MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 23244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021288	GCG	2	6	387957	387962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517842
10002	NC_021288	TTC	2	6	387993	387998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_021288	AGCG	2	8	388033	388040	25 %	0 %	50 %	25 %	507517843
10004	NC_021288	ACG	2	6	388053	388058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517843
10005	NC_021288	GC	3	6	388119	388124	0 %	0 %	50 %	50 %	507517843
10006	NC_021288	GCA	2	6	388176	388181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517843
10007	NC_021288	TTC	2	6	388205	388210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517843
10008	NC_021288	CGAT	2	8	388247	388254	25 %	25 %	25 %	25 %	507517843
10009	NC_021288	TCG	2	6	388358	388363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517843
10010	NC_021288	ATC	2	6	388447	388452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517843
10011	NC_021288	CGT	2	6	388503	388508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517843
10012	NC_021288	GCC	3	9	388510	388518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517843
10013	NC_021288	GAG	2	6	388597	388602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507517843
10014	NC_021288	GTG	2	6	388604	388609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517843
10015	NC_021288	GTCGC	2	10	388610	388619	0 %	20 %	40 %	40 %	507517843
10016	NC_021288	ATC	2	6	388640	388645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517843
10017	NC_021288	TCGCCG	2	12	388730	388741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507517843
10018	NC_021288	CG	3	6	388821	388826	0 %	0 %	50 %	50 %	507517843
10019	NC_021288	CTG	2	6	388837	388842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517843
10020	NC_021288	GTT	2	6	388870	388875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507517843
10021	NC_021288	TGG	2	6	388890	388895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517843
10022	NC_021288	GC	4	8	388903	388910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_021288	GCGG	2	8	388944	388951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_021288	GCC	2	6	389033	389038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_021288	GGTT	2	8	389063	389070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_021288	GAC	2	6	389083	389088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_021288	CGC	2	6	389116	389121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_021288	GAC	2	6	389161	389166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_021288	GAC	2	6	389204	389209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_021288	TGC	2	6	389247	389252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517844
10031	NC_021288	ATGG	2	8	389354	389361	25 %	25 %	50 %	0 %	507517844
10032	NC_021288	GC	3	6	389362	389367	0 %	0 %	50 %	50 %	507517844
10033	NC_021288	CG	3	6	389371	389376	0 %	0 %	50 %	50 %	507517844
10034	NC_021288	CGAT	2	8	389446	389453	25 %	25 %	25 %	25 %	507517844
10035	NC_021288	TCG	2	6	389633	389638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_021288	TTC	2	6	389659	389664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_021288	AG	3	6	389714	389719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021288	TTCGC	2	10	389838	389847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10039	NC_021288	GCC	2	6	389880	389885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_021288	GCG	2	6	389895	389900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021288	CCTTT	2	10	389901	389910	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10042	NC_021288	TCG	2	6	389925	389930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517845
10043	NC_021288	TGA	2	6	389937	389942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517845
10044	NC_021288	TCA	2	6	389948	389953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517845
10045	NC_021288	CAC	2	6	390058	390063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507517845
10046	NC_021288	GCC	2	6	390174	390179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517845
10047	NC_021288	TCG	2	6	390186	390191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517845
10048	NC_021288	CGC	2	6	390258	390263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517845
10049	NC_021288	CG	3	6	390300	390305	0 %	0 %	50 %	50 %	507517845
10050	NC_021288	GT	3	6	390345	390350	0 %	50 %	50 %	0 %	507517845
10051	NC_021288	GTCGA	2	10	390362	390371	20 %	20 %	40 %	20 %	507517845
10052	NC_021288	GCTC	2	8	390404	390411	0 %	25 %	25 %	50 %	507517845
10053	NC_021288	ATCGAC	2	12	390412	390423	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507517845
10054	NC_021288	GCCT	2	8	390427	390434	0 %	25 %	25 %	50 %	507517845
10055	NC_021288	TCG	2	6	390441	390446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517845
10056	NC_021288	CCG	2	6	390500	390505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517845
10057	NC_021288	CCT	2	6	390516	390521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507517845
10058	NC_021288	CTT	2	6	390534	390539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517845
10059	NC_021288	CCGG	2	8	390540	390547	0 %	0 %	50 %	50 %	507517845
10060	NC_021288	AAG	2	6	390572	390577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517845
10061	NC_021288	GGTC	2	8	390606	390613	0 %	25 %	50 %	25 %	507517845
10062	NC_021288	TGCT	2	8	390673	390680	0 %	50 %	25 %	25 %	507517845
10063	NC_021288	GCC	2	6	390715	390720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517845
10064	NC_021288	GA	3	6	390732	390737	50 %	0 %	50 %	0 %	507517845
10065	NC_021288	CCG	2	6	390738	390743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517845
10066	NC_021288	GAA	2	6	390835	390840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_021288	ACG	2	6	390940	390945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517846
10068	NC_021288	ACGTGG	2	12	390970	390981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507517846
10069	NC_021288	AGA	2	6	390992	390997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517846
10070	NC_021288	GCT	2	6	391152	391157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517846
10071	NC_021288	GCGAAC	2	12	391203	391214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517846
10072	NC_021288	CTCG	2	8	391257	391264	0 %	25 %	25 %	50 %	507517846
10073	NC_021288	GCC	2	6	391419	391424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517847
10074	NC_021288	CGG	2	6	391440	391445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517847
10075	NC_021288	TGA	2	6	391447	391452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517847
10076	NC_021288	CGC	2	6	391463	391468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517847
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10080	NC_021288	TCA	2	6	391646	391651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517847
10081	NC_021288	GGC	2	6	391662	391667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517847
10082	NC_021288	GGAC	2	8	391668	391675	25 %	0 %	50 %	25 %	507517847
10083	NC_021288	TGC	2	6	391677	391682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517847
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10085	NC_021288	GAT	2	6	391770	391775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517847
10086	NC_021288	AGCC	2	8	391804	391811	25 %	0 %	25 %	50 %	507517847
10087	NC_021288	GC	3	6	391820	391825	0 %	0 %	50 %	50 %	507517847
10088	NC_021288	CGGC	2	8	391828	391835	0 %	0 %	50 %	50 %	507517847
10089	NC_021288	CGA	2	6	391847	391852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517847
10090	NC_021288	CG	3	6	391907	391912	0 %	0 %	50 %	50 %	507517847
10091	NC_021288	GCG	2	6	391931	391936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517847
10092	NC_021288	GA	4	8	391992	391999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021288	CAAA	2	8	392097	392104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_021288	CGG	2	6	392185	392190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_021288	AACT	2	8	392252	392259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_021288	GCG	2	6	392328	392333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_021288	CG	3	6	392332	392337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_021288	TAG	2	6	392465	392470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_021288	GC	3	6	392471	392476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_021288	CACG	2	8	392535	392542	25 %	0 %	25 %	50 %	507517848
10101	NC_021288	GCA	2	6	392553	392558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517848
10102	NC_021288	AAG	2	6	392563	392568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517848
10103	NC_021288	A	6	6	392619	392624	100 %	0 %	0 %	0 %	507517848
10104	NC_021288	GAA	2	6	392641	392646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517848
10105	NC_021288	GAAG	2	8	392649	392656	50 %	0 %	50 %	0 %	507517848
10106	NC_021288	GCGT	2	8	392721	392728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_021288	CG	3	6	392814	392819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_021288	ACG	3	9	392872	392880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_021288	CGCC	2	8	392946	392953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10110	NC_021288	TGC	2	6	393032	393037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517849
10111	NC_021288	GCTC	2	8	393050	393057	0 %	25 %	25 %	50 %	507517849
10112	NC_021288	CCAC	2	8	393314	393321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10113	NC_021288	TCG	2	6	393377	393382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_021288	TG	3	6	393458	393463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021288	CG	4	8	393488	393495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_021288	ATT	2	6	393606	393611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021288	ATTG	2	8	393653	393660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_021288	GGCA	2	8	393719	393726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_021288	CTT	2	6	393898	393903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_021288	CG	3	6	394000	394005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_021288	ACCGGC	2	12	394110	394121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_021288	TCAT	2	8	394126	394133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10123	NC_021288	GCT	2	6	394230	394235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_021288	CGT	2	6	394259	394264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_021288	TTC	2	6	394315	394320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_021288	TA	3	6	394326	394331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021288	GCT	2	6	394361	394366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_021288	CAT	2	6	394423	394428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_021288	TA	3	6	394508	394513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_021288	CGA	2	6	394591	394596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_021288	GGT	2	6	394606	394611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021288	GCG	2	6	394615	394620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_021288	GCA	2	6	394656	394661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517850
10134	NC_021288	TC	3	6	394768	394773	0 %	50 %	0 %	50 %	507517850
10135	NC_021288	A	6	6	394798	394803	100 %	0 %	0 %	0 %	507517850
10136	NC_021288	GCA	2	6	394813	394818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517850
10137	NC_021288	GGC	2	6	394908	394913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_021288	GCGG	2	8	395057	395064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10139	NC_021288	AAT	2	6	395108	395113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_021288	GCT	2	6	395123	395128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_021288	CGAC	2	8	395185	395192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_021288	GAT	2	6	395221	395226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_021288	ATG	2	6	395285	395290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517851
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10145	NC_021288	CCGCG	2	10	395307	395316	0 %	0 %	40 %	60 %	507517851
10146	NC_021288	GC	3	6	395345	395350	0 %	0 %	50 %	50 %	507517851
10147	NC_021288	CG	3	6	395359	395364	0 %	0 %	50 %	50 %	507517851
10148	NC_021288	CGG	2	6	395392	395397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10149	NC_021288	TTG	2	6	395452	395457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_021288	GCG	2	6	395507	395512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_021288	TCAC	2	8	395516	395523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10152	NC_021288	CTTA	2	8	395560	395567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10153	NC_021288	ATC	2	6	395581	395586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10155	NC_021288	CGA	2	6	395772	395777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10156	NC_021288	GCGA	2	8	395897	395904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10157	NC_021288	AGC	2	6	395972	395977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517852
10158	NC_021288	CGA	2	6	395997	396002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517852
10159	NC_021288	AGCA	2	8	396005	396012	50 %	0 %	25 %	25 %	507517852
10160	NC_021288	TCG	2	6	396159	396164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_021288	TGA	2	6	396260	396265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_021288	GTCA	2	8	396289	396296	25 %	25 %	25 %	25 %	507517853
10163	NC_021288	CG	3	6	396307	396312	0 %	0 %	50 %	50 %	507517853
10164	NC_021288	TCA	2	6	396349	396354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517853
10165	NC_021288	CG	3	6	396377	396382	0 %	0 %	50 %	50 %	507517853
10166	NC_021288	GAT	2	6	396419	396424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517853
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10181	NC_021288	ATCA	2	8	397013	397020	50 %	25 %	0 %	25 %	507517853
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10189	NC_021288	GAA	2	6	397493	397498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10193	NC_021288	ATC	2	6	397619	397624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517854
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10198	NC_021288	AG	3	6	397914	397919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10199	NC_021288	CGA	2	6	397949	397954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10200	NC_021288	ATT	2	6	398026	398031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_021288	CAG	2	6	398117	398122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10207	NC_021288	CG	3	6	398501	398506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10208	NC_021288	ATTTT	2	10	398513	398522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10209	NC_021288	GC	3	6	398539	398544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10219	NC_021288	ACT	2	6	399022	399027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10230	NC_021288	CTT	2	6	399723	399728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517857
10231	NC_021288	GCCT	2	8	399766	399773	0 %	25 %	25 %	50 %	507517857
10232	NC_021288	GATC	2	8	399883	399890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10233	NC_021288	CTG	2	6	400027	400032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517858
10234	NC_021288	GGC	2	6	400053	400058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517858
10235	NC_021288	GGAC	2	8	400061	400068	25 %	0 %	50 %	25 %	507517858
10236	NC_021288	CCG	2	6	400090	400095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10237	NC_021288	GGC	2	6	400162	400167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10238	NC_021288	TC	3	6	400172	400177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10239	NC_021288	CGC	2	6	400253	400258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10240	NC_021288	GT	3	6	400379	400384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_021288	CG	3	6	400415	400420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10242	NC_021288	TCA	2	6	400424	400429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_021288	CGC	2	6	400454	400459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10244	NC_021288	CAT	2	6	400518	400523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_021288	CGAC	2	8	400539	400546	25 %	0 %	25 %	50 %	507517859
10246	NC_021288	AGC	2	6	400722	400727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517859
10247	NC_021288	AAC	2	6	400835	400840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507517859
10248	NC_021288	CTC	2	6	400940	400945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	507517859
10249	NC_021288	CCA	2	6	400979	400984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507517859
10250	NC_021288	GC	4	8	401029	401036	0 %	0 %	50 %	50 %	507517859
10251	NC_021288	CCG	2	6	401210	401215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517859
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10254	NC_021288	CGT	2	6	401254	401259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517859
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10260	NC_021288	ACT	2	6	401570	401575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10262	NC_021288	CAGG	2	8	401754	401761	25 %	0 %	50 %	25 %	507517860
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10350	NC_021288	A	7	7	406108	406114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10351	NC_021288	TGA	2	6	406128	406133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10352	NC_021288	GCT	2	6	406140	406145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10353	NC_021288	ACCG	2	8	406158	406165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10354	NC_021288	TA	4	8	406279	406286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_021288	GCG	2	6	406347	406352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517864
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10358	NC_021288	AGG	2	6	406474	406479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507517864
10359	NC_021288	GT	3	6	406570	406575	0 %	50 %	50 %	0 %	507517864
10360	NC_021288	GCA	3	9	406771	406779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517864
10361	NC_021288	CTGT	2	8	406827	406834	0 %	50 %	25 %	25 %	507517864
10362	NC_021288	AAG	2	6	406930	406935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517864
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10366	NC_021288	TCA	2	6	407392	407397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10367	NC_021288	GATG	2	8	407413	407420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_021288	A	6	6	407495	407500	100 %	0 %	0 %	0 %	507517865
10369	NC_021288	CAG	2	6	407538	407543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517865
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