MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia thailandensis MSMB121 chromosome 2

Total Repeats: 89224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021174	CTG	2	6	4	9	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021174	CGC	2	6	58	63	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021174	TGA	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021174	CGC	2	6	110	115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021174	ACG	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021174	GAA	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021174	TCC	2	6	317	322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021174	CCG	3	9	423	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021174	TCA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021174	CCGA	2	8	453	460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021174	ATG	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021174	CGG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021174	GCG	2	6	561	566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021174	TCAG	2	8	594	601	25 %	25 %	25 %	25 %	488605519
15	NC_021174	GAC	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605519
16	NC_021174	CG	3	6	777	782	0 %	0 %	50 %	50 %	488605519
17	NC_021174	ATC	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021174	TCGA	2	8	850	857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021174	TCT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021174	CGCC	2	8	905	912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_021174	TG	3	6	1024	1029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021174	AGT	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021174	GCGCG	2	10	1138	1147	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021174	GGT	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021174	CGA	2	6	1236	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021174	CGA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021174	TGA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021174	TGC	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021174	CG	3	6	1387	1392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021174	CGC	2	6	1395	1400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021174	GC	3	6	1409	1414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021174	CAA	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021174	TGGT	2	8	1462	1469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021174	GAT	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021174	CGC	2	6	1526	1531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021174	CCCG	2	8	1532	1539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_021174	CGCC	2	8	1540	1547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_021174	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488605742
39	NC_021174	GTC	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488605742
40	NC_021174	CGC	2	6	1640	1645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605742
41	NC_021174	CTT	2	6	1695	1700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488605742
42	NC_021174	CGC	2	6	1722	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605742
43	NC_021174	GGC	2	6	1779	1784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605742
44	NC_021174	CCTTTT	2	12	1796	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488605742
45	NC_021174	CCT	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488605742
46	NC_021174	GAG	2	6	1821	1826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488605742
47	NC_021174	GCT	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488605742
48	NC_021174	AT	3	6	1884	1889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021174	CGG	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605638
50	NC_021174	TGTC	2	8	1933	1940	0 %	50 %	25 %	25 %	488605638
51	NC_021174	GC	4	8	1974	1981	0 %	0 %	50 %	50 %	488605638
52	NC_021174	CG	4	8	2012	2019	0 %	0 %	50 %	50 %	488605638
53	NC_021174	CGG	2	6	2028	2033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605638
54	NC_021174	CGC	2	6	2052	2057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605638
55	NC_021174	GCC	2	6	2306	2311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605638
56	NC_021174	CGC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605638
57	NC_021174	GCG	2	6	2357	2362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605638
58	NC_021174	TC	3	6	2363	2368	0 %	50 %	0 %	50 %	488605638
59	NC_021174	ACG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605638
60	NC_021174	AGC	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021174	CG	3	6	2458	2463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021174	GC	5	10	2484	2493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021174	CGA	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021174	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021174	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021174	TCG	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021174	GCG	2	6	2612	2617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021174	ATG	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021174	CGA	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021174	ATC	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021174	CG	3	6	2668	2673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021174	C	7	7	2716	2722	0 %	0 %	0 %	100 %	488605516
73	NC_021174	CGC	3	9	2734	2742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605516
74	NC_021174	CGC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605516
75	NC_021174	CCGGC	2	10	2803	2812	0 %	0 %	40 %	60 %	488605516
76	NC_021174	CAG	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605516
77	NC_021174	CGG	2	6	2872	2877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605516
78	NC_021174	GC	3	6	2886	2891	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
79	NC_021174	CGC	2	6	2895	2900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605516
80	NC_021174	TCG	3	9	2910	2918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488605516
81	NC_021174	CGA	2	6	2934	2939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605516
82	NC_021174	GCG	2	6	2945	2950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605516
83	NC_021174	GGC	2	6	2951	2956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605516
84	NC_021174	GTC	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488605516
85	NC_021174	GCC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605516
86	NC_021174	GC	4	8	3037	3044	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
87	NC_021174	ACG	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605516
88	NC_021174	GC	3	6	3067	3072	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
89	NC_021174	CG	3	6	3132	3137	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
90	NC_021174	CCA	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488605516
91	NC_021174	GCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488605516
92	NC_021174	TG	3	6	3183	3188	0 %	50 %	50 %	0 %	488605516
93	NC_021174	GC	3	6	3214	3219	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
94	NC_021174	CGG	2	6	3250	3255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488605516
95	NC_021174	CGGC	2	8	3274	3281	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
96	NC_021174	CGC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488605516
97	NC_021174	GC	3	6	3335	3340	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
98	NC_021174	GAC	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488605516
99	NC_021174	CGAT	2	8	3393	3400	25 %	25 %	25 %	25 %	488605516
100	NC_021174	GC	3	6	3435	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	488605516
101	NC_021174	GCG	2	6	3473	3478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021174	GC	3	6	3509	3514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021174	CGG	2	6	3519	3524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021174	CGTC	2	8	3527	3534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021174	A	7	7	3618	3624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021174	GCAC	2	8	3633	3640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021174	TCG	2	6	3738	3743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021174	ACCGA	2	10	3807	3816	40 %	0 %	20 %	40 %	488606783
109	NC_021174	TCGC	2	8	3840	3847	0 %	25 %	25 %	50 %	488606783
110	NC_021174	CGCC	2	8	3896	3903	0 %	0 %	25 %	75 %	488606783
111	NC_021174	CGC	2	6	3926	3931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
112	NC_021174	CGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
113	NC_021174	CGC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
114	NC_021174	GCGCCC	2	12	3969	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
115	NC_021174	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488606783
116	NC_021174	CCT	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488606783
117	NC_021174	CG	3	6	4043	4048	0 %	0 %	50 %	50 %	488606783
118	NC_021174	TCG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606783
119	NC_021174	TCG	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606783
120	NC_021174	GCC	2	6	4104	4109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
121	NC_021174	GC	3	6	4110	4115	0 %	0 %	50 %	50 %	488606783
122	NC_021174	ACG	2	6	4123	4128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488606783
123	NC_021174	CG	3	6	4134	4139	0 %	0 %	50 %	50 %	488606783
124	NC_021174	CGA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488606783
125	NC_021174	GC	4	8	4189	4196	0 %	0 %	50 %	50 %	488606783
126	NC_021174	CGT	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606783
127	NC_021174	GCC	2	6	4259	4264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606783
128	NC_021174	ACG	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488606783
129	NC_021174	ATC	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488606783
130	NC_021174	GCG	2	6	4353	4358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488606783
131	NC_021174	GAGC	2	8	4375	4382	25 %	0 %	50 %	25 %	488606783
132	NC_021174	CAC	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488606199
133	NC_021174	GC	3	6	4422	4427	0 %	0 %	50 %	50 %	488606199
134	NC_021174	GCGA	2	8	4448	4455	25 %	0 %	50 %	25 %	488606199
135	NC_021174	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606199
136	NC_021174	CTG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606199
137	NC_021174	CGAG	2	8	4560	4567	25 %	0 %	50 %	25 %	488606199
138	NC_021174	GGC	2	6	4597	4602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488606199
139	NC_021174	CG	3	6	4630	4635	0 %	0 %	50 %	50 %	488606199
140	NC_021174	CGCGG	2	10	4640	4649	0 %	0 %	60 %	40 %	488606199
141	NC_021174	GCTG	2	8	4683	4690	0 %	25 %	50 %	25 %	488606199
142	NC_021174	CGC	2	6	4709	4714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606199
143	NC_021174	CCG	2	6	4739	4744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606199
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145	NC_021174	CGC	2	6	4761	4766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606199
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267	NC_021174	CGCGG	2	10	7607	7616	0 %	0 %	60 %	40 %	488606117
268	NC_021174	CG	4	8	7630	7637	0 %	0 %	50 %	50 %	488606117
269	NC_021174	CGG	3	9	7657	7665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488606117
270	NC_021174	CGC	2	6	7668	7673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488606117
271	NC_021174	TCG	3	9	7686	7694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606117
272	NC_021174	ACG	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488606117
273	NC_021174	GC	3	6	7701	7706	0 %	0 %	50 %	50 %	488606117
274	NC_021174	CG	3	6	7713	7718	0 %	0 %	50 %	50 %	488606117
275	NC_021174	TGC	2	6	7728	7733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488606117
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277	NC_021174	CGA	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488606117
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279	NC_021174	GCGG	2	8	7874	7881	0 %	0 %	75 %	25 %	488606117
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379	NC_021174	CGCCC	2	10	10538	10547	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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391	NC_021174	CGC	2	6	10949	10954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_021174	GCGG	3	12	10987	10998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
393	NC_021174	CGG	2	6	11007	11012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_021174	TCG	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_021174	GCC	2	6	11093	11098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_021174	CGTT	2	8	11161	11168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
397	NC_021174	CGT	2	6	11279	11284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_021174	CCG	2	6	11300	11305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_021174	GCGG	2	8	11308	11315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
400	NC_021174	GCT	2	6	11333	11338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_021174	TCG	2	6	11346	11351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_021174	GGC	3	9	11406	11414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_021174	GGAT	2	8	11419	11426	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
404	NC_021174	GC	3	6	11430	11435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
405	NC_021174	CG	3	6	11443	11448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
406	NC_021174	TCCC	2	8	11449	11456	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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408	NC_021174	GCG	2	6	11473	11478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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