MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 39518

< Previous12...3233343536373839404142...7980Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_021294	GCC	2	6	654097	654102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526282
18004	NC_021294	CGA	2	6	654103	654108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526282
18005	NC_021294	TCG	2	6	654114	654119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526282
18006	NC_021294	GC	4	8	654127	654134	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18007	NC_021294	CG	3	6	654172	654177	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18008	NC_021294	TTGCGC	2	12	654204	654215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526282
18009	NC_021294	GC	3	6	654267	654272	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18010	NC_021294	CGA	2	6	654277	654282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526282
18011	NC_021294	CG	3	6	654304	654309	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18012	NC_021294	GCG	2	6	654328	654333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526282
18013	NC_021294	CG	4	8	654412	654419	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18014	NC_021294	CGC	2	6	654439	654444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526282
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18017	NC_021294	ATT	2	6	654522	654527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507526282
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18020	NC_021294	CCG	2	6	654582	654587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526282
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18022	NC_021294	CGG	2	6	654604	654609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526282
18023	NC_021294	TGA	2	6	654672	654677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507526282
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18028	NC_021294	TTC	2	6	654752	654757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507526282
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18030	NC_021294	CTG	2	6	654782	654787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526282
18031	NC_021294	TGCG	2	8	654861	654868	0 %	25 %	50 %	25 %	507526282
18032	NC_021294	GCCG	2	8	654877	654884	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
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18049	NC_021294	GC	3	6	655463	655468	0 %	0 %	50 %	50 %	507526282
18050	NC_021294	GTCG	2	8	655480	655487	0 %	25 %	50 %	25 %	507526282
18051	NC_021294	GCG	2	6	655491	655496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526282
18052	NC_021294	A	6	6	655528	655533	100 %	0 %	0 %	0 %	507526282
18053	NC_021294	CG	3	6	655542	655547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18055	NC_021294	TCG	2	6	655577	655582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526283
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18057	NC_021294	CGA	2	6	655706	655711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526283
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18060	NC_021294	CGC	2	6	655847	655852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18061	NC_021294	TG	3	6	655861	655866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18102	NC_021294	GAAG	2	8	657897	657904	50 %	0 %	50 %	0 %	507526285
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18106	NC_021294	CGGC	2	8	658024	658031	0 %	0 %	50 %	50 %	507526285
18107	NC_021294	CG	4	8	658049	658056	0 %	0 %	50 %	50 %	507526285
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18112	NC_021294	CA	3	6	658170	658175	50 %	0 %	0 %	50 %	507526285
18113	NC_021294	CG	3	6	658181	658186	0 %	0 %	50 %	50 %	507526285
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18119	NC_021294	GCGCC	2	10	658306	658315	0 %	0 %	40 %	60 %	507526285
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18121	NC_021294	GC	3	6	658344	658349	0 %	0 %	50 %	50 %	507526285
18122	NC_021294	CGC	2	6	658365	658370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526285
18123	NC_021294	CAC	2	6	658422	658427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507526285
18124	NC_021294	AGT	2	6	658439	658444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507526285
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18126	NC_021294	TCG	2	6	658494	658499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526286
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18128	NC_021294	GCG	2	6	658561	658566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18129	NC_021294	GATG	2	8	658572	658579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18130	NC_021294	CTG	2	6	658680	658685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526287
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18141	NC_021294	CGT	2	6	659057	659062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18145	NC_021294	TGC	2	6	659253	659258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18147	NC_021294	CG	3	6	659305	659310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18148	NC_021294	CCG	2	6	659328	659333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18171	NC_021294	CGA	2	6	660029	660034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18172	NC_021294	CGC	2	6	660053	660058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18173	NC_021294	CCGG	2	8	660093	660100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18181	NC_021294	CG	4	8	660430	660437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18182	NC_021294	CAC	2	6	660465	660470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18183	NC_021294	GCC	2	6	660482	660487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18184	NC_021294	CG	3	6	660533	660538	0 %	0 %	50 %	50 %	507526291
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18241	NC_021294	GTC	2	6	662702	662707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526295
18242	NC_021294	GCT	2	6	662734	662739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526295
18243	NC_021294	ACG	2	6	662772	662777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526295
18244	NC_021294	CG	3	6	662802	662807	0 %	0 %	50 %	50 %	507526295
18245	NC_021294	GCT	2	6	662815	662820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526295
18246	NC_021294	GTTTCG	2	12	662829	662840	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507526295
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18261	NC_021294	CCGG	2	8	663611	663618	0 %	0 %	50 %	50 %	507526295
18262	NC_021294	CG	3	6	663625	663630	0 %	0 %	50 %	50 %	507526295
18263	NC_021294	GGT	2	6	663640	663645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507526295
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18269	NC_021294	ACG	2	6	663808	663813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18271	NC_021294	GGC	2	6	663900	663905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526296
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18280	NC_021294	CG	3	6	664214	664219	0 %	0 %	50 %	50 %	507526296
18281	NC_021294	CTG	2	6	664221	664226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526296
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18326	NC_021294	TCGG	2	8	665753	665760	0 %	25 %	50 %	25 %	507526297
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18335	NC_021294	GCT	2	6	665988	665993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526297
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18348	NC_021294	CA	3	6	666300	666305	50 %	0 %	0 %	50 %	507526297
18349	NC_021294	CGA	2	6	666327	666332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526297
18350	NC_021294	GCA	2	6	666333	666338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526297
18351	NC_021294	GC	3	6	666346	666351	0 %	0 %	50 %	50 %	507526297
18352	NC_021294	AGCG	2	8	666356	666363	25 %	0 %	50 %	25 %	507526297
18353	NC_021294	TG	3	6	666372	666377	0 %	50 %	50 %	0 %	507526297
18354	NC_021294	GAG	2	6	666414	666419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507526298
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18356	NC_021294	CGA	2	6	666476	666481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526298
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18359	NC_021294	GC	3	6	666549	666554	0 %	0 %	50 %	50 %	507526298
18360	NC_021294	CG	3	6	666576	666581	0 %	0 %	50 %	50 %	507526298
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18362	NC_021294	CGAAG	2	10	666692	666701	40 %	0 %	40 %	20 %	507526298
18363	NC_021294	TGC	2	6	666706	666711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526298
18364	NC_021294	GGC	2	6	666743	666748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526298
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18366	NC_021294	CG	3	6	666766	666771	0 %	0 %	50 %	50 %	507526298
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18381	NC_021294	CG	3	6	667322	667327	0 %	0 %	50 %	50 %	507526299
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18442	NC_021294	GAAG	2	8	669549	669556	50 %	0 %	50 %	0 %	507526303
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18472	NC_021294	GTT	2	6	670496	670501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18473	NC_021294	TAA	2	6	670572	670577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18474	NC_021294	TGG	2	6	670629	670634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18475	NC_021294	GCA	2	6	670672	670677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18479	NC_021294	GCA	2	6	670815	670820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526305
18480	NC_021294	CA	3	6	670819	670824	50 %	0 %	0 %	50 %	507526305
18481	NC_021294	ACA	2	6	670876	670881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18482	NC_021294	GAG	2	6	670930	670935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18483	NC_021294	GGC	2	6	670973	670978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526306
18484	NC_021294	GCGCG	2	10	671014	671023	0 %	0 %	60 %	40 %	507526306
18485	NC_021294	CG	4	8	671020	671027	0 %	0 %	50 %	50 %	507526306
18486	NC_021294	TCG	2	6	671050	671055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526306
18487	NC_021294	TCG	2	6	671215	671220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526306
18488	NC_021294	CGGC	2	8	671242	671249	0 %	0 %	50 %	50 %	507526306
18489	NC_021294	GCT	2	6	671273	671278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526306
18490	NC_021294	GCCCG	2	10	671324	671333	0 %	0 %	40 %	60 %	507526306
18491	NC_021294	GCT	2	6	671450	671455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526306
18492	NC_021294	CG	3	6	671492	671497	0 %	0 %	50 %	50 %	507526306
18493	NC_021294	CCGGCC	2	12	671509	671520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526306
18494	NC_021294	CGAC	2	8	671566	671573	25 %	0 %	25 %	50 %	507526306
18495	NC_021294	AGC	2	6	671611	671616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526306
18496	NC_021294	CTA	2	6	671633	671638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507526306
18497	NC_021294	GGC	2	6	671643	671648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526306
18498	NC_021294	CGG	2	6	671653	671658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526306
18499	NC_021294	TGA	2	6	671659	671664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507526306
18500	NC_021294	CG	4	8	671725	671732	0 %	0 %	50 %	50 %	507526306

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