MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_020410	TCT	2	6	2204073	2204078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856059
47003	NC_020410	CCT	2	6	2204110	2204115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856060
47004	NC_020410	AAT	2	6	2204155	2204160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856060
47005	NC_020410	CAT	2	6	2204239	2204244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856060
47006	NC_020410	GGC	2	6	2204299	2204304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856060
47007	NC_020410	GAG	2	6	2204365	2204370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856060
47008	NC_020410	GCA	2	6	2204388	2204393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856060
47009	NC_020410	GCC	2	6	2204425	2204430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856060
47010	NC_020410	TCA	2	6	2204432	2204437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856060
47011	NC_020410	TCA	2	6	2204460	2204465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856060
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47013	NC_020410	A	6	6	2204569	2204574	100 %	0 %	0 %	0 %	452856060
47014	NC_020410	GCT	2	6	2204805	2204810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856061
47015	NC_020410	GCA	2	6	2204811	2204816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856061
47016	NC_020410	TCA	2	6	2204848	2204853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856061
47017	NC_020410	CAG	2	6	2204862	2204867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856061
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47019	NC_020410	CTT	2	6	2204928	2204933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856061
47020	NC_020410	TTC	2	6	2204952	2204957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856061
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47022	NC_020410	TCTG	2	8	2205130	2205137	0 %	50 %	25 %	25 %	452856061
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47024	NC_020410	CTG	3	9	2205144	2205152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856061
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47032	NC_020410	TCAGC	2	10	2205428	2205437	20 %	20 %	20 %	40 %	452856061
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47119	NC_020410	GAA	2	6	2209501	2209506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856065
47120	NC_020410	A	6	6	2209597	2209602	100 %	0 %	0 %	0 %	452856065
47121	NC_020410	CGTC	2	8	2209605	2209612	0 %	25 %	25 %	50 %	452856065
47122	NC_020410	GGC	2	6	2209630	2209635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856065
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47130	NC_020410	A	7	7	2209900	2209906	100 %	0 %	0 %	0 %	452856065
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47134	NC_020410	CGG	2	6	2210097	2210102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856065
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47142	NC_020410	A	6	6	2210526	2210531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47143	NC_020410	T	7	7	2210556	2210562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47144	NC_020410	GGCA	2	8	2210593	2210600	25 %	0 %	50 %	25 %	452856066
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47183	NC_020410	TTC	2	6	2212178	2212183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856067
47184	NC_020410	T	6	6	2212206	2212211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47185	NC_020410	TTACA	2	10	2212234	2212243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47186	NC_020410	A	6	6	2212320	2212325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47187	NC_020410	CGT	2	6	2212419	2212424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856068
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47218	NC_020410	T	6	6	2213793	2213798	0 %	100 %	0 %	0 %	452856068
47219	NC_020410	ATC	2	6	2213901	2213906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856068
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47223	NC_020410	ATAA	2	8	2214085	2214092	75 %	25 %	0 %	0 %	452856068
47224	NC_020410	CTA	2	6	2214134	2214139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856068
47225	NC_020410	TTCA	2	8	2214154	2214161	25 %	50 %	0 %	25 %	452856068
47226	NC_020410	T	7	7	2214205	2214211	0 %	100 %	0 %	0 %	452856069
47227	NC_020410	CGC	2	6	2214212	2214217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856069
47228	NC_020410	TTTA	2	8	2214230	2214237	25 %	75 %	0 %	0 %	452856069
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47231	NC_020410	T	6	6	2214465	2214470	0 %	100 %	0 %	0 %	452856069
47232	NC_020410	CTT	2	6	2214510	2214515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856069
47233	NC_020410	CAC	2	6	2214536	2214541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856069
47234	NC_020410	TC	3	6	2214543	2214548	0 %	50 %	0 %	50 %	452856069
47235	NC_020410	CTT	2	6	2214610	2214615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856069
47236	NC_020410	T	8	8	2214650	2214657	0 %	100 %	0 %	0 %	452856069
47237	NC_020410	TCCG	2	8	2214683	2214690	0 %	25 %	25 %	50 %	452856069
47238	NC_020410	CAT	2	6	2214698	2214703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856069
47239	NC_020410	TCG	2	6	2214756	2214761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856069
47240	NC_020410	CTT	2	6	2214772	2214777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856069
47241	NC_020410	TCA	2	6	2214834	2214839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856069
47242	NC_020410	CTA	3	9	2214841	2214849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856069
47243	NC_020410	TTTG	2	8	2214864	2214871	0 %	75 %	25 %	0 %	452856069
47244	NC_020410	ATA	2	6	2215014	2215019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856070
47245	NC_020410	TAAAA	2	10	2215101	2215110	80 %	20 %	0 %	0 %	452856070
47246	NC_020410	CTTC	2	8	2215129	2215136	0 %	50 %	0 %	50 %	452856070
47247	NC_020410	ATC	2	6	2215179	2215184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856070
47248	NC_020410	GC	3	6	2215195	2215200	0 %	0 %	50 %	50 %	452856070
47249	NC_020410	A	6	6	2215390	2215395	100 %	0 %	0 %	0 %	452856070
47250	NC_020410	CATAT	2	10	2215472	2215481	40 %	40 %	0 %	20 %	452856070
47251	NC_020410	CTT	2	6	2215498	2215503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856070
47252	NC_020410	T	6	6	2215502	2215507	0 %	100 %	0 %	0 %	452856070
47253	NC_020410	GTC	2	6	2215578	2215583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856070
47254	NC_020410	ATG	2	6	2215596	2215601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856070
47255	NC_020410	T	7	7	2215618	2215624	0 %	100 %	0 %	0 %	452856070
47256	NC_020410	GCC	2	6	2215707	2215712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856070
47257	NC_020410	CGTGA	2	10	2215715	2215724	20 %	20 %	40 %	20 %	452856070
47258	NC_020410	GCG	2	6	2215759	2215764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856070
47259	NC_020410	TGTC	2	8	2215768	2215775	0 %	50 %	25 %	25 %	452856070
47260	NC_020410	TAAA	2	8	2215848	2215855	75 %	25 %	0 %	0 %	452856070
47261	NC_020410	ATA	3	9	2215860	2215868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856070
47262	NC_020410	CAT	2	6	2215883	2215888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856070
47263	NC_020410	CGT	2	6	2215898	2215903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856070
47264	NC_020410	GCC	2	6	2216060	2216065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856070
47265	NC_020410	TAAA	2	8	2216084	2216091	75 %	25 %	0 %	0 %	452856070
47266	NC_020410	GCA	2	6	2216100	2216105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856070
47267	NC_020410	GGCT	2	8	2216186	2216193	0 %	25 %	50 %	25 %	452856071
47268	NC_020410	T	6	6	2216231	2216236	0 %	100 %	0 %	0 %	452856071
47269	NC_020410	TGC	2	6	2216313	2216318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856071
47270	NC_020410	CGC	2	6	2216356	2216361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856071
47271	NC_020410	CTG	2	6	2216477	2216482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856071
47272	NC_020410	CAA	2	6	2216488	2216493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856071
47273	NC_020410	TAAAA	2	10	2216593	2216602	80 %	20 %	0 %	0 %	452856071
47274	NC_020410	AAG	2	6	2216669	2216674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856071
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47276	NC_020410	T	6	6	2216707	2216712	0 %	100 %	0 %	0 %	452856071
47277	NC_020410	T	6	6	2216951	2216956	0 %	100 %	0 %	0 %	452856071
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47279	NC_020410	T	6	6	2216997	2217002	0 %	100 %	0 %	0 %	452856071
47280	NC_020410	ACAT	2	8	2217072	2217079	50 %	25 %	0 %	25 %	452856071
47281	NC_020410	TGC	2	6	2217181	2217186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856071
47282	NC_020410	T	8	8	2217213	2217220	0 %	100 %	0 %	0 %	452856071
47283	NC_020410	CCG	2	6	2217311	2217316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856071
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47288	NC_020410	CTG	2	6	2217476	2217481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856071
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47299	NC_020410	CAC	2	6	2217847	2217852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856072
47300	NC_020410	GTC	2	6	2217887	2217892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856072
47301	NC_020410	ACC	2	6	2218019	2218024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856072
47302	NC_020410	CAC	2	6	2218094	2218099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856072
47303	NC_020410	CCTTTT	2	12	2218124	2218135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856072
47304	NC_020410	GC	3	6	2218254	2218259	0 %	0 %	50 %	50 %	452856072
47305	NC_020410	GAAT	2	8	2218287	2218294	50 %	25 %	25 %	0 %	452856072
47306	NC_020410	CGC	2	6	2218298	2218303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856072
47307	NC_020410	T	6	6	2218306	2218311	0 %	100 %	0 %	0 %	452856072
47308	NC_020410	CTCCC	2	10	2218327	2218336	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
47309	NC_020410	CTGC	2	8	2218337	2218344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47310	NC_020410	ATC	2	6	2218361	2218366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47311	NC_020410	GCG	2	6	2218455	2218460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856073
47312	NC_020410	TTC	2	6	2218513	2218518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856073
47313	NC_020410	GCG	2	6	2218561	2218566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856073
47314	NC_020410	CTGT	2	8	2218570	2218577	0 %	50 %	25 %	25 %	452856073
47315	NC_020410	ATG	2	6	2218604	2218609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856073
47316	NC_020410	CTTT	2	8	2218618	2218625	0 %	75 %	0 %	25 %	452856073
47317	NC_020410	CTT	2	6	2218668	2218673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856073
47318	NC_020410	GGAA	2	8	2218714	2218721	50 %	0 %	50 %	0 %	452856073
47319	NC_020410	ACGT	2	8	2218739	2218746	25 %	25 %	25 %	25 %	452856073
47320	NC_020410	TTG	2	6	2218778	2218783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856073
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47329	NC_020410	T	6	6	2219163	2219168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47330	NC_020410	AACA	2	8	2219176	2219183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47331	NC_020410	AT	3	6	2219209	2219214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47332	NC_020410	ATA	2	6	2219244	2219249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856074
47333	NC_020410	ATG	2	6	2219258	2219263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856074
47334	NC_020410	ACC	2	6	2219273	2219278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856074
47335	NC_020410	AAG	2	6	2219293	2219298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856074
47336	NC_020410	T	7	7	2219322	2219328	0 %	100 %	0 %	0 %	452856074
47337	NC_020410	CGT	2	6	2219368	2219373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856074
47338	NC_020410	GTC	2	6	2219447	2219452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856074
47339	NC_020410	GCC	2	6	2219462	2219467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856074
47340	NC_020410	AAAG	2	8	2219530	2219537	75 %	0 %	25 %	0 %	452856074
47341	NC_020410	GC	3	6	2219565	2219570	0 %	0 %	50 %	50 %	452856074
47342	NC_020410	CCA	2	6	2219595	2219600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856074
47343	NC_020410	ATG	2	6	2219621	2219626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856074
47344	NC_020410	CTT	2	6	2219646	2219651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856074
47345	NC_020410	T	6	6	2219686	2219691	0 %	100 %	0 %	0 %	452856074
47346	NC_020410	ATA	2	6	2219720	2219725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856074
47347	NC_020410	CTTTT	2	10	2219779	2219788	0 %	80 %	0 %	20 %	452856075
47348	NC_020410	GCG	2	6	2219789	2219794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856075
47349	NC_020410	CGA	2	6	2219863	2219868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856075
47350	NC_020410	TCGG	2	8	2219871	2219878	0 %	25 %	50 %	25 %	452856075
47351	NC_020410	CGC	2	6	2220041	2220046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856075
47352	NC_020410	GAT	2	6	2220103	2220108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856075
47353	NC_020410	G	6	6	2220111	2220116	0 %	0 %	100 %	0 %	452856075
47354	NC_020410	GGC	2	6	2220145	2220150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856075
47355	NC_020410	CTG	2	6	2220156	2220161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856075
47356	NC_020410	AT	3	6	2220163	2220168	50 %	50 %	0 %	0 %	452856075
47357	NC_020410	TCA	2	6	2220196	2220201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856075
47358	NC_020410	CTT	2	6	2220253	2220258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856075
47359	NC_020410	TTCA	2	8	2220278	2220285	25 %	50 %	0 %	25 %	452856075
47360	NC_020410	CCGC	2	8	2220368	2220375	0 %	0 %	25 %	75 %	452856076
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47366	NC_020410	T	6	6	2220541	2220546	0 %	100 %	0 %	0 %	452856076
47367	NC_020410	TTA	2	6	2220552	2220557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856076
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47385	NC_020410	TTG	2	6	2221515	2221520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47386	NC_020410	A	7	7	2221585	2221591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47387	NC_020410	CTGA	2	8	2221617	2221624	25 %	25 %	25 %	25 %	452856077
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47468	NC_020410	AGC	2	6	2225338	2225343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856082
47469	NC_020410	TCCGC	2	10	2225350	2225359	0 %	20 %	20 %	60 %	452856082
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47472	NC_020410	ATCC	2	8	2225459	2225466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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