MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 39518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021294	TCGCCA	2	12	438330	438341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507526075
12002	NC_021294	T	7	7	438350	438356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_021294	TCG	2	6	438408	438413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12004	NC_021294	TCG	2	6	438432	438437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12005	NC_021294	CGC	2	6	438441	438446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526076
12006	NC_021294	GCGG	2	8	438507	438514	0 %	0 %	75 %	25 %	507526076
12007	NC_021294	CG	3	6	438538	438543	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12008	NC_021294	CATG	2	8	438619	438626	25 %	25 %	25 %	25 %	507526076
12009	NC_021294	CAG	2	6	438646	438651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12010	NC_021294	GCCCA	2	10	438666	438675	20 %	0 %	20 %	60 %	507526076
12011	NC_021294	TGC	2	6	438696	438701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12012	NC_021294	GTT	2	6	438802	438807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507526076
12013	NC_021294	CGAG	2	8	438955	438962	25 %	0 %	50 %	25 %	507526076
12014	NC_021294	CG	3	6	438963	438968	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12015	NC_021294	CTG	2	6	439027	439032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12016	NC_021294	ATCG	2	8	439034	439041	25 %	25 %	25 %	25 %	507526076
12017	NC_021294	AGCG	2	8	439074	439081	25 %	0 %	50 %	25 %	507526076
12018	NC_021294	TTG	2	6	439101	439106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507526076
12019	NC_021294	CGC	2	6	439120	439125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526076
12020	NC_021294	CG	3	6	439169	439174	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12021	NC_021294	TCG	2	6	439215	439220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12022	NC_021294	TTC	2	6	439256	439261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507526076
12023	NC_021294	GC	4	8	439280	439287	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12024	NC_021294	CG	3	6	439345	439350	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12025	NC_021294	TCGA	2	8	439356	439363	25 %	25 %	25 %	25 %	507526076
12026	NC_021294	GCA	2	6	439408	439413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12027	NC_021294	CG	3	6	439419	439424	0 %	0 %	50 %	50 %	507526076
12028	NC_021294	GTC	2	6	439433	439438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12029	NC_021294	CGA	2	6	439447	439452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12030	NC_021294	TCGT	2	8	439476	439483	0 %	50 %	25 %	25 %	507526076
12031	NC_021294	CGC	2	6	439510	439515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526076
12032	NC_021294	GCA	2	6	439531	439536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526076
12033	NC_021294	CGCCT	2	10	439550	439559	0 %	20 %	20 %	60 %	507526076
12034	NC_021294	GCA	2	6	439600	439605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526076
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12036	NC_021294	GCT	2	6	439666	439671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526076
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12038	NC_021294	GT	3	6	439778	439783	0 %	50 %	50 %	0 %	507526076
12039	NC_021294	GATC	2	8	439795	439802	25 %	25 %	25 %	25 %	507526076
12040	NC_021294	CCTG	2	8	439818	439825	0 %	25 %	25 %	50 %	507526076
12041	NC_021294	GGA	2	6	439870	439875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507526076
12042	NC_021294	CTTGC	2	10	440057	440066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12043	NC_021294	GCC	2	6	440153	440158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526077
12044	NC_021294	GC	3	6	440219	440224	0 %	0 %	50 %	50 %	507526077
12045	NC_021294	CG	3	6	440244	440249	0 %	0 %	50 %	50 %	507526077
12046	NC_021294	TCG	2	6	440277	440282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526077
12047	NC_021294	CCGA	2	8	440327	440334	25 %	0 %	25 %	50 %	507526077
12048	NC_021294	GCG	2	6	440406	440411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526077
12049	NC_021294	GCC	2	6	440500	440505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526077
12050	NC_021294	GC	3	6	440568	440573	0 %	0 %	50 %	50 %	507526077
12051	NC_021294	ACG	2	6	440576	440581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526077
12052	NC_021294	CG	3	6	440665	440670	0 %	0 %	50 %	50 %	507526077
12053	NC_021294	ATCGA	2	10	440672	440681	40 %	20 %	20 %	20 %	507526077
12054	NC_021294	CG	4	8	440700	440707	0 %	0 %	50 %	50 %	507526077
12055	NC_021294	CGA	2	6	440757	440762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526077
12056	NC_021294	AGCC	2	8	440798	440805	25 %	0 %	25 %	50 %	507526077
12057	NC_021294	GCC	2	6	440829	440834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526077
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12061	NC_021294	ATCGAA	2	12	440943	440954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	507526078
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12065	NC_021294	CG	3	6	441122	441127	0 %	0 %	50 %	50 %	507526078
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12068	NC_021294	CCTGAT	2	12	441209	441220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507526078
12069	NC_021294	CGA	2	6	441359	441364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526078
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12073	NC_021294	CAA	2	6	441681	441686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507526078
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12075	NC_021294	CCG	2	6	441752	441757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12076	NC_021294	A	6	6	441792	441797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_021294	CG	3	6	441912	441917	0 %	0 %	50 %	50 %	507526079
12078	NC_021294	CTT	2	6	441941	441946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507526079
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12081	NC_021294	CGA	2	6	442086	442091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526079
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12089	NC_021294	CGG	2	6	442447	442452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526080
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12094	NC_021294	CG	3	6	442647	442652	0 %	0 %	50 %	50 %	507526080
12095	NC_021294	CGA	2	6	442689	442694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526080
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12098	NC_021294	CAG	2	6	442815	442820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_021294	CGC	2	6	442849	442854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12100	NC_021294	ATTT	2	8	442918	442925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_021294	GCG	2	6	442987	442992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526081
12102	NC_021294	TCC	2	6	443001	443006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507526081
12103	NC_021294	GC	3	6	443024	443029	0 %	0 %	50 %	50 %	507526081
12104	NC_021294	CGG	2	6	443047	443052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526081
12105	NC_021294	CCTT	2	8	443061	443068	0 %	50 %	0 %	50 %	507526081
12106	NC_021294	GC	3	6	443136	443141	0 %	0 %	50 %	50 %	507526081
12107	NC_021294	AGCCG	2	10	443155	443164	20 %	0 %	40 %	40 %	507526081
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12117	NC_021294	ACG	2	6	443523	443528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526082
12118	NC_021294	GCG	2	6	443550	443555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526082
12119	NC_021294	CGC	2	6	443556	443561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526082
12120	NC_021294	ATCCG	2	10	443575	443584	20 %	20 %	20 %	40 %	507526082
12121	NC_021294	TGA	2	6	443651	443656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507526082
12122	NC_021294	GTC	2	6	443707	443712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526082
12123	NC_021294	TCG	2	6	443717	443722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526082
12124	NC_021294	AGCG	2	8	443762	443769	25 %	0 %	50 %	25 %	507526082
12125	NC_021294	GC	3	6	443781	443786	0 %	0 %	50 %	50 %	507526082
12126	NC_021294	CGC	2	6	443793	443798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507526082
12127	NC_021294	CG	3	6	443856	443861	0 %	0 %	50 %	50 %	507526082
12128	NC_021294	GCTC	2	8	443883	443890	0 %	25 %	25 %	50 %	507526082
12129	NC_021294	TGCGTG	2	12	443918	443929	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	507526082
12130	NC_021294	CGCC	2	8	443940	443947	0 %	0 %	25 %	75 %	507526082
12131	NC_021294	CGA	2	6	443970	443975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526082
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12134	NC_021294	GC	3	6	444088	444093	0 %	0 %	50 %	50 %	507526082
12135	NC_021294	CGG	2	6	444166	444171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526082
12136	NC_021294	GAGAT	2	10	444209	444218	40 %	20 %	40 %	0 %	507526082
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12140	NC_021294	CGT	2	6	444264	444269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526082
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12142	NC_021294	TTG	2	6	444323	444328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507526082
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12149	NC_021294	TCG	2	6	444647	444652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526082
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12152	NC_021294	CGG	2	6	444753	444758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526082
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12154	NC_021294	CTTGC	2	10	444844	444853	0 %	40 %	20 %	40 %	507526082
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12157	NC_021294	TCG	2	6	444890	444895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526082
12158	NC_021294	CG	3	6	444902	444907	0 %	0 %	50 %	50 %	507526082
12159	NC_021294	ACGGC	2	10	444951	444960	20 %	0 %	40 %	40 %	507526082
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12161	NC_021294	CGTC	2	8	445040	445047	0 %	25 %	25 %	50 %	507526082
12162	NC_021294	GCGCG	2	10	445077	445086	0 %	0 %	60 %	40 %	507526082
12163	NC_021294	GCC	2	6	445136	445141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12164	NC_021294	GC	5	10	445169	445178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12165	NC_021294	AGC	2	6	445188	445193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12166	NC_021294	TCC	2	6	445223	445228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12167	NC_021294	CTG	3	9	445262	445270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12168	NC_021294	GCG	2	6	445279	445284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12169	NC_021294	GC	3	6	445287	445292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12170	NC_021294	ATC	2	6	445293	445298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12171	NC_021294	GAT	2	6	445353	445358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507526083
12172	NC_021294	CTT	2	6	445377	445382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507526083
12173	NC_021294	GC	3	6	445395	445400	0 %	0 %	50 %	50 %	507526083
12174	NC_021294	TGC	2	6	445439	445444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526083
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12177	NC_021294	GCG	2	6	445539	445544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12178	NC_021294	CGT	2	6	445550	445555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12193	NC_021294	CG	3	6	446133	446138	0 %	0 %	50 %	50 %	507526084
12194	NC_021294	CT	3	6	446188	446193	0 %	50 %	0 %	50 %	507526084
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12228	NC_021294	CGGA	2	8	447487	447494	25 %	0 %	50 %	25 %	507526085
12229	NC_021294	GGC	2	6	447498	447503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526085
12230	NC_021294	GC	3	6	447580	447585	0 %	0 %	50 %	50 %	507526085
12231	NC_021294	TGAA	2	8	447611	447618	50 %	25 %	25 %	0 %	507526085
12232	NC_021294	CAG	2	6	447646	447651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526085
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12235	NC_021294	TCG	2	6	447863	447868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12236	NC_021294	CGT	2	6	447891	447896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12237	NC_021294	TCG	2	6	447998	448003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526086
12238	NC_021294	AT	3	6	448042	448047	50 %	50 %	0 %	0 %	507526086
12239	NC_021294	GAG	2	6	448086	448091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_021294	CAA	2	6	448165	448170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507526087
12241	NC_021294	GAA	2	6	448180	448185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507526087
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12489	NC_021294	TCG	2	6	456782	456787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526099
12490	NC_021294	CGTTG	2	10	456795	456804	0 %	40 %	40 %	20 %	507526099
12491	NC_021294	TGC	2	6	456830	456835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526099
12492	NC_021294	GCG	2	6	456856	456861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526099
12493	NC_021294	GC	3	6	456903	456908	0 %	0 %	50 %	50 %	507526099
12494	NC_021294	CGA	2	6	456942	456947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507526099
12495	NC_021294	CG	3	6	456951	456956	0 %	0 %	50 %	50 %	507526099
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12497	NC_021294	GGC	2	6	457092	457097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507526099
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12499	NC_021294	CGT	2	6	457127	457132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507526099
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