MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 51294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020517	GCA	2	6	553351	553356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12003	NC_020517	CCGG	2	8	553383	553390	0 %	0 %	50 %	50 %	476417555
12004	NC_020517	CCA	2	6	553398	553403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417555
12005	NC_020517	GCT	3	9	553411	553419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12006	NC_020517	CGC	2	6	553464	553469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417555
12007	NC_020517	ATG	2	6	553511	553516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417555
12008	NC_020517	CAG	2	6	553646	553651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12009	NC_020517	GGC	2	6	553657	553662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417555
12010	NC_020517	GCA	2	6	553694	553699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12011	NC_020517	GT	3	6	553851	553856	0 %	50 %	50 %	0 %	476417555
12012	NC_020517	CGA	2	6	553885	553890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12013	NC_020517	TAT	2	6	553924	553929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	476417555
12014	NC_020517	AGC	2	6	553962	553967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417555
12015	NC_020517	GCGCG	2	10	553981	553990	0 %	0 %	60 %	40 %	476417555
12016	NC_020517	CGTTA	2	10	554091	554100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12017	NC_020517	GGC	2	6	554129	554134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_020517	TGC	2	6	554161	554166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_020517	GCA	2	6	554196	554201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_020517	GCAAT	2	10	554207	554216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12021	NC_020517	AACGC	2	10	554283	554292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12022	NC_020517	GTC	2	6	554404	554409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_020517	GAT	2	6	554437	554442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_020517	CGG	2	6	554535	554540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12025	NC_020517	CCCAGC	2	12	554552	554563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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12027	NC_020517	GAT	2	6	554614	554619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_020517	TGA	2	6	554625	554630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_020517	GAG	2	6	554659	554664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_020517	AGGC	2	8	554676	554683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12031	NC_020517	GTT	2	6	554754	554759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_020517	GCT	2	6	554773	554778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12035	NC_020517	GTG	2	6	554913	554918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_020517	GTG	2	6	554929	554934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_020517	TG	3	6	554933	554938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_020517	TGG	2	6	554973	554978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_020517	GGGGA	2	10	555009	555018	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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12043	NC_020517	ACC	2	6	555338	555343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12044	NC_020517	AGG	2	6	555366	555371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_020517	AAG	2	6	555391	555396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417556
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12083	NC_020517	C	6	6	556894	556899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12089	NC_020517	GGT	2	6	557089	557094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417557
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12098	NC_020517	CTG	2	6	557204	557209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417557
12099	NC_020517	GTC	2	6	557227	557232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417557
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12109	NC_020517	CCA	2	6	557565	557570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417557
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12111	NC_020517	TCT	2	6	557679	557684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417557
12112	NC_020517	ATC	2	6	557687	557692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417557
12113	NC_020517	CGAGC	2	10	557713	557722	20 %	0 %	40 %	40 %	476417557
12114	NC_020517	CAC	2	6	557755	557760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417557
12115	NC_020517	TAC	2	6	557762	557767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417557
12116	NC_020517	TCA	2	6	557850	557855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417557
12117	NC_020517	GAC	3	9	557910	557918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417557
12118	NC_020517	GCGT	2	8	557955	557962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12119	NC_020517	GCA	2	6	557973	557978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417558
12120	NC_020517	CTGA	2	8	557988	557995	25 %	25 %	25 %	25 %	476417558
12121	NC_020517	GCC	2	6	558021	558026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417558
12122	NC_020517	CGC	2	6	558059	558064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417558
12123	NC_020517	GGC	2	6	558071	558076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417558
12124	NC_020517	GCGCAG	2	12	558080	558091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	476417558
12125	NC_020517	TGA	2	6	558139	558144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417558
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12130	NC_020517	GTC	2	6	558351	558356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417558
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12137	NC_020517	ATC	2	6	558543	558548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417558
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12142	NC_020517	ATC	2	6	558882	558887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417558
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12145	NC_020517	CTC	2	6	558981	558986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12146	NC_020517	AG	3	6	558987	558992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12147	NC_020517	CT	3	6	559023	559028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12148	NC_020517	GAG	2	6	559029	559034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12149	NC_020517	ACT	2	6	559133	559138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417559
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12193	NC_020517	CAT	2	6	561178	561183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417559
12194	NC_020517	TGT	2	6	561281	561286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12195	NC_020517	GGA	2	6	561293	561298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12196	NC_020517	CGA	2	6	561311	561316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417560
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12203	NC_020517	CTG	2	6	561654	561659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417560
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12210	NC_020517	CAT	2	6	561953	561958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417560
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12217	NC_020517	GAT	2	6	562409	562414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12218	NC_020517	AAGGA	2	10	562489	562498	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12219	NC_020517	CGTT	2	8	562518	562525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12220	NC_020517	GCC	2	6	562602	562607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
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12224	NC_020517	GCC	2	6	562668	562673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
12225	NC_020517	GAT	2	6	562704	562709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417561
12226	NC_020517	GGT	2	6	562716	562721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417561
12227	NC_020517	GAA	2	6	562749	562754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417561
12228	NC_020517	GCG	2	6	562756	562761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12229	NC_020517	GCT	2	6	562805	562810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12230	NC_020517	GGC	3	9	562884	562892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12231	NC_020517	GCA	2	6	562938	562943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12232	NC_020517	AGCA	2	8	562995	563002	50 %	0 %	25 %	25 %	476417561
12233	NC_020517	CCG	2	6	563050	563055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
12234	NC_020517	GTC	2	6	563241	563246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12235	NC_020517	CTA	2	6	563342	563347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417561
12236	NC_020517	TGGCA	2	10	563355	563364	20 %	20 %	40 %	20 %	476417561
12237	NC_020517	AAGA	2	8	563412	563419	75 %	0 %	25 %	0 %	476417561
12238	NC_020517	TGG	2	6	563425	563430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417561
12239	NC_020517	CGT	2	6	563437	563442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12240	NC_020517	GAT	2	6	563457	563462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417561
12241	NC_020517	GAC	2	6	563466	563471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12242	NC_020517	AGTAA	2	10	563490	563499	60 %	20 %	20 %	0 %	476417561
12243	NC_020517	AGGCC	2	10	563537	563546	20 %	0 %	40 %	40 %	476417561
12244	NC_020517	CG	3	6	563556	563561	0 %	0 %	50 %	50 %	476417561
12245	NC_020517	ATG	2	6	563593	563598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417561
12246	NC_020517	ACG	2	6	563611	563616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12247	NC_020517	GT	3	6	563623	563628	0 %	50 %	50 %	0 %	476417561
12248	NC_020517	CGG	2	6	563663	563668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12249	NC_020517	TGG	2	6	563686	563691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417561
12250	NC_020517	GGC	2	6	563712	563717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12251	NC_020517	CGGC	2	8	563731	563738	0 %	0 %	50 %	50 %	476417561
12252	NC_020517	GGC	2	6	563772	563777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12253	NC_020517	TTCGAT	2	12	563802	563813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	476417561
12254	NC_020517	CT	3	6	563828	563833	0 %	50 %	0 %	50 %	476417561
12255	NC_020517	AGAT	2	8	563887	563894	50 %	25 %	25 %	0 %	476417561
12256	NC_020517	GACT	2	8	563912	563919	25 %	25 %	25 %	25 %	476417561
12257	NC_020517	CAC	2	6	564065	564070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417561
12258	NC_020517	ACG	2	6	564082	564087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12259	NC_020517	CCA	2	6	564094	564099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417561
12260	NC_020517	TCACCG	2	12	564100	564111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	476417561
12261	NC_020517	ACGG	2	8	564135	564142	25 %	0 %	50 %	25 %	476417561
12262	NC_020517	CGC	2	6	564221	564226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
12263	NC_020517	GC	4	8	564236	564243	0 %	0 %	50 %	50 %	476417561
12264	NC_020517	CGC	2	6	564356	564361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
12265	NC_020517	ACCATC	2	12	564492	564503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	476417561
12266	NC_020517	CCTG	2	8	564512	564519	0 %	25 %	25 %	50 %	476417561
12267	NC_020517	AATC	2	8	564626	564633	50 %	25 %	0 %	25 %	476417561
12268	NC_020517	TCGC	2	8	564654	564661	0 %	25 %	25 %	50 %	476417561
12269	NC_020517	GCC	2	6	564681	564686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
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12272	NC_020517	ACC	2	6	564816	564821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417561
12273	NC_020517	CCG	2	6	564907	564912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417561
12274	NC_020517	GCG	2	6	564954	564959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12275	NC_020517	GGT	2	6	565035	565040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417561
12276	NC_020517	CTA	2	6	565078	565083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417561
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12279	NC_020517	CGG	2	6	565211	565216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417561
12280	NC_020517	GCTT	2	8	565223	565230	0 %	50 %	25 %	25 %	476417561
12281	NC_020517	CGT	2	6	565233	565238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417561
12282	NC_020517	ATG	2	6	565270	565275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12283	NC_020517	GTCT	2	8	565382	565389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12284	NC_020517	GCGAT	2	10	565397	565406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12285	NC_020517	ATCG	2	8	565698	565705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12286	NC_020517	TGT	2	6	565776	565781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12287	NC_020517	C	6	6	565843	565848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12288	NC_020517	CAT	2	6	565920	565925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417562
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12290	NC_020517	CGA	3	9	566019	566027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417562
12291	NC_020517	GTC	2	6	566041	566046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417562
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12295	NC_020517	CGC	2	6	566127	566132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417562
12296	NC_020517	ACA	2	6	566141	566146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417562
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12302	NC_020517	GGCC	2	8	566426	566433	0 %	0 %	50 %	50 %	476417562
12303	NC_020517	GCA	2	6	566463	566468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417562
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12307	NC_020517	CAT	3	9	566640	566648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417562
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12309	NC_020517	CCG	2	6	566711	566716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417562
12310	NC_020517	TCACCT	2	12	566774	566785	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	476417562
12311	NC_020517	CGT	2	6	566805	566810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417563
12312	NC_020517	GCC	2	6	566836	566841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417563
12313	NC_020517	TCATTG	2	12	566881	566892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	476417563
12314	NC_020517	CGG	2	6	566893	566898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417563
12315	NC_020517	CTG	3	9	566919	566927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417563
12316	NC_020517	CGG	2	6	566960	566965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417563
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12319	NC_020517	GAT	2	6	567102	567107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417563
12320	NC_020517	CAAATA	2	12	567134	567145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	476417563
12321	NC_020517	TG	3	6	567156	567161	0 %	50 %	50 %	0 %	476417563
12322	NC_020517	GTG	3	9	567159	567167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417563
12323	NC_020517	CAC	2	6	567224	567229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417563
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12325	NC_020517	CCG	2	6	567388	567393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417563
12326	NC_020517	CCA	2	6	567406	567411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417563
12327	NC_020517	TCC	2	6	567511	567516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417563
12328	NC_020517	AGG	2	6	567550	567555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417563
12329	NC_020517	GTC	2	6	567618	567623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12330	NC_020517	ACT	2	6	567667	567672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12331	NC_020517	AGA	2	6	567727	567732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_020517	AGT	2	6	567757	567762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12333	NC_020517	TGAG	2	8	567836	567843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12334	NC_020517	TGAC	2	8	567864	567871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12335	NC_020517	TCA	2	6	567872	567877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12336	NC_020517	CAC	2	6	567979	567984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417564
12337	NC_020517	AC	3	6	567983	567988	50 %	0 %	0 %	50 %	476417564
12338	NC_020517	GCA	2	6	567990	567995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417564
12339	NC_020517	AAC	2	6	568071	568076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417564
12340	NC_020517	GCC	2	6	568164	568169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417564
12341	NC_020517	CTG	2	6	568200	568205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417564
12342	NC_020517	GGTGCT	2	12	568211	568222	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	476417564
12343	NC_020517	GCCG	2	8	568323	568330	0 %	0 %	50 %	50 %	476417564
12344	NC_020517	TTC	2	6	568338	568343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417564
12345	NC_020517	CATCGC	2	12	568358	568369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	476417564
12346	NC_020517	GGC	2	6	568392	568397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417564
12347	NC_020517	CGG	2	6	568439	568444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417564
12348	NC_020517	TGT	2	6	568474	568479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417564
12349	NC_020517	GGC	2	6	568488	568493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417564
12350	NC_020517	CAT	3	9	568517	568525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417564
12351	NC_020517	TGC	2	6	568531	568536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417564
12352	NC_020517	CCG	2	6	568578	568583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417564
12353	NC_020517	GCG	2	6	568726	568731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417564
12354	NC_020517	GTT	2	6	568787	568792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417564
12355	NC_020517	GCC	2	6	568830	568835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417564
12356	NC_020517	GCATG	2	10	568844	568853	20 %	20 %	40 %	20 %	476417564
12357	NC_020517	CTG	2	6	568938	568943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417564
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12359	NC_020517	GTCG	2	8	568964	568971	0 %	25 %	50 %	25 %	476417564
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12477	NC_020517	TGG	2	6	575038	575043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12481	NC_020517	GCT	2	6	575437	575442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417568
12482	NC_020517	CTG	2	6	575458	575463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417568
12483	NC_020517	TG	3	6	575480	575485	0 %	50 %	50 %	0 %	476417568
12484	NC_020517	GC	3	6	575494	575499	0 %	0 %	50 %	50 %	476417568
12485	NC_020517	CAGT	2	8	575539	575546	25 %	25 %	25 %	25 %	476417568
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12487	NC_020517	GCA	2	6	575638	575643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417568
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12489	NC_020517	GAC	2	6	575834	575839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12490	NC_020517	TCG	2	6	575895	575900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12491	NC_020517	TCTGCT	2	12	575952	575963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12493	NC_020517	AGA	2	6	576068	576073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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