MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. RPE64 DNA

Total Repeats: 23244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021288	CTT	2	6	19577	19582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507517462
502	NC_021288	CGA	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517462
503	NC_021288	GCA	2	6	19697	19702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517462
504	NC_021288	TCA	2	6	19717	19722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517462
505	NC_021288	CGC	2	6	19778	19783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517462
506	NC_021288	GAA	2	6	19788	19793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517462
507	NC_021288	ACA	2	6	19825	19830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507517462
508	NC_021288	CGA	2	6	19858	19863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517462
509	NC_021288	CGC	2	6	19961	19966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517462
510	NC_021288	CGA	2	6	20080	20085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517462
511	NC_021288	GATCA	2	10	20151	20160	40 %	20 %	20 %	20 %	507517462
512	NC_021288	CG	3	6	20194	20199	0 %	0 %	50 %	50 %	507517462
513	NC_021288	CGC	2	6	20228	20233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517462
514	NC_021288	CCG	2	6	20239	20244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517462
515	NC_021288	TGC	2	6	20281	20286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517462
516	NC_021288	AACGC	2	10	20298	20307	40 %	0 %	20 %	40 %	507517462
517	NC_021288	GCG	2	6	20332	20337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517462
518	NC_021288	GCC	2	6	20342	20347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517462
519	NC_021288	ACG	3	9	20389	20397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021288	GCG	2	6	20501	20506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
521	NC_021288	ACA	2	6	20534	20539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507517463
522	NC_021288	TGGC	2	8	20561	20568	0 %	25 %	50 %	25 %	507517463
523	NC_021288	CG	3	6	20584	20589	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
524	NC_021288	GGC	2	6	20592	20597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
525	NC_021288	GCC	3	9	20632	20640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517463
526	NC_021288	CG	3	6	20700	20705	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
527	NC_021288	CCG	2	6	20768	20773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517463
528	NC_021288	CGG	2	6	20790	20795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
529	NC_021288	CG	3	6	20858	20863	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
530	NC_021288	GTG	2	6	20887	20892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507517463
531	NC_021288	CGG	2	6	20945	20950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
532	NC_021288	CGT	2	6	20958	20963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517463
533	NC_021288	CGG	2	6	20972	20977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
534	NC_021288	CGC	2	6	20984	20989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517463
535	NC_021288	CGG	2	6	21035	21040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
536	NC_021288	TGC	2	6	21053	21058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517463
537	NC_021288	AT	3	6	21084	21089	50 %	50 %	0 %	0 %	507517463
538	NC_021288	CGG	2	6	21134	21139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
539	NC_021288	AAG	2	6	21178	21183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517463
540	NC_021288	CGG	2	6	21198	21203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
541	NC_021288	CGT	2	6	21246	21251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517463
542	NC_021288	GAT	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517463
543	NC_021288	TCGC	2	8	21361	21368	0 %	25 %	25 %	50 %	507517463
544	NC_021288	GC	3	6	21367	21372	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
545	NC_021288	ATGTCG	2	12	21458	21469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507517463
546	NC_021288	CG	4	8	21468	21475	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
547	NC_021288	GGC	2	6	21499	21504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517463
548	NC_021288	GCC	2	6	21517	21522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517463
549	NC_021288	GCT	2	6	21536	21541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517463
550	NC_021288	CGA	2	6	21551	21556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517463
551	NC_021288	GAA	2	6	21592	21597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517463
552	NC_021288	CGA	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517463
553	NC_021288	TCGCCA	2	12	21650	21661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507517463
554	NC_021288	CG	3	6	21712	21717	0 %	0 %	50 %	50 %	507517463
555	NC_021288	TAC	2	6	21904	21909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507517463
556	NC_021288	GC	3	6	21919	21924	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
557	NC_021288	TCGT	2	8	21939	21946	0 %	50 %	25 %	25 %	507517464
558	NC_021288	CG	3	6	21964	21969	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
559	NC_021288	CG	3	6	22032	22037	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
560	NC_021288	CGC	2	6	22051	22056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517464
561	NC_021288	AGC	2	6	22057	22062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517464
562	NC_021288	GC	3	6	22061	22066	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
563	NC_021288	CG	3	6	22151	22156	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
564	NC_021288	GC	4	8	22161	22168	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
565	NC_021288	GCA	2	6	22175	22180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517464
566	NC_021288	CGG	3	9	22208	22216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517464
567	NC_021288	GGCAA	2	10	22233	22242	40 %	0 %	40 %	20 %	507517464
568	NC_021288	TCG	2	6	22254	22259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517464
569	NC_021288	ACC	2	6	22281	22286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507517464
570	NC_021288	GAA	2	6	22337	22342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517464
571	NC_021288	TGC	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517464
572	NC_021288	CGCA	2	8	22450	22457	25 %	0 %	25 %	50 %	507517464
573	NC_021288	CGT	2	6	22490	22495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517464
574	NC_021288	CGG	2	6	22667	22672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517464
575	NC_021288	TGC	2	6	22711	22716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517464
576	NC_021288	CGCT	2	8	22723	22730	0 %	25 %	25 %	50 %	507517464
577	NC_021288	GCCGC	2	10	22743	22752	0 %	0 %	40 %	60 %	507517464
578	NC_021288	GC	4	8	22770	22777	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
579	NC_021288	CGA	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517464
580	NC_021288	CG	3	6	22817	22822	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
581	NC_021288	GC	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
582	NC_021288	CGATAT	2	12	22871	22882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	507517464
583	NC_021288	GC	3	6	22946	22951	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
584	NC_021288	CG	3	6	22977	22982	0 %	0 %	50 %	50 %	507517464
585	NC_021288	CCTG	2	8	22983	22990	0 %	25 %	25 %	50 %	507517464
586	NC_021288	CGA	2	6	22995	23000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021288	GC	3	6	23069	23074	0 %	0 %	50 %	50 %	507517465
588	NC_021288	GTC	2	6	23087	23092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517465
589	NC_021288	CACG	2	8	23137	23144	25 %	0 %	25 %	50 %	507517465
590	NC_021288	AAG	2	6	23186	23191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507517465
591	NC_021288	CTG	2	6	23219	23224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517465
592	NC_021288	GAC	2	6	23255	23260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517465
593	NC_021288	ATCA	2	8	23261	23268	50 %	25 %	0 %	25 %	507517465
594	NC_021288	AGC	2	6	23294	23299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517465
595	NC_021288	CGT	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517465
596	NC_021288	CGA	2	6	23430	23435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517465
597	NC_021288	AGC	2	6	23487	23492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517465
598	NC_021288	ACGG	2	8	23582	23589	25 %	0 %	50 %	25 %	507517465
599	NC_021288	CCG	2	6	23700	23705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517465
600	NC_021288	GC	3	6	23795	23800	0 %	0 %	50 %	50 %	507517465
601	NC_021288	CGA	2	6	23862	23867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517466
602	NC_021288	CGG	3	9	23877	23885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517466
603	NC_021288	TGC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517466
604	NC_021288	GC	3	6	23924	23929	0 %	0 %	50 %	50 %	507517466
605	NC_021288	CGG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517466
606	NC_021288	GC	3	6	24026	24031	0 %	0 %	50 %	50 %	507517466
607	NC_021288	GT	4	8	24064	24071	0 %	50 %	50 %	0 %	507517466
608	NC_021288	GCGT	2	8	24235	24242	0 %	25 %	50 %	25 %	507517467
609	NC_021288	ACG	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517467
610	NC_021288	GC	3	6	24268	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
611	NC_021288	GCGA	2	8	24383	24390	25 %	0 %	50 %	25 %	507517467
612	NC_021288	CG	3	6	24442	24447	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
613	NC_021288	TCG	2	6	24476	24481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517467
614	NC_021288	CGG	2	6	24513	24518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517467
615	NC_021288	CG	3	6	24524	24529	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
616	NC_021288	TCG	2	6	24536	24541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517467
617	NC_021288	GCG	3	9	24566	24574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517467
618	NC_021288	GAT	2	6	24580	24585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517467
619	NC_021288	GC	3	6	24603	24608	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
620	NC_021288	CG	4	8	24683	24690	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
621	NC_021288	ACG	2	6	24692	24697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517467
622	NC_021288	CG	3	6	24705	24710	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
623	NC_021288	ACG	2	6	24719	24724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517467
624	NC_021288	CGA	2	6	24735	24740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517467
625	NC_021288	CG	3	6	24744	24749	0 %	0 %	50 %	50 %	507517467
626	NC_021288	GCA	2	6	24759	24764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517467
627	NC_021288	CGG	2	6	24804	24809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517467
628	NC_021288	CGC	2	6	24834	24839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517467
629	NC_021288	GTC	2	6	24974	24979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517468
630	NC_021288	GC	3	6	24980	24985	0 %	0 %	50 %	50 %	507517468
631	NC_021288	CGCTG	2	10	25041	25050	0 %	20 %	40 %	40 %	507517468
632	NC_021288	ATG	2	6	25082	25087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517468
633	NC_021288	CATGAT	2	12	25123	25134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	507517468
634	NC_021288	GCCC	2	8	25143	25150	0 %	0 %	25 %	75 %	507517468
635	NC_021288	GAT	2	6	25177	25182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507517468
636	NC_021288	CG	3	6	25194	25199	0 %	0 %	50 %	50 %	507517468
637	NC_021288	TCG	2	6	25220	25225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517468
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649	NC_021288	CTG	2	6	25570	25575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507517468
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655	NC_021288	GGC	2	6	25833	25838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507517469
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667	NC_021288	CGC	2	6	26157	26162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517469
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724	NC_021288	GGCG	2	8	28446	28453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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726	NC_021288	GAA	2	6	28487	28492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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728	NC_021288	CAG	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
729	NC_021288	CGT	2	6	28557	28562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
730	NC_021288	TTCCG	2	10	28592	28601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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736	NC_021288	A	6	6	28809	28814	100 %	0 %	0 %	0 %	507517471
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742	NC_021288	ACG	2	6	28967	28972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_021288	TGC	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
744	NC_021288	CGG	2	6	29122	29127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
745	NC_021288	CA	3	6	29142	29147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
746	NC_021288	T	6	6	29227	29232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
747	NC_021288	ACT	2	6	29233	29238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
748	NC_021288	GC	3	6	29271	29276	0 %	0 %	50 %	50 %	507517472
749	NC_021288	TTTGG	2	10	29296	29305	0 %	60 %	40 %	0 %	507517472
750	NC_021288	CGCA	2	8	29332	29339	25 %	0 %	25 %	50 %	507517472
751	NC_021288	GCA	2	6	29358	29363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517472
752	NC_021288	GAC	2	6	29364	29369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507517472
753	NC_021288	GCC	2	6	29443	29448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507517472
754	NC_021288	CA	3	6	29571	29576	50 %	0 %	0 %	50 %	507517472
755	NC_021288	CTGGC	2	10	29614	29623	0 %	20 %	40 %	40 %	507517472
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