MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 33792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021289	CGA	2	6	605358	605363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518877
16003	NC_021289	CCG	2	6	605366	605371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518877
16004	NC_021289	CTT	2	6	605448	605453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518877
16005	NC_021289	GC	3	6	605470	605475	0 %	0 %	50 %	50 %	507518877
16006	NC_021289	TGC	2	6	605516	605521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518877
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16008	NC_021289	CGA	2	6	605694	605699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518878
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16013	NC_021289	GAA	2	6	605959	605964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518878
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16017	NC_021289	CGC	3	9	606078	606086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518878
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16021	NC_021289	CG	4	8	606139	606146	0 %	0 %	50 %	50 %	507518878
16022	NC_021289	ACG	2	6	606182	606187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518878
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16027	NC_021289	CGAT	2	8	606326	606333	25 %	25 %	25 %	25 %	507518878
16028	NC_021289	CGC	2	6	606358	606363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518878
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16033	NC_021289	GTG	2	6	606530	606535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518878
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16045	NC_021289	GAA	2	6	607053	607058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518880
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16053	NC_021289	CGAA	2	8	607339	607346	50 %	0 %	25 %	25 %	507518880
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16120	NC_021289	TTC	2	6	610018	610023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518882
16121	NC_021289	GAT	2	6	610058	610063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518882
16122	NC_021289	AC	3	6	610137	610142	50 %	0 %	0 %	50 %	507518883
16123	NC_021289	GC	4	8	610190	610197	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16124	NC_021289	TCG	2	6	610244	610249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16125	NC_021289	GCG	2	6	610345	610350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518883
16126	NC_021289	GCGA	2	8	610381	610388	25 %	0 %	50 %	25 %	507518883
16127	NC_021289	TCG	2	6	610391	610396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16128	NC_021289	CGT	2	6	610412	610417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16129	NC_021289	CCG	2	6	610435	610440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518883
16130	NC_021289	TCG	2	6	610463	610468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16131	NC_021289	CG	3	6	610501	610506	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16132	NC_021289	CGA	2	6	610545	610550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16133	NC_021289	CGA	2	6	610659	610664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16134	NC_021289	CGT	3	9	610683	610691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16135	NC_021289	CG	3	6	610710	610715	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16136	NC_021289	AAGGC	2	10	610736	610745	40 %	0 %	40 %	20 %	507518883
16137	NC_021289	GTC	2	6	610783	610788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
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16139	NC_021289	GTGC	2	8	610905	610912	0 %	25 %	50 %	25 %	507518883
16140	NC_021289	GCA	2	6	610914	610919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16141	NC_021289	GGA	2	6	610920	610925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518883
16142	NC_021289	CCGTT	2	10	610963	610972	0 %	40 %	20 %	40 %	507518883
16143	NC_021289	CAT	2	6	611023	611028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518883
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16146	NC_021289	CGCA	2	8	611197	611204	25 %	0 %	25 %	50 %	507518883
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16148	NC_021289	CAA	2	6	611217	611222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518883
16149	NC_021289	GC	3	6	611251	611256	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16150	NC_021289	GATG	2	8	611286	611293	25 %	25 %	50 %	0 %	507518883
16151	NC_021289	CG	4	8	611298	611305	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16152	NC_021289	GCGCG	2	10	611349	611358	0 %	0 %	60 %	40 %	507518883
16153	NC_021289	CGT	2	6	611376	611381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16154	NC_021289	GAA	2	6	611382	611387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518883
16155	NC_021289	GCG	2	6	611399	611404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518883
16156	NC_021289	GCG	2	6	611421	611426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518883
16157	NC_021289	GC	4	8	611457	611464	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16158	NC_021289	GGCG	2	8	611472	611479	0 %	0 %	75 %	25 %	507518883
16159	NC_021289	CAT	2	6	611555	611560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518883
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16161	NC_021289	GC	3	6	611631	611636	0 %	0 %	50 %	50 %	507518883
16162	NC_021289	CATT	2	8	611640	611647	25 %	50 %	0 %	25 %	507518883
16163	NC_021289	GAC	2	6	611667	611672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16164	NC_021289	CGAA	2	8	611687	611694	50 %	0 %	25 %	25 %	507518883
16165	NC_021289	GCA	2	6	611780	611785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16166	NC_021289	GGCG	2	8	611793	611800	0 %	0 %	75 %	25 %	507518883
16167	NC_021289	GAA	2	6	611869	611874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518883
16168	NC_021289	ACGC	2	8	612058	612065	25 %	0 %	25 %	50 %	507518883
16169	NC_021289	TCG	2	6	612122	612127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16170	NC_021289	GTC	2	6	612157	612162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518883
16171	NC_021289	CGG	2	6	612177	612182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518883
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16174	NC_021289	GCCCG	2	10	612276	612285	0 %	0 %	40 %	60 %	507518883
16175	NC_021289	TCAT	2	8	612308	612315	25 %	50 %	0 %	25 %	507518883
16176	NC_021289	GGC	2	6	612367	612372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518883
16177	NC_021289	CCG	2	6	612382	612387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518883
16178	NC_021289	CGC	2	6	612422	612427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518883
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16180	NC_021289	CGC	2	6	612458	612463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518883
16181	NC_021289	GCA	2	6	612573	612578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16182	NC_021289	GCG	2	6	612607	612612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518884
16183	NC_021289	TCG	2	6	612682	612687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16184	NC_021289	GTTC	2	8	612734	612741	0 %	50 %	25 %	25 %	507518884
16185	NC_021289	GCT	2	6	612791	612796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16186	NC_021289	GGC	2	6	612821	612826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518884
16187	NC_021289	CGG	2	6	612866	612871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518884
16188	NC_021289	ACG	2	6	613002	613007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16189	NC_021289	CGA	2	6	613013	613018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16190	NC_021289	ATC	2	6	613026	613031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518884
16191	NC_021289	CCG	2	6	613033	613038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518884
16192	NC_021289	TGT	2	6	613039	613044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518884
16193	NC_021289	ACG	2	6	613059	613064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16194	NC_021289	TAC	2	6	613077	613082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518884
16195	NC_021289	CGCA	2	8	613111	613118	25 %	0 %	25 %	50 %	507518884
16196	NC_021289	GTG	2	6	613161	613166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518884
16197	NC_021289	GC	3	6	613171	613176	0 %	0 %	50 %	50 %	507518884
16198	NC_021289	TCC	2	6	613184	613189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507518884
16199	NC_021289	CGA	2	6	613199	613204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16200	NC_021289	CG	3	6	613208	613213	0 %	0 %	50 %	50 %	507518884
16201	NC_021289	CGGCC	2	10	613229	613238	0 %	0 %	40 %	60 %	507518884
16202	NC_021289	GAC	2	6	613293	613298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518884
16203	NC_021289	CGG	2	6	613318	613323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518884
16204	NC_021289	GCG	2	6	613430	613435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518885
16205	NC_021289	GC	3	6	613444	613449	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16206	NC_021289	TCG	2	6	613541	613546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16207	NC_021289	TGCG	2	8	613584	613591	0 %	25 %	50 %	25 %	507518885
16208	NC_021289	CGA	2	6	613623	613628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16209	NC_021289	TGA	2	6	613637	613642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518885
16210	NC_021289	CAT	2	6	613669	613674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518885
16211	NC_021289	CG	4	8	613716	613723	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16212	NC_021289	CGA	2	6	613749	613754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16213	NC_021289	GC	3	6	613756	613761	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16214	NC_021289	TCG	2	6	613814	613819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16215	NC_021289	CGC	2	6	613932	613937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518885
16216	NC_021289	GC	3	6	613949	613954	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16217	NC_021289	CGC	2	6	613998	614003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518885
16218	NC_021289	CGA	2	6	614028	614033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16219	NC_021289	TCG	2	6	614039	614044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16220	NC_021289	CG	3	6	614202	614207	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16221	NC_021289	CGA	2	6	614217	614222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16222	NC_021289	CGC	2	6	614223	614228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518885
16223	NC_021289	GGACA	2	10	614254	614263	40 %	0 %	40 %	20 %	507518885
16224	NC_021289	CG	3	6	614276	614281	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16225	NC_021289	CG	3	6	614333	614338	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16226	NC_021289	TGC	2	6	614360	614365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518885
16227	NC_021289	GC	4	8	614438	614445	0 %	0 %	50 %	50 %	507518885
16228	NC_021289	CGG	2	6	614460	614465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518885
16229	NC_021289	CGC	2	6	614469	614474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518885
16230	NC_021289	CAT	2	6	614613	614618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16231	NC_021289	TGC	2	6	614789	614794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518886
16232	NC_021289	GCG	2	6	614803	614808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518886
16233	NC_021289	CGA	2	6	614823	614828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518886
16234	NC_021289	CG	3	6	614851	614856	0 %	0 %	50 %	50 %	507518886
16235	NC_021289	CG	3	6	614932	614937	0 %	0 %	50 %	50 %	507518886
16236	NC_021289	CG	3	6	614982	614987	0 %	0 %	50 %	50 %	507518886
16237	NC_021289	CGG	2	6	614991	614996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518886
16238	NC_021289	CGA	2	6	615036	615041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518886
16239	NC_021289	CG	3	6	615047	615052	0 %	0 %	50 %	50 %	507518886
16240	NC_021289	GC	3	6	615077	615082	0 %	0 %	50 %	50 %	507518886
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16359	NC_021289	TGC	2	6	620726	620731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518892
16360	NC_021289	TCA	2	6	620744	620749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518892
16361	NC_021289	CGT	2	6	620792	620797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518892
16362	NC_021289	GCA	2	6	620843	620848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518892
16363	NC_021289	TGG	2	6	620858	620863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518892
16364	NC_021289	GGCCG	2	10	620906	620915	0 %	0 %	60 %	40 %	507518892
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16366	NC_021289	GCA	2	6	620970	620975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518892
16367	NC_021289	GAA	2	6	620979	620984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518892
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16370	NC_021289	GAA	2	6	621116	621121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16371	NC_021289	CA	3	6	621129	621134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16372	NC_021289	GC	3	6	621196	621201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16373	NC_021289	GCT	2	6	621206	621211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16374	NC_021289	ATGA	2	8	621233	621240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16375	NC_021289	T	7	7	621278	621284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16376	NC_021289	CTAT	2	8	621297	621304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16377	NC_021289	GCA	2	6	621328	621333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16379	NC_021289	AAG	2	6	621364	621369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16380	NC_021289	GT	3	6	621414	621419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16381	NC_021289	AAT	2	6	621439	621444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16382	NC_021289	GACG	2	8	621528	621535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16383	NC_021289	CGG	2	6	621600	621605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518893
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16455	NC_021289	TG	3	6	624055	624060	0 %	50 %	50 %	0 %	507518894
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16477	NC_021289	ACTTCG	2	12	624939	624950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518896
16478	NC_021289	GC	3	6	624979	624984	0 %	0 %	50 %	50 %	507518896
16479	NC_021289	AGC	2	6	625038	625043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518896
16480	NC_021289	GC	4	8	625088	625095	0 %	0 %	50 %	50 %	507518896
16481	NC_021289	TTGA	2	8	625178	625185	25 %	50 %	25 %	0 %	507518896
16482	NC_021289	GC	3	6	625210	625215	0 %	0 %	50 %	50 %	507518896
16483	NC_021289	GCG	2	6	625237	625242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518896
16484	NC_021289	TCGG	2	8	625281	625288	0 %	25 %	50 %	25 %	507518896
16485	NC_021289	TCG	2	6	625303	625308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518896
16486	NC_021289	GCT	2	6	625369	625374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518896
16487	NC_021289	TCG	2	6	625423	625428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518896
16488	NC_021289	CG	3	6	625624	625629	0 %	0 %	50 %	50 %	507518896
16489	NC_021289	GTT	2	6	625634	625639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518896
16490	NC_021289	ATG	2	6	625665	625670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518896
16491	NC_021289	GTCGA	2	10	625680	625689	20 %	20 %	40 %	20 %	507518896
16492	NC_021289	TTC	2	6	625692	625697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518896
16493	NC_021289	GCAT	2	8	625764	625771	25 %	25 %	25 %	25 %	507518896
16494	NC_021289	GCTCG	2	10	625796	625805	0 %	20 %	40 %	40 %	507518896
16495	NC_021289	CGC	2	6	625882	625887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518896
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16497	NC_021289	GGAA	2	8	625942	625949	50 %	0 %	50 %	0 %	507518896
16498	NC_021289	CTG	2	6	625950	625955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518896
16499	NC_021289	CCATC	2	10	625958	625967	20 %	20 %	0 %	60 %	507518896
16500	NC_021289	GGC	2	6	625972	625977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518896

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