022551	T	9	9	691	699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022551	ATAC	2	8	700	707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022551	AG	3	6	716	721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022551	ATTC	2	8	730	737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022551	A	8	8	760	767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022551	A	6	6	790	795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022551	AT	7	14	809	822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022551	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022551	A	8	8	831	838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022551	ATTA	2	8	846	853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022551	TTA	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022551	CG	8	16	885	900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022551	A	6	6	916	921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022551	A	6	6	926	931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022551	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022551	T	9	9	948	956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022551	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022551	ATTT	2	8	986	993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022551	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022551	AAAT	2	8	1007	1014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022551	A	10	10	1016	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022551	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
57	NC_022551	ACA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
58	NC_022551	TACA	2	8	1120	1127	50 %	25 %	0 %	25 %	549734477
59	NC_022551	A	7	7	1183	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
60	NC_022551	ATT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
61	NC_022551	TTCCTG	2	12	1273	1284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549734477
62	NC_022551	ATG	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
63	NC_022551	CTTATT	2	12	1339	1350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549734477
64	NC_022551	GAT	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
65	NC_022551	T	6	6	1385	1390	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
66	NC_022551	AGA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
67	NC_022551	AAT	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
68	NC_022551	ATA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
69	NC_022551	CTTT	2	8	1545	1552	0 %	75 %	0 %	25 %	549734477
70	NC_022551	CAA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
71	NC_022551	ATT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
72	NC_022551	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
73	NC_022551	TGA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
74	NC_022551	A	7	7	1676	1682	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
75	NC_022551	TAG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
76	NC_022551	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
77	NC_022551	A	6	6	1758	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
78	NC_022551	CTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549734477
79	NC_022551	AGA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
80	NC_022551	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
81	NC_022551	TA	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	549734477
82	NC_022551	AAC	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
83	NC_022551	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
84	NC_022551	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
85	NC_022551	TCT	2	6	1998	2003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734477
86	NC_022551	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
87	NC_022551	A	9	9	2028	2036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022551	A	6	6	2053	2058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022551	A	6	6	2060	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022551	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022551	ATAAA	2	10	2107	2116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022551	T	6	6	2140	2145	0 %	100 %	0 %	0 %	549734478
93	NC_022551	ATT	2	6	2158	2163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
94	NC_022551	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
95	NC_022551	AT	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
96	NC_022551	TTA	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
97	NC_022551	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734478
98	NC_022551	TTA	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
99	NC_022551	A	6	6	2318	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	549734478
100	NC_022551	A	6	6	2374	2379	100 %	0 %	0 %	0 %	549734478
101	NC_022551	AT	3	6	2397	2402	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
102	NC_022551	TA	3	6	2459	2464	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
103	NC_022551	TAAAT	2	10	2486	2495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022551	ATA	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022551	TAA	3	9	2514	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022551	A	7	7	2559	2565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022551	T	8	8	2572	2579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022551	ATTAAT	2	12	2589	2600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022551	A	8	8	2608	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022551	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022551	ATATT	2	10	2633	2642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022551	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022551	T	10	10	2699	2708	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
114	NC_022551	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
115	NC_022551	A	6	6	2731	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
116	NC_022551	ATT	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734479
117	NC_022551	A	9	9	2803	2811	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
118	NC_022551	AAG	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734479
119	NC_022551	A	6	6	2874	2879	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
120	NC_022551	A	9	9	2899	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
121	NC_022551	T	7	7	2908	2914	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
122	NC_022551	T	7	7	2926	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
123	NC_022551	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
124	NC_022551	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	549734479
125	NC_022551	AT	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	549734479
126	NC_022551	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734479
127	NC_022551	A	7	7	2990	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
128	NC_022551	TAATT	2	10	2997	3006	40 %	60 %	0 %	0 %	549734479
129	NC_022551	T	9	9	3008	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
130	NC_022551	ATTTT	2	10	3039	3048	20 %	80 %	0 %	0 %	549734480
131	NC_022551	T	7	7	3045	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
132	NC_022551	A	6	6	3058	3063	100 %	0 %	0 %	0 %	549734480
133	NC_022551	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
134	NC_022551	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
135	NC_022551	TAGA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	25 %	0 %	549734480
136	NC_022551	ATA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
137	NC_022551	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734480
138	NC_022551	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
139	NC_022551	AATA	2	8	3253	3260	75 %	25 %	0 %	0 %	549734480
140	NC_022551	TTTC	2	8	3278	3285	0 %	75 %	0 %	25 %	549734480
141	NC_022551	A	6	6	3291	3296	100 %	0 %	0 %	0 %	549734480
142	NC_022551	T	9	9	3305	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
143	NC_022551	A	9	9	3426	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022551	AAAAT	2	10	3446	3455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022551	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022551	T	9	9	3477	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022551	TGT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022551	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022551	T	7	7	3510	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022551	CAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022551	ATG	3	9	3526	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022551	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022551	GAT	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022551	A	6	6	3609	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022551	A	6	6	3622	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022551	AGA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.