MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 33792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_021289	AGA	2	6	1264101	1264106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519509
33502	NC_021289	CGC	2	6	1264152	1264157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33503	NC_021289	TCGA	2	8	1264181	1264188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33504	NC_021289	GCG	2	6	1264190	1264195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33505	NC_021289	CG	4	8	1264210	1264217	0 %	0 %	50 %	50 %	507519510
33506	NC_021289	CG	3	6	1264220	1264225	0 %	0 %	50 %	50 %	507519510
33507	NC_021289	GCAC	2	8	1264231	1264238	25 %	0 %	25 %	50 %	507519510
33508	NC_021289	AGCG	2	8	1264269	1264276	25 %	0 %	50 %	25 %	507519510
33509	NC_021289	CGC	2	6	1264279	1264284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519510
33510	NC_021289	TCG	2	6	1264285	1264290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519510
33511	NC_021289	GCT	2	6	1264321	1264326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519510
33512	NC_021289	GGC	2	6	1264340	1264345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519510
33513	NC_021289	GC	3	6	1264361	1264366	0 %	0 %	50 %	50 %	507519510
33514	NC_021289	TCG	2	6	1264447	1264452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519510
33515	NC_021289	GCG	2	6	1264461	1264466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519510
33516	NC_021289	GC	3	6	1264495	1264500	0 %	0 %	50 %	50 %	507519510
33517	NC_021289	ACGG	2	8	1264601	1264608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33518	NC_021289	CG	3	6	1264661	1264666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33519	NC_021289	CGTTTG	3	18	1264707	1264724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33520	NC_021289	CAG	2	6	1264748	1264753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519511
33521	NC_021289	ACG	2	6	1264809	1264814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519511
33522	NC_021289	TGC	3	9	1264922	1264930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519511
33523	NC_021289	ATC	2	6	1264941	1264946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519511
33524	NC_021289	GC	4	8	1264988	1264995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33525	NC_021289	GC	4	8	1264999	1265006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33526	NC_021289	GCC	2	6	1265034	1265039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519512
33527	NC_021289	CGA	2	6	1265096	1265101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33528	NC_021289	CTT	2	6	1265111	1265116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
33529	NC_021289	CGGC	2	8	1265131	1265138	0 %	0 %	50 %	50 %	507519512
33530	NC_021289	CTT	2	6	1265241	1265246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
33531	NC_021289	CGAGCG	2	12	1265255	1265266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507519512
33532	NC_021289	CGG	2	6	1265297	1265302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519512
33533	NC_021289	CGA	2	6	1265343	1265348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33534	NC_021289	TGA	2	6	1265354	1265359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519512
33535	NC_021289	CG	3	6	1265372	1265377	0 %	0 %	50 %	50 %	507519512
33536	NC_021289	TTC	2	6	1265385	1265390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
33537	NC_021289	GCA	2	6	1265435	1265440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33538	NC_021289	CGT	2	6	1265441	1265446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33539	NC_021289	TCT	2	6	1265465	1265470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
33540	NC_021289	TGC	2	6	1265554	1265559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33541	NC_021289	CG	3	6	1265592	1265597	0 %	0 %	50 %	50 %	507519512
33542	NC_021289	CGTTG	2	10	1265643	1265652	0 %	40 %	40 %	20 %	507519512
33543	NC_021289	CGT	2	6	1265687	1265692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519512
33544	NC_021289	GCC	2	6	1265721	1265726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519512
33545	NC_021289	GCC	2	6	1265730	1265735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519512
33546	NC_021289	CAC	2	6	1265739	1265744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507519512
33547	NC_021289	CTC	2	6	1265770	1265775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33548	NC_021289	TC	3	6	1265785	1265790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33549	NC_021289	TGA	2	6	1265795	1265800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33550	NC_021289	CCGTT	2	10	1265821	1265830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33551	NC_021289	CG	3	6	1265881	1265886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33552	NC_021289	T	6	6	1265896	1265901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33553	NC_021289	CTA	2	6	1265913	1265918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33554	NC_021289	CCAGCG	2	12	1265945	1265956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507519513
33555	NC_021289	GCC	3	9	1265967	1265975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33556	NC_021289	GCA	2	6	1266026	1266031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519513
33557	NC_021289	CCG	2	6	1266088	1266093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33558	NC_021289	GCG	2	6	1266151	1266156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519513
33559	NC_021289	AGATCG	2	12	1266178	1266189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507519513
33560	NC_021289	CG	3	6	1266204	1266209	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33561	NC_021289	CCCATG	2	12	1266241	1266252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507519513
33562	NC_021289	GC	3	6	1266291	1266296	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33563	NC_021289	GCG	2	6	1266299	1266304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519513
33564	NC_021289	CTT	2	6	1266324	1266329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519513
33565	NC_021289	GAC	2	6	1266339	1266344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519513
33566	NC_021289	CGG	2	6	1266347	1266352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519513
33567	NC_021289	CGC	2	6	1266381	1266386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33568	NC_021289	CCTT	2	8	1266397	1266404	0 %	50 %	0 %	50 %	507519513
33569	NC_021289	TTGCG	2	10	1266493	1266502	0 %	40 %	40 %	20 %	507519513
33570	NC_021289	TCG	2	6	1266523	1266528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519513
33571	NC_021289	CTT	2	6	1266539	1266544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519513
33572	NC_021289	GC	4	8	1266548	1266555	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33573	NC_021289	CTG	2	6	1266591	1266596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519513
33574	NC_021289	CG	3	6	1266599	1266604	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33575	NC_021289	CCG	2	6	1266632	1266637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33576	NC_021289	GTT	2	6	1266654	1266659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507519513
33577	NC_021289	CGA	2	6	1266680	1266685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519513
33578	NC_021289	CG	3	6	1266728	1266733	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33579	NC_021289	GCG	2	6	1266749	1266754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519513
33580	NC_021289	GAT	2	6	1266807	1266812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519513
33581	NC_021289	GCC	2	6	1266820	1266825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33582	NC_021289	TTG	2	6	1266859	1266864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507519513
33583	NC_021289	GC	3	6	1266915	1266920	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33584	NC_021289	GC	3	6	1266994	1266999	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33585	NC_021289	CGAG	2	8	1267052	1267059	25 %	0 %	50 %	25 %	507519513
33586	NC_021289	CCG	2	6	1267060	1267065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33587	NC_021289	CCG	2	6	1267076	1267081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519513
33588	NC_021289	GC	3	6	1267083	1267088	0 %	0 %	50 %	50 %	507519513
33589	NC_021289	GTCA	2	8	1267107	1267114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33590	NC_021289	GC	4	8	1267169	1267176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33591	NC_021289	TCG	2	6	1267245	1267250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33592	NC_021289	ACG	2	6	1267292	1267297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33593	NC_021289	A	6	6	1267353	1267358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33594	NC_021289	TC	3	6	1267425	1267430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33595	NC_021289	GCC	2	6	1267460	1267465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33596	NC_021289	TTA	2	6	1267534	1267539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33597	NC_021289	CGTG	2	8	1267543	1267550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33598	NC_021289	A	6	6	1267600	1267605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33599	NC_021289	AAT	2	6	1267695	1267700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33600	NC_021289	GAC	2	6	1267711	1267716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33601	NC_021289	AT	4	8	1267811	1267818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33602	NC_021289	TA	4	8	1267834	1267841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33603	NC_021289	TAA	2	6	1267883	1267888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33604	NC_021289	AT	3	6	1267904	1267909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33605	NC_021289	TGAA	2	8	1267916	1267923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33606	NC_021289	CAT	2	6	1268063	1268068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519514
33607	NC_021289	GGT	2	6	1268113	1268118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507519514
33608	NC_021289	TCCT	2	8	1268162	1268169	0 %	50 %	0 %	50 %	507519514
33609	NC_021289	CG	3	6	1268195	1268200	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33610	NC_021289	CGT	2	6	1268207	1268212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519514
33611	NC_021289	AGC	2	6	1268214	1268219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519514
33612	NC_021289	CGG	2	6	1268227	1268232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519514
33613	NC_021289	TTCGA	2	10	1268310	1268319	20 %	40 %	20 %	20 %	507519514
33614	NC_021289	GC	4	8	1268351	1268358	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33615	NC_021289	GC	3	6	1268384	1268389	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33616	NC_021289	GC	4	8	1268447	1268454	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33617	NC_021289	GC	4	8	1268494	1268501	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33618	NC_021289	TCG	2	6	1268505	1268510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519514
33619	NC_021289	GC	4	8	1268528	1268535	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33620	NC_021289	GC	3	6	1268569	1268574	0 %	0 %	50 %	50 %	507519514
33621	NC_021289	GATGCC	2	12	1268606	1268617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507519514
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.