MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 plasmid pBamNAU-B3a

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022531	ATC	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022531	GCAG	2	8	70	77	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022531	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022531	ATG	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022531	GCA	2	6	267	272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022531	TTTA	2	8	303	310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022531	CGG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022531	GGA	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022531	GAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022531	CGAA	2	8	441	448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022531	T	7	7	530	536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022531	T	7	7	603	609	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
13	NC_022531	GTA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
14	NC_022531	T	7	7	818	824	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
15	NC_022531	AT	3	6	832	837	50 %	50 %	0 %	0 %	549700064
16	NC_022531	T	7	7	863	869	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
17	NC_022531	TGC	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
18	NC_022531	T	6	6	921	926	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
19	NC_022531	TTCTG	2	10	975	984	0 %	60 %	20 %	20 %	549700064
20	NC_022531	ATTT	2	8	986	993	25 %	75 %	0 %	0 %	549700064
21	NC_022531	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
22	NC_022531	CAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
23	NC_022531	TTG	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
24	NC_022531	CTT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
25	NC_022531	AG	4	8	1269	1276	50 %	0 %	50 %	0 %	549700064
26	NC_022531	T	6	6	1296	1301	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
27	NC_022531	T	6	6	1307	1312	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
28	NC_022531	TTG	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
29	NC_022531	AATAG	2	10	1347	1356	60 %	20 %	20 %	0 %	549700064
30	NC_022531	TGT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
31	NC_022531	T	7	7	1418	1424	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
32	NC_022531	GTC	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
33	NC_022531	CGT	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
34	NC_022531	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
35	NC_022531	ACA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
36	NC_022531	TTC	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
37	NC_022531	CTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
38	NC_022531	TTATT	2	10	1586	1595	20 %	80 %	0 %	0 %	549700064
39	NC_022531	CTT	3	9	1598	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
40	NC_022531	T	7	7	1638	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
41	NC_022531	TGT	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
42	NC_022531	TA	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	549700064
43	NC_022531	TGTA	2	8	1757	1764	25 %	50 %	25 %	0 %	549700064
44	NC_022531	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700064
45	NC_022531	T	6	6	1834	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
46	NC_022531	TGT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
47	NC_022531	TCT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
48	NC_022531	AAATT	2	10	1931	1940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022531	TATG	3	12	1994	2005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022531	CCA	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_022531	TTTTGG	2	12	2065	2076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022531	TTATT	2	10	2113	2122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022531	T	7	7	2142	2148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022531	TTG	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022531	T	7	7	2325	2331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022531	T	8	8	2370	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022531	AT	3	6	2434	2439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022531	T	6	6	2445	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022531	CAA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022531	T	7	7	2504	2510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022531	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022531	TGC	2	6	2581	2586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022531	TC	3	6	2620	2625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022531	CGG	2	6	2628	2633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022531	GA	3	6	2694	2699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022531	GTAT	2	8	2808	2815	25 %	50 %	25 %	0 %	549700065
67	NC_022531	G	7	7	2817	2823	0 %	0 %	100 %	0 %	549700065
68	NC_022531	AAGA	2	8	2865	2872	75 %	0 %	25 %	0 %	549700065
69	NC_022531	A	6	6	2914	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
70	NC_022531	A	6	6	3010	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
71	NC_022531	AGC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
72	NC_022531	ATC	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700065
73	NC_022531	TGT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700065
74	NC_022531	CATG	2	8	3221	3228	25 %	25 %	25 %	25 %	549700065
75	NC_022531	CGGC	2	8	3254	3261	0 %	0 %	50 %	50 %	549700065
76	NC_022531	GAT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700065
77	NC_022531	AAG	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
78	NC_022531	ATCA	2	8	3405	3412	50 %	25 %	0 %	25 %	549700065
79	NC_022531	CAG	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
80	NC_022531	A	6	6	3519	3524	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
81	NC_022531	A	6	6	3594	3599	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
82	NC_022531	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
83	NC_022531	GGC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
84	NC_022531	GAA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
85	NC_022531	AAGAT	2	10	3763	3772	60 %	20 %	20 %	0 %	549700065
86	NC_022531	GAG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549700065
87	NC_022531	GCG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
88	NC_022531	GAA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
89	NC_022531	AGA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
90	NC_022531	CGAAA	2	10	4010	4019	60 %	0 %	20 %	20 %	549700065
91	NC_022531	A	7	7	4017	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
92	NC_022531	AGGT	2	8	4040	4047	25 %	25 %	50 %	0 %	549700065
93	NC_022531	GCT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700065
94	NC_022531	AATA	2	8	4248	4255	75 %	25 %	0 %	0 %	549700065
95	NC_022531	TTC	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
96	NC_022531	CCA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549700066
97	NC_022531	T	7	7	4321	4327	0 %	100 %	0 %	0 %	549700066
98	NC_022531	AGTG	2	8	4380	4387	25 %	25 %	50 %	0 %	549700066
99	NC_022531	T	6	6	4409	4414	0 %	100 %	0 %	0 %	549700066
100	NC_022531	TTC	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
101	NC_022531	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700066
102	NC_022531	AGTG	2	8	4567	4574	25 %	25 %	50 %	0 %	549700066
103	NC_022531	TTC	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
104	NC_022531	TAT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022531	GTT	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022531	GTTT	2	8	4942	4949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022531	AAAT	2	8	4992	4999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022531	AGG	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022531	GTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022531	GATT	2	8	5066	5073	25 %	50 %	25 %	0 %	549700067
111	NC_022531	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
112	NC_022531	AGA	3	9	5180	5188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
113	NC_022531	GGA	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022531	CAAA	2	8	5325	5332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022531	GTTT	2	8	5336	5343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022531	G	6	6	5385	5390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022531	TGG	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022531	A	6	6	5486	5491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022531	GA	3	6	5512	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022531	CCT	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_022531	G	6	6	5602	5607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022531	T	7	7	5649	5655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022531	TGT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022531	GTA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022531	CAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022531	TA	3	6	5860	5865	50 %	50 %	0 %	0 %	549700068
127	NC_022531	A	6	6	5880	5885	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
128	NC_022531	A	6	6	5912	5917	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
129	NC_022531	TTA	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
130	NC_022531	TAT	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
131	NC_022531	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
132	NC_022531	TTC	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700068
133	NC_022531	TGA	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
134	NC_022531	ATTTT	2	10	6219	6228	20 %	80 %	0 %	0 %	549700068
135	NC_022531	T	6	6	6242	6247	0 %	100 %	0 %	0 %	549700068
136	NC_022531	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
137	NC_022531	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
138	NC_022531	GAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
139	NC_022531	A	6	6	6388	6393	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
140	NC_022531	GAA	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
141	NC_022531	A	6	6	6546	6551	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
142	NC_022531	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
143	NC_022531	GAGGG	2	10	6625	6634	20 %	0 %	80 %	0 %	549700068
144	NC_022531	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	549700068
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182	NC_022531	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.