MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 33792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021289	TCG	2	6	546645	546650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518813
14502	NC_021289	GCG	2	6	546652	546657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518813
14503	NC_021289	TGA	2	6	546676	546681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518813
14504	NC_021289	ACG	2	6	546696	546701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518813
14505	NC_021289	ACG	2	6	546806	546811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_021289	TCGA	2	8	546874	546881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14507	NC_021289	CGA	2	6	546966	546971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_021289	CAG	2	6	547080	547085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_021289	AAG	2	6	547096	547101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_021289	TGA	2	6	547128	547133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_021289	CTA	2	6	547159	547164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_021289	GC	4	8	547181	547188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14513	NC_021289	CCA	2	6	547199	547204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14514	NC_021289	ACG	2	6	547206	547211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_021289	CAG	2	6	547275	547280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_021289	TGCG	2	8	547307	547314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14517	NC_021289	A	7	7	547319	547325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_021289	CCA	2	6	547418	547423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14519	NC_021289	GTG	2	6	547478	547483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518814
14520	NC_021289	ATCC	2	8	547527	547534	25 %	25 %	0 %	50 %	507518814
14521	NC_021289	GCT	2	6	547553	547558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518814
14522	NC_021289	GTA	2	6	547595	547600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518814
14523	NC_021289	GCG	2	6	547683	547688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_021289	GATC	2	8	547733	547740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14525	NC_021289	AGTG	2	8	547747	547754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_021289	AAG	2	6	547760	547765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_021289	GC	3	6	547798	547803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14528	NC_021289	GC	3	6	547886	547891	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14529	NC_021289	GCG	2	6	547929	547934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518815
14530	NC_021289	CCAC	2	8	548054	548061	25 %	0 %	0 %	75 %	507518815
14531	NC_021289	CG	3	6	548102	548107	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14532	NC_021289	TCC	2	6	548144	548149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507518815
14533	NC_021289	GATT	2	8	548151	548158	25 %	50 %	25 %	0 %	507518815
14534	NC_021289	GCG	2	6	548244	548249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518815
14535	NC_021289	CGA	2	6	548253	548258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518815
14536	NC_021289	GC	3	6	548284	548289	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14537	NC_021289	GCC	2	6	548309	548314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518815
14538	NC_021289	CG	3	6	548353	548358	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14539	NC_021289	GC	3	6	548364	548369	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14540	NC_021289	TGCA	2	8	548407	548414	25 %	25 %	25 %	25 %	507518815
14541	NC_021289	GAT	2	6	548442	548447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518815
14542	NC_021289	CGA	2	6	548454	548459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518815
14543	NC_021289	AGC	2	6	548492	548497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518815
14544	NC_021289	CCG	2	6	548544	548549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518815
14545	NC_021289	CG	3	6	548570	548575	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14546	NC_021289	GCG	3	9	548573	548581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518815
14547	NC_021289	GC	3	6	548593	548598	0 %	0 %	50 %	50 %	507518815
14548	NC_021289	CAGA	2	8	548632	548639	50 %	0 %	25 %	25 %	507518815
14549	NC_021289	CGCT	2	8	548654	548661	0 %	25 %	25 %	50 %	507518815
14550	NC_021289	GGC	2	6	548772	548777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518815
14551	NC_021289	ATG	2	6	548869	548874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_021289	CG	3	6	548886	548891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14553	NC_021289	ATG	2	6	548892	548897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_021289	GC	3	6	548938	548943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_021289	ATC	2	6	548949	548954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_021289	GAT	2	6	548970	548975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_021289	ATC	2	6	548985	548990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_021289	ATG	2	6	549003	549008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_021289	GGC	2	6	549069	549074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518816
14560	NC_021289	GC	3	6	549083	549088	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14561	NC_021289	AGCGA	2	10	549163	549172	40 %	0 %	40 %	20 %	507518816
14562	NC_021289	GC	4	8	549174	549181	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14563	NC_021289	CGC	2	6	549206	549211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518816
14564	NC_021289	TCT	2	6	549281	549286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518816
14565	NC_021289	GC	3	6	549292	549297	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14566	NC_021289	CGG	2	6	549310	549315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518816
14567	NC_021289	GGCAC	2	10	549337	549346	20 %	0 %	40 %	40 %	507518816
14568	NC_021289	CGT	2	6	549391	549396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
14569	NC_021289	CGA	2	6	549415	549420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518816
14570	NC_021289	TCA	2	6	549443	549448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518816
14571	NC_021289	TCG	2	6	549460	549465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
14572	NC_021289	CCGA	2	8	549498	549505	25 %	0 %	25 %	50 %	507518816
14573	NC_021289	CGG	2	6	549547	549552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518816
14574	NC_021289	GAAGA	2	10	549600	549609	60 %	0 %	40 %	0 %	507518816
14575	NC_021289	GC	3	6	549651	549656	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14576	NC_021289	CGC	2	6	549686	549691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518816
14577	NC_021289	CATTC	2	10	549705	549714	20 %	40 %	0 %	40 %	507518816
14578	NC_021289	GCT	2	6	549719	549724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
14579	NC_021289	TTC	2	6	549768	549773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518816
14580	NC_021289	ATC	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518816
14581	NC_021289	TGA	3	9	549838	549846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518816
14582	NC_021289	CTTT	2	8	549860	549867	0 %	75 %	0 %	25 %	507518816
14583	NC_021289	ACG	2	6	549940	549945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518816
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14585	NC_021289	CG	3	6	550027	550032	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14586	NC_021289	GCCG	2	8	550061	550068	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
14587	NC_021289	GAC	2	6	550094	550099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_021289	GAC	2	6	550135	550140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518817
14589	NC_021289	GCAC	2	8	550235	550242	25 %	0 %	25 %	50 %	507518817
14590	NC_021289	GGC	2	6	550328	550333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518817
14591	NC_021289	AGA	2	6	550412	550417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518817
14592	NC_021289	TCA	2	6	550430	550435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_021289	CTG	2	6	550540	550545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14594	NC_021289	CG	3	6	550605	550610	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14595	NC_021289	CGA	2	6	550629	550634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14596	NC_021289	CG	3	6	550644	550649	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14597	NC_021289	CGA	2	6	550659	550664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14598	NC_021289	TGC	2	6	550677	550682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14599	NC_021289	CTT	2	6	550686	550691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518818
14600	NC_021289	GGC	2	6	550720	550725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
14601	NC_021289	CG	5	10	550831	550840	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14602	NC_021289	GCG	2	6	550918	550923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
14603	NC_021289	TCG	2	6	550947	550952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14604	NC_021289	ACG	2	6	550955	550960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14605	NC_021289	CTG	2	6	550968	550973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14606	NC_021289	CGC	2	6	550974	550979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
14607	NC_021289	CGC	2	6	550987	550992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
14608	NC_021289	CCGATG	2	12	550995	551006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14609	NC_021289	CTG	2	6	551044	551049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14610	NC_021289	CGC	2	6	551077	551082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
14611	NC_021289	CGC	2	6	551098	551103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
14612	NC_021289	GCT	2	6	551131	551136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14613	NC_021289	GCG	2	6	551141	551146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
14614	NC_021289	GC	3	6	551149	551154	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14615	NC_021289	TGCGC	2	10	551179	551188	0 %	20 %	40 %	40 %	507518818
14616	NC_021289	GC	3	6	551234	551239	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14617	NC_021289	GGC	2	6	551244	551249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
14618	NC_021289	CT	3	6	551260	551265	0 %	50 %	0 %	50 %	507518818
14619	NC_021289	CGCC	2	8	551292	551299	0 %	0 %	25 %	75 %	507518818
14620	NC_021289	GC	3	6	551315	551320	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
14621	NC_021289	CAT	2	6	551325	551330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518818
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14623	NC_021289	GCA	2	6	551382	551387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14624	NC_021289	CGA	2	6	551388	551393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
14625	NC_021289	TCG	2	6	551450	551455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
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14672	NC_021289	T	6	6	553371	553376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14674	NC_021289	CATG	2	8	553444	553451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14681	NC_021289	CGT	2	6	553812	553817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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14728	NC_021289	CG	3	6	555474	555479	0 %	0 %	50 %	50 %	507518821
14729	NC_021289	GAGTG	2	10	555499	555508	20 %	20 %	60 %	0 %	507518821
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14734	NC_021289	GGC	2	6	555672	555677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518821
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14739	NC_021289	TCG	2	6	555848	555853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518821
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14744	NC_021289	TCGA	2	8	556022	556029	25 %	25 %	25 %	25 %	507518821
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14983	NC_021289	GC	3	6	565507	565512	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
14984	NC_021289	TGC	2	6	565545	565550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518831
14985	NC_021289	CAGC	2	8	565599	565606	25 %	0 %	25 %	50 %	507518831
14986	NC_021289	GC	3	6	565605	565610	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
14987	NC_021289	GCCG	2	8	565624	565631	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
14988	NC_021289	CGC	2	6	565651	565656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518831
14989	NC_021289	GCG	2	6	565698	565703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518831
14990	NC_021289	ATG	2	6	565716	565721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518831
14991	NC_021289	GC	3	6	565749	565754	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
14992	NC_021289	CGT	2	6	565756	565761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518831
14993	NC_021289	TGCGC	2	10	565765	565774	0 %	20 %	40 %	40 %	507518831
14994	NC_021289	GAT	2	6	565855	565860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518831
14995	NC_021289	GCT	2	6	565873	565878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518831
14996	NC_021289	CCG	2	6	565916	565921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518831
14997	NC_021289	GC	3	6	565969	565974	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
14998	NC_021289	CGC	2	6	566054	566059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518831
14999	NC_021289	GC	3	6	566093	566098	0 %	0 %	50 %	50 %	507518831
15000	NC_021289	ATC	2	6	566109	566114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518831

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