MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia miyamotoi LB-2001

Total Repeats: 24589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_022079	GCT	2	6	904013	904018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530576175
24503	NC_022079	AAG	2	6	904073	904078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530576175
24504	NC_022079	AGAA	2	8	904108	904115	75 %	0 %	25 %	0 %	530576175
24505	NC_022079	ATG	2	6	904119	904124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576175
24506	NC_022079	T	6	6	904290	904295	0 %	100 %	0 %	0 %	530576175
24507	NC_022079	GTG	2	6	904296	904301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530576175
24508	NC_022079	AAT	2	6	904310	904315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576175
24509	NC_022079	TAT	2	6	904345	904350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530576175
24510	NC_022079	GTA	2	6	904443	904448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576175
24511	NC_022079	TTAT	2	8	904494	904501	25 %	75 %	0 %	0 %	530576175
24512	NC_022079	A	6	6	904542	904547	100 %	0 %	0 %	0 %	530576175
24513	NC_022079	AGA	2	6	904600	904605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530576175
24514	NC_022079	GAT	2	6	904706	904711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576175
24515	NC_022079	TGT	2	6	904732	904737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530576175
24516	NC_022079	TGA	2	6	904741	904746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576175
24517	NC_022079	AGATA	2	10	904827	904836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_022079	GA	3	6	904843	904848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24519	NC_022079	TGAT	2	8	904854	904861	25 %	50 %	25 %	0 %	530576176
24520	NC_022079	AGT	2	6	904877	904882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24521	NC_022079	AAT	2	6	904888	904893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24522	NC_022079	TAA	2	6	904902	904907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24523	NC_022079	TGA	2	6	904911	904916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24524	NC_022079	TA	3	6	904928	904933	50 %	50 %	0 %	0 %	530576176
24525	NC_022079	CTG	2	6	904938	904943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530576176
24526	NC_022079	GAGAA	2	10	904958	904967	60 %	0 %	40 %	0 %	530576176
24527	NC_022079	GTT	2	6	904991	904996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530576176
24528	NC_022079	TATT	2	8	905109	905116	25 %	75 %	0 %	0 %	530576176
24529	NC_022079	TTG	2	6	905121	905126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530576176
24530	NC_022079	AGT	2	6	905182	905187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24531	NC_022079	GATAAA	2	12	905201	905212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530576176
24532	NC_022079	CTT	2	6	905213	905218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530576176
24533	NC_022079	ATG	2	6	905228	905233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24534	NC_022079	AGG	2	6	905248	905253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530576176
24535	NC_022079	GAA	2	6	905273	905278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530576176
24536	NC_022079	TTA	2	6	905295	905300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530576176
24537	NC_022079	TAA	2	6	905310	905315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24538	NC_022079	ATT	2	6	905351	905356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530576176
24539	NC_022079	CTA	2	6	905388	905393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530576176
24540	NC_022079	AAGG	2	8	905444	905451	50 %	0 %	50 %	0 %	530576176
24541	NC_022079	TAT	2	6	905464	905469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530576176
24542	NC_022079	TA	4	8	905472	905479	50 %	50 %	0 %	0 %	530576176
24543	NC_022079	TAG	2	6	905521	905526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24544	NC_022079	AGA	2	6	905569	905574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530576176
24545	NC_022079	GGT	2	6	905597	905602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530576176
24546	NC_022079	AAT	2	6	905662	905667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24547	NC_022079	TCT	2	6	905670	905675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530576176
24548	NC_022079	TTGG	2	8	905700	905707	0 %	50 %	50 %	0 %	530576176
24549	NC_022079	CAG	2	6	905826	905831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530576176
24550	NC_022079	TAG	2	6	905865	905870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24551	NC_022079	TGA	2	6	905872	905877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24552	NC_022079	GT	3	6	905972	905977	0 %	50 %	50 %	0 %	530576176
24553	NC_022079	TGT	2	6	905986	905991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530576176
24554	NC_022079	AAT	2	6	906028	906033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24555	NC_022079	T	6	6	906049	906054	0 %	100 %	0 %	0 %	530576176
24556	NC_022079	TCA	2	6	906068	906073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530576176
24557	NC_022079	TTA	2	6	906113	906118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530576176
24558	NC_022079	CAA	2	6	906123	906128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530576176
24559	NC_022079	GTA	2	6	906218	906223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576176
24560	NC_022079	ATA	2	6	906236	906241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530576176
24561	NC_022079	TTTA	2	8	906249	906256	25 %	75 %	0 %	0 %	530576176
24562	NC_022079	TGT	2	6	906268	906273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24563	NC_022079	GTA	2	6	906291	906296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530576177
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24569	NC_022079	ATATT	2	10	906530	906539	40 %	60 %	0 %	0 %	530576177
24570	NC_022079	TA	3	6	906562	906567	50 %	50 %	0 %	0 %	530576177
24571	NC_022079	AGTGGT	2	12	906587	906598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	530576177
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24573	NC_022079	AT	3	6	906707	906712	50 %	50 %	0 %	0 %	530576177
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24575	NC_022079	GGA	3	9	906834	906842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530576177
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24585	NC_022079	TAT	2	6	907209	907214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24586	NC_022079	AGA	2	6	907215	907220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24587	NC_022079	TAAGT	2	10	907230	907239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24588	NC_022079	ATTGT	2	10	907240	907249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24589	NC_022079	TAA	2	6	907275	907280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.