MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Butyrate-producing bacterium SM4/1

Total Repeats: 52447

< Previous12...3334353637383940414243...104105Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021024	TTTTC	2	10	1110172	1110181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18502	NC_021024	A	6	6	1110341	1110346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_021024	GGCA	2	8	1110405	1110412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18504	NC_021024	ATC	2	6	1110451	1110456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_021024	C	6	6	1110460	1110465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18506	NC_021024	CCTTC	2	10	1110486	1110495	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18507	NC_021024	AGG	2	6	1110530	1110535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_021024	CTG	2	6	1110641	1110646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18509	NC_021024	CTC	2	6	1110661	1110666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18510	NC_021024	GACA	2	8	1110685	1110692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18511	NC_021024	GCGG	2	8	1110734	1110741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18512	NC_021024	TA	3	6	1110916	1110921	50 %	50 %	0 %	0 %	479182564
18513	NC_021024	CTC	2	6	1110943	1110948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479182564
18514	NC_021024	CTC	2	6	1110952	1110957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479182564
18515	NC_021024	T	6	6	1111011	1111016	0 %	100 %	0 %	0 %	479182564
18516	NC_021024	CTG	2	6	1111039	1111044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18517	NC_021024	T	7	7	1111112	1111118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_021024	TCT	2	6	1111139	1111144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18519	NC_021024	TCC	2	6	1111249	1111254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18520	NC_021024	GCT	2	6	1111264	1111269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_021024	TTG	2	6	1111346	1111351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_021024	AGA	2	6	1111385	1111390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_021024	TTC	2	6	1111571	1111576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18524	NC_021024	CAT	2	6	1111633	1111638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18525	NC_021024	GCCTG	2	10	1111641	1111650	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18526	NC_021024	CGC	2	6	1111723	1111728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18527	NC_021024	CCT	2	6	1111755	1111760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18528	NC_021024	GAT	2	6	1111849	1111854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479182565
18529	NC_021024	TC	4	8	1111880	1111887	0 %	50 %	0 %	50 %	479182565
18530	NC_021024	TC	4	8	1111894	1111901	0 %	50 %	0 %	50 %	479182565
18531	NC_021024	GCT	2	6	1111930	1111935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18532	NC_021024	GCC	2	6	1112083	1112088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18533	NC_021024	GAG	2	6	1112185	1112190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_021024	CT	3	6	1112197	1112202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18535	NC_021024	CCGG	2	8	1112222	1112229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18536	NC_021024	CCCT	2	8	1112266	1112273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18537	NC_021024	GAGG	2	8	1112274	1112281	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_021024	GGC	2	6	1112289	1112294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_021024	TCC	2	6	1112328	1112333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18540	NC_021024	GCC	2	6	1112434	1112439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18541	NC_021024	C	6	6	1112467	1112472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18542	NC_021024	ATC	2	6	1112493	1112498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18543	NC_021024	CTCC	2	8	1112537	1112544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18544	NC_021024	CTG	2	6	1112545	1112550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_021024	GCC	2	6	1112610	1112615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18546	NC_021024	CGC	2	6	1112639	1112644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18547	NC_021024	TGTC	2	8	1112655	1112662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18548	NC_021024	CTC	2	6	1112700	1112705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18549	NC_021024	N	718	718	1112767	1113484	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_021024	A	6	6	1113492	1113497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_021024	T	6	6	1113559	1113564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_021024	CGG	2	6	1113617	1113622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18553	NC_021024	A	7	7	1113641	1113647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_021024	CT	3	6	1113653	1113658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18555	NC_021024	CGA	2	6	1113777	1113782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_021024	A	6	6	1113846	1113851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_021024	AGC	2	6	1113920	1113925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18558	NC_021024	CGG	2	6	1113937	1113942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18559	NC_021024	AGAA	2	8	1113972	1113979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_021024	TTTC	2	8	1113981	1113988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18561	NC_021024	CCTG	2	8	1114028	1114035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18562	NC_021024	GCC	2	6	1114051	1114056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18563	NC_021024	CCG	2	6	1114069	1114074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18564	NC_021024	TTC	2	6	1114093	1114098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_021024	TTCCC	2	10	1114121	1114130	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18566	NC_021024	TC	3	6	1114189	1114194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18567	NC_021024	GTG	2	6	1114210	1114215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_021024	A	6	6	1114245	1114250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_021024	TCC	2	6	1114291	1114296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18570	NC_021024	CTC	2	6	1114297	1114302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18571	NC_021024	CATG	2	8	1114369	1114376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18572	NC_021024	TC	3	6	1114411	1114416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18573	NC_021024	CTGC	2	8	1114730	1114737	0 %	25 %	25 %	50 %	479182566
18574	NC_021024	CCCG	2	8	1114835	1114842	0 %	0 %	25 %	75 %	479182566
18575	NC_021024	CTG	2	6	1114843	1114848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479182566
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18578	NC_021024	GCA	3	9	1114972	1114980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479182566
18579	NC_021024	TA	3	6	1114989	1114994	50 %	50 %	0 %	0 %	479182566
18580	NC_021024	ATA	3	9	1114992	1115000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479182566
18581	NC_021024	CCT	2	6	1115020	1115025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18582	NC_021024	T	6	6	1115052	1115057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18583	NC_021024	AGA	2	6	1115106	1115111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_021024	CAG	2	6	1115224	1115229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18585	NC_021024	AGC	2	6	1115313	1115318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18586	NC_021024	GCA	2	6	1115327	1115332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18587	NC_021024	GGC	2	6	1115347	1115352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18588	NC_021024	ATG	2	6	1115360	1115365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_021024	N	329	329	1115384	1115712	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_021024	TCC	2	6	1115723	1115728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18591	NC_021024	GCAG	2	8	1115747	1115754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18592	NC_021024	GCC	2	6	1115833	1115838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18593	NC_021024	GCT	2	6	1115854	1115859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18594	NC_021024	TCA	2	6	1115912	1115917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18595	NC_021024	GA	4	8	1115923	1115930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_021024	GGA	2	6	1115946	1115951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_021024	CAT	2	6	1115961	1115966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18598	NC_021024	CAG	2	6	1116000	1116005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18599	NC_021024	GCC	2	6	1116043	1116048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18600	NC_021024	GCC	3	9	1116126	1116134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479182567
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18603	NC_021024	AG	3	6	1116223	1116228	50 %	0 %	50 %	0 %	479182567
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18607	NC_021024	A	6	6	1116344	1116349	100 %	0 %	0 %	0 %	479182567
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18609	NC_021024	CCTG	2	8	1116385	1116392	0 %	25 %	25 %	50 %	479182567
18610	NC_021024	TTC	2	6	1116408	1116413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479182567
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18615	NC_021024	A	6	6	1116761	1116766	100 %	0 %	0 %	0 %	479182567
18616	NC_021024	CGC	2	6	1116787	1116792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479182567
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18624	NC_021024	CTGC	2	8	1117168	1117175	0 %	25 %	25 %	50 %	479182567
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18626	NC_021024	GGC	2	6	1117285	1117290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479182567
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18734	NC_021024	GAG	2	6	1122435	1122440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18735	NC_021024	N	251	251	1122550	1122800	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18737	NC_021024	CTG	2	6	1122912	1122917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18738	NC_021024	CTC	2	6	1122957	1122962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18742	NC_021024	GAT	2	6	1123054	1123059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18743	NC_021024	CAA	2	6	1123069	1123074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18744	NC_021024	GACG	2	8	1123112	1123119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18746	NC_021024	CGA	2	6	1123147	1123152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18749	NC_021024	GAG	2	6	1123331	1123336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18751	NC_021024	GAG	2	6	1123415	1123420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18753	NC_021024	CAGA	2	8	1123467	1123474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18754	NC_021024	TGCTG	2	10	1123526	1123535	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18755	NC_021024	N	357	357	1123577	1123933	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18871	NC_021024	GAG	2	6	1130509	1130514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18872	NC_021024	GGA	2	6	1130550	1130555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18873	NC_021024	AGA	3	9	1130561	1130569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18874	NC_021024	AAG	2	6	1130571	1130576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18875	NC_021024	ACC	3	9	1130764	1130772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18876	NC_021024	CCG	2	6	1130835	1130840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18877	NC_021024	GTACA	2	10	1130941	1130950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18878	NC_021024	N	481	481	1130968	1131448	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18879	NC_021024	CAGC	2	8	1131504	1131511	25 %	0 %	25 %	50 %	479182579
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18883	NC_021024	CTG	2	6	1131635	1131640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479182579
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18892	NC_021024	GCA	2	6	1131947	1131952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18893	NC_021024	TGCTC	2	10	1131953	1131962	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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18899	NC_021024	GGA	2	6	1132156	1132161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18901	NC_021024	GAG	2	6	1132315	1132320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18902	NC_021024	TCTG	2	8	1132356	1132363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18903	NC_021024	AG	3	6	1132410	1132415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18904	NC_021024	GTAC	2	8	1132434	1132441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18906	NC_021024	GAG	2	6	1132534	1132539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18982	NC_021024	TG	3	6	1138722	1138727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18993	NC_021024	TAT	2	6	1139216	1139221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18994	NC_021024	N	1858	1858	1139241	1141098	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18995	NC_021024	GCA	2	6	1141100	1141105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18996	NC_021024	TGAA	2	8	1141117	1141124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18997	NC_021024	AGC	2	6	1141142	1141147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18998	NC_021024	GAA	2	6	1141168	1141173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18999	NC_021024	AG	3	6	1141290	1141295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_021024	TG	3	6	1141332	1141337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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