MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia thailandensis MSMB121 chromosome 1

Total Repeats: 124161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021173	GC	5	10	548516	548525	0 %	0 %	50 %	50 %	488603348
16002	NC_021173	ATC	2	6	548613	548618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488603348
16003	NC_021173	TGC	2	6	548626	548631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488603348
16004	NC_021173	GA	3	6	548643	548648	50 %	0 %	50 %	0 %	488603348
16005	NC_021173	GAG	2	6	548654	548659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488603348
16006	NC_021173	GGC	3	9	548730	548738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604643
16007	NC_021173	GTA	2	6	548839	548844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488604643
16008	NC_021173	GCG	2	6	548864	548869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604643
16009	NC_021173	CGC	2	6	548874	548879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604643
16010	NC_021173	TCG	2	6	548880	548885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16011	NC_021173	GCC	2	6	548894	548899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604643
16012	NC_021173	GC	3	6	548911	548916	0 %	0 %	50 %	50 %	488604643
16013	NC_021173	ACG	2	6	548924	548929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16014	NC_021173	GATACG	2	12	548955	548966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488604643
16015	NC_021173	CCG	2	6	549012	549017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604643
16016	NC_021173	GC	3	6	549048	549053	0 %	0 %	50 %	50 %	488604643
16017	NC_021173	CGCGGT	2	12	549118	549129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488604643
16018	NC_021173	CGGTG	2	10	549139	549148	0 %	20 %	60 %	20 %	488604643
16019	NC_021173	ACG	2	6	549149	549154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16020	NC_021173	CGCTT	3	15	549161	549175	0 %	40 %	20 %	40 %	488604643
16021	NC_021173	CTG	2	6	549232	549237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16022	NC_021173	CCT	2	6	549270	549275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488604643
16023	NC_021173	CG	3	6	549295	549300	0 %	0 %	50 %	50 %	488604643
16024	NC_021173	GAGC	2	8	549387	549394	25 %	0 %	50 %	25 %	488604643
16025	NC_021173	CGTGCG	2	12	549433	549444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488604643
16026	NC_021173	GCG	2	6	549449	549454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604643
16027	NC_021173	TCG	2	6	549461	549466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16028	NC_021173	CG	3	6	549481	549486	0 %	0 %	50 %	50 %	488604643
16029	NC_021173	CTG	2	6	549556	549561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16030	NC_021173	TGC	2	6	549578	549583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16031	NC_021173	GGTC	2	8	549633	549640	0 %	25 %	50 %	25 %	488604643
16032	NC_021173	TGC	2	6	549674	549679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16033	NC_021173	CGA	2	6	549684	549689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16034	NC_021173	TTC	3	9	549692	549700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488604643
16035	NC_021173	ACG	2	6	549704	549709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16036	NC_021173	CTG	2	6	549715	549720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16037	NC_021173	CGT	2	6	549769	549774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604643
16038	NC_021173	TGCG	2	8	549893	549900	0 %	25 %	50 %	25 %	488604643
16039	NC_021173	GGC	2	6	549913	549918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604643
16040	NC_021173	GGA	2	6	549949	549954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_021173	TCG	2	6	549976	549981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_021173	GC	3	6	549992	549997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16043	NC_021173	CG	3	6	550013	550018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_021173	CGGC	2	8	550022	550029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16045	NC_021173	GC	4	8	550034	550041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16046	NC_021173	GC	4	8	550054	550061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16047	NC_021173	GC	3	6	550063	550068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16048	NC_021173	GGC	2	6	550162	550167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_021173	CGA	2	6	550182	550187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_021173	CGG	2	6	550196	550201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_021173	GCG	2	6	550218	550223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_021173	GC	3	6	550345	550350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16053	NC_021173	GGC	2	6	550441	550446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_021173	GCAC	2	8	550495	550502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_021173	ACTA	2	8	550511	550518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16056	NC_021173	GGA	2	6	550532	550537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_021173	GTC	2	6	550562	550567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_021173	GAT	2	6	550606	550611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603541
16059	NC_021173	GC	3	6	550629	550634	0 %	0 %	50 %	50 %	488603541
16060	NC_021173	AGC	3	9	550718	550726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488603541
16061	NC_021173	GCC	2	6	550771	550776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603541
16062	NC_021173	TTG	2	6	550792	550797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488603541
16063	NC_021173	ATG	2	6	550826	550831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_021173	AAG	2	6	550868	550873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_021173	AG	3	6	550872	550877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_021173	ATC	2	6	550899	550904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_021173	TGG	2	6	550909	550914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_021173	TGA	2	6	550934	550939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488603234
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16070	NC_021173	CGA	2	6	551009	551014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488603234
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16072	NC_021173	GCC	2	6	551082	551087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603234
16073	NC_021173	GCC	3	9	551094	551102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603234
16074	NC_021173	GCC	2	6	551112	551117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488603234
16075	NC_021173	GATC	2	8	551123	551130	25 %	25 %	25 %	25 %	488603234
16076	NC_021173	AATC	2	8	551228	551235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_021173	TCG	2	6	551253	551258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_021173	GCGCG	2	10	551275	551284	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16079	NC_021173	TCCG	2	8	551289	551296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16080	NC_021173	GTC	2	6	551314	551319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_021173	TCG	2	6	551335	551340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_021173	TCG	2	6	551392	551397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_021173	C	6	6	551406	551411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16084	NC_021173	CGTT	2	8	551437	551444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16085	NC_021173	CGT	2	6	551445	551450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_021173	TCG	2	6	551468	551473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_021173	GCG	2	6	551515	551520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_021173	GCG	2	6	551531	551536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_021173	CG	3	6	551540	551545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16090	NC_021173	CG	3	6	551548	551553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16091	NC_021173	CGG	2	6	551591	551596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_021173	GGTT	2	8	551637	551644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_021173	TCA	2	6	551670	551675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_021173	GC	3	6	551712	551717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16095	NC_021173	GGCGG	2	10	551766	551775	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16096	NC_021173	ATT	2	6	551932	551937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_021173	CGT	2	6	551970	551975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_021173	CCG	3	9	552077	552085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16099	NC_021173	CGC	2	6	552092	552097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16100	NC_021173	GGC	2	6	552098	552103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_021173	GCG	2	6	552112	552117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_021173	TCCG	2	8	552137	552144	0 %	25 %	25 %	50 %	488604854
16103	NC_021173	CGGC	2	8	552237	552244	0 %	0 %	50 %	50 %	488604854
16104	NC_021173	CGA	2	6	552253	552258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
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16106	NC_021173	CGACG	2	10	552292	552301	20 %	0 %	40 %	40 %	488604854
16107	NC_021173	AGC	2	6	552302	552307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16108	NC_021173	CAG	3	9	552328	552336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16109	NC_021173	GAG	2	6	552367	552372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488604854
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16111	NC_021173	CGA	2	6	552432	552437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16112	NC_021173	AGC	2	6	552444	552449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16113	NC_021173	GC	3	6	552546	552551	0 %	0 %	50 %	50 %	488604854
16114	NC_021173	CTTGTT	2	12	552559	552570	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488604854
16115	NC_021173	TTC	2	6	552608	552613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488604854
16116	NC_021173	CAG	2	6	552640	552645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
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16119	NC_021173	CTG	2	6	552769	552774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16120	NC_021173	GCC	2	6	552832	552837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604854
16121	NC_021173	ACG	2	6	552866	552871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16122	NC_021173	TTG	2	6	552935	552940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488604854
16123	NC_021173	GAA	2	6	552991	552996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488604854
16124	NC_021173	TCG	2	6	553002	553007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16125	NC_021173	GAA	2	6	553018	553023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488604854
16126	NC_021173	GC	3	6	553024	553029	0 %	0 %	50 %	50 %	488604854
16127	NC_021173	CGT	2	6	553050	553055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604854
16128	NC_021173	GTCG	2	8	553063	553070	0 %	25 %	50 %	25 %	488604854
16129	NC_021173	CGTG	2	8	553104	553111	0 %	25 %	50 %	25 %	488604854
16130	NC_021173	GTC	2	6	553162	553167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604854
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16134	NC_021173	TAG	2	6	553295	553300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488604854
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16164	NC_021173	ATG	2	6	554461	554466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16166	NC_021173	CG	3	6	554482	554487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16167	NC_021173	CGG	2	6	554490	554495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16168	NC_021173	TCG	2	6	554499	554504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16170	NC_021173	GCT	2	6	554574	554579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16171	NC_021173	A	8	8	554644	554651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16172	NC_021173	TGA	2	6	554654	554659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16176	NC_021173	GGC	2	6	554802	554807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16191	NC_021173	CG	3	6	555231	555236	0 %	0 %	50 %	50 %	488603318
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16197	NC_021173	GGA	2	6	555457	555462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16198	NC_021173	GC	4	8	555475	555482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16199	NC_021173	CG	4	8	555499	555506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16200	NC_021173	GAGCG	2	10	555549	555558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16201	NC_021173	ACG	2	6	555574	555579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16203	NC_021173	CG	3	6	555606	555611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16204	NC_021173	TGCG	2	8	555616	555623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16205	NC_021173	GC	5	10	555638	555647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16206	NC_021173	CG	3	6	555648	555653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16207	NC_021173	GTG	2	6	555661	555666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16208	NC_021173	GGC	2	6	555671	555676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16210	NC_021173	GC	3	6	555711	555716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16211	NC_021173	CG	3	6	555727	555732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16212	NC_021173	CGAT	2	8	555747	555754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16213	NC_021173	CCA	2	6	555771	555776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16214	NC_021173	GC	3	6	555808	555813	0 %	0 %	50 %	50 %	488604672
16215	NC_021173	GCA	2	6	555877	555882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604672
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16220	NC_021173	TCG	2	6	556008	556013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604672
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16222	NC_021173	GAT	2	6	556132	556137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488604672
16223	NC_021173	ACT	2	6	556173	556178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488604672
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16226	NC_021173	G	6	6	556274	556279	0 %	0 %	100 %	0 %	488604672
16227	NC_021173	TCG	2	6	556293	556298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604672
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16229	NC_021173	GCC	2	6	556440	556445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604672
16230	NC_021173	CG	3	6	556460	556465	0 %	0 %	50 %	50 %	488604672
16231	NC_021173	TCGCGC	2	12	556473	556484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488604672
16232	NC_021173	TCG	2	6	556491	556496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604672
16233	NC_021173	GGC	3	9	556513	556521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604672
16234	NC_021173	GGC	2	6	556527	556532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604672
16235	NC_021173	CGT	2	6	556557	556562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604672
16236	NC_021173	ATCT	2	8	556661	556668	25 %	50 %	0 %	25 %	488604672
16237	NC_021173	GCGG	2	8	556894	556901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16238	NC_021173	GCG	2	6	556907	556912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16239	NC_021173	CGA	2	6	556920	556925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16240	NC_021173	GCG	2	6	556926	556931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16241	NC_021173	A	7	7	556956	556962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16242	NC_021173	GC	4	8	556977	556984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16243	NC_021173	T	6	6	556992	556997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16244	NC_021173	GCCG	2	8	556998	557005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16245	NC_021173	GTC	2	6	557025	557030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16246	NC_021173	CGC	2	6	557043	557048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16247	NC_021173	CCGACG	2	12	557105	557116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488604650
16248	NC_021173	CGC	4	12	557156	557167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604650
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16367	NC_021173	CG	3	6	560185	560190	0 %	0 %	50 %	50 %	488602339
16368	NC_021173	GAT	2	6	560199	560204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488602339
16369	NC_021173	CG	3	6	560266	560271	0 %	0 %	50 %	50 %	488602339
16370	NC_021173	GTC	2	6	560281	560286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488602339
16371	NC_021173	GAA	2	6	560353	560358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488602339
16372	NC_021173	TCGA	2	8	560371	560378	25 %	25 %	25 %	25 %	488602339
16373	NC_021173	TTG	2	6	560432	560437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488602339
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16375	NC_021173	CGA	2	6	560451	560456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488602339
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16388	NC_021173	GC	3	6	560738	560743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16468	NC_021173	GC	3	6	562927	562932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16471	NC_021173	CG	3	6	563096	563101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16472	NC_021173	CGG	2	6	563148	563153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16473	NC_021173	CG	3	6	563213	563218	0 %	0 %	50 %	50 %	488604933
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16489	NC_021173	GCA	3	9	563583	563591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488604933
16490	NC_021173	GGC	2	6	563598	563603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604933
16491	NC_021173	GCTCGT	2	12	563694	563705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604933
16492	NC_021173	CGG	3	9	563715	563723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604933
16493	NC_021173	CGG	2	6	563852	563857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488604933
16494	NC_021173	CG	3	6	563878	563883	0 %	0 %	50 %	50 %	488604933
16495	NC_021173	TGA	2	6	563990	563995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488604933
16496	NC_021173	ACGC	2	8	564011	564018	25 %	0 %	25 %	50 %	488604933
16497	NC_021173	CTG	2	6	564031	564036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604933
16498	NC_021173	CGT	3	9	564039	564047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488604933
16499	NC_021173	CGC	2	6	564069	564074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488604933
16500	NC_021173	GC	4	8	564073	564080	0 %	0 %	50 %	50 %	488604933

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