MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 52756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	GTG	3	9	1	9	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021008	TAC	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021008	GTG	2	6	90	95	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021008	TGA	2	6	116	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021008	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021008	TCCT	2	8	144	151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021008	TTTTG	2	10	171	180	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021008	T	7	7	212	218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021008	GGC	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021008	TGG	2	6	303	308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021008	GACC	2	8	338	345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021008	GGT	2	6	378	383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021008	TCT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021008	ATGGG	2	10	436	445	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021008	CGG	2	6	466	471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021008	GCA	2	6	564	569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021008	CGC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021008	GAGT	2	8	670	677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021008	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021008	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021008	TCG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021008	CGGG	2	8	836	843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021008	GAA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021008	GAG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021008	GCG	2	6	1134	1139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021008	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021008	GGT	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021008	GTC	3	9	1252	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021008	TCGTG	2	10	1264	1273	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021008	CCG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021008	GGA	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021008	ATC	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021008	AC	3	6	1590	1595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021008	GCA	2	6	1619	1624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021008	CCT	2	6	1734	1739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021008	CG	3	6	1785	1790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021008	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021008	CGT	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021008	GGTG	2	8	1860	1867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021008	GGT	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021008	CGT	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021008	GCCG	2	8	1955	1962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021008	TGGCG	2	10	1976	1985	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021008	GTG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021008	TCGAA	2	10	2062	2071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021008	TGA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021008	GTC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021008	GTG	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021008	TG	3	6	2171	2176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021008	TTGC	2	8	2177	2184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021008	TGG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021008	GCC	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021008	ACCG	2	8	2303	2310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021008	G	6	6	2336	2341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021008	AGT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021008	GCGA	2	8	2399	2406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021008	GAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021008	GC	3	6	2454	2459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021008	GCCG	2	8	2496	2503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021008	GGGAG	2	10	2726	2735	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021008	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021008	GGA	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021008	G	6	6	2993	2998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021008	TC	3	6	3049	3054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021008	CGG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021008	TCG	3	9	3202	3210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021008	CGT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021008	AGG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021008	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021008	CAC	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021008	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021008	GCC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021008	TCCGGG	2	12	3678	3689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021008	GTA	2	6	3741	3746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021008	GCCG	2	8	3776	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021008	GGT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021008	GAT	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021008	GCC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021008	TGG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021008	AC	3	6	4056	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021008	CGG	2	6	4237	4242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021008	CG	3	6	4485	4490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021008	AGTGCA	2	12	4657	4668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021008	GAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021008	CCGGTG	2	12	4729	4740	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021008	TCG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021008	CGT	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021008	GAG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021008	TCC	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021008	GCC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021008	AGA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021008	GCG	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021008	CGC	3	9	5515	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021008	A	6	6	5598	5603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021008	ACG	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021008	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021008	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021008	T	7	7	5861	5867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021008	TGC	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
100	NC_021008	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134918
101	NC_021008	ATCA	2	8	6242	6249	50 %	25 %	0 %	25 %	479134918
102	NC_021008	GC	3	6	6285	6290	0 %	0 %	50 %	50 %	479134918
103	NC_021008	CGG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
104	NC_021008	CGG	2	6	6313	6318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
105	NC_021008	GGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
106	NC_021008	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
107	NC_021008	TGG	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134918
108	NC_021008	CTC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021008	CG	3	6	6461	6466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021008	GATG	2	8	6495	6502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021008	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
112	NC_021008	CGC	2	6	6691	6696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
113	NC_021008	GGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
114	NC_021008	CG	3	6	6769	6774	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
115	NC_021008	CAC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134919
116	NC_021008	GCCG	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
117	NC_021008	CG	4	8	6848	6855	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
118	NC_021008	GAA	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
119	NC_021008	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
120	NC_021008	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
121	NC_021008	GTCG	2	8	6932	6939	0 %	25 %	50 %	25 %	479134919
122	NC_021008	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
123	NC_021008	CTT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
124	NC_021008	CTG	3	9	7082	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
125	NC_021008	GCC	2	6	7142	7147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
126	NC_021008	GAC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134919
127	NC_021008	TCT	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
128	NC_021008	CGG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
129	NC_021008	GTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
130	NC_021008	TGG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
131	NC_021008	TCGGA	2	10	7255	7264	20 %	20 %	40 %	20 %	479134919
132	NC_021008	GCC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
133	NC_021008	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
134	NC_021008	TGG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
135	NC_021008	CCG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
136	NC_021008	TGA	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
137	NC_021008	GGA	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134919
138	NC_021008	CTT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
139	NC_021008	GAA	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
140	NC_021008	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
141	NC_021008	ATC	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
142	NC_021008	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
143	NC_021008	TCA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
144	NC_021008	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
145	NC_021008	GAA	2	6	7916	7921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
146	NC_021008	TGG	2	6	7999	8004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
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181	NC_021008	TGA	2	6	9050	9055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021008	CCT	2	6	12240	12245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
253	NC_021008	TGA	2	6	12303	12308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
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258	NC_021008	GAT	2	6	12463	12468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
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260	NC_021008	ACCG	2	8	12541	12548	25 %	0 %	25 %	50 %	479134921
261	NC_021008	AGC	2	6	12608	12613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
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264	NC_021008	GTG	2	6	12745	12750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021008	TCG	2	6	12753	12758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021008	AAAC	2	8	12819	12826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
267	NC_021008	TGA	2	6	12841	12846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021008	CTC	2	6	12864	12869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_021008	GTG	2	6	12882	12887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021008	TCG	2	6	12904	12909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_021008	CGT	2	6	12994	12999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134922
272	NC_021008	GGC	2	6	13018	13023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134922
273	NC_021008	CGT	2	6	13027	13032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134922
274	NC_021008	GCT	2	6	13052	13057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134922
275	NC_021008	ATG	2	6	13078	13083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134922
276	NC_021008	CG	3	6	13085	13090	0 %	0 %	50 %	50 %	479134923
277	NC_021008	CCGTG	2	10	13124	13133	0 %	20 %	40 %	40 %	479134923
278	NC_021008	CG	3	6	13157	13162	0 %	0 %	50 %	50 %	479134923
279	NC_021008	TGA	2	6	13187	13192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134923
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387	NC_021008	CAG	2	6	19294	19299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_021008	CTA	2	6	19831	19836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_021008	AAT	2	6	19893	19898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134931
401	NC_021008	TAC	2	6	19932	19937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
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403	NC_021008	TTG	3	9	19983	19991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134931
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