MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 47021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020515	ACAA	2	8	2	9	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020515	A	6	6	93	98	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020515	ATTTT	2	10	213	222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020515	GCTT	2	8	263	270	0 %	50 %	25 %	25 %	470165992
5	NC_020515	AGA	2	6	387	392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165992
6	NC_020515	ATT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470165992
7	NC_020515	GTGC	2	8	439	446	0 %	25 %	50 %	25 %	470165992
8	NC_020515	A	6	6	458	463	100 %	0 %	0 %	0 %	470165992
9	NC_020515	GTA	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165992
10	NC_020515	AG	3	6	540	545	50 %	0 %	50 %	0 %	470165992
11	NC_020515	ATTA	2	8	552	559	50 %	50 %	0 %	0 %	470165992
12	NC_020515	AGCCA	2	10	577	586	40 %	0 %	20 %	40 %	470165992
13	NC_020515	TGG	2	6	656	661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165992
14	NC_020515	GAGT	2	8	857	864	25 %	25 %	50 %	0 %	470165992
15	NC_020515	T	6	6	874	879	0 %	100 %	0 %	0 %	470165992
16	NC_020515	TCAT	2	8	885	892	25 %	50 %	0 %	25 %	470165992
17	NC_020515	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165992
18	NC_020515	GCA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165992
19	NC_020515	AAAG	2	8	1066	1073	75 %	0 %	25 %	0 %	470165992
20	NC_020515	TTG	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165992
21	NC_020515	CCG	2	6	1346	1351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470165992
22	NC_020515	TGA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165992
23	NC_020515	CGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470165992
24	NC_020515	CCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470165992
25	NC_020515	TTGA	2	8	1474	1481	25 %	50 %	25 %	0 %	470165992
26	NC_020515	GCA	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165992
27	NC_020515	A	7	7	1567	1573	100 %	0 %	0 %	0 %	470165992
28	NC_020515	TG	3	6	1645	1650	0 %	50 %	50 %	0 %	470165992
29	NC_020515	TGG	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165992
30	NC_020515	ACAA	2	8	1767	1774	75 %	0 %	0 %	25 %	470165993
31	NC_020515	AGA	2	6	1798	1803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165993
32	NC_020515	ATC	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165993
33	NC_020515	ATGG	2	8	2026	2033	25 %	25 %	50 %	0 %	470165993
34	NC_020515	GGTACG	2	12	2144	2155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470165993
35	NC_020515	CAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165993
36	NC_020515	GCA	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165993
37	NC_020515	GATA	2	8	2290	2297	50 %	25 %	25 %	0 %	470165993
38	NC_020515	AGCA	2	8	2317	2324	50 %	0 %	25 %	25 %	470165993
39	NC_020515	TGT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165993
40	NC_020515	AGA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165993
41	NC_020515	CTT	2	6	2635	2640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020515	CAT	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020515	TC	3	6	2685	2690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020515	T	6	6	2727	2732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020515	T	6	6	2789	2794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020515	T	6	6	2836	2841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020515	T	6	6	2871	2876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020515	TAA	3	9	2902	2910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020515	AAT	3	9	2912	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020515	TA	3	6	2929	2934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020515	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020515	AT	3	6	3093	3098	50 %	50 %	0 %	0 %	470165994
53	NC_020515	TGG	3	9	3113	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165994
54	NC_020515	AGC	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165994
55	NC_020515	GTGC	2	8	3351	3358	0 %	25 %	50 %	25 %	470165994
56	NC_020515	AAG	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165994
57	NC_020515	TGG	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165994
58	NC_020515	AAC	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165994
59	NC_020515	GGT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165994
60	NC_020515	CGG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470165994
61	NC_020515	CAC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470165994
62	NC_020515	ACA	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165994
63	NC_020515	TGA	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165994
64	NC_020515	TCT	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470165994
65	NC_020515	TAT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470165994
66	NC_020515	CCA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470165994
67	NC_020515	AC	3	6	4075	4080	50 %	0 %	0 %	50 %	470165994
68	NC_020515	ATC	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165994
69	NC_020515	AG	3	6	4271	4276	50 %	0 %	50 %	0 %	470165994
70	NC_020515	TGA	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165994
71	NC_020515	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	470165994
72	NC_020515	AAGA	2	8	4501	4508	75 %	0 %	25 %	0 %	470165994
73	NC_020515	CCG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470165994
74	NC_020515	AAG	2	6	4684	4689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165994
75	NC_020515	GTGC	2	8	4833	4840	0 %	25 %	50 %	25 %	470165994
76	NC_020515	GGCA	2	8	4873	4880	25 %	0 %	50 %	25 %	470165994
77	NC_020515	GAA	2	6	4934	4939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165994
78	NC_020515	T	6	6	4988	4993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020515	ATGA	2	8	5044	5051	50 %	25 %	25 %	0 %	470165995
80	NC_020515	AACCG	2	10	5073	5082	40 %	0 %	20 %	40 %	470165995
81	NC_020515	GCC	2	6	5089	5094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470165995
82	NC_020515	AGG	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470165995
83	NC_020515	CTA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165995
84	NC_020515	GCA	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165995
85	NC_020515	GAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165995
86	NC_020515	ACA	2	6	5411	5416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165995
87	NC_020515	A	6	6	5422	5427	100 %	0 %	0 %	0 %	470165995
88	NC_020515	GACT	2	8	5531	5538	25 %	25 %	25 %	25 %	470165995
89	NC_020515	GTGC	2	8	5722	5729	0 %	25 %	50 %	25 %	470165995
90	NC_020515	A	6	6	5807	5812	100 %	0 %	0 %	0 %	470165995
91	NC_020515	A	6	6	5849	5854	100 %	0 %	0 %	0 %	470165995
92	NC_020515	AAAT	2	8	5911	5918	75 %	25 %	0 %	0 %	470165996
93	NC_020515	CAA	2	6	5928	5933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165996
94	NC_020515	ATT	2	6	5960	5965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470165996
95	NC_020515	TGA	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165996
96	NC_020515	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470165996
97	NC_020515	TGT	2	6	6151	6156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165996
98	NC_020515	GAA	2	6	6246	6251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165996
99	NC_020515	TGG	2	6	6415	6420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165996
100	NC_020515	TGG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165996
101	NC_020515	A	8	8	6478	6485	100 %	0 %	0 %	0 %	470165996
102	NC_020515	TAA	2	6	6486	6491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165996
103	NC_020515	GTT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020515	T	7	7	6533	6539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020515	TAGA	2	8	6589	6596	50 %	25 %	25 %	0 %	470165997
106	NC_020515	GTT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165997
107	NC_020515	GTTT	2	8	6712	6719	0 %	75 %	25 %	0 %	470165997
108	NC_020515	TCTG	2	8	6733	6740	0 %	50 %	25 %	25 %	470165997
109	NC_020515	TAA	2	6	6850	6855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165997
110	NC_020515	T	6	6	6856	6861	0 %	100 %	0 %	0 %	470165997
111	NC_020515	TGG	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470165997
112	NC_020515	TTA	2	6	6881	6886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470165997
113	NC_020515	T	6	6	6900	6905	0 %	100 %	0 %	0 %	470165997
114	NC_020515	TAA	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165997
115	NC_020515	TG	4	8	6971	6978	0 %	50 %	50 %	0 %	470165997
116	NC_020515	AAT	2	6	7021	7026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165997
117	NC_020515	TAA	2	6	7047	7052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165997
118	NC_020515	TTC	2	6	7072	7077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470165997
119	NC_020515	GTT	3	9	7101	7109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165997
120	NC_020515	TGA	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165997
121	NC_020515	GCTG	2	8	7258	7265	0 %	25 %	50 %	25 %	470165997
122	NC_020515	A	7	7	7298	7304	100 %	0 %	0 %	0 %	470165997
123	NC_020515	CTG	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470165997
124	NC_020515	TTTA	2	8	7390	7397	25 %	75 %	0 %	0 %	470165997
125	NC_020515	GAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470165997
126	NC_020515	AAG	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470165997
127	NC_020515	ATTG	2	8	7495	7502	25 %	50 %	25 %	0 %	470165997
128	NC_020515	T	7	7	7569	7575	0 %	100 %	0 %	0 %	470165997
129	NC_020515	T	6	6	7668	7673	0 %	100 %	0 %	0 %	470165997
130	NC_020515	TTG	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470165997
131	NC_020515	AAT	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470165997
132	NC_020515	TTTTG	2	10	7716	7725	0 %	80 %	20 %	0 %	470165997
133	NC_020515	ATG	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470165997
134	NC_020515	TCA	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165997
135	NC_020515	TAA	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020515	CTTA	2	8	7862	7869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020515	TGA	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020515	T	6	6	7922	7927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020515	CT	3	6	7978	7983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020515	T	7	7	8085	8091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020515	T	7	7	8095	8101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020515	ATG	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020515	T	6	6	8126	8131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020515	A	6	6	8989	8994	100 %	0 %	0 %	0 %	470165998
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259	NC_020515	T	7	7	13624	13630	0 %	100 %	0 %	0 %	470166002
260	NC_020515	A	6	6	13675	13680	100 %	0 %	0 %	0 %	470166002
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272	NC_020515	TTA	2	6	14248	14253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166003
273	NC_020515	ATT	2	6	14265	14270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166003
274	NC_020515	AG	3	6	14361	14366	50 %	0 %	50 %	0 %	470166003
275	NC_020515	ATTAC	2	10	14431	14440	40 %	40 %	0 %	20 %	470166003
276	NC_020515	ATG	2	6	14455	14460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166003
277	NC_020515	TAA	2	6	14490	14495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166003
278	NC_020515	GTT	2	6	14520	14525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020515	CAA	2	6	14529	14534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_020515	T	6	6	14535	14540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020515	A	6	6	14543	14548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020515	TATT	2	8	14553	14560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020515	ATT	2	6	14599	14604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166004
284	NC_020515	CAA	2	6	14609	14614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166004
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287	NC_020515	TCT	2	6	14698	14703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470166004
288	NC_020515	TAG	2	6	14834	14839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166004
289	NC_020515	AGG	2	6	14898	14903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020515	TGT	2	6	14905	14910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470166005
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295	NC_020515	CAA	2	6	15144	15149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166005
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299	NC_020515	GCT	2	6	15281	15286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470166005
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303	NC_020515	AGC	2	6	15431	15436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470166006
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370	NC_020515	A	7	7	19776	19782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_020515	AAC	2	6	19787	19792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_020515	TAT	2	6	20512	20517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470166011
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398	NC_020515	T	6	6	20734	20739	0 %	100 %	0 %	0 %	470166011
399	NC_020515	AAGAT	2	10	20783	20792	60 %	20 %	20 %	0 %	470166011
400	NC_020515	ATC	2	6	20831	20836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470166011
401	NC_020515	AT	3	6	20915	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	470166011
402	NC_020515	AGA	2	6	20949	20954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470166011
403	NC_020515	ATA	2	6	21005	21010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166011
404	NC_020515	T	7	7	21054	21060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_020515	A	7	7	21063	21069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_020515	AACAA	2	10	21133	21142	80 %	0 %	0 %	20 %	470166012
407	NC_020515	TGG	3	9	21159	21167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470166012
408	NC_020515	AAC	2	6	21212	21217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166012
409	NC_020515	GTAG	2	8	21262	21269	25 %	25 %	50 %	0 %	470166012
410	NC_020515	T	6	6	21310	21315	0 %	100 %	0 %	0 %	470166012
411	NC_020515	ATA	2	6	21401	21406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166012
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443	NC_020515	T	6	6	23056	23061	0 %	100 %	0 %	0 %	470166014
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447	NC_020515	TAT	2	6	23298	23303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_020515	ATG	2	6	23487	23492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470166015
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495	NC_020515	TCT	2	6	25830	25835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_020515	TAA	2	6	25901	25906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470166018
498	NC_020515	CAA	2	6	25954	25959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470166018
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