MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_020410	ACG	2	6	2252149	2252154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856113
48002	NC_020410	CGC	2	6	2252159	2252164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856113
48003	NC_020410	T	8	8	2252203	2252210	0 %	100 %	0 %	0 %	452856113
48004	NC_020410	T	6	6	2252219	2252224	0 %	100 %	0 %	0 %	452856113
48005	NC_020410	TGTC	2	8	2252318	2252325	0 %	50 %	25 %	25 %	452856113
48006	NC_020410	TCC	2	6	2252544	2252549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856113
48007	NC_020410	GTT	2	6	2252551	2252556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856113
48008	NC_020410	AAT	2	6	2252563	2252568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856113
48009	NC_020410	T	6	6	2252568	2252573	0 %	100 %	0 %	0 %	452856113
48010	NC_020410	AGAC	2	8	2252649	2252656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48011	NC_020410	ATT	3	9	2252676	2252684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48012	NC_020410	GATAT	2	10	2252710	2252719	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48013	NC_020410	AACTG	2	10	2252770	2252779	40 %	20 %	20 %	20 %	452856114
48014	NC_020410	A	6	6	2252782	2252787	100 %	0 %	0 %	0 %	452856114
48015	NC_020410	CGTC	2	8	2252870	2252877	0 %	25 %	25 %	50 %	452856114
48016	NC_020410	ACG	2	6	2252915	2252920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856114
48017	NC_020410	CGA	2	6	2252923	2252928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856114
48018	NC_020410	A	7	7	2252946	2252952	100 %	0 %	0 %	0 %	452856114
48019	NC_020410	CGC	2	6	2252989	2252994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856114
48020	NC_020410	ATC	2	6	2253047	2253052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856114
48021	NC_020410	ATTG	2	8	2253055	2253062	25 %	50 %	25 %	0 %	452856114
48022	NC_020410	AAG	2	6	2253080	2253085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856114
48023	NC_020410	AGG	2	6	2253090	2253095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856114
48024	NC_020410	ATGA	2	8	2253186	2253193	50 %	25 %	25 %	0 %	452856115
48025	NC_020410	GAC	2	6	2253213	2253218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856115
48026	NC_020410	CTT	2	6	2253233	2253238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856115
48027	NC_020410	TGA	2	6	2253244	2253249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856115
48028	NC_020410	TGA	2	6	2253334	2253339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856115
48029	NC_020410	CGG	2	6	2253345	2253350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856115
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48031	NC_020410	TCC	2	6	2253385	2253390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856115
48032	NC_020410	C	6	6	2253423	2253428	0 %	0 %	0 %	100 %	452856115
48033	NC_020410	TTC	2	6	2253539	2253544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856115
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48035	NC_020410	AAG	2	6	2253594	2253599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856115
48036	NC_020410	CCG	2	6	2253722	2253727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856115
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48038	NC_020410	GCCC	2	8	2253827	2253834	0 %	0 %	25 %	75 %	452856115
48039	NC_020410	TG	3	6	2253990	2253995	0 %	50 %	50 %	0 %	452856115
48040	NC_020410	CGT	2	6	2254029	2254034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856115
48041	NC_020410	GCC	2	6	2254050	2254055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856115
48042	NC_020410	TCA	2	6	2254081	2254086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856115
48043	NC_020410	TCT	2	6	2254102	2254107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856115
48044	NC_020410	GAT	2	6	2254131	2254136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856115
48045	NC_020410	TTCCC	2	10	2254151	2254160	0 %	40 %	0 %	60 %	452856115
48046	NC_020410	CTT	2	6	2254169	2254174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856115
48047	NC_020410	TCA	2	6	2254277	2254282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856115
48048	NC_020410	CTT	2	6	2254297	2254302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856116
48049	NC_020410	TCATCC	2	12	2254410	2254421	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452856116
48050	NC_020410	GCG	2	6	2254441	2254446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856116
48051	NC_020410	AAGA	2	8	2254460	2254467	75 %	0 %	25 %	0 %	452856116
48052	NC_020410	TCA	2	6	2254479	2254484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856116
48053	NC_020410	CCG	2	6	2254531	2254536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856116
48054	NC_020410	TTC	2	6	2254547	2254552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856116
48055	NC_020410	CT	3	6	2254559	2254564	0 %	50 %	0 %	50 %	452856116
48056	NC_020410	CCGG	2	8	2254605	2254612	0 %	0 %	50 %	50 %	452856116
48057	NC_020410	TCCT	2	8	2254670	2254677	0 %	50 %	0 %	50 %	452856116
48058	NC_020410	GCTT	2	8	2254726	2254733	0 %	50 %	25 %	25 %	452856116
48059	NC_020410	T	8	8	2254797	2254804	0 %	100 %	0 %	0 %	452856116
48060	NC_020410	T	6	6	2254813	2254818	0 %	100 %	0 %	0 %	452856116
48061	NC_020410	TCA	2	6	2254831	2254836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856116
48062	NC_020410	TC	3	6	2254854	2254859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48063	NC_020410	TAT	2	6	2254860	2254865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48064	NC_020410	AT	3	6	2254871	2254876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48065	NC_020410	CATG	2	8	2254886	2254893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48066	NC_020410	ACGG	2	8	2254989	2254996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48067	NC_020410	ATT	2	6	2255225	2255230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856117
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48074	NC_020410	ATG	2	6	2255602	2255607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856117
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48079	NC_020410	TACT	2	8	2255851	2255858	25 %	50 %	0 %	25 %	452856117
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48083	NC_020410	GA	3	6	2255913	2255918	50 %	0 %	50 %	0 %	452856117
48084	NC_020410	AGC	2	6	2255950	2255955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856117
48085	NC_020410	TTTA	2	8	2256050	2256057	25 %	75 %	0 %	0 %	452856118
48086	NC_020410	CAG	2	6	2256087	2256092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856118
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48089	NC_020410	T	6	6	2256162	2256167	0 %	100 %	0 %	0 %	452856118
48090	NC_020410	TCT	2	6	2256172	2256177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856118
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48092	NC_020410	GCT	2	6	2256263	2256268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856118
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48095	NC_020410	GGA	2	6	2256361	2256366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48098	NC_020410	A	6	6	2256401	2256406	100 %	0 %	0 %	0 %	452856119
48099	NC_020410	TGGC	2	8	2256407	2256414	0 %	25 %	50 %	25 %	452856119
48100	NC_020410	GTTCG	2	10	2256418	2256427	0 %	40 %	40 %	20 %	452856119
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48102	NC_020410	A	6	6	2256512	2256517	100 %	0 %	0 %	0 %	452856119
48103	NC_020410	CGG	2	6	2256522	2256527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856119
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48116	NC_020410	GA	3	6	2257057	2257062	50 %	0 %	50 %	0 %	452856119
48117	NC_020410	GAT	2	6	2257145	2257150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856119
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48119	NC_020410	CTT	2	6	2257164	2257169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856119
48120	NC_020410	TGC	2	6	2257176	2257181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856119
48121	NC_020410	A	6	6	2257187	2257192	100 %	0 %	0 %	0 %	452856119
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48123	NC_020410	A	6	6	2257311	2257316	100 %	0 %	0 %	0 %	452856119
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48132	NC_020410	CTG	2	6	2257884	2257889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856121
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48175	NC_020410	A	6	6	2259685	2259690	100 %	0 %	0 %	0 %	452856124
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48178	NC_020410	AATG	2	8	2259823	2259830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48179	NC_020410	A	6	6	2259853	2259858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48236	NC_020410	A	6	6	2262379	2262384	100 %	0 %	0 %	0 %	452856128
48237	NC_020410	ATT	2	6	2262404	2262409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856128
48238	NC_020410	TC	3	6	2262427	2262432	0 %	50 %	0 %	50 %	452856128
48239	NC_020410	AGC	2	6	2262433	2262438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856128
48240	NC_020410	GCC	2	6	2262460	2262465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856128
48241	NC_020410	CCG	2	6	2262470	2262475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856128
48242	NC_020410	ATT	2	6	2262478	2262483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856128
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48246	NC_020410	AAG	2	6	2262566	2262571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856128
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48258	NC_020410	GA	3	6	2263046	2263051	50 %	0 %	50 %	0 %	452856128
48259	NC_020410	A	6	6	2263090	2263095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48260	NC_020410	CGG	2	6	2263096	2263101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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48262	NC_020410	CGC	2	6	2263114	2263119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48263	NC_020410	A	6	6	2263130	2263135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48264	NC_020410	GAA	2	6	2263281	2263286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48265	NC_020410	A	7	7	2263285	2263291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48266	NC_020410	TTCA	2	8	2263305	2263312	25 %	50 %	0 %	25 %	452856129
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48299	NC_020410	A	7	7	2264714	2264720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48300	NC_020410	T	7	7	2264769	2264775	0 %	100 %	0 %	0 %	452856131
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48304	NC_020410	TA	3	6	2264890	2264895	50 %	50 %	0 %	0 %	452856131
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48331	NC_020410	CATC	2	8	2266280	2266287	25 %	25 %	0 %	50 %	452856132
48332	NC_020410	AAG	2	6	2266332	2266337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856132
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48341	NC_020410	CCTTC	2	10	2266956	2266965	0 %	40 %	0 %	60 %	452856133
48342	NC_020410	GGC	2	6	2266966	2266971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856133
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48345	NC_020410	GCA	2	6	2267091	2267096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856133
48346	NC_020410	GCC	2	6	2267127	2267132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856133
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48348	NC_020410	AGT	2	6	2267226	2267231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856133
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48350	NC_020410	C	6	6	2267255	2267260	0 %	0 %	0 %	100 %	452856133
48351	NC_020410	TGG	2	6	2267286	2267291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856133
48352	NC_020410	CGC	2	6	2267313	2267318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856133
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48354	NC_020410	ACGG	2	8	2267442	2267449	25 %	0 %	50 %	25 %	452856133
48355	NC_020410	TATG	2	8	2267484	2267491	25 %	50 %	25 %	0 %	452856133
48356	NC_020410	A	6	6	2267536	2267541	100 %	0 %	0 %	0 %	452856133
48357	NC_020410	TCC	2	6	2267543	2267548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856133
48358	NC_020410	TCG	2	6	2267618	2267623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856133
48359	NC_020410	A	6	6	2267625	2267630	100 %	0 %	0 %	0 %	452856133
48360	NC_020410	GCA	2	6	2267634	2267639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856133
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48364	NC_020410	CAAT	2	8	2267759	2267766	50 %	25 %	0 %	25 %	452856133
48365	NC_020410	TAAA	2	8	2267791	2267798	75 %	25 %	0 %	0 %	452856133
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48367	NC_020410	TTTTC	2	10	2267911	2267920	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48368	NC_020410	ATT	2	6	2267929	2267934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48369	NC_020410	A	7	7	2267947	2267953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48370	NC_020410	GCATA	2	10	2267974	2267983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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48373	NC_020410	AAC	2	6	2268036	2268041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48378	NC_020410	GAA	2	6	2268241	2268246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48394	NC_020410	CAT	2	6	2269007	2269012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856134
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48396	NC_020410	TC	3	6	2269158	2269163	0 %	50 %	0 %	50 %	452856135
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48445	NC_020410	TTTTC	2	10	2271895	2271904	0 %	80 %	0 %	20 %	452856137
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48450	NC_020410	CGGG	2	8	2272153	2272160	0 %	0 %	75 %	25 %	452856137
48451	NC_020410	T	6	6	2272201	2272206	0 %	100 %	0 %	0 %	452856137
48452	NC_020410	GAA	2	6	2272239	2272244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856137
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48454	NC_020410	TC	3	6	2272338	2272343	0 %	50 %	0 %	50 %	452856137
48455	NC_020410	GCT	3	9	2272366	2272374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856137
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48457	NC_020410	CGG	2	6	2272461	2272466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48458	NC_020410	GCT	2	6	2272501	2272506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856138
48459	NC_020410	CTGCAG	2	12	2272541	2272552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452856138
48460	NC_020410	CGC	2	6	2272591	2272596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856138
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48462	NC_020410	AGT	2	6	2272708	2272713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856138
48463	NC_020410	ATA	2	6	2272799	2272804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856138
48464	NC_020410	CGTC	2	8	2272909	2272916	0 %	25 %	25 %	50 %	452856138
48465	NC_020410	TCA	2	6	2272992	2272997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856138
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48469	NC_020410	CCAG	2	8	2273172	2273179	25 %	0 %	25 %	50 %	452856138
48470	NC_020410	GCC	2	6	2273228	2273233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856138
48471	NC_020410	CATC	2	8	2273327	2273334	25 %	25 %	0 %	50 %	452856138
48472	NC_020410	C	6	6	2273442	2273447	0 %	0 %	0 %	100 %	452856138
48473	NC_020410	ATC	2	6	2273480	2273485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856138
48474	NC_020410	TCT	2	6	2273490	2273495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856138
48475	NC_020410	AT	3	6	2273497	2273502	50 %	50 %	0 %	0 %	452856138
48476	NC_020410	TTA	2	6	2273634	2273639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856138
48477	NC_020410	ATA	2	6	2273664	2273669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856138
48478	NC_020410	AATG	2	8	2273687	2273694	50 %	25 %	25 %	0 %	452856138
48479	NC_020410	TCA	2	6	2273703	2273708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856138
48480	NC_020410	CTTT	2	8	2273745	2273752	0 %	75 %	0 %	25 %	452856138
48481	NC_020410	TCC	2	6	2273832	2273837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856138
48482	NC_020410	TA	3	6	2273873	2273878	50 %	50 %	0 %	0 %	452856138
48483	NC_020410	TTTA	2	8	2273945	2273952	25 %	75 %	0 %	0 %	452856138
48484	NC_020410	TCA	2	6	2274009	2274014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856138
48485	NC_020410	AAAAT	2	10	2274037	2274046	80 %	20 %	0 %	0 %	452856138
48486	NC_020410	T	6	6	2274104	2274109	0 %	100 %	0 %	0 %	452856138
48487	NC_020410	GCT	2	6	2274112	2274117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856138
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48489	NC_020410	GCC	2	6	2274315	2274320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856138
48490	NC_020410	CTTT	2	8	2274327	2274334	0 %	75 %	0 %	25 %	452856138
48491	NC_020410	GCG	2	6	2274355	2274360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856138
48492	NC_020410	A	6	6	2274418	2274423	100 %	0 %	0 %	0 %	452856138
48493	NC_020410	CATTC	2	10	2274492	2274501	20 %	40 %	0 %	40 %	452856138
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48495	NC_020410	AC	3	6	2274559	2274564	50 %	0 %	0 %	50 %	452856138
48496	NC_020410	CT	3	6	2274572	2274577	0 %	50 %	0 %	50 %	452856138
48497	NC_020410	ATA	2	6	2274595	2274600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856138
48498	NC_020410	CAG	2	6	2274725	2274730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856138
48499	NC_020410	TCCG	2	8	2274759	2274766	0 %	25 %	25 %	50 %	452856138
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