MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_020410	ATG	2	6	2111641	2111646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855962
45003	NC_020410	TCT	2	6	2111728	2111733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855962
45004	NC_020410	CCA	2	6	2111765	2111770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452855962
45005	NC_020410	TAT	2	6	2111873	2111878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855962
45006	NC_020410	GCT	2	6	2111884	2111889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855962
45007	NC_020410	T	6	6	2111889	2111894	0 %	100 %	0 %	0 %	452855962
45008	NC_020410	CTT	2	6	2111906	2111911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855962
45009	NC_020410	CGG	2	6	2112017	2112022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855962
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45011	NC_020410	TTC	2	6	2112079	2112084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855962
45012	NC_020410	ATA	2	6	2112120	2112125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855962
45013	NC_020410	TA	3	6	2112156	2112161	50 %	50 %	0 %	0 %	452855962
45014	NC_020410	TGCT	2	8	2112197	2112204	0 %	50 %	25 %	25 %	452855962
45015	NC_020410	CAA	2	6	2112215	2112220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452855962
45016	NC_020410	ATA	2	6	2112252	2112257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855962
45017	NC_020410	CTT	2	6	2112266	2112271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855962
45018	NC_020410	GCA	2	6	2112276	2112281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855962
45019	NC_020410	T	6	6	2112287	2112292	0 %	100 %	0 %	0 %	452855962
45020	NC_020410	TTC	2	6	2112357	2112362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855962
45021	NC_020410	GCA	2	6	2112380	2112385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855962
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45024	NC_020410	CTC	3	9	2112519	2112527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855962
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45031	NC_020410	T	7	7	2112915	2112921	0 %	100 %	0 %	0 %	452855962
45032	NC_020410	CGC	2	6	2112935	2112940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855962
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45043	NC_020410	A	6	6	2113389	2113394	100 %	0 %	0 %	0 %	452855962
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45102	NC_020410	CG	3	6	2116013	2116018	0 %	0 %	50 %	50 %	452855964
45103	NC_020410	GGCC	2	8	2116042	2116049	0 %	0 %	50 %	50 %	452855964
45104	NC_020410	CCGC	2	8	2116053	2116060	0 %	0 %	25 %	75 %	452855964
45105	NC_020410	GTTTT	2	10	2116087	2116096	0 %	80 %	20 %	0 %	452855964
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45110	NC_020410	CCG	3	9	2116426	2116434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855964
45111	NC_020410	ATGCC	2	10	2116486	2116495	20 %	20 %	20 %	40 %	452855964
45112	NC_020410	T	6	6	2116524	2116529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45113	NC_020410	A	7	7	2116638	2116644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45114	NC_020410	GAC	2	6	2116756	2116761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855965
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45117	NC_020410	TCG	2	6	2116887	2116892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855965
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45119	NC_020410	GT	3	6	2116952	2116957	0 %	50 %	50 %	0 %	452855965
45120	NC_020410	GCA	2	6	2116965	2116970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855965
45121	NC_020410	CAAC	2	8	2117089	2117096	50 %	0 %	0 %	50 %	452855965
45122	NC_020410	CCG	2	6	2117143	2117148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855965
45123	NC_020410	CA	3	6	2117151	2117156	50 %	0 %	0 %	50 %	452855965
45124	NC_020410	CGG	2	6	2117170	2117175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855965
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45128	NC_020410	T	7	7	2117290	2117296	0 %	100 %	0 %	0 %	452855966
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45130	NC_020410	CGTC	2	8	2117335	2117342	0 %	25 %	25 %	50 %	452855966
45131	NC_020410	TC	3	6	2117404	2117409	0 %	50 %	0 %	50 %	452855966
45132	NC_020410	TGA	2	6	2117432	2117437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855966
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45134	NC_020410	TCA	2	6	2117543	2117548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855966
45135	NC_020410	CTC	2	6	2117608	2117613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45136	NC_020410	GAT	2	6	2117628	2117633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45138	NC_020410	TCA	3	9	2117686	2117694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45139	NC_020410	TGTT	2	8	2117729	2117736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45140	NC_020410	A	6	6	2117740	2117745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45141	NC_020410	ATA	2	6	2117776	2117781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45143	NC_020410	A	6	6	2117802	2117807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45144	NC_020410	AATGAA	2	12	2117824	2117835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452855967
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45151	NC_020410	TGTT	2	8	2118106	2118113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45152	NC_020410	CAA	2	6	2118119	2118124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45153	NC_020410	AAT	2	6	2118130	2118135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45155	NC_020410	CAA	2	6	2118281	2118286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45156	NC_020410	TTTC	2	8	2118304	2118311	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45157	NC_020410	CGGAA	2	10	2118312	2118321	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45158	NC_020410	ATG	2	6	2118334	2118339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45159	NC_020410	ATTTC	2	10	2118431	2118440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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45162	NC_020410	T	6	6	2118522	2118527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45185	NC_020410	A	6	6	2119563	2119568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45186	NC_020410	AAT	2	6	2119574	2119579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45188	NC_020410	A	7	7	2119672	2119678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45189	NC_020410	T	6	6	2119697	2119702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45232	NC_020410	T	7	7	2121304	2121310	0 %	100 %	0 %	0 %	452855971
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45238	NC_020410	ACG	2	6	2121429	2121434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855971
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45240	NC_020410	CCA	2	6	2121550	2121555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452855971
45241	NC_020410	GAT	2	6	2121581	2121586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855971
45242	NC_020410	TGA	2	6	2121739	2121744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855971
45243	NC_020410	CG	3	6	2121761	2121766	0 %	0 %	50 %	50 %	452855971
45244	NC_020410	CAA	2	6	2121844	2121849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452855971
45245	NC_020410	TAA	2	6	2121877	2121882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855971
45246	NC_020410	AGC	2	6	2122059	2122064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855971
45247	NC_020410	GAT	2	6	2122067	2122072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855971
45248	NC_020410	TGC	2	6	2122123	2122128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855971
45249	NC_020410	CCG	2	6	2122134	2122139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855971
45250	NC_020410	GAA	2	6	2122235	2122240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855971
45251	NC_020410	CAG	2	6	2122247	2122252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855971
45252	NC_020410	AAT	2	6	2122322	2122327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855971
45253	NC_020410	TCC	2	6	2122390	2122395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855971
45254	NC_020410	AGC	2	6	2122404	2122409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855971
45255	NC_020410	GCC	2	6	2122413	2122418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855971
45256	NC_020410	ACG	3	9	2122500	2122508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855971
45257	NC_020410	CCT	2	6	2122584	2122589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855972
45258	NC_020410	T	6	6	2122654	2122659	0 %	100 %	0 %	0 %	452855972
45259	NC_020410	GCC	2	6	2122760	2122765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855972
45260	NC_020410	GTC	2	6	2122783	2122788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855972
45261	NC_020410	GAT	2	6	2122818	2122823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855972
45262	NC_020410	T	7	7	2122851	2122857	0 %	100 %	0 %	0 %	452855972
45263	NC_020410	CAG	2	6	2122882	2122887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855972
45264	NC_020410	ATC	2	6	2122888	2122893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855972
45265	NC_020410	GA	3	6	2122903	2122908	50 %	0 %	50 %	0 %	452855972
45266	NC_020410	GGCC	2	8	2122950	2122957	0 %	0 %	50 %	50 %	452855972
45267	NC_020410	GC	3	6	2123026	2123031	0 %	0 %	50 %	50 %	452855972
45268	NC_020410	CTG	2	6	2123047	2123052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855972
45269	NC_020410	A	6	6	2123081	2123086	100 %	0 %	0 %	0 %	452855972
45270	NC_020410	AGAA	2	8	2123110	2123117	75 %	0 %	25 %	0 %	452855972
45271	NC_020410	TCT	2	6	2123126	2123131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855972
45272	NC_020410	A	6	6	2123177	2123182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45273	NC_020410	A	7	7	2123184	2123190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45274	NC_020410	A	7	7	2123207	2123213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45275	NC_020410	AGCA	2	8	2123215	2123222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45276	NC_020410	CTCA	2	8	2123269	2123276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45277	NC_020410	CTT	2	6	2123375	2123380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45278	NC_020410	ATT	2	6	2123433	2123438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45279	NC_020410	CGTTT	2	10	2123482	2123491	0 %	60 %	20 %	20 %	452855973
45280	NC_020410	ATAAAT	2	12	2123492	2123503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855973
45281	NC_020410	CGA	2	6	2123516	2123521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855973
45282	NC_020410	ATG	2	6	2123572	2123577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855973
45283	NC_020410	TGA	2	6	2123605	2123610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855973
45284	NC_020410	CATA	2	8	2123714	2123721	50 %	25 %	0 %	25 %	452855973
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45291	NC_020410	CT	3	6	2123994	2123999	0 %	50 %	0 %	50 %	452855973
45292	NC_020410	T	6	6	2124038	2124043	0 %	100 %	0 %	0 %	452855973
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45301	NC_020410	AAT	2	6	2124447	2124452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855973
45302	NC_020410	CTTC	2	8	2124455	2124462	0 %	50 %	0 %	50 %	452855973
45303	NC_020410	GAT	2	6	2124536	2124541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855973
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45308	NC_020410	T	7	7	2124701	2124707	0 %	100 %	0 %	0 %	452855973
45309	NC_020410	T	6	6	2124723	2124728	0 %	100 %	0 %	0 %	452855973
45310	NC_020410	CCG	2	6	2124737	2124742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855973
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45312	NC_020410	CTC	2	6	2124765	2124770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855973
45313	NC_020410	TCA	2	6	2124868	2124873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855973
45314	NC_020410	T	6	6	2124879	2124884	0 %	100 %	0 %	0 %	452855973
45315	NC_020410	CTT	2	6	2124926	2124931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855973
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45317	NC_020410	ATGT	2	8	2124977	2124984	25 %	50 %	25 %	0 %	452855973
45318	NC_020410	CCCT	2	8	2125001	2125008	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45319	NC_020410	A	6	6	2125066	2125071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45320	NC_020410	CCGC	2	8	2125168	2125175	0 %	0 %	25 %	75 %	452855974
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45325	NC_020410	GTA	2	6	2125470	2125475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855974
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45328	NC_020410	T	6	6	2125598	2125603	0 %	100 %	0 %	0 %	452855974
45329	NC_020410	GACA	2	8	2125632	2125639	50 %	0 %	25 %	25 %	452855974
45330	NC_020410	CTC	2	6	2125644	2125649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855974
45331	NC_020410	ACAGCG	2	12	2125877	2125888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855974
45332	NC_020410	TTC	2	6	2125911	2125916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855974
45333	NC_020410	ATCG	2	8	2125938	2125945	25 %	25 %	25 %	25 %	452855974
45334	NC_020410	CT	3	6	2126145	2126150	0 %	50 %	0 %	50 %	452855974
45335	NC_020410	GCG	2	6	2126227	2126232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855974
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45340	NC_020410	GGAA	2	8	2126441	2126448	50 %	0 %	50 %	0 %	452855974
45341	NC_020410	TCA	3	9	2126584	2126592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855974
45342	NC_020410	CTT	2	6	2126705	2126710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855974
45343	NC_020410	T	6	6	2126709	2126714	0 %	100 %	0 %	0 %	452855974
45344	NC_020410	CAG	2	6	2126796	2126801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855974
45345	NC_020410	CCAAT	2	10	2126950	2126959	40 %	20 %	0 %	40 %	452855974
45346	NC_020410	TTC	2	6	2126967	2126972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855974
45347	NC_020410	TTCTT	2	10	2126980	2126989	0 %	80 %	0 %	20 %	452855974
45348	NC_020410	TGT	2	6	2127015	2127020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855974
45349	NC_020410	ACA	2	6	2127088	2127093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45350	NC_020410	A	7	7	2127093	2127099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45351	NC_020410	TTC	2	6	2127202	2127207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855975
45352	NC_020410	GT	3	6	2127214	2127219	0 %	50 %	50 %	0 %	452855975
45353	NC_020410	CTCCG	2	10	2127238	2127247	0 %	20 %	20 %	60 %	452855975
45354	NC_020410	TCC	2	6	2127251	2127256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855975
45355	NC_020410	ATC	2	6	2127347	2127352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45356	NC_020410	ACCTG	2	10	2127403	2127412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45357	NC_020410	ACA	2	6	2127421	2127426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45358	NC_020410	TCGA	2	8	2127432	2127439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45359	NC_020410	ATT	2	6	2127457	2127462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45360	NC_020410	TCA	2	6	2127525	2127530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855976
45361	NC_020410	ATT	2	6	2127598	2127603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855976
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45482	NC_020410	TCGC	2	8	2133004	2133011	0 %	25 %	25 %	50 %	452855981
45483	NC_020410	CTT	3	9	2133047	2133055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855981
45484	NC_020410	CAT	2	6	2133080	2133085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855981
45485	NC_020410	AAT	2	6	2133206	2133211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855981
45486	NC_020410	AT	3	6	2133226	2133231	50 %	50 %	0 %	0 %	452855981
45487	NC_020410	CCA	2	6	2133254	2133259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452855981
45488	NC_020410	GCC	3	9	2133281	2133289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855981
45489	NC_020410	CGGCC	2	10	2133290	2133299	0 %	0 %	40 %	60 %	452855981
45490	NC_020410	CTG	2	6	2133303	2133308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855981
45491	NC_020410	TCA	2	6	2133341	2133346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855981
45492	NC_020410	TGC	2	6	2133413	2133418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855981
45493	NC_020410	TCT	2	6	2133444	2133449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855981
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45497	NC_020410	T	6	6	2133586	2133591	0 %	100 %	0 %	0 %	452855981
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45500	NC_020410	TTTA	2	8	2133651	2133658	25 %	75 %	0 %	0 %	452855981

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