MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 23244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021288	CGC	2	6	510527	510532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517942
13002	NC_021288	ACT	2	6	510577	510582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517942
13003	NC_021288	ACTCGA	2	12	510638	510649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507517942
13004	NC_021288	CAG	2	6	510650	510655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517942
13005	NC_021288	CGT	2	6	510665	510670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517942
13006	NC_021288	CACGCG	2	12	510674	510685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507517942
13007	NC_021288	CG	4	8	510682	510689	0 %	0 %	50 %	50 %	507517942
13008	NC_021288	TGT	2	6	510872	510877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517943
13009	NC_021288	CGGC	2	8	510939	510946	0 %	0 %	50 %	50 %	507517943
13010	NC_021288	CGT	2	6	510962	510967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517943
13011	NC_021288	GTC	2	6	511069	511074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517943
13012	NC_021288	GCC	2	6	511110	511115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517943
13013	NC_021288	GGC	2	6	511141	511146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517943
13014	NC_021288	CTG	2	6	511167	511172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517943
13015	NC_021288	TC	3	6	511299	511304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_021288	ATCG	2	8	511319	511326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_021288	TTG	2	6	511335	511340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517944
13018	NC_021288	CGA	2	6	511512	511517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517944
13019	NC_021288	CGC	2	6	511539	511544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517944
13020	NC_021288	CG	3	6	511557	511562	0 %	0 %	50 %	50 %	507517944
13021	NC_021288	GC	4	8	511563	511570	0 %	0 %	50 %	50 %	507517944
13022	NC_021288	TCT	2	6	511605	511610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517944
13023	NC_021288	CGA	2	6	511614	511619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517944
13024	NC_021288	GC	3	6	511687	511692	0 %	0 %	50 %	50 %	507517944
13025	NC_021288	CGA	2	6	511770	511775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517944
13026	NC_021288	TCG	2	6	511776	511781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517944
13027	NC_021288	CGA	2	6	511986	511991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_021288	CTT	2	6	511996	512001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_021288	GAT	2	6	512044	512049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517945
13030	NC_021288	CAT	2	6	512077	512082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517945
13031	NC_021288	GCC	2	6	512119	512124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517945
13032	NC_021288	AAC	2	6	512144	512149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507517945
13033	NC_021288	GAT	3	9	512242	512250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517945
13034	NC_021288	GC	5	10	512290	512299	0 %	0 %	50 %	50 %	507517945
13035	NC_021288	GC	4	8	512397	512404	0 %	0 %	50 %	50 %	507517945
13036	NC_021288	CGG	2	6	512556	512561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517945
13037	NC_021288	GCC	2	6	512576	512581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517945
13038	NC_021288	CGA	2	6	512592	512597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517945
13039	NC_021288	CGA	2	6	512680	512685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517945
13040	NC_021288	ACG	2	6	512739	512744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13041	NC_021288	CG	3	6	512884	512889	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13042	NC_021288	GAT	2	6	512909	512914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13043	NC_021288	CGT	2	6	512977	512982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13044	NC_021288	GAT	2	6	513028	513033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13045	NC_021288	GCGACG	2	12	513065	513076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507517946
13046	NC_021288	ATC	2	6	513105	513110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517946
13047	NC_021288	GCA	2	6	513124	513129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13048	NC_021288	CGT	2	6	513139	513144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13049	NC_021288	GTT	3	9	513194	513202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517946
13050	NC_021288	GCTG	2	8	513208	513215	0 %	25 %	50 %	25 %	507517946
13051	NC_021288	TCA	2	6	513225	513230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517946
13052	NC_021288	AGC	2	6	513237	513242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13053	NC_021288	GAT	2	6	513308	513313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13054	NC_021288	CGTC	2	8	513322	513329	0 %	25 %	25 %	50 %	507517946
13055	NC_021288	CGC	2	6	513340	513345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13056	NC_021288	TGC	2	6	513367	513372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13057	NC_021288	CGT	2	6	513397	513402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13058	NC_021288	CGT	2	6	513445	513450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13059	NC_021288	CGT	2	6	513490	513495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13060	NC_021288	CGC	2	6	513556	513561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13061	NC_021288	GCC	2	6	513644	513649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13062	NC_021288	GGC	2	6	513720	513725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517946
13063	NC_021288	CGC	2	6	513748	513753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13064	NC_021288	GC	3	6	513752	513757	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13065	NC_021288	ATG	2	6	513828	513833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13066	NC_021288	GAT	2	6	513850	513855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13067	NC_021288	AGC	2	6	514008	514013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13068	NC_021288	GC	3	6	514048	514053	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13069	NC_021288	CG	4	8	514147	514154	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13070	NC_021288	GCG	3	9	514152	514160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517946
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13073	NC_021288	GCC	2	6	514307	514312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13074	NC_021288	GAT	2	6	514328	514333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13075	NC_021288	CGT	2	6	514360	514365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13076	NC_021288	GAT	2	6	514372	514377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13077	NC_021288	CGC	2	6	514468	514473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517946
13078	NC_021288	GC	3	6	514472	514477	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13079	NC_021288	TCG	2	6	514512	514517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517946
13080	NC_021288	AGC	2	6	514561	514566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517946
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13083	NC_021288	GAT	2	6	514637	514642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517946
13084	NC_021288	CGCT	2	8	514657	514664	0 %	25 %	25 %	50 %	507517946
13085	NC_021288	CG	3	6	514690	514695	0 %	0 %	50 %	50 %	507517946
13086	NC_021288	GATC	2	8	514817	514824	25 %	25 %	25 %	25 %	507517946
13087	NC_021288	CG	3	6	514869	514874	0 %	0 %	50 %	50 %	507517947
13088	NC_021288	GC	3	6	514896	514901	0 %	0 %	50 %	50 %	507517947
13089	NC_021288	AGC	2	6	515032	515037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13090	NC_021288	CGC	2	6	515057	515062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517947
13091	NC_021288	GA	3	6	515063	515068	50 %	0 %	50 %	0 %	507517947
13092	NC_021288	CCG	2	6	515129	515134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517947
13093	NC_021288	TGC	2	6	515167	515172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13094	NC_021288	AGAA	2	8	515188	515195	75 %	0 %	25 %	0 %	507517947
13095	NC_021288	CGCC	2	8	515204	515211	0 %	0 %	25 %	75 %	507517947
13096	NC_021288	GA	3	6	515329	515334	50 %	0 %	50 %	0 %	507517947
13097	NC_021288	TTC	2	6	515362	515367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517947
13098	NC_021288	AGA	2	6	515384	515389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517947
13099	NC_021288	TGA	2	6	515447	515452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517947
13100	NC_021288	GAT	2	6	515457	515462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517947
13101	NC_021288	CCG	2	6	515497	515502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517947
13102	NC_021288	AGC	2	6	515510	515515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13103	NC_021288	GCG	2	6	515516	515521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13104	NC_021288	TGA	2	6	515564	515569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517947
13105	NC_021288	GC	3	6	515673	515678	0 %	0 %	50 %	50 %	507517947
13106	NC_021288	TTG	2	6	515692	515697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517947
13107	NC_021288	TCG	2	6	515737	515742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13108	NC_021288	GCG	2	6	515749	515754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13109	NC_021288	GC	3	6	515814	515819	0 %	0 %	50 %	50 %	507517947
13110	NC_021288	GCG	2	6	515847	515852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13111	NC_021288	GAA	2	6	515877	515882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517947
13112	NC_021288	GCG	2	6	515947	515952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13113	NC_021288	TCG	2	6	516019	516024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13114	NC_021288	CG	3	6	516044	516049	0 %	0 %	50 %	50 %	507517947
13115	NC_021288	GGC	2	6	516068	516073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13116	NC_021288	GATT	2	8	516095	516102	25 %	50 %	25 %	0 %	507517947
13117	NC_021288	GAT	2	6	516108	516113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517947
13118	NC_021288	TGCGT	2	10	516206	516215	0 %	40 %	40 %	20 %	507517947
13119	NC_021288	GCG	2	6	516226	516231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13120	NC_021288	TCG	2	6	516250	516255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13121	NC_021288	GCG	2	6	516341	516346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517947
13122	NC_021288	GCA	2	6	516368	516373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13123	NC_021288	CTG	2	6	516405	516410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
13124	NC_021288	TCG	2	6	516442	516447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
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13126	NC_021288	GTA	2	6	516504	516509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517947
13127	NC_021288	CCG	2	6	516697	516702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517947
13128	NC_021288	GCCA	2	8	516785	516792	25 %	0 %	25 %	50 %	507517947
13129	NC_021288	CCG	2	6	516904	516909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517947
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13132	NC_021288	TCG	2	6	516946	516951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517947
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13145	NC_021288	CTCG	2	8	517310	517317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13146	NC_021288	CACG	2	8	517373	517380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13147	NC_021288	TGTC	2	8	517468	517475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13162	NC_021288	CG	3	6	518005	518010	0 %	0 %	50 %	50 %	507517948
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13227	NC_021288	CGAG	2	8	520528	520535	25 %	0 %	50 %	25 %	507517949
13228	NC_021288	CTGG	2	8	520550	520557	0 %	25 %	50 %	25 %	507517949
13229	NC_021288	GCT	2	6	520575	520580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517949
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13235	NC_021288	TCC	2	6	520776	520781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507517950
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13237	NC_021288	AGCG	2	8	520839	520846	25 %	0 %	50 %	25 %	507517950
13238	NC_021288	TTG	2	6	520852	520857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517950
13239	NC_021288	GGGC	2	8	520870	520877	0 %	0 %	75 %	25 %	507517950
13240	NC_021288	TCG	2	6	520890	520895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517950
13241	NC_021288	GC	3	6	520937	520942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13242	NC_021288	GTC	2	6	521009	521014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13243	NC_021288	AGTCGA	2	12	521086	521097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13244	NC_021288	GC	3	6	521124	521129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13245	NC_021288	CAC	2	6	521141	521146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13246	NC_021288	GCA	2	6	521158	521163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13247	NC_021288	ATC	2	6	521165	521170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13248	NC_021288	TGT	2	6	521179	521184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_021288	GTT	2	6	521189	521194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_021288	AGAC	2	8	521257	521264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13251	NC_021288	GC	3	6	521273	521278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13252	NC_021288	A	7	7	521449	521455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_021288	TCG	2	6	521471	521476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_021288	A	6	6	521487	521492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_021288	GCT	2	6	521559	521564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13256	NC_021288	ATT	2	6	521588	521593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_021288	GAT	2	6	521661	521666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517951
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13259	NC_021288	TGCG	2	8	521732	521739	0 %	25 %	50 %	25 %	507517951
13260	NC_021288	CTCGTT	2	12	521808	521819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	507517951
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13263	NC_021288	CGA	2	6	521865	521870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517951
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13270	NC_021288	GC	3	6	522174	522179	0 %	0 %	50 %	50 %	507517951
13271	NC_021288	GCA	2	6	522191	522196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517951
13272	NC_021288	GC	3	6	522209	522214	0 %	0 %	50 %	50 %	507517951
13273	NC_021288	TGC	2	6	522260	522265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517951
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13276	NC_021288	GCG	2	6	522379	522384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517952
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13278	NC_021288	TGC	2	6	522428	522433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517952
13279	NC_021288	TCGC	2	8	522463	522470	0 %	25 %	25 %	50 %	507517952
13280	NC_021288	GCG	2	6	522533	522538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517952
13281	NC_021288	ACG	2	6	522544	522549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517952
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13283	NC_021288	GGC	2	6	522602	522607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517952
13284	NC_021288	CGG	2	6	522690	522695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517952
13285	NC_021288	CAT	2	6	522699	522704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517952
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13301	NC_021288	GC	3	6	523625	523630	0 %	0 %	50 %	50 %	507517952
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13321	NC_021288	ACG	2	6	524337	524342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13332	NC_021288	CCG	2	6	524873	524878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13333	NC_021288	GAT	2	6	524919	524924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517955
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13343	NC_021288	CCG	2	6	525332	525337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517955
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13346	NC_021288	CA	3	6	525514	525519	50 %	0 %	0 %	50 %	507517955
13347	NC_021288	TAA	2	6	525538	525543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_021288	AAT	2	6	525568	525573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_021288	CG	3	6	525622	525627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13350	NC_021288	TGT	2	6	525692	525697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13351	NC_021288	CAA	2	6	525706	525711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13352	NC_021288	GAGCT	2	10	525716	525725	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13353	NC_021288	CAG	2	6	525809	525814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517956
13354	NC_021288	T	6	6	525883	525888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13355	NC_021288	TGC	2	6	525903	525908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13356	NC_021288	ATC	2	6	525994	525999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13357	NC_021288	A	6	6	526073	526078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_021288	A	6	6	526176	526181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_021288	GCA	2	6	526207	526212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13361	NC_021288	AAT	2	6	526291	526296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13482	NC_021288	GCT	2	6	532044	532049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517962
13483	NC_021288	TC	3	6	532058	532063	0 %	50 %	0 %	50 %	507517962
13484	NC_021288	CTCG	2	8	532110	532117	0 %	25 %	25 %	50 %	507517962
13485	NC_021288	CG	3	6	532198	532203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13486	NC_021288	TTC	3	9	532271	532279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517963
13487	NC_021288	CTG	2	6	532295	532300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517963
13488	NC_021288	CTA	2	6	532314	532319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517963
13489	NC_021288	TCG	2	6	532334	532339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517963
13490	NC_021288	AAC	2	6	532354	532359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13491	NC_021288	TCG	2	6	532386	532391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_021288	CG	3	6	532425	532430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13493	NC_021288	GC	3	6	532449	532454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13494	NC_021288	AACA	2	8	532520	532527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13495	NC_021288	ACA	2	6	532545	532550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_021288	GA	3	6	532596	532601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_021288	GAAC	2	8	532609	532616	50 %	0 %	25 %	25 %	507517964
13498	NC_021288	CGG	2	6	532827	532832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517964
13499	NC_021288	CGT	2	6	532859	532864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517964
13500	NC_021288	AGT	2	6	532881	532886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517964

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